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Etude structurale et fonctionnelle de la reconnaissance et de la métabolisation de lésions puriques et pyrimidiques dans l'ADN par la Formamidopyrimidine-ADN glycosylase

Le Bihan, Yann-Vaï Castaing, Bertrand. January 2009 (has links) (PDF)
Thèse de doctorat : Biophysique moléculaire : Orléans : 2009. / Titre provenant de l'écran-titre.
2

Régulation du facteur de réplication de l'ADN MCM7 par poly-ubiquitinylation : rôles d'Int6 et BRCA1

Buchsbaum, Samuel. Jalinot, Pierre January 2006 (has links)
Thèse de doctorat : Sciences de la vie : Lyon, École normale supérieure (sciences) : 2006. / Bibliogr. p. 206-235.
3

Étude des facteurs déterminant le clivage de l'ADN par l'ADN topoisomerase II

Fournier, Michèle 16 April 2018 (has links)
L'ADN topoisomérase II (TOP2) joue un rôle critique dans les processus métaboliques de l'ADN. Elle catalyse le passage d'un segment d'ADN intact à travers un second via une cassure double brin transitoire. L'objectif de cette étude in vitro était de déterminer le rôle des distorsions de structure et . de la torsion superhélicoïdale comme déterminants potentiels des clivages induits par les TOP2a humaine (hTOP2a) et TOP2 de drosophile (DmTOP2). Nous avons utilisé un plasmide (pBS-SAR) contenant un segment de SAR du gène interféron-~ 1 humain comme substrat. La spécificité des sites de clivage induits par les TOP2 a été analysée par extension-ligation-mediated-PCR (ELMPCR). Cette technique détecte des cassures d'ADN dépourvues d'extrémité 5' -phosphate, telles que les extrémités bloquées produites par les TOP2. Des cinétiques de relaxation ont révélé que la hTOP2a était au moins 10 fois plus active sur le SAR que sur l'ADN plasmidique. Nous avons montré qu'en présence d'étoposide et d'un rapport enzyme:DNA bas, la hTOP2a induit deux clivages forts dans le plasmide surenroulé mais aucun dans le plasmide relaxé. Ceux-ci ont été localisés en bordure de zones dont l'hypersensibilité à la bléomycine et la nucléase SIest accentuée par la torsion, suggérant que la reconnaissance d'une altération de structure induite par superhélicité est requise pour un clivage TOP2 efficace, dans ces conditions. Avec un rapport enzyme:ADN élevé, les patrons de clivage du pBS-SAR surenroulé par hTOP2a et DmTOP2 étaient similaires. Par contre, la reconnaissance de particularités intrinsèques à la structure de l'ADN linéaire semble suffire au clivage induit par hTOP2a mais non DmTOP2. En absence d'étoposide, et en présence d'ATPyS substituant l'ATP, la DmTOP2 et la hTOP2a clivent l'ADN dans les zones du SAR qui sont intrinsèquement hypersensibles à la nucléase SI et au KMn04, à des sites distincts des principaux clivages induits par étoposide. En conclusion, nos résultats supportent un modèle dans lequel des distorsions intrinsèques à la structure primaire du SAR, qui peuvent être accentuées par des altérations de structure induites par torsion superhélicoïdale, conjointement avec les interactions drogue-enzyme, agissent comme signaux de reconnaissance des sites de clivage des TOP2, et possiblement comme catalyseurs de la réaction de clivage.
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Mécanisme de déclenchement de l'apoptose par des lésions à l'ADN : protection par l'induction de l'expression de p21(Waf1/Cip1)

Bissonnette, Nathalie. January 1998 (has links)
Thèses (Ph.D.)--Université de Sherbrooke (Canada), 1998. / Titre de l'écran-titre (visionné le 20 juin 2006). Publié aussi en version papier.
5

Caractérisation de fragments d'ADNc issus d'un immunocriblage à l'aide de sérums de patients rhumatoïdes

Laniel, Marc-André. January 1998 (has links)
Thèses (M.Sc.)--Université de Sherbrooke (Canada), 1998. / Titre de l'écran-titre (visionné le 20 juillet 2006). Publié aussi en version papier.
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Incorporation spécifique d'une pyrimidine oxydée dans l'ADN cellulaire

Ratelle, Guillaume. January 2001 (has links)
Thèses (M.Sc.)--Université de Sherbrooke (Canada), 2001. / Titre de l'écran-titre (visionné le 20 juin 2006). Publié aussi en version papier.
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¿Nos encontramos frente a una nueva clase de mutagenos?

Cuyubamba, Oscar R., Pryor, William, Shane, Barbara S., Squadrito, Giuseppe 25 September 2017 (has links)
El 1 ,3-dinitronaftaleno, previamente identificado en polvo ambiental, forma aductos covalentes con nucleótidos del DNA a temperatura ambiente fácilmente. La potencia mutagénica de un hidrocarburo aromático policíclico dinitrado (HAPDN), el 1, 3-dinitrofluoranteno, es prácticamente independiente de la cepa de Salmonella Typhimurium (TA98, TA98NR y TA98/1, 8DNP6) empleada en el Test de Ames. Este comportamiento poco usual sugiere que este HAPDN no requeriría de la activación metabólica vía la "nitroreductasa clásica" y/o de la acetilasa El hecho de que el 1, 3- dinitronaftaleno forma aductos covalentes con nucleótidos del DNA rápidamente está de acuerdo con que HAPDN meta disubstituídos podrían prescindir de las rutas usuales de activación metabólica. / 1,3-Dinitronaphthalene, previous1y identified in particulate organic matter, easily forms covalent adducts with DNA nucleotides at room temperature. The mutagenic potency of a related dinitropolycyclic aromatic hydrocarbon (dinitroPAH) with meta disubstitution, namely 1,3-dinitrofluoranthene, is rather independent of the Salmonella Typhimurium tester strain (TA98, TA98NR and TA98/l, 8DNP6) when assayed according to the Ames Test. This unusual behavior suggests that it does not require metabolic activation via the "classical nitroreductase" and/or the acetylase. The fact that 1,3--dinitronaphthalene readily forms covalent adducts with DNA nucleotides further suggests that dinitroPAH with meta nitro-groups may not require the usual metabolic activation pathways.
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Étude des phénomènes reliés à la présence du brin complémentaire au brin cible lors d'hybridation avec sondes de captures fixées sur support solide

Boissinot, Karel 20 April 2018 (has links)
Cette thèse de doctorat présente 3 études reliées à l’hybridation d’ADN fixée à un support solide et les phénomènes qui y sont associés. L’hybridation d’ADN en phase aqueuse est bien caractérisée, cependant plusieurs phénomènes et paramètres restent encore à déterminer lorsqu’un des brins est fixé sur un support solide. Un de ces paramètres est l’influence du brin complémentaire en fonction de la longueur de l’extrémité d’ADN cible immobilisée exposée à la phase aqueuse. Pour mieux comprendre ce phénomène, nous avons établi une méthode pour digérer spécifiquement le brin d’ADN complémentaire pour simplifier l’hybridation sur support solide. La combinaison d’une molécule favorisant la digestion du brin complémentaire et d’une molécule bloquant la digestion du brin cible a permis de produire un ADN cible simple brin à l’aide de l’exonucléase Lambda, permettant d’obtenir des signaux d’hybridation supérieurs à ceux obtenus avec des ADN doubles brins. Ensuite, l’observation en temps réel de l’hybridation d’amplicons simples brins et doubles brins a permis de mieux comprendre les phénomènes de compétition entre le brin complémentaire et la cible. Finalement, les conclusions des deux premières études nous ont permis d’inventer une technologie tirant profit de la compétition entre le brin complémentaire et la sonde de capture et de l’activité exonucléase pour réaliser l’amplification PCR et l’hybridation sur biopuce en un seul site réactionnel et dans un seul tampon réactionnel. La combinaison de ces techniques aura pour effet une simplification des dispositifs et une diminution du nombre de réactifs permettant la fabrication de tests diagnostiques automatisés à moindre coûts. Les travaux de cette thèse ont permis d’approfondir nos connaissances sur les phénomènes reliés à l’hybridation sur support solide et de concevoir une technologie faisant l’objet d’une demande de brevet. La suite logique de ces travaux serait de poursuivre le développement et l’optimisation de la technologie pour augmenter ses capacités de multiplexage tout en l’intégrant à un dispositif microfluidique et à un instrument de détection qui combine amplification PCR et hybridation sur biopuce dans une seule réaction réalisée en une seule étape. / This thesis presents three studies related to the phenomenon related to DNA hybridization onto capture probes attached to solid support. The work was carried out in the context of infectious diseases detection, but the conclusions are of interest to any test based on the recognition of genetic material by solid support immobilized capture probes. DNA hybridization in aqueous phase is well characterised, however several parameters and phenomena related to hybridization onto solid supports are still to be determined. One of these parameters is the influence of the complementary strand in relation with the length of the solvent-exposed immobilized target strand. To better understand this phenomenon, we established a method to specifically digest the complementary DNA strands to simplify hybridization onto solid support. The presence of a molecule favorising digestion on the complementary strand and a blocking molecule on the target strand enabled selective digestion of the complementary strand using Lambda exonuclease in PCR buffer. Hybridization of single-stranded target DNA generated this way resulted in significantly higher fluorescence signals than those obtained with double stranded hybridization. Afterwards, observation of real-time hybridization of single-stranded amplicons and double-stranded amplicons to capture probes fixed onto solid support allowed for a better understanding of the competition phenomena between the complementary strand and the capture probe. Finally, the knowledge gained with the first two studies was used to invent a technology taking advantage of the competition between the complementary strand and the capture probe and exonuclease activity to perform single vessel and single buffer PCR amplification and microarray hybridization. The combination of these techniques will simplify devices and require fewer reagents storage and handling, facilitating production of automated diagnostic tests at lower costs. The works of this thesis have expended our understanding of the phenomena associated with hybridization onto a solid support and also resulted in the creation of a new technology covered by a patent application. The logical progression of this work is to further develop and optimize this technology by integrating it into a microfluidic device and an instrument compatible with the detection of microarrays to increase the multiplexing capabilities of molecular diagnostics.
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Conception, synthèse, caractérisation chimique et évaluation biologique de nouveaux agents anticancéreux ciblant les microtubules et les mécanismes de réparation et de réplication de l’ADN

Gagné-Boulet, Mathieu January 2021 (has links)
No description available.
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Sites de translocations oncogéniques dans le gène MLL : corrélation avec des sites de clivage par la topoisomérase II cartographiés in vivo au niveau du nucléotide /

Boucher, Patrick. January 2003 (has links)
Thèse (M.Sc.)--Université Laval, 2003. / Bibliogr.: f. 86-90. Publié aussi en version électronique.

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