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Fenômica aplicada à caracterização de frutos em germoplasma de abóbora / Phenomics applied to the characterization of fruits in germplasm of winter squash

Machado Junior, Ronaldo 19 July 2017 (has links)
Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2018-04-20T12:47:27Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 553880 bytes, checksum: b222e62ef2640f900d07544560fc22d7 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-04-20T12:47:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 553880 bytes, checksum: b222e62ef2640f900d07544560fc22d7 (MD5) Previous issue date: 2017-07-19 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais / O cultivo de abóbora (Cucurbita moschata D.) é amplamente difundido no mundo. Isso se deve a facilidade de produção, versatilidade de cultivo, boa adaptabilidade às condições ambientais, boa aceitação no consumo e possibilidade de expansão de área de plantio. Seus frutos possuem grande importância para atividades humanas, uma vez que pode ser utilizada para diversos fins industriais, alimentícios e medicinais. O Brasil possui ampla variabilidade genética de abóbora. No intuito de preservar essa variabilidade genética foram criados seis bancos de germoplasma, mantidos por instituições públicas. O Banco de Germoplasma de Hortaliças da Universidade Federal de Viçosa (BGH-UFV) detém mais de 350 acessos de C. moschata, ainda pouco explorados. Apesar da facilidade e simplicidade das técnicas tradicionais aplicadas à caracterização dos frutos, elas demandam tempo, mão de obra e recursos financeiros. Uma alternativa a essas avaliações seria a fenotipagem de alta qualidade e em larga escala por meio de imagens, cujo tema é abordado pela fenômica. A expectativa é que a fenotipagem baseada em imagens permitirá expandir experimentos e realizar avaliações fenotípicas rápidas e mais precisas. O objetivo desse trabalho foi avaliar a eficiência da fenotipagem de frutos de abóbora por meio de imagens digitais. Para isso, foram avaliadas 466 frutos provenientes de 148 acessos de C. moschata mantidos no BGH-UFV e 4 testemunhas. Após corte longitudinal, os frutos foram avaliados quanto aos descritores comprimento e diâmetro do fruto e da cavidade interna, por meio de mensuração manual e por análise de imagens, utilizando um aplicativo desenvolvido com auxílio da biblioteca de processamento digital de imagens do MATLAB. Identificou-se leve variação entre as metodologias de fenotipagem. Entretanto, a avaliação por meio das mensurações nas imagens apresentou alta concordância, correlação quase perfeita e de desempenho classificado como ótimo em todos os descritores em comparação com as medidas manuais. Uma vez que se conhece as dimensões do comprimento, diâmetro, e cavidade interna do fruto é possível determinar o rendimento médio de polpa. Conclui-se que a avaliação de frutos de abóbora por meio de imagens é eficiente, pois permite avaliar um grupo maior de genótipos com rapidez, praticidade, precisão e ainda armazenar as imagens para futuras pesquisas. / The cultivation of winter squash (Cucurbita moschata Duchesne) is worldwide widespread. This results from its easy of production, versatility of cultivation, good adaptability to the environmental conditions, from its good acceptability in the consumer markets and from the possibility of expanding the areas intended to its cultivation. The fruits of C. moschata are important in a series of activities such as in the industry, in food industry and medical purposes. The country of Brazil holds a wide genetic variability of C. moschata. Until the present, six germoplasm banks have been created aiming to conserve this variability. The Vegetable Germoplasm Bank of the Universidade Federal de Viçosa (BGH-UFV) holds more than 350 accessions of C. moschata, still little used. Despite the ease and simplicity of the traditional techniques used in the characterization of fruits, they require time, labor and financial resources. One alternative to this characterization is the phenotyping of high quality and in large scale thru images, which is included in the phenomics. The expectation is that the phenotyping based in images will enable expanding the experiments and carry out phenotypic evaluations faster and more precisely. The objective of this work was to evaluate the efficiency of the phenotyping of fruits of winter squash thru digital images. For this, it was evaluated 466 fruits from 148 accessions of C. moschata kept by the BGH-UFV and four checks. After longitudinal cutting, the fruits were evaluated as to the descriptors length and diameter of fruit and the internal cavity, by means of manual measurement and by image analysis, using an app developed with the aid of the digital image-processing library of MATILAB. It was identified a slight variation among the phenotyping methodologies. However, the evaluation based on the measurements of images had high agreement, almost perfect correlation and performances classified as optimal in all the descriptors in comparison to the manual measurements. Once known the dimensions of length, diameter and internal cavity of fruits it is possible determining the average yield of pulp. It is concluded that the evaluation of winter squash fruits by means of images is efficient, since it allows to evaluate a larger group of genotypes with higher speed, practicality, precision, besides allowing the storage of images for future purposes.
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Herança do porte e descritores morfoagrônomicos de abóbora (Cucurbita moschata Duchesne) / Inheritance of plant habit and morphological descriptors of pumpkin (Cucurbita moschata Duchesne)

Almeida, Cleverson Freitas 25 July 2017 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2018-06-13T14:32:59Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 866080 bytes, checksum: d00ec6f2914fbcc7fed97024d6833ea5 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-06-13T14:32:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 866080 bytes, checksum: d00ec6f2914fbcc7fed97024d6833ea5 (MD5) Previous issue date: 2017-07-25 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A abóbora (Cucurbita moschata Duch.) possui grande potencial para utilização de suas sementes como fonte de óleo, com excelente qualidade nutricional. Uma grande dificuldade em aumentar a produtividade de óleo em abóbora é o seu hábito de crescimento, que em geral é indeterminado com caules rastejantes que atingem grandes distâncias, a partir da coroa central o que impede maiores adensamentos de plantio, proporcionando reduzida quantidade de plantas por área. No entanto, alguns genótipos apresentam hábito reduzido, os quais possuem entrenós mais curtos, que possibilitaria aumento da densidade e, consequentemente, maior produtividade de sementes e óleo por área. Dessa forma, a transferência de alelos que confere essa redução do entrenó para genótipos com alto teor de óleo possibilitaria maior produtividade de semente por área, consequentemente de óleo. Para aumentar a eficiência desse processo é necessário o entendimento da herança desse hábito, assim como dos descritores relacionados. Diante disso, o objetivo desse trabalho foi estudar o controle genético de descritores morfoagronômicos e relacionados ao porte, visando reduzir o comprimento do entrenó e aumentar a produção de sementes e óleo em C. moshata. Para isso foi realizada análise de gerações, que permite avaliar simultaneamente várias gerações ou populações, incluindo genitores (P1 e P2 ), híbridos (F1 ) e gerações segregantes F 2 , além das derivadas de retrocruzamentos. O genitor P 1 é o acesso BGH 7319 pertencente ao Banco de Germoplasma de Hortaliças da Universidade Federal de Viçosa (BGH-UFV), acesso considerado promissor para produção de óleo funcional. O genitor P 2 é o cultivar Tronco Verde que possui o gene que confere a redução do entrenó, em homozigose. Foram avaliados 17 descritores relacionados ao porte, quatro ao florescimento, 11 aos frutos, sete as sementes e três de produção, totalizando 42 descritores. Todas as características avaliadas foram submetidas à análise de geração, em que foram estimadas as médias e variâncias aditivas, desvios da dominância, fenotípica, genética e ambiental. Para o modelo aditivo dominante, foram estimados os efeitos aditivos, dominantes e da média. Para o modelo completo foram estimados os efeitos das médias de todos os possíveis homozigotos, aditivos, dominantes e epistáticos: aditivo x aditivo, aditivo x dominante e dominante x dominante. Além disso, foram utilizados estimadores de máxima verossimilhança para determinar qual o melhor modelo genético em explicar as características de comprimento médio do entrenó antes e após o florescimento. O modelo aditivo dominante foi adequado para explicar 22 dos 42 descritores avaliados (52,42%). Para este modelo, o desvio de dominância foi significativo para 17 (77,27%) e para aqueles explicados pelo modelo completo foi significativo para 15 (75,00%), demonstrando sua grande influência no controle de tais descritores. Com a utilização de estimadores de máxima verossimilhança o modelo mais adequado para explicar o comprimento médio do entrenó antes do florescimento foi aquele que considera o gene de efeito maior com efeitos aditivos e de dominância mais poligenes de efeitos aditivos e de dominância sob influência do ambiente. Para o comprimento médio do entrenó após o florescimento o modelo mais adequando é aquele que considera apenas poligenes de efeitos aditivos mais efeitos ambientais. / The pumpkin seeds (Cucurbita moschata Duch.) has a great potential to be used as an oil source, which one has a high nutritional quality. Despite of that, there is a great difficult to increase the pumpkin oil production, related to type of plant pumpkin growth. The main features of pumpkin plant are undetermined growth, crawling stems which generally reach great distances from the central growth. As a result, occurs the inhibition of planting density and a less amount of pumpkin can be planting by area. As a possible solution, there is some genotypes of pumpkin which have a reduced habit growth and shorter internodes, providing a possibility to increase the planting density and consequently, higher seed and oil yields per area. This manner, the transference of these alleles, responsible by reduction of internodes of the training to genotypes with high oil content would allow higher seed productivity per area, consequently of oil. To increase the efficiency the allele transference process, it is necessary to understand the inheritance of this habit of plant growth, as well as related descriptors. Therefore, this research aimed to study the genetic control of morphoagronomic descriptors related to plant size, providing manner to reduce the length of internodes and increase the pumpkin seed and oil production in C. moshata. To undertake this research it was performed a generational analysis allowing the simultaneous evaluation of various generations or populations, including parents (P1 and P2 ), hybrids (F1 ), segregating generations F2 and those derived from backcrossing. The P 1 parent is the BGH 7319 access belonging to the Vegetable Germplasm Bank of the Federal University of Viçosa (BGH-UFV), an access considered promising to the production of functional oil. The P 2 parent is the Tronco Verde, cultivar that possesses the gene that confers the reduction of the internodes, in homozygous. Seventeen descriptors related to plant size, four to flowering, 11 to fruits, seven seeds and three of production were evaluated, totalizing 42 descriptors. All evaluated characteristics were submitted to the generation analysis, in which were estimated the means and additive, dominance deviations, phenotypic, genetic and environmental variances. To the dominant additive model were estimated the additive, dominant and means effects. In the complete model were estimated the effects of the means, additive, dominant, epistatic and of all possible homozygotes. In addition, maximum likelihood estimators were used to determine the best genetic model to explain the characteristics of length internode before and after flowering. The dominant additive model was adequate to explain 22 of the 42 descriptors evaluated (52.42%). To this model, the dominance deviation was significant for 17 (77.27%) and for those explained by the complete model it was significant for 15 (75.00%), demonstrating its great influence in the control of such descriptors. With the use of maximum likelihood estimators, the most adequate model to explain the length internode average before flowering was that considered the major effect gene with additive and dominance effects plus polygenes of additive effects and dominance, under influence of the environment. For the average length of the internodes after flowering the most suitable model is that considered only polygenes of additive effects plus environmental effects.
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Potencial de híbridos e população segregante de abóbora para a produção de óleo e redução do porte da planta / Potential of hybrids and segregating population of pumpkin for the production of oil and reducing the size of the plant

Laurindo, Renata Dias Freitas 23 July 2015 (has links)
Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2015-11-12T08:38:51Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 452878 bytes, checksum: 0961c06a01890af66e4b0af9bd0b7716 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-11-12T08:38:51Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 452878 bytes, checksum: 0961c06a01890af66e4b0af9bd0b7716 (MD5) Previous issue date: 2015-07-23 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / A abóbora (Cucurbita moschata Duch.) desempenha papel importante na alimentação humana, podendo-se consumir a parte vegetativa e os frutos, inclusive suas sementes. As sementes possuem elevado valor nutritivo, devido ao alto teor proteico e oleoginoso. A presença de ácidos graxos insaturados e compostos bioativos no óleo das sementes de abóbora, o eleva a classe de alimentos funcionais. Mesmo com esse potencial, o rendimento de óleo é baixa, pois as abóboras possuem hábito de crescimento rastejante, necessitando de espaçamentos maiores, podendo uma única planta ocupar uma área de até 25m2. No entanto, quando se utiliza abóboras tipo moita, esse espaçamento pode ser reduzido para até 1m2. A alternativa para a redução do espaçamento utilizado na cultura é a introgressão do gene de nanismo (gene Bush). O objetivo com o presente estudo foi promover a caracterização e avaliação de populações híbridas e segregantes provenientes do cruzamento entre acessos de C. moschata do Banco de Germoplasma de Hortaliças da Universidade Federal de Viçosa (BGH-UFV) com potencial oleaginoso e cultivares que possuem o gene de nanismo (Bush) visando a obtenção de genótipos com elevada produtividade de óleo das sementes e com reduzida arquitetura da planta. O delineamento experimental utilizado foi o de blocos casualizados, com três repetições. Cinco plantas dos acessos do BGH-UFV (BGH-7319 e BGH-7765), cultivares (Piramoita e Tronco Verde) e híbridos F1 (BGH-7319 x Piramoita, BGH-7319 x Tronco Verde, BGH-7765 x Tronco Verde) foram utilizadas por repetição, sendo consideradas as três plantas centrais das parcelas como úteis e trinta plantas para cada uma das três populações F 2 (‘População 1 F2’, ‘População 2 F2’, ‘População 3 F2’). Foram aplicados 28 descritores, sendo 9 relativos a fase vegetativa das plantas, 12 referentes aos frutos e 7 às sementes. Os dados experimentais foram submetidos à análise de variância e as médias dos tratamentos contrastadas com as médias das testemunhas a 5 % de probabilidade, pelo teste Dunnett. As análises foram realizadas utilizando-se o Aplicativo Computacional em Genética e Estatística GENES. Na predição do potencial das populações para obtenção de linhagens superiores, foi utilizada a metodologia de JINKS & POONI (1976). Para as características da fase vegetativa, foi observada reduzida variabilidade. O comprimento da rama aos 7, 14, 21, 28 e 35 dias após o transplantio não possibilitou diferenciar os genótipos do tipo moita e rastejante. O comprimento do entrenó aos 30 e 60 dias após o transplantio e o hábito de crescimento para todos os tratamentos avaliados obtiveram padrão intermediário às testemunhas tipo moita e rastejante. O híbrido BGH-7319 x Piramoita se destacou para as características prolificidade, diâmetro e comprimento da cavidade interna do fruto, diâmetro do fruto, massa e número de sementes por fruto e carotenoides totais na polpa. Dentre essas, com exceção de carotenoides totais, este híbrido superou seu genitor de melhor desempenho para todas as demais características. O híbrido BGH- 7319 x Tronco Verde, se destacou em relação às características massa média do fruto, diâmetro da cavidade interna e diâmetro do fruto, massa de sementes por fruto, massa de 100 sementes, comprimento, largura e espessura da semente. De maneira geral, para as características de semente que obtiveram diferenças significativas, este híbrido também superou o seu genitor de melhor desempenho. Mediante a metodologia de JINKS & POONI (1976), a ‘População 2 F2’ derivada do cruzamento entre os genitores BGH-7319 e Tronco Verde foi considerada a mais promissora, superando os padrões pré- estabelecidos em 53% dos descritores aplicados, dentre estes, descritores relacionados à redução do porte da planta. / The pumpkin (Cucurbita moschata Duch.) plays an important role in human nutrition. The vegetative part, fruit and seeds can be consumed. Seeds have high nutritional value due to the high protein and oil content. The presence of unsaturated fatty acids and bioactive compounds in the oil of pumpkin’s seeds make this vegetable a functional food. Despite this potential, the oil yield is low because the pumpkins have a creeping growth habit and require larger spacing. A single plant can occupy an area of up to 25m2. When using brush type pumpkins, this spacing can be reduced up to 1m 2. The alternative to reduce the spacing in this crop is the introgression of dwarfism gene (Bush gene). The aim in this study was to promote the characterization and evaluation of hybrid and segregating populations from the cross between access C. moschata the Germplasm Bank of the Federal University of Viçosa vegetables (BGH-UFV) with oily potential and cultivars that have the dwarfism gene (Bush) aimed at obtaining genotypes with high productivity oil seeds and with reduced architecture of the plant. The experimental design was a randomized complete block design with three replications. Five plants of BGH- UFV accesses (BGH-7319, BGH-7765), cultivars (Piramoita and Tronco Verde) and F1 hybrids (BGH-7319 x Piramoita, BGH-7319 x Tronco Verde, BGH-7765 x Tronco Verde) were used by repetition, considering the three central plants of the plots as useful and thirty plants for each of the three F2 populations ('Population 1 F2', 'Population 2 F2', Population 3 F2 '). 28 descriptors were applied, 9 for the growing season of plants, 12 related to fruit and seeds 7. The experimental data were subjected to analysis of variance and treatment means contrasted with the average of the controls at 5% of probability by the Dunnett’s test. The analysis were performed using the software GENES. In the prediction of the potential of the populations for the obtantion of superior strains, the methodology of JINKS & POONI (1976) was used. Low variability was observed for the characteristics of the vegetative phase. The length of the branch at 7, 14, 21, 28 and 35 days after transplanting did not allow the differentiation of genotypes of bush and creeping growth habit. The length of the internode at 30 and 60 days after transplanting and the growth habit for all the treatments obtained intermediate pattern to the bush and creeping type controls. The BGH-7319 x Piramoita hybrid stood out for prolificacy, diameter and length of the inner cavity, diameter of the fruit, mass and number of seeds per fruit and total carotenoids in the pulp. Among these, except for total carotenoids, this hybrid surpassed its genitor of better performance for all other characteristics. The BGH- 7319 x Tronco Verde hybrid stood out in relation to the average fruit mass, diameter of the inner cavity, diameter of the fruit, mass of seeds per fruit, mass of 100 seeds, length, width and thickness of the seed. For seeds characteristics that had significant differences, this hybrid also topped their best performance genitor. By the methodology of JINKS & POONI (1976), the 'Population 2 F2' derived from the cross between the BGH-7319 and Tronco Verde genitors was considered the most promising, exceeding the pre-established standards in 53% of descriptors applied, including, descriptors related to the size reduction of the plant.

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