Les microsatellites, séquences répétées en tandem de période une à six paires de bases, sont des entités génomiques présentes dans tous les organismes qu'ils soient animaux, végétaux ou microbiens. Ils présentent un cycle de vie caractérisé par trois phases principales : une apparition et une maturation, une dynamique à l'état mature, puis une dégénérescence. Nous nous intéressons dans cette thèse à la première phase, l'apparition des microsatellites. <br />Pour traiter ces questions, nous nous sommes basés sur l'analyse de la séquence du génome humain. L'une des lacunes de ce type d'analyse est qu'il faut d'abord extraire les microsatellites du génome, et qu'il existe plusieurs algorithmes de nature et fonctionnement différents. La première partie de cette thèse se concentre donc sur la comparaison de quelques-uns des principaux algorithmes de recherche de répétitions en tandem, et dresse un portait des différentes qualités et limitations de chacun des algorithmes.<br />Deux possibilités majeures sont détaillées, l'apparition par l'intermédiaire d'éléments transposables (ETs), et l'apparition spontanée à partir d'une séquence quelconque. Dans le premier cas, l'étude est focalisée sur le rôle des queues polyA des séquences Alu chez les primates. La question de l'apparition à partir d'une séquence quelconque cherche à établir l'impact de trois mécanismes mutationnels différents sur la création et le développement primordial des microsatellites : la mutation ponctuelle, le glissement de polymérase et la micro-duplication adjacente de quelques nucléotides. Un modèle général d'apparition des microsatellites est aussi proposé, suggérant une dynamique d'apparition plus complexe que ce qui était précédemment supposé.

La présence de poussières au sein des plasmas est rencontrée dans de multiples environnements tels que les plasmas de laboratoires ou les plasmas de fusion. Les processus conduisant à leur formation constituent un vaste champ d'études depuis plusieurs années. Ce travail de thèse a pour objectif d'étudier un nouveau mécanisme de croissance des poussières dans un plasma radiofréquence capacitif en mélange argon/acétylène. Dans certaines conditions, il a été observé que des ondes de densité de poussières apparaissaient spontanément au sein des nuages de poussières. Elles peuvent grandement favoriser l'agglomération des particules grâce à l'importante énergie cinétique qu'elles leur transfèrent. Pour réaliser cette étude, différents outils diagnostics ont été développés. Pour sonder les populations de poussières nanométriques, un premier diagnostic basé sur des mesures d'extinction dans le domaine visible associé à une méthode inverse a été mis au point. Un second diagnostic permettant l'étude des populations d'agglomérats supra-microniques a été utilisé. Il est basé sur l'utilisation de l'imagerie rapide et l'analyse automatique des films à l'aide d'un algorithme adapté (TRACE). Enfin, une méthode d'extraction des poussières en vue d'analyses ex-situ et utilisant la force de thermophorèse a été développée.Ces diagnostics ont ensuite été appliqués à l'étude des ondes de poussières et des processus d'agglomération. Nous avons montré que des agglomérats de plusieurs centaines de microns pouvaient être formés en quelques dizaines de secondes. L'influence des conditions expérimentales sur les caractéristiques des ondes et des agglomérats formés a également été étudiée / The dust particle growth in plasmas is of major concern for safety issues in fusion reactors, and conversely has important industrial impacts. Dusty plasmas produced in laboratory, fusion, and in astrophysical environments have been therefore widely studied for many years to better understand the involved physical phenomena. In this thesis work, we have investigated a new dust-growing mechanism in a capacitive radio-frequency plasma of argon/acetylene mixture, with developing necessary diagnostic tools. The population of nano-particles was probed using visible-wavelength range extinction measurements combined with an inverse method. The motions and the collisions in enlarging agglomerates were followed through a fast-imaging device and the images were then analyzed using a compatible algorithm (TRACE). Ex-situ studies were also carried out on dust particles collected with an extraction technique based on the thermophoresis force. These diagnostic tools allowed us to observe a spontaneous emergence of dust density waves (DDWs) under specific experimental conditions. These waves impart substantial kinetic energy to the dust particles and thus enhance their agglomeration rate. Large agglomerates up to several hundreds of microns may thus be produced in a few tens of seconds. We have also studied the influence of experimental conditions (power, pressure) on the waves and the agglomerate characteristics

Ces travaux de recherche visaient à développer un système d'aide à la mobilité pour les personnes ayant une déficience visuelle (VIP ‘Visually Impaired Person’) appelé ‘Smart Environment Explorer Stick (SEES)’. Le but particulier de cette recherche était de développer de nouveaux algorithmes pour améliorer la précision de la détection de la présence de poteaux de la canne SEE-stick en utilisant la méthode de calcul de distance et la recherche de paires de lignes verticales basées sur l'optimisation de la technique de détection de contour de Canny. Désormais, l'algorithme de détection des poteaux est appelé l’algorithme YuRHoS. Le SEES développé comme système de support d'aide à la mobilité VIP a été intégré avec succès à plusieurs dispositifs tels que le serveur distant dénommé iSEE, le serveur local embarqué dénommé SEE-phone et la canne intelligente dénommée SEE-stick. Les performances de SEE-stick ont été améliorées grâce à l'algorithme YuRHoS qui permet de discriminer avec précision les objets (obstacles) en forme de poteau parmi les objets détectés. La comparaison des résultats de détection des poteaux avec ceux des autres algorithmes a conclu que l'algorithme YuRHoS était plus efficace et précis. Le lieu et la couleur des poteaux de test d’évaluation étaient deux des facteurs les plus importants qui influaient sur la capacité du SEE-stick à détecter leur présence. Le niveau de précision de SEE-stick est optimal lorsque le test d’évaluation est effectué à l'extérieur et que les poteaux sont de couleur argentée. Les statistiques montrent que la performance de l'algorithme YuRHoS à l'intérieur était 0,085 fois moins bonne qu'à l'extérieur. De plus, la détection de la présence de poteaux de couleur argentée est 11 fois meilleure que celle de poteaux de couleur noir. / This research aimed to develop a technology system of mobility aid for Visually Impaired Person (VIP) called Smart Environment Explorer Stick (SEES).Particular purpose of this research was developing new algorithm in improving accuracy of SEE-stick for pole detection using distance calculation method and vertical line pair search based on Canny edge detection optimization and Hough transform. Henceforth, the pole detection algorithm was named as YuRHoS algorithm.The developed SEES as supporting system of VIP mobility aid had been successfully integrated several devices such as global remote server (iSEE), embedded local server (SEE-phone) and smart stick (SEE-stick). Performance of SEE-stick could be improved through YuRHoS algorithm, which was able to fix the accuracy of SEE-stick in detecting pole. Test comparison of pole detection results among others algorithm concluded that YuRHoS algorithm had better accuracy in pole detection.Two most significant factors affecting SEE-stick ability in detecting pole was test location and pole color. Level of accuracy of SEE-stick would be optimum once the test location was performed outdoor and pole color was silver. Statistics result shown that YuRHoS algorithm performance indoor was 0.085 times worse than outdoor. Meanwhile, silver-pole-color as object detection could increase YuRHoS algorithm performance as much as 11 times better compare to black-pole-color.