L'influence de différents facteurs environnementaux sur le comportement natatoire des copépodes calanoïdes estuariens Eurytemora affinis et Pseudodiaptomus annandalei a été étudiée au moyen d'un système de suivi lagrangien en trois dimensions. Nous avons observé des changements marqués dans le comportement natatoire de P. annandalei en réponse à une augmentation graduelle de salinité. Nos résultats montrent une salinité optimale pour le comportement et peuvent être expliqués par une redirection de la dépense énergétique du mouvement à l'effort d'osmorégulation quand la salinité diverge de la zone optimale. Nous avons étudié les effets immédiats de concentrations non létales de trois polluants sur le comportement de nage d’E. affinis. Nonylphénol, cadmium et un mélange d’hydrocarbures aromatiques polycycliques ont provoqué une augmentation de la vitesse de nage chez les trois stades adultes. Dans la plupart des cas, les effets ont été observés pendant une courte période d’exposition et ont persisté ou diminué pendant une courte période de décontamination. Nos résultats montrent que la première réponse aux polluants semble indépendante de leurs propriétés toxiques et ressemble à une réaction de fuite visant à échapper à des conditions stressantes. Nous avons montré qu'une exposition brève à la toxine de diatomée 2(E), 4(E) decadienal provoque une hyper-activité dose-dépendante pour les trois stades adultes de P. annandalei et une diminution de la vitesse de nage. L’analyse multifractale de la norme du déplacement a révélé chez les trois stades adultes un mouvement plus brownien en présence de la toxine avec des effets moindres chez les femelles non ovigères. / The effects of environmental stressors on the dynamics of Eurytemora affinis and Pseudodiaptomus annandalei, two widespread species of estuarine calanoid copepods, were investigated by means of Three Dimensional Particle Tracking Velocimetry. We observed changes in the swimming behavior of P. annandalei in response to salinity variation. Results show an optimal salinity for swimming activity and highlight differences between adult states. Redirection of energy from swimming to osmoregulation when salinity diverges from the optimal range of the species is a possible explanation. We investigated the effects of sub-lethal concentrations of three commonly found contaminants on the behavior of E. affinis. Nonylphenol, cadmium and polycyclic aromatic hydrocarbons increased both swimming speed and activity. In most cases, effects were observable within 30 minutes of exposure and persisted or faded during a period of depuration of similar duration. Our results suggest that changes in behavior after a short-term exposure may be independent of the general mode of action of the chemicals. The increase in speed and activity resembles an escape reaction permitting copepods to evade stressful conditions. We investigated the effects of the diatom-derived aldehyde 2(E), 4(E) decadienal on the swimming behavior of P. annandalei. Short-term exposure to the toxin induced dose-dependent hyperactivity in the three adult states and a decrease in swimming speed. Multifractal analysis revealed differences in the statistical properties of the swimming behavior. Exposure to the toxin resulted in a more Brownian motion in males and ovigerous females, but had little effects on non-ovigerous females.