El estudio tuvo como objetivo evaluar los potenciales reservorios silvestres de Trypanosoma sp. en cuatro localidades de los departamentos de Amazonas y Loreto, capturando y analizando marsupiales, roedores y quirópteros en busca de este protozoo. Además, se comparó la diversidad y presencia de Trypanosoma sp. en hospederos silvestres del departamento de Amazonas y Loreto, área endémica y no endémica de la enfermedad de Chagas, respectivamente. El estudio se realizó en los centros poblados el Ron y Tres Marías, provincia de Utcubamba departamento de Amazonas y los caseríos Cahuide y Manacamiri en la provincia de Maynas, departamento de Loreto. Los roedores y marsupiales fueron capturados utilizando trampas Tomahawk y Sherman, y para los quirópteros se utilizó redes de neblina. Los animales capturados fueron anestesiados para aplicar la técnica de xenodiagnóstico. Se determinó los índices de biodiversidad utilizando el programa Past; para el análisis porcentual y Prueba Exacta de Fisher se utilizó el software STATA. Se capturaron 95 individuos correspondiendo a 16 especies, Loreto mostro mayor diversidad de especies y abundancia, sin embargo Amazonas mostro mayor abundancia de individuos reservorio conocidos de Trypansoma sp. El 10, 68% (5/47) de los individuos fueron positivos a Trypanosoma sp.: Didelphis marsupialis (2/3), Mus musculus (1/7) y Phyllostomus elongatus (2/4). El quiróptero Phyllostomus elongatus se reporta como nueva especie de reservorio de Trypanosoma sp. para el Perú. Además, se lograron aislar las cepas Trypanosoma sp. obtenidas en los reservorios silvestres estudiados, que según las características morfológicas son compatibles con Trypanosoma cruzi. Por último, se obtuvieron nuevos protocolos anestésicos para los quirópteros y marsupiales capturados. / --- The study aimed to assess the potential wild reservoirs of Trypanosoma sp. in four localities of the departments of Amazonas and Loreto, capturing and analyzing marsupials, rodents and bats in search of this protozoan. In addition, diversity and presence of Trypanosoma sp. wild hosts in Amazonas and Loreto department, endemic and non-endemic area of Chagas disease respectively. The study was conducted in two population centers Ron y Tres Marias in the province of Utcubamba, Amazonas department and Cahuide and Manacamiri villages in the province of Maynas, Loreto department. Rodents and marsupials were captured using Tomahawk and Sherman traps, and bats used mist nets. Captured animals were anesthetized for xenodiagnosis technique. Biodiversity indices using the Past program were determined; for the percentage analysis and Fisher Exact Test was used STATA software. 95 individuals corresponding to 16 species, Loreto showed greater species diversity and abundance were captured, however Amazonas showed greater abundance of individuals known reservoir of Trypanosoma sp. The 10, 68% (5/47) of the individuals were positive for Trypanosoma sp.: Didelphis marsupialis (2/3), Mus musculus (1/7) and Phyllostomus elongatus (2/4). The chiropteran Phyllostomus elongatus reported as a new reservoir of Trypanosoma sp. for Peru. Furthermore, Trypanosoma sp. strains were isolated. obtained in the studied wild reservoirs, according to the morphological characteristics that are compatible with Trypanosoma cruzi. Finally, news anesthetic protocols for bats and marsupials captured were obtained.