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Selection of mutants defective for starch biosynthesis in marine single-cell cyanobacteria / Sélection de mutants défectieux dans la voie de biosynthèse de l'amidon chez une cyanobactérie unicellulaire marine

Nirmal Raj, Jenifer 16 April 2010 (has links)
L’amidon s’accumule en grains insolubles et semi-cristallins dans d’une part le cytoplasme des algues rouges et des glaucophytes et dans d’autre part les chloroplastes des algues et plantes vertes. Vu la distribution séléctive de l’amidon dans ces trois lignées issues de l’endosymbiose primaire du plaste, nous avons recherché lequel des deux partenaires de cette dernière est responsable de l’origine de cette structure. Nous avons, dans notre travail, contribué à l’identification de polysaccharides de ce type chez un sous groupe particulier de cyanobactéries et avons réalisé une caractérisation détaillée de l’amidon d’une souche de cyanobactérie marine apparentée à Crocosphaera watsonii et Cyanobacterium. Nous avons aussi pu montrer que chez ce sous groupe les grains pouvaient être dégradés par une combinaison d’acitivités phosphorolytiques et hydrolytiques qui leur est associée; définissant de cette manière une voie entièrement différente de celle qui caractérise les plantes et algues vertes. De plus nous avons démontré que le métabolisme de l’amidon répond dans notre souche à un contrôle par l’horloge circadienne. Enfin nous avons été capables d’engendrer et sélectionner des mutants défectueux pour la biosynthèse de l’amidon. Parmi ceux-ci nous rapportons les premiers mutants défectueux pour l’expression d’une amidon synthase chez les cyanobactéries. / Starch defines a semi-crystalline insoluble polysaccharide that aggregates into granules either in the cytosol or the chloroplast of respectively the glaucophytes, red algae and the true plants. Because of the selective distribution of starch within lineages that descend from primary endosymbiosis of the plastid, we investigated the origin of this particular organization. We thuscontributed to the finding of comparable structures in a particular subgroup of cyanobacteria, andmade a structural characterization of this cyanophycean starch from marine cyanobacteria related to Crocosphaera watsonii and Cyanobacterium. We were able to show that, in these cyanobacteria, the solid starch granules could be degraded invitro by a combination of starch bound glucan phosphorylase and endo-amylase; thereby defining a pathway entirely different from that characterizing the green plants and algae. In addition, we demonstrated that starch metabolism, in our particular strain, also responded to circadian clock control. Finally, we were able to generate and select mutants defective for starch biosynthesis. Among these we report the first mutants defective for cyanobacterial soluble starch synthaseactivity.
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Contribution à l’étude fonctionnelle des amidon-synthétases dans la feuille d’Arabidopsis thaliana : initiation et élongation du polysaccharide de réserve / Contribution to the functional study of starch synthases in the leave of Arabidopsis thaliana : initiation and elongation of the storage polysaccharide

Szydlowski, Nicolas 02 October 2009 (has links)
Cinq isoformes d’amidon-synthétase ont été identifiées dans le génome des plantes supérieures. L’une d’entre elles, la GBSS (pour « Granule Bound Starch Synthase ») est liée de manière non covalente au grain d’amidon. Trois autres isoformes, SS1, SS2 et SS3, sont présentes sous forme soluble dans le chloroplaste, où elles participent à l’allongement des glucanes de l’amylopectine. Récemment, il a été proposé qu’une autre isoforme, la SS4, soit impliquée dans le contrôle du nombre de grains d’amidon par chloroplaste et de leur taille. Nous rapportons dans ce travail, l’analyse phénotypique des combinaisons doubles mutantes impliquant les mutations aux loci SS1, SS2 et SS3. Nos résultats, notamment les analyses de distribution de longueur des glucanes de l’amylopectine, montrent que la SS2 et la SS3 sont partiellement redondantes pour l’allongement des glucanes de DP 12 à DP 28. Par ailleurs, l’étude de la structure de l’amylopectine après digestion par la ß-amylase, indique que la synthèse normale du « squelette » du polymère nécessite la présence d’au moins deux des trois isoformes. Nous présentons par ailleurs, un ensemble de données qui indiquent que la SS4 est impliquée dans l’initiation de la synthèse d’amidon, et qu’elle est nécessaire et suffisante pour la production d’un nombre correct de grains d’amidon dans le chloroplaste. La fonction de la SS4 dans l’initiation peut être en partie assumée par la SS3, et la présence de l’une des deux isoformes est suffisante pour initier la synthèse d’amidon dans les triples mutants ss1- ss2- ss3- ou ss1- ss2- ss4-. / Five isoforms of starch synthase (the elongation enzyme of the starch pathway) have been identified in land plants genomes. One of them, the GBSS (Granule Bound Starch Synthase) is noncovalently bound to the starch granule and is responsible for amylose synthesis. Three other isoforms, SS1, SS2 and SS3, are soluble within the chloroplast, where they elongate the amylopectin-forming glucans. Recently, it has been proposed that another isoform, SS4, is involved in the control of the size and the number of starch granules per chloroplast. We are now reporting, the phenotypic analysis of double mutant combinations including mutations at SS1, SS2 and SS3 loci. The analysis of amylopectin glucan length distribution shows that SS2 and SS3 isoforms are partially redundant for the elongation of DP12 to DP28 glucans. In addition, structural studies of amylopectin after ß-amylolysis, suggest that the normal synthesis of amylopectin internal molecular structure requires the presence of at least two of the three isoforms. We also provide in this work, further evidences indicating that SS4 is involved in the initiation of starch synthesis, and that this isoform is necessary and sufficient for the production of the regular number of starch granules per chloroplast. However, SS3 activity is partially redundant to that of SS4 in this regard, and the presence of one of these isoforms is sufficient to initiate starch biosynthesis in the triple mutant lines ss1- ss2- ss3- and ss1- ss2- ss4-.

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