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Análise da identidade taxonômica de Dendropsophus nanus e Dendropsophus walfordi ( Anura, Hylidae) com base em dados moleculares / Taxonomic identity analysis of Dendropsophus nanus e Dendropsophus walfordi (Anura, Hylidae) based on molecular data

Seger, Karin Regina, 1983- 27 August 2018 (has links)
Orientador: Luciana Bolsoni Lourenço / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-27T00:43:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Seger_KarinRegina_M.pdf: 1961069 bytes, checksum: ac950c9cf223e51f3374d9378d583572 (MD5) Previous issue date: 2014 / Resumo: O gênero Dendropsophus apresenta uma grande diversidade de espécies, compreendendo atualmente mais de 90 espécies de anuros hilídeos, e se caracteriza por apresentar como principal sinapomorfia o número cromossômico 2n=30. Muitas problemáticas taxonômicas ainda cercam esse grupo, como a referente a Dendropsophus nanus e Dendropsophus walfordi. Tais espécies já foram consideradas sinônimas com base em dados morfológicos, proposta que foi refutada após análise de canto. Recentes inferências filogenéticas têm apontado o possível parafiletismo dessas duas espécies de anuros, mas nenhuma delas teve a amostragem devidamente desenhada para avaliar cuidadosamente a questão taxonômica decorrente dessa observação. Mesmo o estudo filogenético que incluiu o maior número de representantes dessas espécies contou com apenas cerca de 700 pb de um único marcador genético (gene ribossomal mitocondrial 12S). Além disso, não incluiu nenhum exemplar da localidade-tipo de ambas as espécies e, embora a amostra dessa espécie tenha sido a maior utilizada até o momento em análises filogenéticas, ainda não foi suficiente para cobrir toda a grande área de ocorrência desses anuros. Com o intuito de solucionar tais problemas e contribuir para a análise da delimitação dessas espécies, foi investigado o possível parafiletismo entre as espécies D. nanus e D. walfordi, por meio da comparação de sequências dos genes mitocondriais 12S, 16S e CO1, e com a amostragem de indivíduos de 24 localidades abrangendo a maior parte da distribuição incluindo as localidades-tipo de cada uma das duas espécies. Foi observada alta estruturação genética do grupo de interesse pela análise de variância molecular (AMOVA) e cinco principais clados (A-E) foram identificados em todos os cladogramas inferidos. O parafiletismo de D. nanus com relação a D. walfordi foi observado em todas as análises filogenéticas. As distâncias genéticas entre os clados A-E foram altas e permitem sugerir que o grupo em questão represente na realidade um complexo com mais de duas espécies diferentes / Abstract: The Dendropsophus genus presents a great diversity of species, currently including more than 90 species of hylid frogs, and its main synapomorphy is the chromosome number 2n = 30. Many taxonomic problems still surround this group, as those referred to Dendropsophus nanus and Dendropsophus walfordi. Such species have been considered synonymous based on morphological data, but that proposal was rejected after call analysis. Recent phylogenetic inferences have pointed out the possible paraphyly of these species of frogs, but they were not designed to carefully evaluate the taxonomic question arising from this observation. Even the phylogenetic study that included a large number of representatives of these species did not sampled their type locality and was based on only ~ 700 bp of a single genetic marker (mitochondrial 12S ribosomal gene). In order to solve these problems and contribute to the analysis of these species delimitation, we investigated the possible paraphyly between D. nanus and D. walfordi by comparing the sequences of the mitochondrial genes 12S, 16S and CO1, and sampling specimens from 24 localities, including the type-locality of each of these species. High genetic structuration was observed inside this group by the analysis of molecular variance (AMOVA) and five major clades (A-E) were recognized in all inferred cladograms. The paraphyly of D. nanus with respect to D. walfordi was observed in all phylogenetic analyses. The genetic distances among the Clades A-E were high and allowed to suggest that in fact a complex with more than two different species exist in the analyzed group / Mestrado / Biodiversidade Animal / Mestra em Biologia Animal
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Análise de múltiplas ameaças à conservação e diversidade de anfíbios / Assessment of multiple threats to conservation and diversity of amphibians

Oliveira, Igor Soares de, 1980- 27 August 2018 (has links)
Orientador: Luís Felipe de Toledo Ramos Pereira / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-27T11:16:08Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Oliveira_IgorSoaresde_D.pdf: 4104401 bytes, checksum: 76046f01be0657270cbc44223cd762b9 (MD5) Previous issue date: 2015 / Resumo: As mudanças climáticas possuem potencial para alterar o funcionamento dos ecossistemas através da extinção de espécies e das conexões entre a biota e o ambiente, alterando os padrões aos quais estamos acostumados e exigindo adaptação. As alterações climáticas terão como uma de suas consequências a elevação oceânica, que pode redesenhar as costas de todos os continentes terrestres e afetar a biota associada. Nesse contexto, sobressaem-se os anfíbios como um grupo sensível que sofre diversas pressões e apresenta declínios populacionais, se destacando como vertebrados mais ameaçados da atualidade, com diversas espécies pouco conhecidas. Sendo assim, nesse trabalho analisamos múltiplos efeitos que dificultam a conservação dos anfíbios. Avaliamos os potenciais efeitos das mudanças climáticas e da elevação oceânica sobre os anfíbios com distribuição costeira. Também desenvolvemos um índice para classificar espécies com dados insuficientes com a finalidade de oferecer uma alternativa para a busca de informações para esses taxa e mudar sua classificação atual. Por fim, analisamos a disponibilidade histórica de clima adequado para uma linhagem endêmica do fungo quitrídio em busca de padrões que pudessem explicar sua distribuição e raridade atuais. Utilizamos ferramentas como modelos de distribuição de espécies e sistema de informação geográfica em busca de respostas às nossas questões. Nossos resultados corroboram as mudanças climáticas como um fenômeno com potencial devastador e alertam para potenciais perigos da elevação oceânica. Além disso, nosso índice para espécies deficientes em dados pode auxiliar a direcionar esforços em busca de novas informações. Por fim, nossas análises com relação ao fungo quitrídio corroboram a hipótese de endemismo para a linhagem Bd-Brazil e também evidenciam hábitat adequado passado para o Bd-GPL. Além disso, verificamos baixa sobreposição de nicho climático entre essas duas linhagens, indicando possibilidade de competição. Assim, esperamos que nossos resultados tenham contribuído para o conhecimento de múltiplas ameaças à conservação dos anfíbios e sirvam para direcionar futuros estudos / Abstract: Climate change has the potential to change ecosystem functioning through species extinction and disrupting connection between biota and environment, thus changing natural patterns and requiring adaptation. One certain consequence of climate change is the sea level rise, which is expected to redraw coastal shorelines worldwide and broadly affect coastal-associated biota. In this context, amphibians represent a sensitive group under several current pressures, exhibiting population decline, highlighted as the most current threaten vertebrates on Earth, and also, with several "data deficient" species. Thus, herein we analyzed multiple effects that hamper amphibian conservation. We evaluated potential climate change effects and sea level rise on amphibians with coastal distribution. Also, we developed an index to classify data deficient species in order to offer an alternative further research of such species to gather sufficient information to change their current status. Finally, we analyzed historical availability of suitable habitat for and endemic lineage of the chytrid fungus searching for patterns that explain its current distribution and rarity. We used tools as species distribution models and geographic information system to answer our questions. Our results corroborate climate change as a potentially devastating phenomena and we stress potential threatens derived from sea level rise. Moreover, the index we developed for data deficient species seems to work properly and may drive further effort in searching for further information for those species. Finally, our analyzes related to the chytrid fungus supported the hypothesis of endemism of Bd-Brazil, and also showed past environmental suitability for Bd-GPL. In addition, we verified low environmental niche overlap these two lineages, indicating possibility of competition. Thus, we expect our results may improve current knowledge about multiple threats to amphibian conservation, as well as, they may be used to guide further research / Doutorado / Ecologia / Doutor em Ecologia

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