Thesis (PH. D.)--University of Michigan, 1939. / Thesis note on label mounted on t.p. "Reprinted from Ecological monographs, 11 ... January, 1941." "Literature cited": p. 18-19.

Orientador: Denise de Cerqueira Rossa Feres / Banca: Cinthia Aguirre Brasileiro / Banca: Eliane Gonçalves de Freitas / Banca: Fausto Nomura / Banca: Vitor Hugo Mendonça do Prado / Resumo: A configuração da paisagem tem um papel fundamental na estrutura e organização de comunidades. A vegetação da região noroeste do Estado de São Paulo, caracterizada como Floresta Estacional Semidecidual e Savana, se restringe hoje a 4% de sua área original, tendo sido substituída por pastagens, culturas diversas ou áreas urbanas. Contudo, pouco se conhece sobre o efeito desses remanescentes florestais para a diversidade de anuros caracterizados como habitat-generalistas e dependentes de corpos d'água para reprodução. Desta maneira, nosso objetivo neste estudo foi verificar a importância da configuração da paisagem na diversidade de anuros de área aberta na região noroeste do Estado de São Paulo. Para isso, foram realizados dois estudos: i) um estudo experimental, com poças artificiais instaladas a diferentes distâncias dos fragmentos florestais e, ii) inventários em corpos d'água temporários para avaliar a importância de variáveis ambientais do habitat e da paisagem na distribuição da riqueza de espécies e da abundância populacional de anuros associados a paisagem aberta. No primeiro estudo, nós hipotetizamos que poças de reprodução próximas a fragmentos florestais teriam maior riqueza de espécies e maior abundância populacional de anuros que poças distantes dos fragmentos florestais, porque a proximidade diminuiria os riscos associados com desidratação e predação durante deslocamentos no período reprodutivo. No segundo estudo, nós hipotetizamos que corpos d'água temporários com longo hidroperíodo e alta porcentagem de vegetação localizados próximos a fragmentos florestais iriam abrigar uma maior riqueza de espécies e abundância de anuros porque proporcionariam maior número de microhabitats para sítios de vocalização e refúgio, e menor risco à predação para girinos e imagos recém-metamorfoseados... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Landscape arrangement plays a key role in community structure and composition. The northwestern São Paulo State's vegetation, characterized as Semideciduous Seasonal Forest and Savanna, is restricted to 4% of its original area, having been replaced by grazing, plantations or urban areas. Little is known about the importance of these forest remnants for the diversity of anurans found in this region where most anuran species are characterized as habitat-generalists and dependent on water bodies for reproducing. Thus, the present study's aim was to verify the importance of landscape configuration on the diversity of open-area anurans in northwestern São Paulo State. For this, two studies were performed: i) an experimental study, with artificial pools located at different distances from the forest fragments and, ii) surveys in temporary water bodies to assess the importance of environmental variables of habitat and landscape in the distribution of species richness and abundance of anuran associated with the open-areas. In the first study, we hypothesized that breeding areas near forest fragments would have greater species richness and greater abundance than breeding areas farther from forest fragments because proximity decreases risks associated with dehydration and predation during breeding migrations. While in the second, we hypothesise that temporary pools with long hydroperiod and high percentage of vegetation located near forest fragments will harbor a greater number of species and abundance of anurans because these habitats would have higher number of microhabitats for shelter and calling sites and would provide lower risk of predation for tadpoles and newly metamorphosed. Our results show that landscape configurations has an important influence on frog and toad distribution and abundance in tropical agro-agricultural landscapes and suggest guidelines for maintaining favorable... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Orientador: Denise de Cerqueira Rossa Feres / Banca: Ricardo Jannini Sawaya / Banca: Fausto Nomura / Banca: Lilian Casatti / Banca: Célio Fernando Baptista Haddad / Resumo: O presente estudo teve como objetivo verificar os fatores determinantes da estrutura de comunidades de anuros em corpos d'água e no interior de fragmentos florestais na região noroeste do estado de São Paulo. Foram amostrados 51 corpos d'água por busca em sitio de reprodução e o interior de oito fragmentos florestais por armadilhas de interceptação e queda. Primeiramente analisamos a influência de variáveis locais e da paisagem na riqueza e composição de espécies nos corpos d'água. A riqueza de espécies foi afetada por variáveis de escala local: cobertura vegetal e profundidade (relação positiva) e número de tipos de vegetação (relação negativa). Entretanto, as variáveis da paisagem influenciaram a riqueza de espécies em guildas: a distância até o corpo d'água mais próximo influenciou positivamente a riqueza de anuros escaladores e a vegetação ao redor do corpo d'água influenciou negativamente a riqueza de anuros associados a formações abertas. A composição da fauna de anuros nos corpos d'água pode ser explicada principalmente pelas variáveis ambientais (26,2%) e pela localização espacial dos corpos d'água (19,3%). A combinação entre variáveis ambientais e espaciais explica 7,3% da variação na composição da fauna. As variáveis ambientais que mais influenciaram a variação na composição de espécies foram a velocidade da água e a cobertura vegetal no interior do corpo d'água. A composição de espécies é influenciada por substituição de espécies entre corpos d'água lóticos e lênticos e perda de espécies, que pode ser causada pela redução da quantidade de vegetação no interior dos ambientes lênticos. Além disso, a distância entre os corpos d'água amostrados também foi importante na variação da composição de espécies, refletindo a distribuição geográfica das espécies. Esse resultado evidencia... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Our aim in this study was to establish the key factors structuring anuran communities along water bodies and forest fragments in the northwestern Sao Paulo state. We sampled 51 water bodies using search at breeding sites method, furthermore we used pitfall traps to survey the anuran fauna in eight forest fragments. First we analyzed how water bodies attributes influence species richness and composition at local and landscape scales. Species richness was influenced by local attributes: vegetation cover and water depth (positive relation) and number of vegetation types (negative relation). However, landscape attributes influenced the richness of guilds: distance to the near water body positively influenced the richness of climber anurans and vegetation around the water body influenced negatively the richness of anurans associated with open formations. The composition of the anuran fauna in the water bodies can be explained mainly by the environmental variables (26.2%) and the spatial position of water bodies (19.3%). The combination of spatial and environmental variables explains 7.3% of the variation in the faunal composition. The environmental variables that most influenced the variation in species composition were the water velocity and vegetation cover within the water body. The species composition is regulated by species turnover between lentic and lotic water bodies, and species loss caused by the reduction in the amount of vegetation within lentic environments. Moreover, the distance between the sampled water bodies was also important to explain the variation in species composition, reflecting the geographic distribution of species. This result demonstrates that the conservation of anuran species richness in the water bodies of the studied region, demand the conservation of many types of water bodies at several localities, rather than just protect a large patch of habitat... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

M.Sc. / Two species of multimammate mice occur in South Africa, namely Mastomys natalensis and M. coucha. These species, both reservoirs for different and equally important disease pathogens, are morphologically identical with variations described in chromosome number, sperm morphology, pheromones, ultrasound and allozyme and isozyme markers. Their identical macro morphologies also raise problems where habitat and distribution is concerned. The need to identify various disease threats based on the carrier organism makes their identification important because they occur sympatrically in many areas of South Africa. Both species were expected to occur within the Roan Camp, Kruger National Park, South Africa and therefore toe samples were obtained from D. MacFadyen who was able to capture the Mastomys genus during his biodiversity survey of the area. He was unable to assign species designations to the captured individuals based on external morphology, but identification would allow exploration into the habitat preferences of each species when compared to the vegetation data gathered by MacFadyen using cross tabulation methods. DNA was extracted from 90 toe samples obtained during August 2003 (30 samples) and 2004 (60 samples) and the cytochrome-b region was amplified using the polymerase chain reaction (PCR). Amplified PCR products were cut using the restriction enzyme BsmAI to produce restriction fragment length polymorphism (RFLP) profiles from which the two species were identified. Once identified, the species were associated to vegetation data received from MacFadyen and samples were selected for further analysis using 5 microsatellite loci. Mastomys natalensis was found in very low numbers, as expected, based on the average rainfall and altitude of the sample area, which is preferred by M. coucha. Further insight was gained into the preferences of each species concerning habitat and their respective status as pioneer species in habitat recolonisation. Genetic differences were obtained within the two species with 100% and 80% polymorphic loci for M. coucha and M. natalensis respectively. Allele classes at most of the loci deviated from Hardy-Weinberg equilibrium, probably due to small sample sizes, null alleles and/or heterozygote deficiencies with average heterozygosities of 0.754 for M. coucha and 0.526 for M. natalensis. The genetic distance between the two species was 0.465 and an Rst value of 0.503 indicated a significant differentiation between the two species. Fixed allele differences between the species were not obtained, but private alleles were found at four loci in M. coucha and one locus in M. natalensis. This study therefore contributes to the global information on species identification, genetic variation and ecology of the two cryptic Mastomys species; the three pillars on which the Convention of Biological Diversity (of which South Africa is a signatory) rests upon.

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Orientador: Christopher Gordon Murphy / Coorientador: Denise de Cerqueira Rossa-Feres / Banca: Rogério Pereira Bastos / Banca: Itamar Alves Martins / Resumo: O deslocamento de caracteres pode ser muito importante na divergência das espécies, e para anuros, tem sido documentado para aspectos reprodutivos, mas raramente para outros aspectos relevantes. Dendropsophus nanus e D. sanborni são espécies intimamente relacionadas e similares em morfologia e ecologia, e ambas podem ocorrer e se reproduzir nos mesmos hábitats. Nós testamos a hipótese de que o canto de anúncio e o sítio de vocalização de D. nanus sofreram deslocamento de caracteres em resposta a presença de D. sanborni por meio da comparação de seis parâmetros acústicos, altura do empoleiramento e substrato usado entre D. nanus, encontrada em três corpos d'água em áreas de alopatria, e D. nanus encontrada em três corpos d'água em área de sintopia com D. sanborni. Nós observamos diferenças estatisticamente significativas no tipo de poleiro usado, mas não para a altura do empoleiramento entre as duas áreas. Entre os parâmetros acústicos, os pulsos produzidos por D. nanus foram significativamente mais curtos em sintopia do que em alopatria, um resultado consistente com o deslocamento da duração dos pulsos de D. nanus em sintopia contraposto com os pulsos de longa de D. sanborni. Entretanto, é possível que as diferenças observadas no canto e sítio de vocalização entre sintopia e alopatria sejam também relacioandas a fatores diferentes ao deslocamento de caracteres, como diferenças entre sintopia e alopatria no meio ambiente, fatores sociais e históricos / Abstract: Character displacement can be important in the divergence of species, and for anurans, has been documented for acoustic parameters but seldom for other relevant aspects. Dendropsophus nanus and D. sanborni are closely related species similar in their morphology and ecology, and both can occur and reproduce in the same habitat. We tested the hypothesis that the advertisement calls and sites of vocalization of D. nanus have undergone character displacement in response to the presence of D. sanborni by comparing six call parameters and perch type and height between D. nanus found in three bodies of water in an area of allopatry and D. nanus found in three bodies of water in an area of syntopy with D. sanborni. We observed statistically significant differences in the type of perch used, but not perch height between the two areas. Among acoustic parameters, pulses produced by D. nanus were significantly shorter in syntopy than in allopatry, a result consistent with displacement of pulse duration in D. nanus in sintopia away from the longer pulse duration of D. sanborni. However, is possible that the differences observed in calls and vocalization site between syntopy and allopatry were also related to factors other than characters displacement, such differences between syntopy and allopatry in environmental, social and historical factors / Mestre

Orientador: Itamar Alves Martins / Banca: Mariana Lúcio Lyra / Banca: Maria Cecília Barbosa de Toledo / Resumo: Os objetivos deste estudo foram descrever os caracteres morfométricos, morfológicos e bioacústicos de Scinax hayii da localidade tipo e de três Unidades taxonômicas operacionais (UTO) e comparar as localidades entre si registrando variações encontradas nos caracteres analisados. Foram mensurados 18 caracteres morfométricos em exemplares coletados em campo e exemplares de coleções científicas. A análise morfológica consistiu na comparação qualitativa de caracteres e verificação de presença de faixas e manchas em aspecto dorsal. A análise bioacústica foi realizada através de vocalizações obtidas de exemplares gravados em condições naturais de campo em todas as UTOs. Scinax hayii de Petrópolis apresenta caracteres morfométricos semelhantes a espécimes da UTO Serra do Mar. Os exemplares das UTOs Planície Litorânea e Serra da Mantiqueira apresentam menor tamanho corporal (CRC: 34,2 - 41,5 mm; 31,5 - 42,2 mm; respectivamente). Scinax hayii de Petrópolis, Serra do Mar e Planície Litorânea são desprovidos de faixas ou manchas em padrão dorsal. Exemplares da UTO Serra da Mantiqueira diferem das demais localidades por apresentar coloração dorsal possuindo faixas e manchas. As vocalizações de S. hayii de Petrópolis mostram-se semelhantes aos cantos de exemplares da UTO Serra do Mar. As vocalizações dos espécimes registrados nas UTOs Planície Litorânea e Serra da Mantiqueira diferem das demais localidades e entre si. Indivíduos de Petrópolis e UTO Serra do Mar por possuir caracteres morfológicos e bioacústicos semelhantes indicam ser a mesma espécie. Os exemplares registrados na UTO Planície litorânea possuem caracteres morfológicos e bioacústicos diferente das demais localidades, indicando ser uma nova espécie. Exemplares da UTO Serra da Mantiqueira por possuírem caracteres morfológicos e bioacústicos diferindo das demais localidades indicam ser uma nova... / Abstract: This study aims were to describe the morphometric, morphological and bioacoustic of Scinax hayii characters from the type locality and from three Operational Taxonomic Units to compare the localities with each other and registering founds variations at the characters analyzed. Were measured 18 morphometric characters in collected specimens on field and specimens provided of scientific collections. Morphological analysis was performed by the characters qualitative comparison and checking for the stripes and spots presence on the dorsal aspect. The bioacoustics analysis was performed with obtained recordings of recorded specimens in natural field conditions at all OTUs. Scinax hayii from Petrópolis has similar morphometric characters to OTU Serra do Mar. Specimens of OTU Planície Litorânea and Serra da Mantiqueira have smaller size (CRC: 34,2 - 41,5 mm; 31,5 - 42,2 mm; respectively). Scinax hayii from Petrópolis, Serra do Mar and Planície Litorânea are devoided stripes and spots on dorsal pattern. OTU Serra da Mantiqueira specimens differ from other locations by present dorsal coloration having stripes and spots. The S. hayii from Petrópolis vocalizations are shown like the OTU Serra do Mar call specimens. The recorded specimens vocalizations at OTUs Planície Litorânea and Serra da Mantiqueira differ from another locations and each other. Petrópolis and OTU Serra do Mar specimens by having similar morphological and bioacoustics characters indicate to be of the same species. The registered specimens at UTO Planície Litorânea have different morphological and bioacoustics characters from another locations, indicating that is a new specie. The UTO Serra da Mantiqueira specimens by having different morphological and bioacoustics characters from other locations indicate to be a new specie or the currently revalued specie as S. dolloi. In view of the morphological and bioacoustics analysis... / Mestre

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Orientador: Cláudio José Von Zuben / Coorientador: Fernando José Von Zuben / Banca: Maria José de Oliveira Campos / Banca: Wesley Augusto Conde Godoy / Resumo: Em 2009 Uehara Prado et al., coletaram uma grande quantidade de dados para avaliar o papel das borboletas da família Nymphalidae como bioindicadoras, porém esses dados não foram utilizados em sua totalidade. O presente estudo está direcionado à experimentação e modelagem de interações ecológicas, a partir dos dados obtidos por Uehara-Prado et al. (2009), juntamente com aqueles não previamente utilizados que, no intuito de extrair o máximo de informação de relevância biológica e ecológica. Para tanto, foram utilizados três diferentes tipos de abordagens: (1) Biclusterização (Cheng & Church, 2000; Madeira & Oliveira, 2004); (2) Árvores de decisão (Quinlan, 1986; Bell, 1999; De'ath & Fabricius, 2000; Olden et al., 2008) e (3) Redes Bayesianas (Korb & Nicholson, 2003; McCann et al., 2006; Chen & Pollino, 2012; Pearl, 2014). Os resultados se mostraram bastante promissores, e as três ferramentas atingiram as expectativas; em biclusterização, conseguimos identificar todos os padrões de correlação dentro dos cenários apresentados, árvores de decisão se mostraram extremamente eficazes na classificação das variáveis apresentadas e as Redes Bayesianas conseguiram identificar quais variáveis influenciavam ou eram influenciadas pelas outras. Com este trabalho esperamos incentivar outros pesquisadores à revisitarem antigas bases de dados com ferramentas computacionais mais modernas, pois seu potencial é extraordinário / Abstract:Elucidating the complex interactions networks in ecological systems is not an easy task (Proulx et al., 2005) and, in order to extract information in an efficient way, powerful computational tools and the right approach, to the types of scenario to be studied, are required. In 2009 UeharaPrado et al., collected a great amount of data to assess the role of the Nymphalidae family of butterflies as bio-indicators, but these data were not used in its entirety. This study is aimed at experimentation and modeling of the ecological interactions from the data obtained by UeharaPrado et al. (2009), along with those not previously used, in order to extract the maximum information of biological and ecological significance. Therefore, three different approaches were used: (1) Biclusterization (Cheng & Church, 2000; Wood& Olive, 2004); (2) Decision Trees (Quinlan, 1986; Bell, 1999; De'ath & Fabricius., 2000; Olden et al, 2008) and (3) Bayesian Networks (Korb & Nicholson, 2003; McCann et al., 2006; Chen & Pollino, 2012; Pearl, 2014). The results were very promising, and the three tools reached our expectations; with Biclusterization we managed to identify all the correlation patterns inside the scenarios presented, Decision Trees proved to be extremely effective in the classification of the variables and the Bayesian Networks were able to identify what variables influenced or were influenced by the others. With this work, we hope to encourage other researchers to revisit old databases with more modern computational tools, because its potential is extraordinary / Mestre

Orientador: Otavio Augusto Vuolo Marques / Banca: Márcio Roberto de Costa Martins / Banca: Laura Rodrigues Vieira de Alencar / Banca: Bianca Von Muller Berneck / Banca: Wagner André Pedro / Resumo: A tribo Tachymenini possui grande diversidade morfológica, no uso do habitat e em seus hábitos alimentares. Por esse motivo o grupo demonstra ser um objeto de estudo de grande importância para a ecologia comparativa. Este estudo avalia os atributos ecológicos de vários táxons associada à filogenia reconstruir a história evolutiva do grupo, identificando caracteres ancestrais. Foram coletados dados morfológicos, merísticos, alimentares e reprodutivos das 13 espécies (Calamodontophis paucidens; Gomesophis brasiliensis; Pseudotomodon trigonatus; Ptychophis flavovirgatus; Tachymenis peruviana; Thamnodynastes hypoconia; T. lanei; T. nattereri; T. pallidus; T. rutilus; T. strigatus e Tomodon dorsatus). Para tanto foram obtidos dados da literatura e de coleções herpetológicas brasileiras e do exterior. Por meio da otimização de caracteres foi possível reconhecer a evolução de padrões morfológicos, merísticos, bem como definir a dieta da maioria das espécies estudadas / Abstract: The Tachymenini tribe has great diversity on the morphology, habitat use and feeding habits. For this reason, the group proves to be a very important object of study for comparative ecology. This study evaluates the ecological attributes of various taxa and associate then to phylogeny to the reconstruct of the evolutionary history, identifying ancestral characters of the tribe. Morphological, meristic, feeding and reproductive data were colected for 13 species (Calamodontophis paucidens; Gomesophis brasiliensis; Pseudotomodon trigonatus; Ptychophis flavovirgatus; Tachymenis peruviana; Thamnodynastes hypoconia; T. lanei, T. nattereri, T. pallidus, T. rutilus, T. strigatus and Tomodon dorsatus). Therefore, we obtained data from the literature and many herpetological collections from South America. Through the character optimization was possible to recognize the evolution of morphological and meristic patterns, also define the diet of most species studied / Doutor