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Importance relative des principaux facteurs influençant la dynamique des populations d'ongulés alpins

Turgeon, Roxanne 30 November 2022 (has links)
L'augmentation de la densité d'une population amplifie la compétition pour les ressources, ce qui amène généralement des processus dépendants de la densité qui influencent la dynamique d'une population. Bien que les effets dépendants de la densité soient documentés chez plusieurs grands herbivores, l'importance relative des effets dépendants et indépendants de la densité est peu connue dans les populations d'ongulés relativement isolées, comme les espèces alpines qui vivent généralement en petits groupes. J'ai évalué l'influence relative de la densité, des conditions environnementales et des épisodes de pneumonie et de spécialisation d'un prédateur sur le taux d'accroissement des populations, le taux de reproduction, la proportion de femelles primipares, ainsi que la survie des femelles adultes et des jeunes de l'année de trois populations d'ongulés alpins. Les suivis à long-terme se sont déroulés sur deux populations de mouflons d'Amérique (Ovis canadensis) et une population de chèvres de montagne (Oreamnos americanus) où les individus étaient marqués annuellement depuis 30 à 47 ans. Les facteurs indépendants de la densité avaient la plus forte influence sur le taux d'accroissement des populations, en particulier les épisodes de pneumonie et de spécialisation du cougar (Puma concolor) qui diminuaient le taux d'accroissement de 22,2% et 16,6%, respectivement. Alors que la pneumonie a diminué les taux de survie et que la prédation a influencé négativement tous les paramètres démographiques étudiés, les effets dépendants de la densité ont eu un impact négatif seulement sur la survie juvénile. Mes analyses démontrent que les populations d'ongulés relativement isolées, contrairement aux autres populations, sont plus sensibles aux événements stochastiques qu'aux effets dépendants de la densité. Comme plusieurs de ces populations se retrouvent de plus en plus fragmentées, ces résultats soulignent l'importance de considérer les événements stochastiques qui peuvent jouer un rôle important sur le risque d'extinction de ces populations. / Increases in population density can amplify competition for resources, which generally leads to density-dependent processes regulating population dynamics. Density dependence is documented in multiple large herbivores, but the relative influence of density-dependent and independent effects has been questioned in isolated ungulate populations, such as in mountain species that are generally found in small groups. I evaluated the relative influence of population density, environmental conditions, pneumonia outbreaks, and occurrence of specialist predators on population growth rate, female reproductive rate, proportion of primiparous females, and survival of adult females and young of the year in three mountain ungulate populations. Long-term monitoring was conducted on two bighorn sheep (Ovis canadensis) populations and one mountain goat (Oreamnos americanus) population, following marked animals annually for 30 to 47 years in each population. Long-term studies are useful for understanding large herbivore dynamics, but they are rarely replicated. My study is therefore a major asset for disentangling the relative influence of density-dependent and independent effects on the dynamics of isolated populations. Globally, density-independent factors had the greatest influence on population growth rate, with stochastic pneumonia and cougar (Puma concolor) predation episodes decreasing population growth rate by 22.2% and 16.6%, respectively. While pneumonia outbreaks reduced adult female and juvenile survival rates and predation episodes decreased all demographic rates, population density only decreased juvenile survival. A four-fold increase in density decreased juvenile summer survival by 8.3% and winter survival by 15.0%. My analysis of three mountain ungulate populations reveals how isolated populations, in contrast with well-connected and larger populations, are more sensitive to stochastic events than to density dependence. As many populations of mountain ungulates are declining worldwide and are increasingly isolated, these results highlight the necessity of considering stochastic events because they can greatly increase the risk of extinction of these populations.
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La périodicité des populations d'oiseaux au Québec : patrons et causes possibles

Lacroix-Dubois, Noémie 21 February 2022 (has links)
Le dernier rapport sur l'État des oiseaux du Canada (2019), publié par un consortium d'organismes gouvernementaux et d'OBNL, souligne le déclin de plusieurs espèces et la hausse de plusieurs autres, depuis 50 ans. Plusieurs facteurs sont invoqués pour expliquer ces tendances, mais leur importance demeure nébuleuse, faute de données expérimentales. À défaut de données expérimentales, une connaissance détaillée des tendances demeure pertinente à l'avancement de notre compréhension des causes de ces tendances. Un des aspects les moins connus des tendances des oiseaux est leur périodicité. J'ai évalué la périodicité des tendances des 250 espèces d'oiseaux les plus souvent observées dans la province de Québec, lors des 50 dernières années (1970-2019). La métrique utilisée était la proportion annuelle des carrés de 10 km x 10 km échantillonnés où l'espèce était observée. Les données provenaient des programmes de science participative ÉPOQ et eBird. J'ai utilisé des tests de randomisation et des régressions harmoniques pour évaluer des cycles allant de 2 à 13 ans. L'objectif secondaire de l'étude était d'explorer les causes possibles de la périodicité. Pour ce faire, j'ai évalué l'association entre les patrons d'abondance annuelle et l'Oscillation Nord-Atlantique, les années semencières du sapin baumier ainsi que l'abondance des micromammifères. Parmi les 250 espèces étudiées, 149 montraient au moins un cycle significatif entre 2 et 13 ans. Le cycle de 13 ans était le plus fréquent (87 espèces). Les cycles de 138 espèces étaient corrélés avec l'Oscillation Nord Atlantique, ceux de 36 espèces avec les années semencières et ceux de 84 espèces avec l'abondance des micromammifères. De nature exploratoire, cette étude pose les premiers jalons de notre compréhension de la périodicité chez les populations d'oiseaux dans la province de Québec. Cette étude permet d'énoncer des hypothèses plus précises, certaines desquelles sont discutées en conclusion de ce mémoire / The latest State of Canada's Birds report (2019), published by a consortium of government agencies and non-profit organizations, highlights the decline of several species and the increase of several others over the past 50 years. Several factors may explain these trends, but their importance remains unclear due to the lack of experimental data. In the absence of experimental data, detailed knowledge of trends remains relevant to advancing our understanding of the causes of these trends. One of the lesser-known aspects of bird trends is their periodicity. I evaluated the periodicity of the trends of the 250 species of birds most often observed in the province of Quebec, in the last 50 years (1970-2019). The metric used was the annual proportion of the sampled 10 km x 10 km squares where the species was observed. The data came from birdwatching programs ÉPOQ and eBird. I used harmonic regressions to evaluate cycles ranging from 2 to 13 years. A secondary objective of the study was to explore the possible causes of the periodicity. To do this, I evaluated the association between annual abundance patterns and the North Atlantic Oscillation, balsam fir masting years as well as the abundance of micro mammals. Among the 250 species studied, 149 showed at least one significant cycle between 2 and 13 years. The 13-year cycle was the most frequent (87 species). The cycles of 138 species were correlated with the North Atlantic Oscillation, those from 36 species with masting years, and those from 84 species with small mammal abundance. This exploratory study lays the groundwork for our understanding of periodicity in bird populations in the province of Quebec. This study makes it possible to formulate more precise hypotheses, some of which are discussed at the conclusion of this thesis.
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Estimation de la taille de la population dans les expériences de capture-recapture

Yauck, Mamadou 03 May 2019 (has links)
La thèse présentée ici traite du problème de l'estimation de la taille de la population dans les modèles de capture-recapture. Elle s'intéresse, en particulier, à la question de l'estimation de la taille de la population dans le cadre d'une expérience de capture-recapture à structure d'échantillonnage imbriquée, qui combine les méthodes de population fermée à l'intérieur des périodes primaires (PP) et de population ouverte d'une PP à une autre : le design robuste. Cette thèse propose une méthodologie d'estimation de la taille de la population et de l'incertitude associée aux estimateurs obtenus dans le contexte du design robuste. Dans un premier temps, on aborde le problème de l'estimation des paramètres du design robuste dans le cas d'un nombre suffisamment élevé d'occasions de capture. On généralise le papier fondamental de Jolly (1965) au design robuste en proposant une procédure séquentielle d'estimation des paramètres pour la classe des modèles de design robuste présentés dans Rivest and Daigle (2004) et un estimateur de la variance des paramètres par bootstrap paramétrique. Ces résultats théoriques ont été appliqués à des données d'activation d'applications sur les téléphones intelligents. Les données sont recueillies sur une période d'un an et demi et concernent des utilisateurs de téléphones intelligents qui ont visité un grand concessionnaire automobile basé aux États-Unis. Dans un deuxième temps, on s'intéresse à l'estimation de la taille de la population à partir de deux sources d'information du design robuste: les données à l'intérieur d'une PP (ou intra-période) et les données d'une PP à une autre (ou inter-période). On démontre que les estimateurs de la taille de la population obtenus avec les informations intra-période et inter-période sont asymptotiquement indépendants pour une large classe de modèles de population fermée à l'intérieur des PP. Ainsi, l'estimateur du maximum de vraisemblance pour la taille de la population dans le cas du design robuste est asymptotiquement équivalent à un estimateur pondéré pour le modèle de population ouverte et le modèle de population fermée. On montre que l'estimateur pondéré diffère de celui donné dans Kendall et al. (1995); on démontre que leur estimateur n'est pas efficace, puis on donne une formule explicite pour son efficacité comparativement à l'estimateur pondéré. La perte d'efficacité est ensuite évaluée dans une étude de simulation, puis à travers un exemple tiré de Santostasi et al. (2016) et qui traite de l'estimation de la taille de la population d'une espèce de dauphins vivant dans le Golfe de Corinthe (Grèce). Enfin, on se propose d'étendre les résultats du problème précédent aux modèles de design robuste présentés dans Kendall et al. (1995) et implémentés dans MARK (White and Burnham, 1999). Dans le contexte du design robuste, on dérive l'estimateur du maximum de vraisemblance pour la taille de la population; on propose également trois méthodes d'estimation de la variance de l'erreur associée à l'estimateur. On démontre ensuite que l'estimateur du maximum de vraisemblance pour la taille de la population est plus efficace que l'estimateur des moments proposé par Kendall et al. (1995); la perte d'efficacité de l'estimateur de Kendall ainsi que la performance des trois méthodes d'estimation de la variance de l'erreur associée à l'estimateur du maximum de vraisemblance sont évaluées via une étude de simulation. / This thesis deals with the capture-recapture estimation of population sizes under a hierarchical study design where a capture-recapture experiment, involving secondary capture occasions, is carried out within each sampling period (SP) of an open population model: the robust design. This thesis proposes a methodology for the estimation of population sizes under the robust design and the uncertainty associated with the estimators. The first problem deals with the estimation of the parameters of a robust design with an arbitrary large number of capture occasions. To do so, we generalize the seminal paper of Jolly (1965) to the robust design and propose a sequential estimation procedure for the class of robust design models presented in Rivest and Daigle (2004). A simple parametric bootstrap variance estimator for the model parameters is also proposed. These results are used to analyze a data set about the mobile devices that visited the auto-dealerships of a major auto brand in a US metropolitan area over a period of one year and a half. The second problem deals with the estimation of population sizes using two sources of information for the robust design: the within and the between primary period data. We prove that the population size estimators derived from the two sources are asymptotically independent for a large class of closed population models. In this context, the robust design maximum likelihood estimator of population size is shown to be asymptotically equivalent to a weighted sum of the estimators for the open population Jolly-Seber model (Jolly 1965; Seber 1965) and for the closed population model. This article shows that the weighted estimator is more efficient than the moment estimator of Kendall et al.(1995). A closed form expression for the efficiency associated with this estimator is given and the loss of precision is evaluated in a MonteCarlo study and in a numerical example about the estimation of the size of dolphin populations living in the Gulf of Corinth (Greece) and discussed by Santostasi et al. (2016). The third problem deals with the estimation of population sizes under the robust design models presented in Kendall et al. (1995) and implemented in MARK (White and Burnham, 1999). We derive the maximum likelihood estimator for the population size and propose three methods of estimation for its uncertainty. We prove that the derived maximum likelihood estimator is more efficient than the moment estimator provided in Kendall et al. (1995). The loss of precision associated with the Kendall estimator and the performance of the three methods of estimation for the variance of the maximum likelihood estimator are evaluated in a MonteCarlo study.
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Integrated Population Models and Habitat Metrics for Wildlife Management

Nowak, James 23 April 2018 (has links)
La gestion des espèces est entièrement dépendante de notre capacité à évaluer les décisions de gestion et de les corriger si nécessaire. Dans un monde idéal les gestionnaires auraient une connaissance extensive et mécanistique des systèmes qu’ils gèrent et ces connaissances seraient mises à jour de façon continue. Dans la réalité, les gestionnaires doivent gérer les populations et développer des objectifs de populations en dépit de leur connaissance imparfaites et des manques de données chronique. L’émergence de nouveaux outils statistiques ouvrent toutefois la porte à de nouvelles possibilités ce qui permet une gestion plus proactive de la faune. Dans le Chapitre 1, j’ai évalué l’efficacité de modèles intégrés de populations (MIP) à combler des lacunes dans notre connaissance en présence de données limitées et de modèles de populations mal spécifiés. J’ai démontré que les MIP peuvent maintenir une précision élevée et présenter un biais faible, et ce dans une large gamme de conditions. Dans le chapitre 2, j’ai développé une approche de MIP qui inclut des effets aléatoires entre les différentes populations. J’ai constaté que les effets aléatoires permettent améliorer considérablement les performances des algorithmes d'optimisation, produisent des estimations raisonnables et permettent même d'estimer les paramètres pour les populations avec des données très limitées. J’ai par la suite appliqué le modèle à 51 unités de gestion du Wapiti en Idaho, USA afin de démonter son application. La viabilité des populations à long terme est généralement réalisé à grâce à des manipulations d’habitat qui sont identifiées grâces à des méthodes de sélection des ressources. Les méthodes basées sur la sélection des ressources assume cependant que l’utilisation disproportionnée d’une partie du paysage reflète la volonté d’un individu de remplir une partie de son cycle biologique. Toutefois, dans le troisième chapitre j’ai démontré que des simples mesures d’habitat sont à mieux de décrire la variation dans la survie des Wapitis. Selon, mes résultats, la variation individuelle dans la sélection des habitats était le modèle qui expliquait le mieux la corrélation entre les habitats et le succès reproducteur et que les coefficients de sélection des ressources n’étaient pas corrélés à la survie. / Successful management of harvested species critically depends on an ability to predict the consequences of corrective actions. Ideally, managers would have comprehensive, quantitative and continuous knowledge of a managed system upon which to base decisions. In reality, wildlife managers rarely have comprehensive system knowledge. Despite imperfect knowledge and data deficiencies, a desire exists to manipulate populations and achieve objectives. To this end, manipulation of harvest regimes and the habitat upon which species rely have become staples of wildlife management. Contemporary statistical tools have potential to enhance both the estimation of population size and vital rates while making possible more proactive management. In chapter 1 we evaluate the efficacy of integrated population models (IPM) to fill knowledge voids under conditions of limited data and model misspecification. We show that IPMs maintain high accuracy and low bias over a wide range of realistic conditions. In recognition of the fact that many monitoring programs have focal data collection areas we then fit a novel form of the IPM that employs random effects to effectively share information through space and time. We find that random effects dramatically improve performance of optimization algorithms, produce reasonable estimates and make it possible to estimate parameters for populations with very limited data. We applied these random effect models to 51 elk management units in Idaho, USA to demonstrate the abilities of the models and information gains. Many of the estimates are the first of their kind. Short-term forecasting is the focus of population models, but managers assess viability on longer time horizons through habitat. Modern approaches to understanding large ungulate habitat requirements largely depend on resource selection. An implicit assumption of the resource selection approach is that disproportionate use of the landscape directly reflects an individual’s desire to meet life history goals. However, we show that simple metrics of habitat encountered better describe variations in elk survival. Comparing population level variation through time to individual variation we found that individual variation in habitat used was the most supported model relating habitat to a fitness component. Further, resource selection coefficients did not correlate with survival.
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Dynamique spatio-temporelle des populations de canards barboteurs et de leur habitat

Roy, Christian 23 April 2018 (has links)
Le principal objectif de ma thèse était de quantifier la variation spatiale des populations de canards barboteurs et de leur principal habitat de reproduction, et d'évaluer l'importance de cette variabilité. J’ai d’abord réalisé une étude de cas sur le Canard colvert (Anas platyrhynchos) qui visait à évaluer l’impact de l’utilisation de priors informatifs sur un modèle de population de Gompertz spatialement explicite. Pour ce faire j’ai comparé les résultats d'un modèle naïf et d'un modèle où j’ai restreint les taux de croissance intrinsèques (r) des populations à des valeurs biologiquement réalistes. Le modèle naïf présente des taux de croissances intrinsèques irréalistes et des temps de retour à équilibre beaucoup plus court que ceux présentés dans le modèle informé. Par la suite, j’ai évalué les variations spatiales des facteurs climatiques qui influencent l’abondance des fondrières dans les Prairies. Les précipitations à l’automne et au printemps sont les facteurs les plus importants dans l’ouest tandis que les précipitations durant l’hiver et l’été sont les facteurs les plus importants dans l’est. J’ai par la suite développé une extension multivariée du modèle de population pour évaluer la synchronie dans les populations de quatre espèces de canards barboteurs de l’ouest du continent: le Canard colvert; le Canard pilet (Anas acuta); le Canard d'Amérique (Anas americana); et la Sarcelle d'hiver (Anas crecca). Les populations de Canards pilets et de colverts dans les prairies sont négativement corrélées avec les populations dans le nord de la forêt boréale et de l'Alaska ce qui renforce la thèse selon laquelle une partie de ces populations « survolerait » les prairies pendant les années de sécheresse. Finalement, j’ai évalué la variabilité spatiale et temporelle du taux de récolte de Canard noir (Anas rubripes) sur leur habitat de reproduction canadien à l’aide de données de baguage. La probabilité de récupération des bagues est corrélée avec l’effort de chasse pour les juvéniles, mais je n’ai pas détecté d’impact de l’instauration de la réglementation de récolte plus stricte au début des années 1980. Les taux de récolte le long du fleuve Saint-Laurent et dans les provinces de l'Atlantique demeurent particulièrement élevés et devraient être étroitement surveillés pour éviter la surexploitation. / The main objective of my thesis was to quantify the spatial variation in duck populations in North America and their main breeding habitat and assess the importance of this variability. I first present a study case on the Mallard (Anas platyrhynchos) that aim at assessing at how using informative priors on population parameters effects the conclusions drawn from a spatially explicit Gompertz population model. I compared the results from a naïve model and from a model where I constrained the intrinsic growth rate (r) to biologically realistic values. The naïve model lead to the estimation of unrealistic growth rate and shorter return time to equlibirum than those estimated by the informed model. The effects of the extrinsic factors were however comparable across both model. I subsequently used a spatially-varying coefficients model to assess the spatial variation in the ecological drivers of wetlands abundance in the Prairies pothole region (PPR). Overall, fall and spring precipitation were the most important climatic drivers in ponds abundance in the west while winter and summer precipitation and the most important driver in the east. Based on my previous results, I developed a multivariate extension of the Gompertz population model to assess the synchrony and the spatial variation in populations dynamics of four species of dabbling duck: the Mallard; Northern Pintail (Anas acuta); American Wigeon (Anas americana); and Green-winged Teal (Anas crecca). Northern Pintails and to a lesser extent Mallards showed a pattern of negative correlations among populations in the PPR and populations in the Western boreal forest of northern Canada and Alaska supporting the contention that some individual will “overfly” the PPR during drought years. Finally, I assessed the spatial and temporal variability in harvest rate of American Black Duck (Anas rubripes) on their Canadian breeding ground with direct recoveries from banding data. Juveniles recovery probabilities were correlated with the hunter effort but did not decreased after the implementation of new, stricter, harvest regulations in the early 1980’s. Harvest rate along the Saint Lawrence River system and in the Atlantic Provinces remain particularly high and should be closely monitored to avoid overexploitation.
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Stratégies biodémographiques du cerf de Virginie en réponse aux variations de la densité de population et des facteurs environnementaux

Ayotte, Pascale 24 April 2018 (has links)
Tableau d'honneur de la Faculté des études supérieures et postdoctorales, 2017-2018 / Les fluctuations de la densité de population et la stochasticité environnementale induisent des variations dans l’acquisition des ressources et les dépenses énergétiques des ongulés. Ces variations modulent, via différents mécanismes, leurs stratégies biodémographiques. L’objectif de cette étude était d’évaluer l’influence de la densité de population et des facteurs environnementaux sur l’allocation des ressources aux différents paramètres individuels de la condition corporelle et de l’effort de reproduction chez les femelles du cerf de Virginie, ainsi que de mieux comprendre les conséquences post-reproductives sur la condition corporelle. Nous avons utilisé les données d’un suivi à long terme des traits biodémographiques de cerfs abattus à la chasse sportive à l’île d’Anticosti (Québec, Canada), en mettant l’emphase sur les données recueillies sur les femelles adultes (>2 ans). Nos résultats démontrent que la variabilité des traits biodémographiques est liée aux effets simples de la densité de population et de la productivité végétale. Une densité de population élevée réduisait les gains automnaux sous forme de réserves corporelles, ce qui diminuait la probabilité de concevoir des jumeaux ou des triplets. Une densité de population élevée à la naissance influençait positivement la masse corporelle des femelles à l’automne, et conséquemment la taille de la portée. La vitesse de débourrement de la végétation au printemps affectait positivement l’accumulation des réserves de gras. Notre étude a aussi permis de détecter des effets synergiques entre la densité de population et des facteurs environnementaux sur différents paramètres de la condition corporelle et de l’effort reproducteur. L’effet négatif des précipitations hivernales sur les réserves automnales en gras était seulement détecté à faible densité de population. À faible densité de population, les femelles nées sous des conditions environnementales défavorables tendaient à retarder l’âge à la première reproduction. La productivité végétale au printemps influençait négativement la masse corporelle des femelles à l’automne, et cet effet était plus prononcé à densité de population élevée. Enfin, notre étude révèle que la reproduction affecte la condition corporelle des femelles à l’automne. La lactation influençait négativement la masse corporelle et les réserves corporelles à l’automne, alors que la conception influençait négativement les réserves de gras. En somme, notre étude apporte de nouvelles connaissances pour mieux anticiper la façon dont les populations d’ongulés nordiques, limitées en ressources, peuvent répondre aux changements environnementaux futurs. Nous suggérons que pour les femelles vivant à densité de population élevée et dans des conditions climatiques rigoureuses, la plasticité des stratégies biodémographiques est un déterminant majeur du potentiel reproducteur. / Both population density and environmental stochasticity generate variations in energetic intake and nutritional requirements and expenditures of ungulates. These variations modulate their life-history strategies through different mechanisms. The objective of this study was to evaluate the influence of population density and environmental factors on resource allocation among various parameters of individual body condition and reproductive effort in female white-tailed deer, and to better understand post-reproductive consequences on body condition. We used a long-term dataset of life-history traits of white-tailed deer harvested on Anticosti Island (Québec, Canada), with an emphasis on adult females (>2 years old). Our study revealed that variability in life-history traits is linked to population density and vegetation productivity. High population density reduced autumn gains in body reserves, which in turn reduced the probability of conceiving twins or triplets. High population density at birth positively influenced female body mass in autumn, and consequently litter size. The rate of the spring green-up positively affected body fat accumulation. Our study also allowed us to detect synergistic effects between population density and environmental factors on body condition and reproductive parameters. The negative effect of winter precipitations on fat reserves in autumn only occurred at low population density. At low population density, females born under harsh environmental conditions tended to delay age at first reproduction. Vegetation productivity in spring negatively influenced female body mass in autumn, and this effect was more pronounced at high population density. Finally, our study revealed that reproduction affected female body condition in autumn. Lactation negatively influenced body mass and body reserves, while conception negatively influenced fat reserves. In summary, our study provides additional insights on how northern ungulates limited by food may respond to future environmental changes. We suggest that plasticity in life-history strategies is a major determinant of reproductive potential for females living at high density and under harsh climates.
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Influence of the Allee effect and collective behaviour on population dynamics: the case of the two-spotted spider mite / Influence de l'effet Allee et du comportement collectif sur la dynamique des populations: le cas de l'acarien tisserand

Astudillo Fernandez, Aina 05 September 2011 (has links)
The Allee effect corresponds to a positive relationship between population size and individual fitness. This positive relationship can cause thresholds, that is, critical population sizes below which the population becomes extinct. For species submitted to the Allee effect, the formation and cohesion of groups is therefore crucial to survival. Animals can achieve this collective behaviour through local interactions. Each individual interacts locally with conspecifics and, at the scale of the group, a unity of behaviour emerges: the animals move together, rest in the same place, or choose the same habitat patch to settle on. <p><p>We use a combination of mathematical modelling and experimental work to study certain mechanisms of collective behaviour. In particular we assess the extent to which different individual interactions can induce collective patterns and thereby influence the dynamics of dispersal and settlement of populations. First, we study the collective settlement induced by the arresting effect of a marker secreted by conspecifics. Then, two potential mechanisms for collective movement are examined: following the conspecifics and following a trail laid by conspecifics. Finally, we integrate explicit mechanisms of dispersal behaviour in a dynamic model involving a set of interconnected populations. This allows the study of the interplay between collective movements and Allee effects at the scale of the metapopulation.<p><p>Our work is inspired by the lifestyle of the two-spotted spider mite, Tetranychus urticae, a phytophagous pest of recognised agricultural importance. These subsocial mites live in aggregates on the leaf surface, protected by a collectively spun silk web. Experimental evidence suggests that its population dynamics are subject to the Allee effect. Moreover, these mites show a tendency to migrate collectively, which makes them an appropriate biological model. / Doctorat en Sciences / info:eu-repo/semantics/nonPublished
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collabOr : estimation des tendances démographiques des populations d'orignaux de la Seigneurie de Beaupré par une approche de science collaborative

Côté-Vaillancourt, Dalie 24 April 2018 (has links)
En Amérique du Nord, l’inventaire aérien est la principale méthode d’échantillonnage pour réaliser des estimations d’abondance de populations de grands ongulés. Toutefois, il s’agit d’une opération qui offre des données ponctuelles, peu fréquentes et dont l’utilisation dans un contexte de ressources limitées est remise en question. La science collaborative est une méthode alternative moins dispendieuse qui implique le public pour l’acquisition de données. Plusieurs juridictions utilisent maintenant une approche de science collaborative faisant appel à l’enregistrement des observations quotidiennes des chasseurs pour établir l’état de leurs populations d’orignaux (Alces americanus). Notre objectif était d’évaluer le potentiel d’indices calculés à partir des données d’observation et de récolte d’orignaux recueillies par des chasseurs pour suivre temporellement et spatialement la démographie des populations d’orignaux. Nous avons comparé l’évolution de ces indices avec le taux de croissance des populations d’orignaux estimé par deux inventaires aériens conduits sur la Seigneurie de Beaupré en 2004 et 2013. Le suivi du nombre d’animaux vus par unité d’effort estime une évolution de la population deux fois plus grande que celle enregistrée par inventaires aériens alors que le taux d’augmentation du nombre d’orignaux abattus par unité d’effort la sous-estime de moitié. L’indice d’abondance calculé à partir des observations par les chasseurs reflète mieux l’évolution de la population que l’indice basé sur la récolte en raison des contraintes imposées par le contingentement sévère de la récolte d’orignaux sur le territoire d’étude. Cet indice peu coûteux pourrait devenir un outil complémentaire à des indices permettant de suivre l’impact d’une espèce sur son habitat et à des informations sur la condition physique des individus pour améliorer la gestion des populations animales. / In North America, aerial surveys are the main sampling method for abundance estimations of ungulate populations. This method, however, provides occasional and infrequent estimates, and its use is questioned in a context of limited financial resources availability. Citizen science is a cheaper alternative that involves public in the data collection process. Numerous jurisdictions now use citizen science as an approach for collecting hunter observations and harvest data in order to estimate moose population trends. Our objective was to evaluate the performance of indices based on moose (Alces americanus) observation and harvest data collected by hunters to monitor moose population temporal and spatial trends. We compared the evolution of these indices with the population growth rate estimated from two aerial surveys conducted on the Seigneurie de Beaupré in 2004 and 2013. Moose population growth rate, as estimated from seen per unit effort and catch per unit effort models were respectively half and twice the estimate based on the aerial surveys. The number of moose seen per unit effort reflected better the population trends than the number of moose catch per unit effort due to harvest regulation constraints. Hunter observations are a useful tool for sustainable moose population management and could be combined with indicators of change in habitat and body condition in order to get a better understanding of a population condition.
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Behaviors and global dynamics of population models living in periodically fluctuating environments

Jaberi Bouraki, Majid 16 April 2018 (has links)
Dans ce projet, nous étudions certaines classes d équations non-linéaires aux différences pour toutes les valeurs non-négatives admissibles de paramètres et de conditions initiales. Dans la première partie, nous présentons quelques définitions initiales et nécessaires de la stabilité dans la littérature des équations aux différences. Nous exprimons également plusieurs résultats connus et quelques théorèmes qui seront utiles dans notre recherche à la suite. Dans le deuxièllle chapitre, on étudie l'intervalle invariant, le caractère des sellli-cycles, la stabilité globale, et le "boundedness" de l'équation aux différences [Formule mathématique]. Dans la deuxième partie de ce travail, nous étudions la famille de modèles de la population, d'ordre supérieur, de l'équation logistique non-autonorne [Formule mathématique]. En particulier, le comporternent périodique, l'attractivité des solutions et la stabilité de solutions sont examinés en détail. Ce modèle représente les différentes croissances de population telles que la plupart des saumons et "spruce budworms" ayant assez de nourriture (feuillage). L'impact du caractère saisonnier , qui est indubitablenlent présent dans la croissance de la population, sur le comporternent des solutions (croissance de la population) est également envisagé. Enfin, nous présentons un modèle déterministe de l'infection par le VIH (virus d'immunodéficience hurnaine) en présence de la trithérapie. Puis la stabilité globale asymptotique de l'équilibre "disease-free" et l'équilibre endémique sont étudiés pour le modèle continu. En outre, le modèle est implicitement estimé par la méthode des différences finies, un système d'équations aux différences, afin de résoudre le système d 'IVP (problème aux valeurs initiales) . La dynamique du modèle estimé est complètement déterminée par une quantité de seuil R appelée le "basic reproduction number". Lorsque le nombre associé à la reproduction est inférieur à l'unité, le résultat indique que l'infection par le VIH peut être éliminée de la personne infectée. Un équilibre stable endémique existe lorsque le nombre associé à la reproduction est supérieur à l'unité (conduisant à la persistance et l'existence du VIH au sein de la personne infectée, puis de la communauté) .
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Etude de l'histoire évolutive d'insectes phytophages: approche phylogéographique et développements méthodologiques

Dellicour, Simon 04 December 2013 (has links)
Doctorat en Sciences / info:eu-repo/semantics/nonPublished

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