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Caracterização genética dos hantavírus em roedores sigmodontíneos e humanos em área endêmica de síndrome cardiopulmonar por hantavírus no estado de Minas GeraisLimongi, Jean Ezequiel 06 May 2013 (has links)
The hantaviruses are among the most important zoonotic pathogens of humans, especially due
to high fatality, those associated with Hantavirus Pulmonary Syndrome (HPS). In Brazil,
more than 1600 cases of HPS have been confirmed since 1993, with a fatality rate of 40%.
The viral genotypes associated with HPS in humans, as well as those present in wild rodents
were investigated in an endemic area of the state of Minas Gerais in this study. Furthermore,
the seroprevalence for hantaviruses, the karyotyping of rodent species captured and the
population dynamics of these animals on the Cerrado vegetation types were also evaluated in
an ecoepidemiological approach. The ELISA and / or RT-PCR were used to test sera from
human cases of SPH and wild rodents and rodent lung fragments. In our study, six patients
were evaluated, of these six (100%) were seroreactive in ELISA in six (100%) was possible to
amplify viral genetic material and in five (83.3%) was possible sequencing. Were observed in
all the viral genotype Araraquara (ARAV), but with the formation of two well-defined
clusters. The case fatality rate was 50%. Regarding rodents, 258 specimens were captured.
Nine taxa were identified to species level and seven in genus level, all belonging to the
subfamily Sigmodontinae. Necromys lasiurus was the most abundant (70.2). We observed a
greater diversity of rodents in a fitofisionomy called semi-deciduous dry forest (07 taxa in
species level and four in genus level). The winter dry season was associated with the highest
capture success (p <0.0001). There was a higher prevalence of pregnancy during the rainy
season (p <0.0001). There was a prevalence of IgG antibodies against hantavirus of 1.6%, all
specimens of N. lasiurus. Among the four seroreactive rodents, three (75%) was possible to
amplify viral genetic material and two (50%) was possible sequencing. Only ARAV viral
genotype was observed. Samples of rodents had higher phylogenetic identity with the
genotype sequenced of the human sample of Uberlândia, Minas Gerais, where the rodents
were also captured. Samples identified with ARAV analyzed in this study were distributed at
a distance of approximately 400 kilometers. Despite the geographical distance, we observed a
high phylogenetic identity between two samples 384 km distant from each other. The
environmental and demographic changes that have occurred in recent decades in the study
area affected the ecology of wild rodents and facilitated the occurrence of hantavirus
infections in humans and the emergence of HPS in this region, mainly ARAV transmitted by
N. lasiurus. The observation in this study only the genotype ARAV in specimens of N.
lasiurus and humans, does not exclude the possibility of co-circulation of other viral
genotypes in this area, beyond the possibility of the existence of other reservoirs of
hantaviruses, including non-rodents. / Os hantavírus estão entre os patógenos zoonóticos mais importantes para o homem,
especialmente devido a alta letalidade, daqueles associados à Síndrome Pulmonar por
hantavírus (SPH). No Brasil, mais de 1600 casos de SPH foram confirmados desde 1993, com
uma taxa de letalidade de 40%. Os genótipos virais associados à SPH em humanos, bem
como os presentes nos roedores silvestres foram investigados em uma área endêmica do
estado de Minas Gerais neste estudo. Além disso, a soroprevalência para hantavírus, a
cariotipagem das espécies de roedores capturadas e a dinâmica populacional destes animais
nas fitofisionomias do Cerrado também foram avaliadas em uma abordagem
ecoepidemiológica. O ELISA e/ou o RT-PCR foram utilizados para testar amostras de soro de
casos humanos suspeitos de SPH e de roedores silvestres e fragmentos de pulmão de
roedores. Em nossa casuística, seis pacientes foram avaliados, destes (100%) foram
sororreativos no ELISA, e em seis (100%) foi possível amplificar material genético viral e em
cinco (83,3%) foi possível o sequenciamento. Em todos foram observados o genótipo viral
Araraquara (ARAV), porém com a formação de dois clusters bem definidos. A taxa de
letalidade dos casos foi de 50%. Em relação aos roedores, 258 espécimes foram capturados.
Nove táxons foram identificados a nível específico e sete a nível genérico, todos pertencentes
à subfamília Sigmodontinae. Necromys lasiurus foi a espécie mais capturada (70,2). Foi
observada maior diversidade de roedores na fitofisionomia Mata seca semidecídua (07 táxons
a nível específico e quatro a nível genérico), A estação inverno seco esteve relacionada com o
maior sucesso de captura (p < 0,0001). Houve maior prevalência de prenhez durante a estação
chuvosa (p<0,0001). Observou-se uma prevalência de anticorpos IgG contra hantavírus de
1,6%, todos espécimes de N. lasiurus. Dentre os quatro roedores sororreativos, em três (75%)
foi possível amplificar material genético viral e em dois (50%) foi possível o sequenciamento.
Somente o genótipo viral ARAV foi observado. Estes tiveram maior identidade filogenética
com o genótipo viral sequenciado de uma amostra humana do município de Uberlândia-MG,
local onde também os roedores foram capturados. As amostras identificadas com ARAV
analisados no presente estudo foram distribuídas a uma distância de aproximadamente 400
quilômetros. Apesar da distância geográfica, observamos uma alta identidade filogenética
entre duas amostras distantes 384 km entre si. As alterações ambientais e demográficas
ocorridas nas últimas décadas na área de estudo afetou a ecologia dos roedores silvestres e
facilitou a ocorrência de infecções humanas por hantavírus e a emergência da SPH nesta
região, principalmente por ARAV transmitido por N. lasiurus. A observação neste estudo
apenas do genótipo ARAV em espécimes de N. lasiurus e humanos, não exclui a
possibilidade de cocirculação de outros genótipos virais nesta área, além da possibilidade da
existência de outros reservatórios de hantavírus, inclusive não roedores. / Doutor em Imunologia e Parasitologia Aplicadas
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