Epidemiological studies have shown that human adults have a higher chance of developing various metabolic disorders, such as type II diabetes and hypertension, due to maternal under nutrition. The concept that conditions encountered in early development can have far reaching implications for an individual’s adult life is known as the Developmental Origins of Health and Disease (DOHaD) hypothesis. In vitro studies have shown that if the amino acid leucine is not available at a high enough concentration the embryo will not exhibit normal trophectoderm protrusive activity which precedes implantation. The amino acid transport system System B0,+ is the main gateway into these cells for leucine but its expression at the transcription level has never been shown in preimplantation blastocysts. We investigated System B0,+ expression in preimplantation blastocysts from dams fed a control versus a low-protein isocaloric diet (18% and 9% casein, respectively). Using RT-PCR to detect the System B0,+ transcript, ATB0,+, we found that indeed there is expression of this amino acid transporter in the pre-implantation rat blastocyst. Due to the gender-specific nature of many DOHaD phenomena, the blastocysts were sexed using gender specific primers and a nested PCR approach. Quantitative real time PCR (qRT-PCR) results show no significant difference in ATB0,+ expression in blastocysts taken from dams fed either diet (9% n= 56, 18% n = 52; 7 dams from each diet group). Furthermore, separating the data by gender reveals no significant difference in expression. However, while not significant, there does appear to be a trend in the protein restricted blastocysts towards increased transcription of ATB0,+, suggesting System B0,+ may be responding at the transcription level to the diet. This could be part of the predictive adaptive response leading to a reprogrammed phenotype as described by the DOHaD hypothesis. Further work is needed to elucidate System B0,+’s role in developmental programming.

Epidemiological studies have shown that human adults have a higher chance of developing various metabolic disorders, such as type II diabetes and hypertension, due to maternal under nutrition. The concept that conditions encountered in early development can have far reaching implications for an individual’s adult life is known as the Developmental Origins of Health and Disease (DOHaD) hypothesis. In vitro studies have shown that if the amino acid leucine is not available at a high enough concentration the embryo will not exhibit normal trophectoderm protrusive activity which precedes implantation. The amino acid transport system System B0,+ is the main gateway into these cells for leucine but its expression at the transcription level has never been shown in preimplantation blastocysts. We investigated System B0,+ expression in preimplantation blastocysts from dams fed a control versus a low-protein isocaloric diet (18% and 9% casein, respectively). Using RT-PCR to detect the System B0,+ transcript, ATB0,+, we found that indeed there is expression of this amino acid transporter in the pre-implantation rat blastocyst. Due to the gender-specific nature of many DOHaD phenomena, the blastocysts were sexed using gender specific primers and a nested PCR approach. Quantitative real time PCR (qRT-PCR) results show no significant difference in ATB0,+ expression in blastocysts taken from dams fed either diet (9% n= 56, 18% n = 52; 7 dams from each diet group). Furthermore, separating the data by gender reveals no significant difference in expression. However, while not significant, there does appear to be a trend in the protein restricted blastocysts towards increased transcription of ATB0,+, suggesting System B0,+ may be responding at the transcription level to the diet. This could be part of the predictive adaptive response leading to a reprogrammed phenotype as described by the DOHaD hypothesis. Further work is needed to elucidate System B0,+’s role in developmental programming.

Deux analyses indépendantes du canal de désintegration B0 ! K0s K0s K0s ont été effectuées, utilisant un échantillon de 468 millions de paires B¯B enregistrées par le détecteur BABAR auprès de l'usine à B PEP-II à SLAC National Laboratory. La première analyse est dépendant du temps et integrée sur l'espace de phase. Son but est d'extraire simultanément des deux sous-canaux B0 ! 3K0s (¼+¼−) et B0 ! 2K0s (¼+¼−)K0s (¼0¼0), les paramètres S et C de violation de CP. Il est intéressant de comparer les valeurs mesurées avec les mesures des modes charmonium. Le résultat obtenu est • S = −0.94+0.24 −0.21 ± 0.06 • C = −0.17+0.18 −0.18 ± 0.04 , où la première incertitude est statistique et la deuxième est systématique. Ce résultat est compatible avec la prédiction du modèle standard et les mesures des modes charmonium. La deuxième analyse est une analyse en amplitude (ou dans le plan de Dalitz). Elle est intégrée sur le temps. Son but est d'extraire le rapport de branchement total, ainsi que les rapports de branchement des modes résonnants partiels. C'est la première fois que cette analyse est effectuée pour le canal étudié. Le résultat est • B(B0 ! K0s K0s K0s ) = (6.18 ± 0.47 ± 0.14 ± 0.06) × 10−6 • B(B0 ! f0(980)K0s ; f0(980) ! K0s K0s ) = (2.69+1.25 −1.18 ± 0.35 ± 1.87) × 10−6 • B(B0 ! f0(1710)K0s ; f0(1710) ! K0s K0s ) = (0.50+0.46 −0.23 ± 0.04 ± 0.12) × 10−6 • B(B0 ! f2(2010)K0s ; f2(2010) ! K0s K0s ) = (0.54+0.21 −0.20 ± 0.03 ± 0.44) × 10−6 • B(B0 ! Nonresonant; K0s K0s K0s) = (13.31+2.23 −2.30 ± 0.55 ± 2.77) × 10−6 • B(B0 ! Âc0K0s ; Âc0 ! K0s K0s) = (0.46+0.25 −0.16 ± 0.01 ± 0.19) × 10−6 , où la première incertitude est statistique, la deuxième est systématique et la troisième est liée au modèle de l'amplitude. Aucun signal statistiquement significatif de la résonance controversée fX(1500) n'a été observé. dumm

LHCb est une expérience dédiée à l'étude de la violation CP dans le système des mésons B et à l'étude de leurs désintégrations rares. En 2000, la collaboration a décidé de modifier son appareillage pour minimiser la matière rencontrée par les particules et optimiser le système de déclenchement. C'est dans ce contexte que se place cette thèse qui comprend trois parties. La première est relative à l'identification des électrons qui est principalement basée sur l'information fournie par le système des calorimètres mais tire aussi profit des mesures du RICH et du détecteurs à muons. L'efficacité d'identification des électrons est environ 94% avec un taux d'identification de pions comme électrons égal à 0.7% et une pureté de l'échantillon d'électrons de 65%. Dans la première partie est aussi présentée la reconstruction des photons Bremsstrahlung, qui permet une sélection du J/psi se désintégrant en paire e+e- et ainsi celle du canal B0d→ J/psi(ee) Ks. La deuxième partie décrit la sélection de ce canal qui consiste en un ensemble de coupures cinématiques et topologiques. L'efficacité totale de sélection est 0.176% correspondant à 28000 événements reconstruits par an, avec un rapport B/S, pour le fond bb inclusif, comprit dans l'intervalle à 90% de niveau de confiance [0.017;0.069]. Enfin, dans la dernière partie sont présentées les méthodes d'étiquetage de la saveur des mésons B. L'ajout de l'information fournie par le détecteur de vertex permet de rejeter les électrons issus de conversion de photon et ainsi d'améliorer sensiblement les performances. Ces performances ont ensuite été utilisées pour déterminer la sensibilité de l'expérience LHCb à la mesure de sin(2beta). L'erreur statistique attendue sur sin(2beta), après un an de prise de données correspondant à une luminosité intégrée de 2 fb-1 et une section efficace de production des paires bb de 0.5 mb, varie de 0,015 à 0.020 en fonction des paramètres sin(2b) et |lambda f| et du niveau de bruit de fond.

L'expérience BABAR, dont la prise de données a débuté en 1999 auprès du collisionneur PEP-II a SLAC, a pour objectif principal l'étude de la violation de la symétrie CP dans le système des mésons B. Après avoir précisémment mesuré sin2beta, notre attention se porte sur les deux autres angles alpha et gamma du triangle d'unitarité. Les travaux présentés dans cette thèse concernent la mesure de l'angle alpha dans le mode B0->rhopi. Nous avons réalisé une analyse CP dépendante du temps, ainsi que la mesure des rapports d'embranchement des modes B0->rho+-pi-+ et B0->rho-K+. Les résultats obtenus avec une luminosité intégrée de 80.9 fb-1 sont les suivants: B(B0->rho+-pi-+) = (22.6 +- 1.8 +- 2.2) 10-6, B(B0->rho-K+) = ( 7.3 +- 1.3 +- 1.3) 10-6, ACP(rhopi) = -0.18 +- 0.08 +- 0.03, ACP(rhoK) = -0.28 +- 0.17 +- 0.08, C(rhopi) = -0.36 +- 0.18 +- 0.04, S(rhopi) = -0.19 +- 0.24 +- 0.03, delatC(rhopi) = 0.28 +- 0.19 +- 0.04, deltaS(rhopi) = 0.15 +- 0.25 +- 0.03. Nous avons également mesuré le rapport d'embranchement de B0->rho0pi0, avec une signification statistique de 2.7 sigmas. Nous calculons une limite supérieure sur ce rapport d'embranchement: B(B0->rho0pi0) < 2.7 x 10-6 at 90 % CL. Enfin, nous avons developpé le coeur de l'analyse complète de B0->pi+pi-pi0, qui exploite toute l'information présente dans le diagramme de Dalitz. Des estimations de sensibilité expérimentale pour alpha ont été effectuées. Les résultats obtenus pour les modes B0->rhopi sont interprétés en terme de contraintes sur l'angle alpha au sein de méthodes utilisant la symétrie SU(2) et les modes B+->rhopi, ou la symétrie SU(3) et les modes B0->rhoK et B0->K*pi. Nous avons aussi réalisé la mesure du rapport d'embranchement du mode B0->a0pi sur une luminosité plus réduite de 20 fb-1, menant au résultat: B(B0->a0pi) = (6.2 +3.0-2.5 +- 1.1) 10-6. Des études phénoménologiques sur la faisabilité d'une analyse CP et la détermination de l'angle alpha grâce à ce mode ont aussi été accomplies. Enfin, nous décrivons les améliorations apportées au système de protection du SVT durant les périodes d'injection. En dehors du champ de la collaboration BABAR, nous avons développé un logiciel, dénomé CKMFitter permettant de réaliser une analyse globale de la matrice CKM au sein d'une analyse fréquentiste.

In todays Radiotherapy Treatment Planning, RTP, it is common to use Computed Tomography, CT, together with Magnetic Resonance Imaging, MRI, where CT provides electron density information and a geometrical reference, and where MRI provides superior soft tissue contrast. To sim- plify the workflow and improve treatment accuracy, research groups have demonstrated how to exclude CT and use a MRI-only approach. In this thesis, a method for spatial distortion analysis, ultimately enabling quality assurance, QA, of the spatial accuracy of MRI, was defined, tested and evaluated. A phantom was built to cover the entire clinical Field Of View, FOV, and 6mm-diameter fluid filled paintball markers were placed in a well-defined geometrical pattern within the phantom, and used as positive contrast. The phantom was imaged with a 3D Fast Gradient Echo sequence and a 3D Fast Spin Echo sequence. The markers were identified in the image data by a MATLAB-algorithm, and the location of the center of mass was calculated for each marker and compared to a theoretical reference. The location error was defined as the spatial distortion - a measurement of the spatial accuracy. Imaging parameters were altered and the effect on the spatial accuracy was analyzed. The spatial distortions were successfully measured within the entire (maximal) clinical FOV. It was shown that high readout bandwidth reduced distortions in the frequency encoding direction. These distortions could thus be attributed to B0-inhomogeneities. It was also determined that increasing the readout bandwidth to the maximum value reduced the maximum distortions in the frequency encoding direction to the same level as the maximum distortions in the other two phase-encoding directions of the 3D acquisitions. The voxel size had a very small effect on the spatial accuracy, enabling large voxelsize to be used when imaging the phantom, to decrease the scan time. The method was deemed capable of serving as a basis for QA of the spatial accuracy of large FOV MRI, which is needed in future MRI-only RTP approaches.

Cette thèse est dédiée à l’étude des désintégrations B0 s → φγ au LHCb afin de mesurer la polarisation du photon . Au niveau des quarks, ces désintégrations procèdent via une transition pingouin b→ sγ et sont sensibles aux éventuelles contributions virtuelles de Nouvelle Physique. La mesure de la polarisation du photon permet de tester la structure V – A du couplage du Modèle Standard dans les processus des diagrammes de boucles de pingouin. Cette mesure peut être réalisée en étudiant le taux de désintégration dépendant du temps des mésons B. Une analyse délicate a été faite pour comprendre la distribution du temps propre et l’acceptance de sélection qui affecte cette distribution. Afin de contrôler l’acceptance de temps propre, des méthodes basées sur les données ont été développées. Plusieurs stratégies utilisées dans la mesure de la polarisation des photons sont introduites et des résultats préliminaires sont présentés. De plus, une étude de certains effets systématiques est discutée. Dans le cadre de l’étude des désintégrations radiatives, une nouvelle procédure d’identification de photons a été développée et nous avons fourni un outil pour calibrer la performance de la variable de séparation photon/pion neutre sur la simulation. Ces outils sont d’intérêt général pour la collaboration LHCb et sont largement utilisés. / This thesis is dedicated to the study of the photon polarization in B0 s → φγ decays at LHCb. At the quark level, such decays proceed via a b→ sγ penguin transition and are sensitive to possible virtual contributions from New Physics. The measurement of the photon polarization stands also as a test of the V – A structure of the Standard Model coupling in the processes mediated by loop penguin diagrams. The measurement of the photon polarization can be done through a study of the time-dependent decay rate of the B meson. A delicate treatment has been done to understand the proper time distribution and the selection acceptance affecting it. To control the proper time acceptance, data driven control methods have been developed. Several possible strategies to measure the photon polarization are introduced and preliminary blinded results are presented. A study of some of the systematic effects is discussed. In the context of studying radiative decays, the author has developed a new photon identification procedure and has provided a tool to calibrate the performance of the photon/neutral pion separation variable on simulation. Those tools are of general interest for the LHCb collaboration and are widely used.

No description available.