Orientador: Humberto Tonhati / Coorientador: Rusbel Raúl Aspilcueta Borquis / Banca: João Ademir de Oliveira / Banca: Anibal Eugênio Vercesi Filho / Resumo: Este trabalho teve como objetivo estimar parâmetros genéticos para características de crescimento, utilizando-se um modelo multi-característica. Foram analisados registros de 14956 animais da raça Brahman, participantes do programa de melhoramento da raça Brahman, desenvolvido pela Associação Nacional de Criadores e Pesquisadores (ANCP). Por meio de inferência bayesiana foram obtidas estimativas de componentes de variância para os pesos nas idades padrão aos 60 (P60), 120 (P120), 210 (P210), 365 (P365), 450 (P450) e 550 (P550) dias. As análises foram realizadas empregando-se o software GIBBS2F90, assumindo um modelo animal. Para os pesos às idades padronizadas estudadas foram considerados os efeitos fixos de grupo de contemporâneos (rebanho - ano nascimento - estação de nascimento - sexo - manejo) e idade do animal no momento da pesagem (linear e quadrático) como covariável, e os efeitos aleatórios genético aditivo direto, genético aditivo materno e residual. As estimativas de herdabilidade genética direta foram 0,31 (P60), 0,37 (P120), 0,34 (P210), 0,38 (P365), 0,37 (P450) e 0,45 (P550). As estimativas de herdabilidade genética materna foram 0,18 (P60), 0,19 (P120), 0,22 (P210), 0,14 (P365), 0,11 (P450), e 0,08 (P550). Os valores de correlação genética direta variaram de 0,79 (P60 / P450) a 0,94 (P365 / P450). Em vista dos parâmetros estimados, verifica-se que as características aqui estudadas apresentam variabilidade genética suficiente para realizar a seleção dos animais. As correlações genéticas indicam que a seleção simultânea para as características em estudo pode ser eficiente / Abstract: The objective of this work was to estimate genetic parameters for growth traits using a multiple-traits model. Were analyzed records of 14956 animals of Brahman Breed, participants of Breeding Program of Brahman cattle, developed by Breeders and Researchers National Association (ANCP). Using Bayesian inference were obtained estimations of variance components for standardized weights at 60 (W60), 120 (W120), 210 (W210), 365 (W365), 450 (W450) and 550 (W550) days. Analyzes were done using Gibbs2f90 Software, assuming an animal model. For standardized weights were considered fixed effects of contemporary group (herd - birth year - birth season - sex - management) and animal age at weighting moment (linear and quadratic) as covariate, and randomized effects of direct additive genetic, maternal additive genetic and residual. Direct Heritability estimations were 0,31 (W60), 0,37 (W120), 0,34 (W210), 0,38 (W365), 0,37 (W450) and 0,45 (W550). Maternal heritability estimations were 0,18 (W60), 0,19 (W120), 0,22 (W210), 0,14 (W365), 0,11 (W450), and 0,08 (W550). Genetic correlation values varied from 0,79 (W60 / W450) a 0,94 (W365 / W450).. According estimated genetic parameters, was verified that standardized weights presented enough genetic variation for animal selection. Genetic correlations indicate that a simultaneously selection for all the traits of this study could be efficient / Mestre

Resumo: Os objetivos deste estudo foram verificar a possibilidade de utilização da prenhez de novilhas como critério de seleção e as possíveis associações genéticas entre esta característica e peso ao sobreano, altura na garupa e escores visuais, por meio da estimação de variâncias e covariâncias das características, de modo que possam ser utilizadas para predizer os valores genéticos dos animais e a resposta a seleção. Foram analisados 30.407, 7.226, 49.901, 46.919, 46.917, 46.909 dados para prenhez de novilhas (Pr16), altura na garupa (ALTG), peso ao sobreano (PES), conformação (C), precocidade de terminação )P) e musculatura (M), respectivamente. Também foram analisados 12.315, 4.526, 29.789 dados para Pr16, ALTG e PES, respectivamente, de animais com pai e mãe conhecidos. Os animais utilizados são provenientes do arquivo zootécnico da Agropecuária Jacarezinho Ltda, localizada mo município de Valparaíso, São Paulo. Foram realizadas analisadas bicaracaterísticas, sendo computadas duas cadeias independentes de 600.000 ciclos para Pr16, ALTG e PES e de 400.000 ciclos para Pr16, C, P e M. Foram retirados os 5.000 primeiros ciclos como período de descarte amostral. Distribuições "flat" foram assumidas para todos os componentes de (co) variâncias. Herdabilidade de 0,20 e correlação genética de 0,30 foram assumidas como valores iniciais para e entre as características. O critério de convergência foi de 10-12. Os resultados indicam que a prenhez aos 16 meses, pode ser utilizada como critério de seleção com possibilidades de ganho genético na precocidade sexual das novilhas. A seleção para peso ao sobreano não levará a mudanças genéticas na precocidade sexual em fêmeas...(Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The objectives of this study were verify the possibility of use pregnant heifer as selection criteria and the genetic associations between this trait with weight at yearling, hip height and visual scores. Variances and covariances between the traits were estimated in order to estimate the breeding values of the animals and the response to selection. It were analyzed 30,407, 7,226, 49,901, 46,919, 46,917, 46,909 records of pregnant heifers (Pr16), hip height (ALTG), yearling weight (PES), conformation (C), finished precocity (P), musculature (M), respectively, from animals with dam known. Also, it were analyzed 12,315, 4,526, 29,789 records for Pr16, ALTG and PES, respectively, from animals with sire and dam known. The animals utilized were belonging to Agropecuária Jacarezinho Ltda, located in Valparaíso council, São Paulo state. Two-trait analyses were accomplished, being computed two independent chains of 600,000 cycles for Pr16, ALTG e PES and of 400,000 cycles for Pr16, C, P and M. For analyses of posterior distribution of heritability coefficients, the first 5,000 cycles were deleted. Flat distributions were assumed for all the (co)variance components. Initial values for heritability and genetic correlation were 0.20 and 0.30, respectively. Convergence criteria was 10-12. Heritability for pregnancy at 16 months, suggest, that this trait could be utilized as selection criteria, and response to selection will be obtained for sexual precocity of the heifers. Selection for yearling weight won’t carry genetic changes in the sexual precocity of the heifers. Selection for pregnancy at 16 months of age, in long term, will carry a decrease in the size of the animals. Selection for increase visual score of conformation, finished precocity and musculature, probably, will produce a low or no response in the pregnancy of the heifers at 16 months of age. / Orientadora: Lucia Galvão de Albuquerque / Coorientador: Josineudson Augusto II de Vasconcelos Silva / Banca: Henrique Nunes de Oliveira / Banca: Joanir Pereira Eler / Mestre

Resumo: Dados de bovinos da raça Red Angus oriundos de um único criatório localizado no centro-sul norte-americano foram utilizados com o objetivo de avaliar a significância da interação genótipo-ambiente (IGA) em animais nascidos na primavera e no outono por meio da estimação da sua correlação genética. Foi utilizada a inferência bayesiana (programa MTGSAM) em análises uni-caráter e bi-caráter dos pesos ao nascer (PN), aos 205 dias (PD), aos 365 dias (PA) e ganho de peso entre 205 e 365 dias (GA), sendo estimadas as funções de densidade de probabilidade associadas às herdabilidades e correlações genéticas, tendo as últimas médias de 0,56, -0,11, 0,43 e 0,40, e modas de 0,66, -0,07, 0,39 e 0,49, respectivamente para cada caráter, mostrando uma grande significância da IGA. A metodologia mostrou-se capaz de estimar satisfatoriamente os componentes de (co)variância, mesmo em um volume limitado de dados, mostrando correlações genéticas extremamente baixas em clima heterogêneo em um mesmo local, pondo em discussão os resultados da análise uni-caráter. / Abstract: Data from Red Angus cattle from a single herd located in middle-southern from USA were analyzed with the objective of evaluating the significance of genotype by environment interaction (GxEI) in calves born in Spring and Fall by estimation of its genetic correlation. The Bayesian inference (MTGSAM program) were used in an uni-character and a bi-character analysis of birth weight, 205-days weight, 365-days weight and gain between 205 and 365 days. The functions of probabilistic density of heritabilities and genetic correlations were estimated, with this last ones having averages of 0,56, -0,11, 0,43 and 0,40, and modes of 0,66, -0,07, 0,39 and 0,49, respectively for each character, showing a large significance of GxEI. The methodology was satisfactory in estimating the (co)variance components, even with a small volume of dates, showing low values of genetic correlations in a place with heterogeneous climate, generating discussion about the uni-character analysis. / Orientador: Henrique Nunes de Oliveira / Coorientador: Lúcia Galvão Albuquerque / Mestre

Orientador: Aluir Porfírio Dal Poz / Banca: Nilton Nobuhiro Imai / Banca: Maurício Galo / Banca: Edson Aparecido Mitishita / Resumo: As metodologias para a extração automática de telhados desempenham um papel importante no contexto de aquisição de informação espacial para Sistemas de Informação Geográficas (SIG). Neste sentido, este trabalho propõe uma metodologia para extração automática de contornos de telhado de edifícios utilizando dados de varredura a laser. A metodologia baseiase em duas etapas principais: 1) Extração de regiões altas (edifícios, árvores etc.) de um Modelo Digital de Elevação (MDE) gerado a partir dos dados laser; 2) Extração das regiões altas que correspondem a contornos de telhados. Na primeira etapa são utilizadas as técnicas de divisão recursiva, via estrutura quadtree e de fusão Bayesiana de regiões considerando Markov Random Field (MRF). Inicialmente a técnica de divisão recursiva é usada para particionar o MDE em regiões homogêneas. No entanto, devido a ligeiras diferenças de altura no MDE, nesta etapa a fragmentação das regiões pode ser relativamente alta. Para minimizar essa fragmentação, a técnica de fusão Bayesiana de regiões é aplicada nos dados segmentados. Utiliza-se para tanto um modelo hierárquico, cujas alturas médias das regiões dependem de uma média geral e de um efeito aleatório, que incorpora a relação de vizinhança entre elas. A distribuição a priori para o efeito aleatório é especificada como um modelo condicional auto-regressivo (CAR). As distribuições a posteriori para os parâmetros de interesse foram obtidas utilizando o Amostrador de Gibbs. Na segunda etapa os contornos de telhados são identificados entre todos os objetos altos extraídos na etapa anterior. Levando em conta algumas propriedades de telhados e as medidas de alguns atributos (por exemplo, área, retangularidade, ângulos entre eixos principais de objetos) é construída uma função de energia a partir do modelo MRF. / Abstract: Methodologies for automatic building roof extraction are important in the context of spatial information acquisition for geographical information systems (GIS). Thus, this work proposes a methodology for automatic extraction of building roof contour from laser scanning data. The methodology is based on two stages: 1) Extraction of high regions (buildings, trees etc.) from a Digital Elevation Model (DEM) derived from laser scanning data; 2) Building roof contour extraction. In the first stage is applied the recursive splitting technique using the quadtree structure followed by a Bayesian merging technique considering Markov Random Field (MRF) model. The recursive splitting technique subdivides the DEM into homogeneous regions. However, due to slight height differences in the DEM, in this stage the region fragmentation can be relatively high. In order to minimize the fragmentation, a region merging technique based on the Bayesian framework is applied to the previously segmented data. Thus, a hierarchical model is proposed, whose height values in the data depend on a general mean plus a random effect. The prior distribution for the random effects is specified by the Conditional Autoregressive (CAR) model. The posterior probability distributions are obtained by the Gibbs sampler. In the second stage the building roof contours are identified among all high objects extracted previously. / Doutor

Resumo: Características reprodutivas são importantes na produção de bovinos de corte, entretanto são pouco utilizadas em programas de melhoramento genético, pois são fortemente influenciadas por fatores ambientais. Neste estudo procurou-se verificar as relações existentes entre características de crescimento, de conformação e de reprodução como proposta para definição de critério de seleção para fertilidade na raça Canchim. As características analisadas foram: idade ao primeiro parto (IPP), idade ao primeiro parto penalizada (IPPPEN), idade ao segundo parto (ISP), idade ao segundo parto penalizada (ISPPEN), ocorrência de parição até os 38 meses de idade (PP38), e circunferência escrotal (CE420), peso (PE420) e escore de conformação frigorífica (CF420) aos 420 dias de idade. As médias (± DP) das estimativas de herdabilidade foram iguais a 0,02 ± 0,01(IPP); 0,03 ± 0,01 (IPPPEN); 0,05 ± 0,04 (ISP); 0,05 ± 0,02 (ISPPEN); 0,06 ± 0,03 (PP38); 0,25 ± 0,04 (CE420), 0,30 ± 0,02 (PE420) e 0,17 ± 0,05 (CF420). As médias (± DP) das estimativas de correlação genética com PE420 foram -0,09 ± 0,20 (IPP); 0,05 ± 0,21 (IPPPEN); 0,10 ± 0,18 (ISP); 0,13 ± 0,16 (ISPPEN); -0,09 ± 0,17 (PP38), com CE420 foram -0,67 ± 0,23 (IPP); -0,50 ± 0,25 (IPPPEN); -0,33 ± 0,18 (ISP); -0,31 ± 0,25 (ISPPEN) e 0,37 ± 0,25 (PP38), e com CF420 foram -0,16 ± 0,34 (IPP), -0,33 ± 0,36 (IPPPEN), 0,16 ± 0,36 (ISP), 0,35 ± 0,35 (ISPPEN) e 0,42 ± 0,28 (PP38). Estes resultados sugerem que as características reprodutivas das fêmeas (CR) não deverão apresentar boas respostas à seleção, que a seleção para PE420 não deverá provocar mudanças nas CR, que a seleção para maior CE420 deverá melhorar as CR e que a seleção para maior CF420 deve resultar em maior PP38 / Abstract: Reproductive traits are important to beef cattle production systems, however their use in animal breeding programs is still small, because they are strongly influenced by environmental factors. Genetic parameters of reproduction, growth and conformation traits were estimated in a Canchim population to evaluate their potential to be included as selection criteria in a breeding program. The traits studied were age at first calving (IPP), age at first calving penalized (IPPPEN), age at second calving (ISP), age at second calving penalized (ISPPEN), occurrence of calving until 38 months of age (PP38), scrotal circumference (CE420), body weight (PE420) and carcass conformation score (CF420) at 420 days of age. The mean (± SD) of the heritability estimates were 0.02 ± 0.01 (IPP); 0.03 ± 0.01 (IPPPEN); 0.05 ± 0.04 (ISP); 0.05 ± 0.02 (ISPPEN); 0.06 ± 0.03 (PP38); 0.25 ± 0.04 (CE420); 0.30 ± 0.02 (PE420) and 0,17 ± 0,05 (CF420). The mean (± SD) of the genetic correlation estimates with PE420 were -0.09 ± 0.20 (IPP); 0.05 ± 0.21 (IPPPEN); 0.10 ± 0.18 (ISP); 0.13 ± 0.16 (ISPPEN) and -0.09 ± 0.17 (PP38), with CE420 were -0.67 ± 0.23 (IPP); -0.50 ± 0.25 (IPPPEN); -0.33 ± 0.18 (ISP); -0.31 ± 0.25 (ISPPEN) and 0.37 ± 0.25 (PP38), and with CF420 were -0.16 ± 0,34 (IPP), -0.33 ± 0,36 (IPPPEN), 0.16 ± 0,36 (ISP), 0.35 ± 0,35 (ISPPEN) and 0.42 ± 0,28 (PP38). These results suggest that the female reproductive traits (RT) will not show good genetic progress through selection, that selection for PE420 should not change RT, that selection to increase CE420 should change female reproductive traits favorably, and that selection to increase CF420 should increase PP38 / Orientador: Maurício Mello de Alencar / Coorientador: Fernando Sebastián Baldi Rey / Coorientador: Luiz Otávio Campos da Silva / Banca: Arthur dos Santos Mascioli / Banca: João Cláudio do Carmo Panetto / Banca: Humberto Tonhati / Banca: Pedro Franklin Barbosa / Doutor

Orientador: Henrique Nunes de Oliveira / Banca: Lucia Galvão de Albuquerque / Banca: Maria Eugênia Zerlotti Mercadante / Resumo: Com o objetivo de estudar a interação genótipo - ambiente (IGA) no peso ao sobreano, foram utilizados 99.366 registros provenientes de diferentes rebanhos da raça Nelore de cinco estados brasileiros (São Paulo, Mato Grosso, Mato Grosso do Sul, Goiás e Minas Gerais). Os dados são provenientes de animais nascidos entre 1991 a 2006 participantes do Programa de Melhoramento Genético da Raça Nelore (PMGRN). As informações foram coletadas pelos próprios criadores, sendo posteriormente transferidas à Associação Nacional de Criadores e Pesquisadores (ANCP) e então incorporadas ao banco de dados. Neste estudo foram utilizados apenas os dados dos animais criados exclusivamente a pasto. Os componentes de (co)variância foram obtidos através de uma análise unicaracterística (onde considerou-se o peso como mesma característica em todos os estados) e multicaracterística (na qual considerou-se a expressão do peso em cada estado como uma característica distinta). As estimativas foram obtidas por meio de inferência bayesiana, e o modelo de análise incluiu os efeitos fixos de grupos de contemporâneos e, como aleatórios, os efeitos genético aditivo direto e residual. A interação genótipo - ambiente foi verificada através da correlação genética (rg). As interações foram consideradas importantes quando os valores de rg ficaram abaixo de 0,80. Posteriormente, verificou-se o efeito da interação sobre a seleção considerando uma análise uni ou multicaracterística. As estimativas de herdabilidade em Mato Grosso (0,39±0,03) e Mato Grosso do Sul (0,37±0,02) foram mais baixas que as encontradas em Goiás (0,51±0,02), São Paulo (0,44±0,02) e Minas Gerais (0,41±0,04). As correlações genéticas estimadas entre os pesos nos diferentes estados foram positivas... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The goal was to study genotype by environment interaction (GEI) for yearling weight. Records of 99,366 Nellore cattle from five Brazilian states (São Paulo, Mato Grosso, Mato Grosso do Sul, Goias and Minas Gerais) were used. Animals were born between 1991 to 2006 belonging to the Nellore Cattle Breeding Program (NCBP). Information was collected by farmers then, was transferred to the National Association of Breeders and Researchers (NABR) and incorporated into the database. This study used only data from animals raised exclusively on pasture. The (co)variance components were obtained using univariate (considering record as same trait in all states) and multiple-trait models, considering record from each state as a different trait. Estimates were obtained by Bayesian inference. The model for yearling weight included genetic fixed factor of contemporary groups and random animal genetic and residual effects. The genotype environment interaction was verified by genetic correlation (rg), where values below 0.80 indicated important interaction. Subsequently, the effect of interaction was verified on the selection considering a univariate or multiple-trait models. The direct heritability estimates of yearling weight in Mato Grosso (0.39±0.03) and Mato Grosso do Sul (0.37±0.02) were lower than Goiás (0.51±0.02), São Paulo (0.44±0.02) and Minas Gerais (0.41±0.04). The acrossstates estimates of genetic correlations were positive and moderate (0.67 to 0.75) between the states Goiás and Mato Grosso, Goias and Minas Gerais, São Paulo and Minas Gerais, and between Mato Grosso do Sul and Minas Gerais. These estimates indicates that genotype by environment interactions are biologically important. These results show that the animals selected will not be the same depending of the considered state, reducing the response... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Orientador: Lucia Galvão de Albuquerque / Banca: Danísio Prado Munari / Banca: Márcio Cinachi Pereira / Resumo: Os objetivos deste estudo foram estimar associações genéticas entre o perímetro escrotal obtido aos 9 (PE9), 12 (PE12) e 18 meses de idade (PE18) e características reprodutivas medidas diretamente em novilhas tais como: idade ao primeiro parto (IPP), ocorrência de prenhez aos 16 meses de idade (Pr16) e reconcepção de fêmeas primíparas (REC), utilizando inferência Bayesiana, com intuito de verificar a possibilidade de incluí-las como critérios de seleção em programas de melhoramento genético de bovinos de corte. Foram analisados 158.148 dados de animais da raça Nelore, nascidos entre 1990 e 2006 e pertencentes ao arquivo zootécnico da Agropecuária Jacarezinho Ltda., localizada no município de Valparaíso, São Paulo. Foram realizadas análises uni e bi-características. Em análises bicaracterísticas, as estimativas de herdabilidade foram iguais a 0,22±0,05; 0,39±0,09; 0,20±0,06; 0,20±0,01; 0,54±0,03 e 0,17±0,03 para PE9, PE12, PE18, IPP, Pr16 e REC, respectivamente. As correlações genéticas estimadas entre PE9 e IPP, Pr16 e REC foram de -0,48±0,13; 0,51±0,13 e 0,02±0,19, respectivamente. As correlações genéticas entre PE12 e IPP, Pr16 e REC foram de -0,41±0,12; 0,35±0,12 e -0,16±0,17, respectivamente. As correlações genéticas entre PE18 e IPP, Pr16 e REC foram de - 0,29±0,13; 0,28±0,14 e -0,03±0,18, respectivamente. Esses resultados sugerem que a seleção de animais com maior perímetro escrotal, principalmente aos 12 meses de idade deverá ocasionar maior ocorrência de prenhez aos 16 meses e menor idade ao primeiro parto em fêmeas da raça Nelore / Abstract: The objectives of this study were estimate genetic associations between scrotal circumference obtained at 9 (SC9),12 (SC12) and 18 months of age (SC18) and reproductive traits measured directly in heifers as: age at first calving (AFC) occurrence of pregnancy at 16 months of age (HP16) and heifers subsequent rebreeding (HSR), using Bayesian inference, in order to verify the possibility of including them as criteria for selection in breeding programs for beef cattle. It were analyzed 158,148 records from Nelore cattle, born between 1990 and 2006 and belonging to Agropecuária Jacarezinho Ltda., located in Valparaíso council, São Paulo state. Single and two-trait analyses were accomplished. In two-trait analysis, the heritability estimates were equal to 0.22 ± 0.05, 0.39 ± 0.09, 0.20 ± 0.06, 0.20 ± 0.01, 0.54 ± 0.03, and 0.17 ± 0.03 for SC9, SC12, SC18, AFC, HP16 and HSR, respectively. The genetic correlation between AFC and SC9, HP16 and HSR were -0.48±0,13, 0.51±0,13 and 0.02±0,19, respectively. Genetic correlations between SC12 and AFC, HP16 and REC were -0.41±0,12, 0.35±0,12 and - 0.16±0,17, respectively. Genetic correlations between SC18 and AFC, HP16 and HSR were -0.29±0,13, 0.28±0,14 and -0.03±0,18, respectively. These results suggest that selection of animals with larger scrotal circumference, especially at 12 months of age should result in a higher incidence of pregnancy at 16 months and a decrease in age at first calving in Nellore females / Mestre