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Avaliação da presença de biomarcador molecular de contaminação fecal hospedeiro específico em águas de recreação costeira no Estado do Rio de Janeiro / Evaluation the presence of molecular biomarkers of fecal contamination in specific host coastal recreation waters of the State of Rio de Janeiro

Oliveira, Samara Sant'Anna de January 2014 (has links)
Submitted by Alexandre Sousa (alexandre.sousa@incqs.fiocruz.br) on 2015-02-09T12:58:24Z No. of bitstreams: 1 Mestrado_Samara.pdf: 1104803 bytes, checksum: 5102dcd99cdbe779bd08ee1a5892c2a4 (MD5) / Approved for entry into archive by Alexandre Sousa (alexandre.sousa@incqs.fiocruz.br) on 2015-02-09T12:58:33Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Mestrado_Samara.pdf: 1104803 bytes, checksum: 5102dcd99cdbe779bd08ee1a5892c2a4 (MD5) / Approved for entry into archive by Alexandre Sousa (alexandre.sousa@incqs.fiocruz.br) on 2015-02-09T12:58:51Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Mestrado_Samara.pdf: 1104803 bytes, checksum: 5102dcd99cdbe779bd08ee1a5892c2a4 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-02-09T12:58:51Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Mestrado_Samara.pdf: 1104803 bytes, checksum: 5102dcd99cdbe779bd08ee1a5892c2a4 (MD5) Previous issue date: 2014 / Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde / Atualmente, indicadores bacteriológicos utilizados para avaliar a balneabilidade das águas de recreação estabelecidos em legislações, apresentam limitações como a correlação com seu hospedeiro. Uma variedade de micro-organismos anaeróbios vem sendo considerados alvos promissores no desenvolvimento de indicadores de poluição fecal hospedeiro-especifico. A espécie M. smithii é a única espécie conhecida que coloniza exclusivamente o trato gastrointestinal humano e é altamente prevalente em esgoto. Sendo assim, este projeto tem como objetivo avaliar a presença de M. smithii como bioindicador de contaminação fecal hospedeiro-especifico em águas de recreação costeira no estado do Rio de Janeiro. Para isso foram coletadas amostras de águas superficiais de13 praias (Ilha do governador (n=4), Copacabana (n=1), Leblon (n=2), Prainha (n=2), Ramos (1), Araruama (n=2), Niterói (n=1)) em seguida os parâmetros físico-químicos e as concentrações de coliformes termotolerantes foram determinados. Em seguida foi realizada a caracterização das comunidades de Methano brevibacterspp. através da construção de bibliotecas do gene rrsdo 16S rRNAea detecção e quantificação do M. smithii pela qPCR do gene nifH. Os parâmetros físico-químicos, apresentaram alterações significativas em relação a salinidade e condutividade. Quando analisados em relação a balneabilidade, somente as praias Seca, Pontinha e Ramos apresentaram-se como próprias para atividade recreativa. As análises das bibliotecas demonstraram a prevalência de M. smithiie de organismos não cultivados, muito provavelmente novas espécies do gênero Methano brevibacter ainda não descritas. A PCR convencional detectou M. smithii em 11 amostras, enquanto a qPCR detectou e quantificou cópias do gene nifHem12 amostras. A partir dos dados obtidos podemos concluir que as aplicações de novos indicadores na determinação da origem da contaminação das águas de recreação contribuem para uma avaliação mais precisa da qualidade das águas e consequentemente da saúde da pública. / Currently, bacteriological indicators used to assess bathing water recreation established in laws, have limitations such as the correlation with its host. A variety of anaerobic micro-organisms has been considered promising targets in the development of host-specific indicators of fecal pollution. The specie M. smithiiis the only known species that exclusively colonizes the human gastrointestinal tract and is highly prevalent in sewage. Thus, this project aims to assess the presence of M. smithii as bioindicator of host-specific fecal pollution in coastal recreation waters of Rio de Janeiro. For this surface water samples from 13 beaches (Ilha do Governador (n = 4), Copacabana (n = 1), Leblon (n = 2), Prainha (n = 2), Ramos (1), Araruama (n = 2), Niteroi (n = 1)) then the physico-chemical parameters and concentrations of fecal coliforms were determined. Then the characterization of communities Methanobrevibacterspp was performed. by constructing libraries rrs 16S rRNAe detection and quantification by qPCR of M. smithiinifH. The physico-chemical parameter settings showed significant changes in relation to salinity and conductivity. When analyzed for bathing, only Seca, Pontinha Ramos beaches and presented themselves as fitfor recreational activity. Analyses of libraries demonstrated the prevalence of M. smithii and uncultivated organisms, most likely new species of the genus Methanobrevibacter not yet described. Conventional PCR detected in M. smithii 11 samples, while qPCR detected and quantified copies of the nifH 12 samples. From the data obtained we can conclude that applications of new indicators in determining the source of contamination of water recreation contribute to a more accurate assessment of water quality and consequently the health of the public.

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