Made available in DSpace on 2014-06-11T19:33:32Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2008-12-17Bitstream added on 2014-06-13T20:05:37Z : No. of bitstreams: 1 pereira_mc_dr_jabo.pdf: 621440 bytes, checksum: 260b1b949ce4be72f4da602866530c0c (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A otimização da eficiência econômica dos rebanhos bovinos está diretamente relacionada à vida reprodutiva das matrizes. Assim, espera-se que o incremento na taxa de reconcepção de fêmeas primíparas leve a um aumento produtividade da pecuária de corte. O trabalho teve o objetivo de avaliar a reconcepção de fêmeas primíparas de um rebanho comercial da raça Nelore, utilizando inferência Bayesiana, modelo de sobrevivência e Método ℜ, com intuito de verificar a possibilidade de utilizar a característica como critério de seleção. Os registros analisados são provenientes de fêmeas da raça Nelore, nascidas entre 1984 e 2002, e pertencentes ao arquivo zootécnico da Agropecuária Jacarezinho Ltda., empresa que se dedica à bovinocultura de corte, localizada no noroeste do Estado de São Paulo, Brasil. As estimativas de herdabilidade foram iguais a 0,15; 0,18; e 0,07 utilizando inferência Bayesiana, modelo de sobrevivência e Método ℜ, respectivamente. De modo geral, os resultados indicaram dificuldade em se obter progresso genético para esta característica por meio de seleção. Entretanto, mesmo pequenos aumentos nos índices de reconcepção de novilhas podem contribuir para a eficiência econômica da atividade, dado os baixos índices descritos atualmente no cenário nacional. Modificações no ambiente em que as novilhas foram criadas podem elevar ou diminuir consideravelmente a taxa de reconcepção do rebanho. As estimativas de correlação genética entre a reconcepção de fêmeas primíparas e o peso ao sobreano e o perímetro escrotal foram -0,66 e -0,07, respectivamente. Assim, a seleção para peso ao sobreano poderá levar a uma diminuição na taxa de reconcepção de fêmeas primíparas da raça Nelore. A utilização do perímetro escrotal como critério de seleção em programas de melhoramento animal não causou mudanças genéticas na reconcepção de fêmeas primíparas. / The optimization of the economic efficiency of cattle herds is directly related to the reproductive life of dam. Thus, the increase in the heifer subsequent rebreeding rate will lead to greater productivity of the livestock production. The objective of this study was to evaluate the heifer subsequent rebreeding in a commercial herd of the Nelore cattle, using Bayesian inference, survival model and the Method ℜ, in order to verify the possibility of using this trait as selection criterion. The records analyzed are from Nelore cattle females, born between 1984 and 2002, belonging to Agropecuária Jacarezinho Ltda., a company which works with beef cattle and is located in the northwest of the State of São Paulo, Brazil. The estimates of heritability were 0.15, 0.18 and 0.07 when using Bayesian inference, the survival model and the Method ℜ, respectively. In general, these results indicate that it is difficult to obtain genetic progress by selection for this trait. However, small increases in the heifer subsequent rebreeding can contribute to the economic efficiency of the activity, given the low subsequent rebreeding rates in the national scene. Changes in the environment where the heifers were bred can considerably increase or decrease the subsequent rebreeding rates the herd. The genetic correlation between the heifer subsequent rebreeding and the yearling weight was -0.66. Thus, selection for yearling weight may reduce the rates of rebreeding subsequent of heifers in Nelore cattle. The genetic correlation between the heifers subsequent rebreeding and the scrotal circumference was - 0.07. The use of the scrotal circumference as criterion of selection in programs of animal improvement will not cause any genetic changes in the rebreeding subsequent of heifers.

Submitted by DANIELA BARRETO AMARAL TEIXEIRA null (danielabateixeira@hotmail.com) on 2016-07-09T12:26:08Z No. of bitstreams: 1 DissertaçãoDaniela.pdf: 1505420 bytes, checksum: b57087f798762d84c029781714eac7b5 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Paula Grisoto (grisotoana@reitoria.unesp.br) on 2016-07-12T16:54:26Z (GMT) No. of bitstreams: 1 teixeira_dba_me_jabo.pdf: 1505420 bytes, checksum: b57087f798762d84c029781714eac7b5 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-12T16:54:26Z (GMT). No. of bitstreams: 1 teixeira_dba_me_jabo.pdf: 1505420 bytes, checksum: b57087f798762d84c029781714eac7b5 (MD5) Previous issue date: 2016-06-20 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A habilidade de permanência (HP), que pode ser definida como a probabilidade de uma vaca parir numa determinada idade, dado que ela teve esta oportunidade, é uma característica reprodutiva de grande importância em bovinos de corte, estando diretamente relacionada à produtividade do rebanho. O objetivo deste trabalho foi estimar parâmetros genéticos e identificar possíveis regiões do genoma que estejam associadas com a expressão fenotípica da HP de vacas da raça Nelore. Os componentes de variância foram estimados por inferência bayesiana utilizando um modelo de limiar no qual foram considerados os efeitos sistemáticos de grupos de contemporâneos e precocidade sexual, e os efeitos aleatórios de animal e resíduo.Os efeitos dos SNPs foram estimados por meio da metodologia ssGBLUP, sendo utilizados na análise 2838 animais genotipados com o painel de alta densidade da Illumina (Bovine HD Assay Illumina, San Diego, CA, USA). A variância explicada por janelas formadas por 200 SNPs consecutivos foi utilizada na identificação das regiões de maior efeito sobre a expressão da característica HP. A herdabilidade encontrada utilizando a matriz A (pedigree) foi de 0,11±0,01 e utilizando a matriz H( matriz de parentesco que combina a informação de pedigree e dos SNPs) de 0,14±0,01. Foram encontrados 147 genes candidatos para a característica habilidade de permanência em regiões dos cromossomos 1, 2, 5, 6, 9, 20 e no cromossomo sexual X. Novas regiões candidatas para a característica habilidade de permanência foram detectadas e a maioria está relacionada a funções reprodutivas, imunológicas e ligadas ao sistema nervoso. / Stayability, which can be defined as the probability of a cow calving to a certain age since it has this opportunity, is a reproduction trait of great importance in beef cattle and is directly related to the productivity of the herd. The objective of this study was to estimate variance components through single-step G-BLUP methodology, and use the solutions of the SNPs effects to identify possible regions of the genome that are associated with the phenotypic expression of stayability in Nellore cows. The variance components were estimated by Bayesian inference using a threshold model in which were considered the fixed effects of precocity and contemporary groups, and the random effects of residue and animal. The effects of SNP were estimated by ssGBLUP methodology being used for the analysis 2838 animals genotyped with the Illumina panel of high density ( HD Assay Bovine Illumina, San Diego, CA , USA ). A Manhattan plot containing the variance explained by the windows formed by 200 SNPs consecutive was used to identify regions of greatest effect on the expression of stayability trait. The heritability found using the A matrix was 0.11 ± 0.01 and using the H matrix was 0.14 ± 0.01. 147 potential genes for stayability were found in regions of chromosomes 1,2,5,6,9,20 and sexual chromosome X. New candidate regions for stayability were detected and most of them are related to reproductive, immune and nervous system. / FAPESP: 2009/16118-5