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Filogeografia de Triatoma sordida (Stål, 1859) nas ecorregiões do cerrado, caatinga e chaco

Ribeiro, Carla Cristina Moreira January 2014 (has links)
Made available in DSpace on 2016-04-04T12:42:09Z (GMT). No. of bitstreams: 2 carla_ribeiro_ioc_mest_2014.pdf: 1991393 bytes, checksum: 9d95a62cabcb098791835cb30218c6b4 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2014 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Triatoma sordida é um triatomíneo nativo de regiões de clima tipicamente seco e de altas temperaturas. Apresenta ampla distribuição, ocorrendo no Brasil, Argentina, Paraguai e Bolívia. É um importante vetor secundário da doença de Chagas sendo frequentemente capturado em ecótopos artificiais próximos a habitações humanas, como galinheiros, currais e estábulos. Por ser uma espécie autóctone e apresentar populações silvestres e peridomésticas que podem ocasionalmente recolonizar áreas previamente tratadas, principalmente após a eliminação dos vetores de maior importância epidemiológica, estratégias tradicionais de controle vetorial, como o uso de inseticidas residuais, podem ser ineficazes para eliminação de T. sordida. Por estas razões, torna-se necessário o desenvolvimento de novas medidas de vigilância e controle destinadas especificamente a este vetor. Estudos moleculares têm demonstrado alta diversidade genética entre populações de T. sordida, sugerindo que esta espécie representa na verdade um complexo de espécies crípticas que podem apresentar diferenças quanto à relevância epidemiológica. Deste modo, para a elaboração e aplicação de melhores estratégias de controle contra esse vetor é fundamental que uma correta identificação taxonômica de T. sordida seja realizada, além da delimitação precisa de sua distribuição geográfica. Um estudo filogeográfico de espécimes de T. sordida coletados em nove localidades no Brasil e uma na Argentina foi realizado utilizando um fragmento de 510 pb do gene mitocondrial citocromo b (cyt b) As análises filogenéticas revelaram que as populações de T. sordida amostradas nesse estudo formam um grupo monofilético, filogeneticamente distinto de populações de T. sordida da Bolívia (T. sordida grupos 1 e 2). Interessantemente, análise das amostras de Rochedo em Mato Grosso do Sul sugerem a ocorrência de um processo recente de especiação. Resultados das análises populacionais revelaram baixos níveis de fluxo gênico entre as populações estudadas (valores de Fst entre 0,22 e 1,00). As sequências de cyt b das populações de T. sordida apresentaram baixa diversidade nucleotídica (valores de \03C0 entre 0,0000 e 0,0077) e 23 haplótipos foram detectados (três deles compartilhados entre diferentes localidades). A população identificada como Poxoréu/Formosa/Lontra apresentou valores negativos e significativos nos testes de neutralidade (ressaltando que o teste de Fu apresentou valor-p limítrofe) o que juntamente com os resultados obtidos a partir das análises de mismatch distribution e da rede de haplótipos, indicam expansão súbita e recente dessa população. Isto sugere que, possivelmente, a ecorregião do cerrado brasileiro seja o centro de origem e dispersão de T. sordida / Triatoma sordida is a triatomine species native to regions of typically dry weather and high temperatures. It presents a wide distribution, occurring in Brazil, Argentina, Paraguay and Bolivia. It is an important secondary vector for Chagas disease being often captured in artificial ecotopes close to human dwellings, such as chicken coops, corrals and stables. Because it is an autochthonous species with sylvatic and peridomestic populations that can occasionally recolonize previously treated areas (mainly after the elimina tion of vectors of greater epidemiological importance) traditional vector control strategies, such as the use of residual insecticides, may be ineffective against T. sordida . For these reasons, the development of new measures of surveillance and control in tended specifically for this vector are required. Molecular studies have shown high genetic diversity among T. sordida populations, suggesting that this species represents, actually, a cryptic species complex that may conceal units with differences in epid emiological relevance. Thereby, to elaborate better control strategies against this vector it is important to determine the taxonomic status of T. sordida populations and the limits of their geographic distribution. A phylogeographic study of T. sordida sp ecimens collected from nine locations in Brazil and one in Argentina was carried out using a fragment of 510pb of the mitochondrial gene cytochrome b (cyt b ). The phylogenetic analyses revealed that the T. sordida populations sampled consist in a monophyle tic group distinct of T. sordida populations of Bolivia ( T. sordida groups 1 and 2). Interestingly, the analysis of Mato Grosso do Sul samples suggests the occurrence of a recent speciation process. Results of population analyses revealed low levels of gen ic flow among the studied populations ( F st values between 0.22 and 1.00). Nucleotide diversity was low (π values between 0 and 0.0077) and twenty three haplotypes were detected (three of them shared among different locations). The population identified as Poxoréu/Formosa/Lontra showed negative and significant values in tests of neutrality (the Fu test gave borderline p - values), which along with the obtained results from mismatch distribution analysis and from the haplotype network, indicate a sudden and rec ent expansion of this population. This indicates that, possibly, the Brazilian cerrado ecoregion is the center of origin and dispersion of T. sordida .
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Avaliação e retificação da identificação específica de moluscos do gênero Biomphalaria PRESTON, 1910 do acervo da Coleção de Malacologia Médica (Fiocruz-CMM)

Silva, Cryslaine Aguiar January 2012 (has links)
Submitted by Nuzia Santos (nuzia@cpqrr.fiocruz.br) on 2012-08-17T13:05:38Z No. of bitstreams: 1 Dissertacao_Cryslaine Aguiar Silva[1].pdf: 4463723 bytes, checksum: 12a5258b0c98c7c52fdd0066ba8b4910 (MD5) / Made available in DSpace on 2012-08-17T13:05:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao_Cryslaine Aguiar Silva[1].pdf: 4463723 bytes, checksum: 12a5258b0c98c7c52fdd0066ba8b4910 (MD5) / As coleções biológicas constituem importante fonte de informações, propiciando conhecimento e desenvolvimento científico. A Coleção de Malacologia Médica (Fiocruz-CMM) do Centro de Pesquisas René Rachou, localizada no Laboratório de Helmintologia e Malacologia Médica (LHMM) conta atualmente com cerca de onze mil exemplares de moluscos de importância médica e veterinária, principalmente os do gênero Biomphalaria. Desde a década de 1990, o LHMM recebe moluscos de diversas regiões do Brasil e do exterior e utiliza caracteres morfológicos e/ou moleculares na identificação das espécies. Parte do acervo não foi identificada por técnicas moleculares e em 332 pontos de coleta os exemplares encontravam-se sem identificação. Assim, o objetivo do presente trabalho foi avaliar e retificar a identificação dos moluscos do gênero Biomphalaria presentes na Fiocruz- CMM. Para isso o acervo foi separado em dois grupos: grupo I: exemplares inseridos entre 1993 e 2002, com 620 pontos de coleta e 5.137 exemplares; grupo II: inseridos entre 2003 e 2009, com 464 pontos de coleta e 1.924 exemplares. A identificação específica dos exemplares do acervo foi realizada pela morfologia e/ou pela PCR-RFLP. Os resultados foram agrupados em seis categorias: 1) dados corretos; 2) equívocos (classificados como outra espécie); 3) adequações (espécie em sinonímia); 4) inconclusivos (mesma espécie com perfis moleculares diferentes), 5) material degradado e 6) exemplares identificados pela primeira vez (depositados sem identificação). No grupo I, 41,8% dos pontos de coleta os exemplares estavam com dados taxonômicos corretos; em 2,1% tinham equívocos; em 0,8% houve adequação; em 25,5% a identificação foi inconclusiva; em 1,9% estavam degradados impossibilitando a identificação e em 27,9% foram identificados pela primeira vez. No grupo II, 70,7% dos pontos de coleta os exemplares estavam com dados taxonômicos corretos; em 5,6% tinham equívocos; em 10,1% a identificação foi inconclusiva; em 5,4% os exemplares estavam degradados impossibilitando a identificação e em 8,2% foram identificados pela primeira vez. Os equívocos ocorreram entre: B. peregrina e B. tenagophila (35,8%), B.tenagophila e B. glabrata (20,5%), B. tenagophila e B. occidentalis (7,7%), B. peregrina e B.intermedia (5,2%), B. intermedia e B. straminea (5,2%), B. amazonica e B. cousini (5,1%), B.straminea e B. occidentalis (2,6%), B. straminea e B. oligoza (2,6%), B. prona e B. kuhniana (2,6%), B. tenagophila e B. t. guaibensis (2,6%), B. straminea e B. glabrata (2,6%), B. tenagophila e B. straminea (2,6%), B. peregrina e B. schrammi (2,6%), e B. peregrina e B. straminea (2,6%). A adequação foi em virtude de B. obstructa e B. temascalensis serem sinonímias de B. havanensis. Na categoria inconclusiva ficaram B. aff. straminea, B. tenagophila oriundas da Argentina e B. peregrina. Estes dados demonstram a importância da utilização de mais de uma técnica na identificação específica e da boa preservação dos exemplares do acervo. Estes dados foram utilizados para atualizar os livros de registro de recebimento de moluscos, livro de tombo e a base de dados do CRIA. Estudos taxonômicos serão realizados com as espécies da categoria inconclusivos. / The biological collections are an important source of information providing knowledge and scientific development. The Medical Malacology Collection (Fiocruz-CMM) of René Rachou Research Center located at the Laboratory of Medical Helminthology and Malacology (LHMM) has currently about eleven thousand specimens of molluscs of medical and veterinary importance, especially the genre Biomphalaria. Since 1990s, the LHMM receives molluscs from various regions of Brazil and abroad and utilizes morphological and/or molecular method for species’ identification. Part of the collection has not been identified by molecular techniques and 332 collection points were unidentified. Thus, o objective of this present study was assess and rectify the identification of the mollusks of genre Biomphalaria of the Fiocruz-CMM. For this the collection was separated into two groups: group I: specimens inserted between 1993 and 2002 with 620 collection points and 5.137 specimens; group II: inserted between 2003 and 2009, with 464 collection points and 1.924 specimens. The specific identification of specimens from the collection was performed by morphology and/or PCR-RFLP. The results were grouped into six categories: 1) correct data, 2) errors (classified as other species), 3) adjustments (species in synonymy), 4) inconclusive (same species with different molecular profiles) 5) degraded material and 6) sample identified to first time (deposited without identification). In group I, 41.8% of collection points were with correct taxonomic data, 2.1% had errors; 0.8% was adjustment; 25.5% the identification was inconclusive, 1.9% were degraded that was impossible to identify and 27.9% were first time identified. In group II, 70,7% of collection points the specimens were with correct taxonomic data; 5,6% had errors; 10.1% was inconclusive, 5.4% of specimens were degraded making it impossible to identification and 8.2% of specimens were first time identified. The errors has occurred between: B. peregrina and B. tenagophila (35,8%), B. tenagophila and B. glabrata (20.5%), B. tenagophila and B. occidentalis (7.7%), B. peregrina and B. intermedia (5.2%),B. intermedia and B. straminea (5.2%), B. amazonica and B. cousini (5.1%), B. straminea and B. occidentalis (2.6%), B. straminea and B. oligoza (2.6%), B. prona and B. kuhniana (2.6%), B. tenagophila and B. t. guaibensis (2.6%), B. straminea and B. glabrata (2.6%), B. tenagophila and B. straminea (2.6%), B. peregrina and B. schrammi (2.6%), and B. peregrina and B. straminea (2.6%). The adjustment was from B. obstructa and B. temascalensis are synonymy of B. havanensis. The inconclusive category was B. aff. straminea, B. tenagophila from Argentina and B. peregrina. These data demonstrate the importance of using more than one technique in taxonomic confirmation and the good preservation of specimens’ collection. These data was utilized to update the books receive mollusks and data of CRIA. The studies will continue in specimens of the inconclusive category.

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