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Participação da ORF XAC3629 na regulação do operon de resistência a cobre copAB em Xanthomonas citri subsp. citri /

Ucci, Amanda Piovesan. January 2009 (has links)
Orientador: Maria Célia Bertolini / Banca: Jesus Aparecido Ferro / Banca: Julio Cezar Franco de Oliveira / Resumo: Xanthomonas citri subsp. citri (Xcc) é uma bactéria Gram-negativa responsável pelo o cancro cítrico. A doença causada por este fitopatógeno constitui numa das mais graves doenças da citricultura brasileira, cujas medidas de controle capazes de eliminar completamente a doença são ineficientes até o momento. O sequenciamento e anotação do genoma de Xcc juntamente com estudos relacionados à genômica funcional nesta bactéria realizados em nosso laboratório mostraram a existência, na bactéria, de alguns genes (copA e copB) que codificam proteínas envolvidas com o mecanismo de resistência a cobre (CopA e CopB). Os genes que codificam ambas proteínas estão organizados em um operon, cuja transcrição é induzida por cobre e é específica ao metal. Componentes a base de cobre são comumente usados na agricultura como agentes microbicidas a fim de reduzir a severidade desta e também de outras doenças nas plantas. Contudo, a eficácia do cobre está sendo reduzida pelo aparecimento de linhagens de bactérias resistentes a este metal, portanto, estudos visando a compreensão dos mecanismos moleculares envolvidos na resistência a cobre em Xcc são de grande importância. Uma pequena ORF (XAC3629) que codifica uma proteína hipotética de 152 aminoácidos e que se localiza upstream aos genes copAB foi identificada. Neste trabalho foi estudado o papel da ORF na regulação do operon copAB. Linhagens mutantes contendo a ORF XAC3629 interrompida por um transposon (XAC3629::Tn), previamente construídas no laboratório, foram avaliadas em relação ao crescimento em meio contendo diferentes concentrações de cobre. Estas linhagens mostraram perda da resistência quando o metal foi adicionado ao meio, mesmo em baixas concentrações (0,25 mM), sugerindo seu envolvimento na regulação do operon de resistência a cobre copAB. Células da linhagem selvagem ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Xanthomonas citri subsp. citri (Xcc) is a Gram-negative bacterium that causes citrus canker, one of the most serious diseases in Brazilian crops, and the ways to eliminate it are not efficient. After sequencing and annotation of the Xcc genome our laboratory started to perform functional genomic studies in Xcc. Previous studies identified two genes (copA and copB) that encode proteins involved in the copper resistance mechanism (CopA and CopB). The genes are organized in an operon whose transcription is induced and specific to copper. Copper compounds are commonly used in agriculture in order to control plant diseases, however the copper effectiveness is being reduced due to the emergence of copper resistant bacteria strains. Therefore, studies related to copper resistance mechanism in Xcc are very relevant. A short ORF (XAC3629) which encodes an 152 amino acids hypothetical protein was identified upstream the operon copAB. In this work the role of the ORF in the operon regulation was studied. Mutant strains containing the ORF XAC3629 interrupetd by a transposon (XAC3629::Tn) were previously constructed in our laboratory and in this work their growth were evaluated in a medium containing different copper concentration. The mutant strains were unable to grow when the metal was added to the medium, even at low concentration (0.25 mM) suggesting that the ORF XAC3629 may have a role in regulating the operon copAB. Wild type Xcc cells are able to grow up to 1 mM copper concentration. Attempts to construct an ORF XAC3629 knocked out strain were performed but this mutant strain was not obtained. Two XAC3629::Tn mutants strains were transformed with a plasmid construction containing the ORF XAC3629 entire sequence plus its flanking regions. The results did not show functional complementation (recovery of the copper resistance when cells were grown in medium containing ... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

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