Ce mémoire s'insère dans le cadre d'un programme de recherche visant à identifier des loci génétiques jouant un rôle dans le développement des maladies inflammatoires de l'intestin. Le principal objectif de notre étude est de mieux comprendre la composante génétique dans l'étiologie des maladies inflammatoires de l'intestin. Ceci sera fait à l'aide de la reconstitution et de l'analyse des généalogies ascendantes d'individus atteints et non atteints, recrutés dans la population du Saguenay-Lac-Saint-Jean. Notre cohorte est composée de 49 personnes, dont 23 ont la colite ulcéreuse et 26 la maladie de Crohn. Le groupe témoin, est composé de 49 personnes. Nos analyses montrent des coefficients d'apparentement plus élevés chez les proposants non-fumeurs et chez ceux ayant la colite ulcéreuse. Les coefficients de consanguinité sont aussi plus élevés chez les proposants ayant une histoire familiale de maladies inflammatoires de l'intestin et chez ceux qui présentent des manifestations extra-intestinales. Finalement, cette étude nous permet de conclure qu'il y a probablement un facteur génétique dans les maladies inflammatoires de l'intestin et que ce facteur pourrait avoir des composantes récessives et dominantes.

L'asthme est reconnu comme étant l'une des maladies chroniques les plus répandues dans l'enfance et sa prévalence dans la population générale est de 5 à 10%. On le définit comme étant une maladie complexe, c'est-à-dire sous l'influence de facteurs environnementaux, ainsi que de nombreux gènes, chacun ayant une contribution variable pour chaque individu. Des groupes de chercheurs ont amorcé des études génétiques au sein de plusieurs groupes ethniques afin de documenter les bases moléculaires des différentes formes d'asthme. Ce mémoire s'inscrit dans une vaste étude qui tente d'identifier les gènes de prédisposition à l'asthme au sein d'une population à effet fondateur. Quatre polymorphismes des gènes de FceRI-B, PPAR-a et PPAR-y, identifiés lors d'études antérieures, ont été évalués dans la population du Saguenay-Lac-Saint-Jean ainsi que pour une cohorte familiale de la région métropolitaine de Québec, en fonction du phénotype asthme. Les résultats obtenus à l'aide du test de déséquilibre de liaison (TDT test) ont montré qu'il n'y a aucune association entre le variant E237G-FceRI-P et l'asthme et les conditions reliées à l'asthme. Aucun participant à l'étude ne possédait le variant I181L-FceRI-p. Cette étude a permis de démontrer que la transmission combinée des variants L162V-PPAR-a et P12A-PPAR-y semble présenter un effet protecteur en ce qui concerne l'atopie. Cette observation n'a toutefois pas été confirmée au sein de la cohorte familiale originaire du Québec métropolitain.

Ce mémoire s'inscrit au sein d'une étude génétique de l'asthme dans la population du Saguenay. L'objectif principal de ce travail est de vérifier si les familles avec une histoire familiale d'asthme et des sous-groupes d'asthmatiques atteints des conditions respiratoires reliées à l'asthme présentent des caractéristiques particulières du point de vue de la consanguinité et de l'apparentement et de vérifier la présence d'ancêtres spécifiques aux familles présentant cette maladie. Les reconstitutions généalogiques ont révélé des niveaux de consanguinité et d'apparentement moins élevés chez les cas que chez les groupes témoins. Parmi les cas, on a cependant trouvé un apparentement et une consanguinité plus élevés dans le sous-groupe des individus atteints d'hyperréactivité bronchique que dans les autres sous-groupes. L'analyse du recouvrement et de la contribution génétique a montré l'absence d'ancêtres communs spécifiques aux familles d'asthmatiques au Saguenay.

L'asthme est un syndrome clinique caractérisé par une augmentation de la réponse de la trachée et des bronches à un ensemble de stimuli. Cette maladie est reconnue comme étant un trait complexe et sa prévalence se situe entre 6 et 12% dans la population générale. Ce mémoire s'inscrit dans un vaste projet de recherche sur l'asthme qui vise à identifier certains gènes de prédisposition à l'asthme. Son objectif est de quantifier l'impact de divers facteurs environnementaux dans l'expression clinique de l'asthme ainsi que de vérifier si les effets de ces facteurs sont les mêmes au sein de deux populations provenant de différentes régions du Québec, soit la région métropolitaine de Québec et le Saguenay-Lac-St-Jean (SLSJ). Certaines différences ont été observées entre les cohortes au niveau de la sensibilisation aux animaux domestiques dont la fréquence est plus élevée chez les individus asthmatiques du SLSJ que chez ceux de la région de Québec (respectivement 81% (n = 172) et 52% (n = 94), p < 0,001). D'après une régression logistique effectuée sur les données, la présence de l'asthme au sein des deux cohortes semble liée à une histoire personnelle d'infections respiratoires. De plus, au SLSJ, l'asthme est principalement associé à la sensibilisation aux allergènes extérieurs et aux antécédents personnels d'eczéma tandis que pour la cohorte de Québec, l'exposition aux allergènes intérieurs et les antécédents personnels d'urticaire seraient les facteurs déterminants. Les résultats d'une analyse de variance ont également démontré que la sensibilisation aux allergènes extérieurs, les antécédents personnels d'infections respiratoires et la région d'origine des individus avaient un effet significatif sur le phénotype.

Cette recherche porte sur une étude généalogique de la schizophrénie (30 cas) et de la psychose maniaco-dépressive (12 cas) dans la région de la Beauce (Québec). Les généalogies ont été reconstruites à l'aide du fichier BALSAC de l'Institut interuniversitaire de recherches sur les populations. L'analyse des composantes généalogiques nous a permis de constater que ces deux maladies partageraient un certain bagage génétique. Dans la schizophrénie il y aurait possiblement un facteur génétique qui serait plus de l'ordre de la dominance. Dans le cas de la psychose maniacodépressive, comme la consanguinité est plus forte et l'apparentement est plus éloigné, les éléments génétiques seraient plus de l'ordre de la récessivité.

Dans cette étude, l'approche du génotype mesuré a été utilisée afin de déterminer si le polymorphisme de l'apolipoprotéine (apo) E influençait les relations existant entre le profil lipidique et l'obésité, d'une part, ainsi que la distribution de la graisse corporelle, d'autre part, mesurées respectivement par l'indice de masse corporelle et le rapport des circonférences de la taille et des hanches. De plus, cette approche a permis de déterminer si le polymorphisme de l'apo E influençait la covariation entre les lipides et les lipoprotéines, et s'il y avait interaction génotype-environnement en utilisant le tabagisme comme facteur environnemental. Les analyses ont été faites sur un échantillon de 233 hommes et 202 femmes d'une population Caucasienne du Lac-Saint-Jean, Chibougamau et Chapais. Les résultats obtenus ont montré que les relations entre le profil lipidique (cholestérol total (CHOL), cholestérol associé aux lipoprotéines de faible densité (LDL-C), cholestérol associé aux lipoprotéines de densité élevée (HDL-C), triglycérides) et l'indice de masse corporelle, ainsi que la distribution de la graisse corporelle, n'étaient pas influencées par le polymorphisme de l'apo E et ce, autant chez l'homme que chez la femme. Cependant, chez les hommes, les corrélations entre le cholestérol et le HDL-C, le cholestérol et les triglycérides, le LDL-C et le HDL-C et le LDL-C et les triglycérides, étaient influencées par le polymorphisme de l'apo E. Pour toutes ces corrélations, les individus de la classe phénotypique E2 (E2/E2, E3/E2) présentaient les corrélations les plus élevées, comparativement aux individus des classes E3 (E3/E3) etE4 (E4/E4, E4/E3), dont les corrélations étaient faibles et dans certains cas, non significativement différentes de zéro. En ce qui concerne la détermination de l'interaction génotype-environnement, les analyses ont révélé que les effets de la cigarette sur les niveaux lipidiques, autant chez l'homme que chez la femme, n'étaient pas influencés par le polymorphisme de l'apo E.

Le gène de 1'apolipoprotéine E qui est polymorphique, est directement impliqué dans la régulation du métabolisme des lipides. La fréquence de ses trois allèles a été mesurée dans plusieurs populations et différentes études ont montré que le polymorphisme de l'apo E exerçait une influence sur les concentrations de lipides, de lipoprotéines et d'apolipoprotéines dans les populations, l'allèle £2 ayant pour effet d'abaisser les niveaux de cholestérol total (Chol) et de cholestérol associé aux lipoprotéines de faible densité (LDLC), tandis que l'allèle £4 exerce un effet contraire. Vu l'importance de cet effet sur les niveaux lipidiques, l'hypothèse a été émise que la variation génétique au sein des apolipoprotéines pouvait être un déterminant majeur du risque de MCV. Dans le but de déterminer les effets du polymorphisme de l'apolipoprotéine E (apo E) sur le profil lipidique de la population du Lac St-Jean-Chibougamau, les phénotypes de l'apo E ainsi que les concentrations plasmatiques de cholestérol total (Chol), de cholestérol associé aux lipoprotéines de faible densité (LDL-C) et de haute densité (HDL-C) et de triglycérides (TG) ont été déterminés chez 435 personnes âgées de 18 à 74 ans. Les fréquences des allèles £2, £3 et £4 dans cette population, ont été estimées à 0.137, 0.749 et 0.1-14, respectivement. Pour les fins de l'analyse, l'échantillon a été subdivisé en trois sous-groupes: les hommes, les femmes pré-ménopausées et les femmes ménopausées. Après ajustement des données pour les effets de l'âge, du poids, de la taille, du ratio taille/hanche (WHR) et de l'indice de masse corporelle (BMI) dans chacun des sous-groupes, l'ANOVA a permis de mettre en évidence des différences significatives entre les groupes phénotypiques Apo E2 (E2/E2 et E3/E2), Apo E3 (E3/E3) et Apo E4 (E4/E3 et E4/E4) pour toutes les variables lipidiques chez les hommes et pour le CHOL et le LDL-C chez les femmes. À la fréquence plus élevée de l'allèle £2 était également associée des concentrations plus élevées de TG chez les hommes et les femmes ménopausées. La subdivision de l'échantillon en 4 districts (Alma, Dolbeau, Roberval et Chibougamau) a révélé des différences dans les fréquences de l'apo E entre les districts, particulièrement au niveau de la fréquence de l'allèle £2. Dans le district de Chibougamau, celle-ci était significativement plus élevée que celle des trois autres districts réunis (Aima, Dolbeau, Roberval). Malgré des différences importantes dans les fréquences des allèles de l'apo E entre les districts, l'analyse de la variance à deux facteurs (Apo E et districts) n'a pas permis de révéler de différence significative dans les concentrations des variables lipidiques entre les districts concernés. A l'exception d'une fréquence plus élevée de l'allèle £2 associée à une augmentation des niveaux de triglycérides, ces résultats sont similaires à ceux observés dans d'autres populations caucasiennes

Cette étude porte sur 177 individus décédés ayant un diagnostic confirmé de dystrophie myotonique (DM). Ces derniers -Lac-Saint-Jean (SLSJ) et/ou de la clinique des maladies neuromusculaires de cette région. L'âge moyen au décès est de 51,3 ans sans différence significative entre les hommes et les femmes. Une progression du nombre de décès en fonction de l'atteinte musculaire est démontrée dans cette étude. L'âge moyen d'apparition des symptômes de la DM a été estimé à 29,8 ans pour 30 individus et la durée moyenne de leur maladie a été de 13,7 ans. Quarante-quatre causes différentes de décès ont été compilées dans cette étude. Regroupées en 9 catégories de mortalité, elles portent principalement sur les causes inconnues de décès (60 cas), les causes pulmonaires (60 cas) et les causes cardiaques (26 cas). Trois municipalités du SLSJ enregistrent une surmortalité des personnes atteintes par rapport à leur population globale; il s'agit entre autres de Chicoutimi et de Jonquière.

Ce mémoire étudie les aspects cliniques, épidémiologiques et génétiques des enfants atteints de la mucolipidose de type II (ML-II) au Saguenay-Lac-Saint-Jean (SLSJ). Le phénotype caractéristique consiste en la présence d'une hypertrophie des gencives, un faciès grossier et/ou vieillot, une altération osseuse et un retard staturo-pondéral. Le décès survient la plupart du temps avant l'âge de 5 ans. Ces signes cliniques ont été retrouvés chez la majorité des enfants du SLSJ. L'incidence estimée de la ML-II au SLSJ s'élève à 1/2.613 naissances et le taux de porteurs à 1/51. La distribution spatiale des malades et des porteurs dans le nord-est du Québec montre une accumulation de cas au SLSJ; la majorité des cas étant nés à Chicoutimi. L'exogamie et l'endogamie ne présentent pas de différence significative entre le groupe malade et les groupes témoins. Le coefficient moyen de consanguinité pour les enfants atteints et dont les parents sont mariés au SLSJ est 2 fois plus élevé que la moyenne des groupes témoins. Il n'a pas de différence entre le coefficient moyen de parenté du groupe cible et la moyenne des coefficients moyens des groupes témoins. La recherche d'un effet fondateur de la ML-II dans le nord-est du Québec a permis d'identifier 34 ancêtres communs dont 33 originaires d'Europe au 17ème siècle, ce qui laisse supposer que le gène de la ML-II a été amené par immigration.

Le syndrome de Zellweger (syndrome cérébro-hépato-rénal) est une maladie autosomale récessive rare. Dans la région du Saguenay-Lac-St-Jean cette maladie a une incidence particulièrement élevée; en effet depuis 1971 huit cas furent répertoriés, ce qui est de quatre à cinq fois supérieur à l'incidence mondiale. Le phénotype rencontré dans cette région est très semblable à celui décrit dans la littérature. La distribution spatiale des lieux d'origine des parents et des enfants a montré qu'ils étaient presque tous originaires de la région. On a calculé le coefficient moyen de consanguinité qui s'est avéré nul pour les patients et les témoins. Le coefficient de parenté par contre est plus élevé pour les cas que pour les témoins ce qui suggère que le gène est fréquent dans cette population. La cystinose est une autre maladie autosomale récessive rare qui a au Saguenay-Lac-St-Jean une incidence dix fois supérieure à l'incidence mondiale. Les signes cliniques associés à la cystinose au Saguenay-Lac-St-Jean sont semblables à ceux décrits dans d'autres populations, à l'exception éventuellement d'une atteinte ophtalmique moins sévère. L'étude de la consanguinité et de la parenté a permis de montrer que le gène est fréquent dans cette population. L'étude de la parenté ainsi que les recherches généalogiques effectuées suggèrent que la présence de cette maladie au Saguenay-Lac-St-Jean est due à un effet fondateur.