Thesis (Ph. D.)--University of Wisconsin--Madison, 1961. / Typescript. Vita. eContent provider-neutral record in process. Description based on print version record. Includes bibliographical references (leaves [35]-39).

Thesis (M.S.)--University of Wisconsin--Madison, 1983. / Typescript. eContent provider-neutral record in process. Description based on print version record. Includes bibliographical references (leaves 40-44).

Essen, Universiẗat, Diss., 2000.

Thesis (M.S.) in Zoology--University of Maine, 2006. / Includes vita. Includes bibliographical references (leaves 80-84).

Proefschrift Universiteit van Amsterdam. / Met samenvatting in het Nederlands.

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O estudo da interação entre os indivíduos de uma mesma espécie ou de espécies diferentes é essencial para o entendimento das dinâmicas envolvidas na manutenção das comunidades ou assembléias na natureza. Assim, o estudo das preferências alimentares das larvas dos drosofilídeos, refletidas no padrão de emergência das mesmas dos sítios de oviposição, é de suma importância, uma vez que este grupo de organismos tornou-se um excelente modelo para o estudo de padrões ecológicos. Assim, esta tese busca identificar como as larvas de espécies de Drosophilidae se relacionam na utilização dos recursos tróficos, identificando quais os principais fatores que podem estar atuando na manutenção da diversidade de espécies de suas assembléias em áreas de Mata Atlântica e urbanas de Florianópolis (SC). Realizamos coletas de frutos em onze localidades do Estado de Santa Catarina, onde montamos uma listagem das espécies vegetais hospedeiras utilizadas como sítio de oviposição e das espécies de Drosophilidae que as utilizam. Observamos que as espécies de Drosophilidae colonizam os ambientes urbanos estudados, mas há uma perda de diversidade de espécies, evidenciada pela ausência de espécies raras nestas amostras. Ainda, as espécies de Drosophilidae coletadas apresentaram um caráter generalista quanto à utilização dos recursos tróficos, onde, nas assembléias de Mata Atlântica, verificou-se a formação de grupos ecológicos funcionais. Este tipo de organização não foi observado nas assembléias urbanas, onde há uma grande sobreposição dos nichos e uma menor diversidade de espécies. Além dos frutos, foram coletados também corpos de frutificação de fungos a fim de verificarmos as espécies de Drosophilidae emergentes dos mesmos. Dentre as espécies de moscas emergentes estão as dos gêneros Drosophila, Hirtodrosophila, Mycodrosophila e Leucophenga. Cabe ressaltar que as espécies neotropicais da radiação immigrans-tripunctata (gênero Drosophila) possuem a capacidade de colonizar fungos em ambientes preservados e alterados do bioma Mata Atlântica. Em outro estudo, buscamos verificar como a limitação de recursos alimentares para as larvas de drosofilídes pode influenciar a interação competitiva entre as mesmas. Para tal, foram coletados frutos de Buchenavia tomentosa (Combretaceae) e submetidos a dois tratamentos, um deles com uma suplementação alimentar. Assim, obtivemos evidências de que há restrições alimentares ou nutricionais em recursos naturais, que aumentam a interação competitiva entre espécies da família Drosophilidae. Entretanto, estas espécies possuem diferentes respostas à esta limitação, e o aumento da competição interespecífica parece ser maior que da intraespecífica. Finalmente, foi realizada uma revisão da ocorrência das espécies de Drosophilidae no Brasil, onde foram levantadas 304 espécies coletadas em nosso território. A maioria dos registros é de espécies do gênero Drosophila, o mais bem estudado da família. Os estados mais bem amostrados até o momento são São Paulo, Rio de Janeiro, Rio Grande do Sul e Santa Catarina, além do Distrito Federal, onde há grupos de pesquisa enfocando a ecologia e taxonomia das espécies de Drosophilidae. Esta revisão auxiliou na avaliação dos objetivos anteriores, contribuindo com um panorama do conhecimento e distribuição desta moscas no Brasil. / The study of the interaction among the individuals of a same species or of different ones is essential for the understanding of the dynamics involved in the communities or assemblies maintenance in nature. Thus, the study of the alimentary preferences of the drosophilids larvae, evidenciated by their emergency pattern of the breeding sites, is of highest importance once that this group of organisms became an excellent model for the study of ecological patterns. So, this thesis aimed to identify how the larvae of the Drosophilidae species use the trophic resources, identifying the main factors that can be acting in the maintenancement of the species diversity of assemblies in areas of Atlantic Rain Forest and urbanized of Florianópolis (SC). We collected fruits in eleven locations of the State of Santa Catarina, and we listed the vegetable host species used as breeding sites and the Drosophilidae species emerged of them. We observed that the Drosophilidae species colonize the studied urban environments, but there is a loss of species diversity, evidenced by the absence of rare species in these samples. Although, the collected Drosophilidae species presented a generalist character for the use of the trophic resources, where, the formation of functional ecological groups was verified in the assemblies of Atlantic Rain Forest. This kind of organization was not observed in the urban assemblies, where there are a high niche overlap and lower species diversity. Besides fruits collections, were carried out collections of fungi bodies of fructification in order to verify their emerging Drosophilidae species. Among the emerging fly species are the ones of the Drosophila, Hirtodrosophila, Mycodrosophila and Leucophenga genera. It to be useful to emphasize that the Neotropical species of the immigrans-tripunctata radiation (Drosophila genus) have capacity to colonize mushrooms in preserved Atlantic Rain Forest and antropic environments. In another study, we search for how the limitation in trophic resources for drosophilid larvae could influence the competitive interaction among them. For such, fruits of Buchenavia tomentosa (Combretaceae) were collected and submitted to two treatments, one of them with an alimentary supply. Thereby, we obtained evidences that there are alimentary or nutritional restrictions in natural resources, which increase the competitive interaction among species of the family Drosophilidae. However, these species have different answers to this limitation, and the increase of the interspecific competition seems to be larger than of the intraspecific. Finally, a revision of the occurrence of the Drosophilidae species in Brazil was accomplished, where were found 304 species recorded in our territory. Most of the records is of species of the Drosophila genus, the best studied of the family. The better evalueted states until the moment are São Paulo, Rio de Janeiro, Rio Grande do Sul and Santa Catarina, besides Distrito Federal, where there are research groups focusing the ecology and taxonomy of the Drosophilidae species. This revision helped us in the evaluation of the previous objectives, contributing with a panorama of the knowledge and distribution of these flies in Brazil.

A descoberta dos elementos genéticos móveis na década de 40 representa a formação de um novo paradigma no campo da genética, onde existe a formação de uma abordagem dinâmica à interpretação do genoma de organismos eucarióticos e procarióticos. A presença de elementos de transposição em praticamente todos os seres vivos indica a sua origem ancestral e indica a importância dos processos de transposição como mecanismo evolutivo. Apesar de em muitos casos os elementos de transposição apresentarem-se como agentes de processos deletérios, sua atividade também está ligada a diversos eventos adaptativos incluindo a formação de novos genes, regulação gênica e constituição estrutural do genoma. Com o recente desenvolvimento de novas tecnologias de sequenciamento, que possibilitaram a expansão massiva do número de genomas completos sequenciados, acumulou-se um grande número de dados de sequência que permitem a comparação direta entre diferentes genomas e assim a realização de análises específicas em larga escala sobre a evolução dos elementos de transposição. Este trabalho utilizou 12 genomas completos de espécies de Drosophila para comparações em larga escala entre genes e transposons, analisando diferentes variáveis evolutivas. Através dessas comparações foi possível identificar padrões específicos de sequências de elementos de transposição em relação às sequências gênicas do genoma hospedeiro. Especificamente, um grande número de sequências de elementos de transposição apresentam valores de Ks significantemente inferiores aos valores de Ks encontrados em sequências gênicas, ao mesmo tempo que apresentam alta similaridade da sequência de DNA. Contudo, em média a sequência de proteína destas mesmas sequências tende a possuir similaridade menor que as sequências gênicas da respectiva comparação. É possível distinguir dois tipos de padrão evolutivo nas sequências de elementos de transposição, o primeiro relacionado a sequências com alta similaridade, baixo valor de Ks e Ka. Tais sequências são provavelmente derivadas de eventos de transposição recente. Um segundo padrão é caracterizado por sequências com alta similaridade, baixo valor de Ks e valor de Ka superior ao encontrado no genoma, gerando sequências com grande valor de Ka/Ks, mas fortemente conservadas, indicando uma possível seleção positiva em sequências de elementos de transposição sujeitos a recente transferência horizontal. / The discovery of transposable elements in the 1940s represents the constitution of a new paradigm in the field of genetics, where is consolidated a new and dynamic interpretation of eukaryotic and prokaryotic genomes. The existence of transposable elements as ancestral components of the genome, indicates the importance of transposition processes as evolutionary mechanisms. Although transposable elements could cause a range of deleterious effects in the host, its activity is also connected to a broad number of adaptative events, including the constitution of new genes, gene regulation and the structural integrity of the genome. With the recent development of new sequencing technologies and massive increase in the number of complete sequenced genomes a new opportunity window was created for the large scale evolutionary analysis of transposable elements in different species. This work analysed 12 complete genomes of Drosophila to conduct large scale comparative analysis between transposable elements and nuclear genes, analysing a number of different variables. Trought this comparisons was possible to identify specific evolutionary patterns of transposable elements and Drosophila nuclear genes. A great number of transposition element sequences presented Ks values significantly lower than the Ks value found for nuclear gene sequences, also presenting a high DNA sequence similarity in relation to the genome sequences. However, the average protein sequence similarity of the transposable element sequences is lower than the nuclear genes protein sequence in the same comparison. It is possible to identify two evolutionary patterns in the transposable element sequences. The first one is characterized by sequences with high similarity and low Ks and Ka values. This sequences are probably subject of a recent horizontal transfer event. The second pattern is characterized by sequences with high similarity, low Ks values and Ka values above the average genome nuclear gene sequences Ka values, producing high values of Ka/Ks. Those second pattern sequences are highly conserved, although with a high Ka/Ks value, probably indicating positive selection over transposable element sequences subject to horizontal transfer.

O estudo da interação entre os indivíduos de uma mesma espécie ou de espécies diferentes é essencial para o entendimento das dinâmicas envolvidas na manutenção das comunidades ou assembléias na natureza. Assim, o estudo das preferências alimentares das larvas dos drosofilídeos, refletidas no padrão de emergência das mesmas dos sítios de oviposição, é de suma importância, uma vez que este grupo de organismos tornou-se um excelente modelo para o estudo de padrões ecológicos. Assim, esta tese busca identificar como as larvas de espécies de Drosophilidae se relacionam na utilização dos recursos tróficos, identificando quais os principais fatores que podem estar atuando na manutenção da diversidade de espécies de suas assembléias em áreas de Mata Atlântica e urbanas de Florianópolis (SC). Realizamos coletas de frutos em onze localidades do Estado de Santa Catarina, onde montamos uma listagem das espécies vegetais hospedeiras utilizadas como sítio de oviposição e das espécies de Drosophilidae que as utilizam. Observamos que as espécies de Drosophilidae colonizam os ambientes urbanos estudados, mas há uma perda de diversidade de espécies, evidenciada pela ausência de espécies raras nestas amostras. Ainda, as espécies de Drosophilidae coletadas apresentaram um caráter generalista quanto à utilização dos recursos tróficos, onde, nas assembléias de Mata Atlântica, verificou-se a formação de grupos ecológicos funcionais. Este tipo de organização não foi observado nas assembléias urbanas, onde há uma grande sobreposição dos nichos e uma menor diversidade de espécies. Além dos frutos, foram coletados também corpos de frutificação de fungos a fim de verificarmos as espécies de Drosophilidae emergentes dos mesmos. Dentre as espécies de moscas emergentes estão as dos gêneros Drosophila, Hirtodrosophila, Mycodrosophila e Leucophenga. Cabe ressaltar que as espécies neotropicais da radiação immigrans-tripunctata (gênero Drosophila) possuem a capacidade de colonizar fungos em ambientes preservados e alterados do bioma Mata Atlântica. Em outro estudo, buscamos verificar como a limitação de recursos alimentares para as larvas de drosofilídes pode influenciar a interação competitiva entre as mesmas. Para tal, foram coletados frutos de Buchenavia tomentosa (Combretaceae) e submetidos a dois tratamentos, um deles com uma suplementação alimentar. Assim, obtivemos evidências de que há restrições alimentares ou nutricionais em recursos naturais, que aumentam a interação competitiva entre espécies da família Drosophilidae. Entretanto, estas espécies possuem diferentes respostas à esta limitação, e o aumento da competição interespecífica parece ser maior que da intraespecífica. Finalmente, foi realizada uma revisão da ocorrência das espécies de Drosophilidae no Brasil, onde foram levantadas 304 espécies coletadas em nosso território. A maioria dos registros é de espécies do gênero Drosophila, o mais bem estudado da família. Os estados mais bem amostrados até o momento são São Paulo, Rio de Janeiro, Rio Grande do Sul e Santa Catarina, além do Distrito Federal, onde há grupos de pesquisa enfocando a ecologia e taxonomia das espécies de Drosophilidae. Esta revisão auxiliou na avaliação dos objetivos anteriores, contribuindo com um panorama do conhecimento e distribuição desta moscas no Brasil. / The study of the interaction among the individuals of a same species or of different ones is essential for the understanding of the dynamics involved in the communities or assemblies maintenance in nature. Thus, the study of the alimentary preferences of the drosophilids larvae, evidenciated by their emergency pattern of the breeding sites, is of highest importance once that this group of organisms became an excellent model for the study of ecological patterns. So, this thesis aimed to identify how the larvae of the Drosophilidae species use the trophic resources, identifying the main factors that can be acting in the maintenancement of the species diversity of assemblies in areas of Atlantic Rain Forest and urbanized of Florianópolis (SC). We collected fruits in eleven locations of the State of Santa Catarina, and we listed the vegetable host species used as breeding sites and the Drosophilidae species emerged of them. We observed that the Drosophilidae species colonize the studied urban environments, but there is a loss of species diversity, evidenced by the absence of rare species in these samples. Although, the collected Drosophilidae species presented a generalist character for the use of the trophic resources, where, the formation of functional ecological groups was verified in the assemblies of Atlantic Rain Forest. This kind of organization was not observed in the urban assemblies, where there are a high niche overlap and lower species diversity. Besides fruits collections, were carried out collections of fungi bodies of fructification in order to verify their emerging Drosophilidae species. Among the emerging fly species are the ones of the Drosophila, Hirtodrosophila, Mycodrosophila and Leucophenga genera. It to be useful to emphasize that the Neotropical species of the immigrans-tripunctata radiation (Drosophila genus) have capacity to colonize mushrooms in preserved Atlantic Rain Forest and antropic environments. In another study, we search for how the limitation in trophic resources for drosophilid larvae could influence the competitive interaction among them. For such, fruits of Buchenavia tomentosa (Combretaceae) were collected and submitted to two treatments, one of them with an alimentary supply. Thereby, we obtained evidences that there are alimentary or nutritional restrictions in natural resources, which increase the competitive interaction among species of the family Drosophilidae. However, these species have different answers to this limitation, and the increase of the interspecific competition seems to be larger than of the intraspecific. Finally, a revision of the occurrence of the Drosophilidae species in Brazil was accomplished, where were found 304 species recorded in our territory. Most of the records is of species of the Drosophila genus, the best studied of the family. The better evalueted states until the moment are São Paulo, Rio de Janeiro, Rio Grande do Sul and Santa Catarina, besides Distrito Federal, where there are research groups focusing the ecology and taxonomy of the Drosophilidae species. This revision helped us in the evaluation of the previous objectives, contributing with a panorama of the knowledge and distribution of these flies in Brazil.