Programų apsaugą yra svarbus šių dienų klausimas. 2009 metais pasaulyje buvo užfksuotas 43% piratavimo lygis, o Rytų Europoje 64% lygis. Vienas iš būdų apsaugoti programas nuo neteisėto naudojimo yra aparatiniai apsaugos metodai. Atlikus aparatinių apsaugos metodų analizę nustatyta, kad pažeidžiamiausia apsaugos vieta yra komunikavimas tarp programos ir aparatinio įrenginio, todėl apsaugos raktai, kurie vykdo dalį programos, gali apsaugoti nuo daugumą apgrąžos inžinerijos atakų. Įrodymui buvo sukurtas simuliacinis paskirstytų skaičiavimų aparatinės apsaugos Matlab modelis ir atliktas eksperimentis jo patikrinimas parodė, kad siūlomas apsaugos modelis yra atsparus derinimo ir programos klonavimo atakoms. Tyrimo metu, buvo sukurtas eksperimentinis apsaugos rakto prototipas, kuri vykdo dalį programos, o apsauga ištirta su dviem eksperimentinėmis programomis nuo derinimo, dekompiliavimo ir programos klonavimo atakų. Eksperimentinis tyrimas parodė, kad galima rasti programos kreipinius į apsaugos raktą, tačiau jų apėjimas ar pakeitimas, sugadina programą, praneša apie nežinomus adresus. Taip pat buvo atliktas eksperimetinės programos, apsaugotos komerciniu apsaugos raktu, tyrimas, kuris parodė, kad tradiciniai apsaugos metodai neužtikrina apsaugos nuo apgrąžos inžinerijos, kaip tai buvo įrodyta su eksperimentiniu apsaugos rakto prototipu. / Software protection is important problem of nowaday. In 2009 the piracy rate reaches 43% of all globe softwares usage, especialy high piracy rate is in Eastern Europe, where 64% of softwares are illegal. This brings hardware-based protection to be one of the prime defense against illegal software usage. The analysis of hardware-based software protection showed that the weakest part of hardware-based protection is communication with software, so dongle method, which computes part of the software inside dongle, could withstand most of reverse engineer attack methods. To prove this Matlab model of distributed dongle-based protection scheme was created and its experimental evaluation showed, that suggested software protection model is resistant against deassembling, debbuging and software cloning attacks. Equally, experimental distributed computing protection dongle prototype was created and tested with two experimental programs against deassembling, debbuging, decompilation and software cloning attacks. This shows that attackers can find calls to the dongle, but can not jump or nop it, such it was done in experimental software protected with traditional commercial dongle.