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Modelagem computacional de redes genéticas regulatórias / Computational modelling of gene regulatory networksGupta, Shantanu 30 September 2016 (has links)
In biology, regulatory networks are sets of macromolecules, mostly proteins and
RNAs that interact to execute task. The main players in regulatory networks are DNAbinding
proteins, also called transcription factors as they modulate the first step in gene
expression. A gene regulatory network (GRN) is a set of genes or proteins that interact with
each other to control a specific cell function. Gene regulatory networks are important in
development, differentiation and to respond to environmental cues. Gene regulatory
networks (GRNs) are the on-off switches of a cell operating at the gene and/or protein
level. The modeling methods can be broadly categorized into continuous and discrete. In
this work , we dedicate attention to discrete models on cell senescence models for
Astrocyte [35], the modelling of drug synergies to control gastric cancer [38], and we also
wrote a paper about Discrete and Continuous Model, advantage or disadvantage of these
models and a list of available softwares for using these kind of approaches. / Em biologia, redes regulatórias são conjuntos de macromoléculas,
principalmente proteínas e RNAs que interagem para executar uma tarefa. As proteínas
de ligação de DNA, também chamadas de fatores de transcrição, são as principais
executoras nas redes regulatórias, visto que modulam o primeiro passo na expressão
gênica. Uma rede genética regulatória (RRG) é um conjunto de genes ou proteínas que
interagem uns com os outros para controlar uma função celular específica. Redes
regulatórias são importantes no desenvolvimento, diferenciação e para responder aos
sinais ambientais. Elas são os botões de liga/desliga de uma célula operando no nível do
gene e/ou proteína. Seus métodos de modelagem podem ser geralmente classificados
em contínuos e discretos. Neste trabalho, dedicamos atenção aos modelos discretos em
senescência celular para astrócitos [35], a modelagem de sinergias de drogas para
controle do câncer gástrico [38] e também escrevemos um artigo sobre Modelos
Discretos e Contínuos, vantagens e desvantagens desses modelos e listagem dos
softwares disponíveis para uso nesse tipo de abordagem.
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