Estudos sobre a diversidade de Bacteria em solos de mangue (Brasil) e marisma (Espanha) são escassos. A vegetação de mangue, composta por espécies como Spartina alterniflora, Rhizophora mangle, Avicennia schaueriana e Laguncularia racemosa, pode ser um dos fatores que determinam a estruturação das comunidades de procariotos. Determinações das estruturas das comunidades e de diversidade de Bacteria podem ocorrer em função das diferentes condições físico-químicas dos solos, refletindo na configuração dos processos biogeoquímicos. O objetivo deste trabalho foi avaliar a variação das estruturas das comunidades de Bacteria e Archaea, bem como a diversidade, em solos de mangue e marisma utilizando DGGE e sequenciamento parcial do rDNA 16S. As estruturas das comunidades de procariotos apresentaram variações em função de condições de vegetação. Proteobacteria e Bacteroidetes estão presentes em todos os solos estudados. A comunidade de Bacteria destes ambientes é dominada por Proteobacteria. Vários dos táxons detectados estão relacionados com ciclos biogeoquímicos importantes para os ambientes estudados. As estimativas não-paramétricas de riqueza de espécies (ACE e Chao1) mostram que solos de mangue e marisma podem conter milhares de espécies de bactérias. As comunidades de Bacteria dos solos de mangue e marisma são significativamene diferentes. Na camada mais superficial do sedimento de mangue predomina Euryarchaeota metanogênicas enquanto que na camada mais profunda predomina Crenarchaeota. Bactérias das ordens Desulfobacterales, Desulfovibrionales e Desulfuromonales podem estar relacionadas com a atividade de sulfato-redução e formação de pirita na camada anaeróbia do perfil de solo de marisma. De uma maneira geral, pode-se concluir que a diversidade e estrutura das comunidades de procariotos de ambientes estuarinos pode variar em função da vegetação estabelecida e do tipo de ambiente. Adicionalmente, solos de mangue e marisma possuem grande diversidade de procariotos, grande parte da qual é desconhecida, podendo representar elevado potencial genético para utilização biotecnológica. / The bacterial diversity in mangrove (Brazil) and marisma (Espanha) soils are largely unknown. Bacterial communities participate in biogeochemicals processes that occurs in soils of estuarine ecosystems. Determinations of the bacterial communities structures and diversity can occur in function of different physico-chemical conditions, reflecting in the biogeochemical processes. The aim of this work was to evaluate the variation of bacterial an archaeal communities structures utilizing DGGE and partial sequencing of 16S rDNA. Bacterial community structures showed more similarity between repetitions samples than the areas under different vegetation. Phylogenetic afiliation shows that several sequences were not clamped into known phyla. Proteobacteria prevails in bacterial communities of mangrove and marisma soils. Several taxa detected are associated to important biogeochemical cycles that occur in estuarine ecosystems. Analysis of species richness showed that mangrove and marisma soils can contain 200 to 6000 species of bacteria. Methanogenic Euryarchaeota was found specially in the upper sample of mangrove sediment analysed whereas the Crenarchaeota was found specially in the lower. Based on the data obtained, it can be concluded that the vegetation is one of the factors affecting the structure of bacterial and archaeal communities in mangrove soils. Additionaly, the effects of edafic factors and seasonal variations have to be considered as determining the prokaryotic community sctuctures, and bacterial and archaeal communities can respond independently to the factors that determine their community structures. Bacterial diversity can vary with the studied estuarine ecosystem. Studies are necessary concerning to diversity of Bacteria, it variation and correlation with biogeochemical process in the mangrove and marisma soils. These soils show a great diversity of bacteria, much of than unknown, which represent a great genetic potential to the biotechnology.

Submitted by Jean Medeiros (jeanletras@uepb.edu.br) on 2017-02-09T13:57:16Z No. of bitstreams: 1 PDF - Climélia da Nóbrega Silva.pdf: 2378682 bytes, checksum: bc27dc4732d9c3146e265bcaaa7cece6 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-09T13:57:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PDF - Climélia da Nóbrega Silva.pdf: 2378682 bytes, checksum: bc27dc4732d9c3146e265bcaaa7cece6 (MD5) Previous issue date: 2014-12-02 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Estuaries are environments that run important ecosystem services, such as nurseries and feeding places for numerous species. However, are subject to various anthropogenic impacts that directly affect their operation. This study aimed to test which taxonomic level is sufficient to evaluate the environmental condition as well as assess the relative efficacy of ecological indicators in estuaries assumed as subject to anthropogenic pressures of different intensities. The research was conducted in the estuaries of the River Paraíba do Norte and Mamanguape River (Northeastern Brazil), in November 2013, totaling 27 sampling sites, parted into four zones according to the values of salinity, sediment composition and depth. The organisms collected were sorted and identified to the lowest possible taxonomic level. This study is divided into two chapters, the first taxonomic depicts sufficiency by addressing the hypothesis that the family level would be more efficient to detect the environmental condition and the second test whether the combined use of the thermodynamically oriented indicators, functional trophic groups wealth rate and diversity index Shannon-Wiener would provide consistent answers in the evaluation of the ecological condition of estuaries. Fill Taxonomic showed that for the purpose of this study, both the family level as gender were enough to detect changes in environmental conditions, for this sample period. Regarding the use of associated ecological indicators to detect changes in ecological conditions of the estuaries, the indicators based on taxa richness, diversity, specific eco- exergy and functional feeding groups did not respond concurrently in the detection of changes in the ecological condition of estuaries with different levels of human impacts. Only eco-exergy index indicated differences in the ecological condition of the assessed ecosystems. Thus, the results obtained from the survey showed the importance of the study on the taxonomic sufficiency and ecological indicators based on benthic communities as a biomonitoring tool, which aims to understand the variations and fluctuations of ecosystems as well as the basis for measures proposed to mitigation of human impacts, conservation and environmental management. / Os estuários são ambientes que prestam serviços ecossistêmicos importantes, como berçários e locais de alimentação para inúmeras espécies. Porém, estão sujeitos a diversos impactos antrópicos que afetam diretamente seu funcionamento. O objetivo do trabalho foi testar qual nível taxonômico é suficiente para avaliar a condição ambiental, assim como verificar a eficácia relativa de indicadores ecológicos em estuários assumidos como sujeitos às pressões antrópicas de diferentes intensidades. A pesquisa foi realizada nos Estuários do Rio Paraíba do Norte e do Rio Mamanguape (Nordeste brasileiro), em novembro de 2013, totalizando 27 pontos de amostragem, divididos em quatro zonas de acordo com os valores de salinidade, composição do sedimento e profundidade. Os organismos coletados foram triados e identificados ao menor nível taxonômico possível. Este estudo está dividido em dois capítulos, o primeiro retrata a suficiência taxonômica, abordando a hipótese de que o nível de família seria mais eficiente em detectar a condição ambiental e o segundo testou se o uso associado dos indicadores termodinamicamente orientados, grupos tróficos funcionais, riqueza de taxa e índice de diversidade de Shannon-Wiener forneceriam respostas concordantes na avaliação da condição ecológica dos estuários. A suficiência taxonômica demonstrou que, para o objetivo desta pesquisa, tanto o nível de família quanto o de gênero foram suficientes em detectar alterações nas condições ambientais, para este período amostral. Em relação à utilização associada de indicadores ecológicos para detectar as mudanças nas condições ecológicas dos estuários, os indicadores baseados na riqueza de taxa, diversidade, eco-exergia específica e grupos tróficos funcionais não responderam de forma concordante na detecção das variações na condição ecológica dos estuários com níveis de impactos antrópicos distintos. Apenas o índice da eco-exergia indicou diferenças na condição ecológica dos ecossistemas avaliados. Assim, os resultados obtidos pela pesquisa evidenciaram a importância do estudo sobre a suficiência taxonômica e indicadores ecológicos baseados nas comunidades bentônicas como um instrumento de biomonitoramento, cujo intuito é entender as variações e flutuações dos ecossistemas, assim como servir de base para propostas de medidas para mitigação dos impactos antrópicos, conservação e gestão ambiental.

Estudos sobre a diversidade de Bacteria em solos de mangue (Brasil) e marisma (Espanha) são escassos. A vegetação de mangue, composta por espécies como Spartina alterniflora, Rhizophora mangle, Avicennia schaueriana e Laguncularia racemosa, pode ser um dos fatores que determinam a estruturação das comunidades de procariotos. Determinações das estruturas das comunidades e de diversidade de Bacteria podem ocorrer em função das diferentes condições físico-químicas dos solos, refletindo na configuração dos processos biogeoquímicos. O objetivo deste trabalho foi avaliar a variação das estruturas das comunidades de Bacteria e Archaea, bem como a diversidade, em solos de mangue e marisma utilizando DGGE e sequenciamento parcial do rDNA 16S. As estruturas das comunidades de procariotos apresentaram variações em função de condições de vegetação. Proteobacteria e Bacteroidetes estão presentes em todos os solos estudados. A comunidade de Bacteria destes ambientes é dominada por Proteobacteria. Vários dos táxons detectados estão relacionados com ciclos biogeoquímicos importantes para os ambientes estudados. As estimativas não-paramétricas de riqueza de espécies (ACE e Chao1) mostram que solos de mangue e marisma podem conter milhares de espécies de bactérias. As comunidades de Bacteria dos solos de mangue e marisma são significativamene diferentes. Na camada mais superficial do sedimento de mangue predomina Euryarchaeota metanogênicas enquanto que na camada mais profunda predomina Crenarchaeota. Bactérias das ordens Desulfobacterales, Desulfovibrionales e Desulfuromonales podem estar relacionadas com a atividade de sulfato-redução e formação de pirita na camada anaeróbia do perfil de solo de marisma. De uma maneira geral, pode-se concluir que a diversidade e estrutura das comunidades de procariotos de ambientes estuarinos pode variar em função da vegetação estabelecida e do tipo de ambiente. Adicionalmente, solos de mangue e marisma possuem grande diversidade de procariotos, grande parte da qual é desconhecida, podendo representar elevado potencial genético para utilização biotecnológica. / The bacterial diversity in mangrove (Brazil) and marisma (Espanha) soils are largely unknown. Bacterial communities participate in biogeochemicals processes that occurs in soils of estuarine ecosystems. Determinations of the bacterial communities structures and diversity can occur in function of different physico-chemical conditions, reflecting in the biogeochemical processes. The aim of this work was to evaluate the variation of bacterial an archaeal communities structures utilizing DGGE and partial sequencing of 16S rDNA. Bacterial community structures showed more similarity between repetitions samples than the areas under different vegetation. Phylogenetic afiliation shows that several sequences were not clamped into known phyla. Proteobacteria prevails in bacterial communities of mangrove and marisma soils. Several taxa detected are associated to important biogeochemical cycles that occur in estuarine ecosystems. Analysis of species richness showed that mangrove and marisma soils can contain 200 to 6000 species of bacteria. Methanogenic Euryarchaeota was found specially in the upper sample of mangrove sediment analysed whereas the Crenarchaeota was found specially in the lower. Based on the data obtained, it can be concluded that the vegetation is one of the factors affecting the structure of bacterial and archaeal communities in mangrove soils. Additionaly, the effects of edafic factors and seasonal variations have to be considered as determining the prokaryotic community sctuctures, and bacterial and archaeal communities can respond independently to the factors that determine their community structures. Bacterial diversity can vary with the studied estuarine ecosystem. Studies are necessary concerning to diversity of Bacteria, it variation and correlation with biogeochemical process in the mangrove and marisma soils. These soils show a great diversity of bacteria, much of than unknown, which represent a great genetic potential to the biotechnology.