Le phénomène El Niño est le mode dominant de la variabilité du climat aux échelles de temps interannuelles dans le Pacifique tropical. Il modifie considérablement le climat régional dans les pays voisins, dont le Pérou pour lequel les impacts socio-économiques peuvent être dramatiques. Comprendre et prévoir El Niño reste un enjeu prioritaire pour la communauté climatique. Des progrès significatifs dans notre compréhension du phénomène El Niño et dans notre capacité à le prédire ont été réalisés dans les années 80, en particulier grâce à la mise en place du système d'observation dans le Pacifique tropical (programme de TOGA, en particulier, ainsi que l'émergence de l'ère des satellites). À la fin du XXe siècle, alors que de nouvelles théories scientifiques ont été proposées et testées, les progrès réalisés dans le domaine de la modélisation numérique et de l'assimilation de données ont conduit à l'idée que le phénomène El Niño pourrait être prévu avec au moins deux ou trois saisons à l'avance. Or, depuis le début du 21ième siècle, les manifestations du phénomène El Niño ont réduit cette expectative: un nouveau type d'El Niño est a été découvert - identifié par des anomalies de température moins intenses et localisées dans le centre du Pacifique équatorial. Ce phénomène, connu sous le nom CP El Niño pour El Niño Pacifique Central ou El Niño Modoki a placé la communauté scientifique devant un nouveau défi. Cette thèse est une contribution à l'effort international actuel pour comprendre la dynamique de ce nouveau type d'El Niño, dans le but de proposer des mécanismes expliquant sa présence accrue au cours des dernières décennies. Plus précisément, l'objectif de cette thèse est d'étudier le rôle des ondes longues équatoriales dans le Pacifique tropical sur la dynamique océanique et la thermodynamique associées au phénomène El Niño de type Pacifique Central. Cette thèse s'intéresse tout d'abord au premier CP El Niño du 21ième siècle, le phénomène El Niño 2002/03, à partir des sorties d'un modèle de circulation océanique général. Ensuite, nous documentons les caractéristiques des ondes équatoriales de Kelvin aux fréquences Intra Saisonnières (ISKw) sur la période 1990-2011, fournissant une statistique de l'activité des ondes ISKw durant l'évolution des événements El Niño de type Central Pacifique. Nos résultats montrent que l'onde ISKw subit une forte dissipation dans le Pacifique Est, qui est interprétée comme provenant de la dispersion des ondes lorsqu'elles rencontrent le front zonal de la stratification dans l'Est du Pacifique (i.e. la pente de la thermocline d'Ouest en Est). Une réflexion partielle de l'onde ISKw en onde de Rossby équatoriale de près de 120°W est également identifiée, ce qui peut expliquer le confinement dans le Pacifique central des anomalies de température de surface associées aux événements El Niño de type Central Pacifique. Nous suggérons que la fréquence accrue au cours des dernières années des événements CP El Niño peut être associée à l'état froid - de type La Niña - observé dans le Pacifique Equatorial depuis les années 90 et les changements dans la variabilité saisonnière de la profondeur de la thermocline depuis les années 2000. / The El Niño phenomenon is the dominant mode of climate variability at interannual timescales in the tropical Pacific. It modifies drastically the regional climate in surrounding countries, including Peru for which the socio-economical impacts can be dramatic. Understanding and predicting El Niño remains a top-priority issue for the climatic community. Large progress in our understanding of El Niño and in our ability to predict it has been made since the 80s thanks to the improvement of the observing system of the tropical Pacific (TOGA program and emergence of the satellite era). At the end of the Twentieth century, whereas new theories were proposed and tested, progress in numerical modeling and data assimilation led to the idea that El Niño could be predicted with at least 2 or 3 seasons in advance. The observations since the beginning of the 21st century have wiped out such expectation: A new type of El Niño, known as the Central Pacific El Niño (CP El Niño) or Modoki El Niño has put the community in front of a new challenge. This thesis is a contribution to the current international effort to understand the dynamics of this new type of El Niño in order to propose mechanisms explaining its increased occurrence in recent decades. More specifically, the objective of the thesis is to study the role of the oceanic equatorial waves in the dynamic and thermodynamic along the equatorial Pacific Ocean, focusing on the CP El Niño. This thesis first takes a close look at the first CP El Niño of the 21st century of this type, i.e. the 2002/03 El Niño, based on an Oceanic General Circulation Model. Then it documents the characteristics of the IntraSeasonal Kelvin waves (ISKws) over the period 1990-2011, providing a statistics on the ISKws activity during the evolution of CP El Niño events. We find that the ISKw experiences a sharp dissipation in the eastern Pacific that is interpreted as resulting from the scattering of energy associated to the zonal contrast in stratification (i.e. sloping thermocline from west to east). Partial reflection of the ISKw as Rossby waves near 120°W is also identified, which may explain the confinement of CP El Niño warming in the central Pacific. We suggest that the increased occurrence of CP El Niño in recent years may be associated to the La Niña-like state since the 90s and changes in the seasonality of the thermocline since the 2000s.