XIV Congreso de la Sociedad Española de Enfermedades Infecciosas y Microbiología Clínica (SEIMC). Barcelona, 19-22 de mayo de 2010 / Antecedentes y Objetivos: El rol de los virus respiratorios ha sido previamente sub-estimado en la comunidad. Por esta razón, el objetivo de este estudio es evaluar la incidencia y las características clínicas de las infecciones respiratorias agudas (IRA) en niños de la Región Sierra Norte del Perú (Cajamarca), para lo cual se utilizó la técnica de RT-PCR multiplex y la RT-PCR a Tiempo Real como prueba de rutina en el laboratorio. Métodos: En este estudio fueron incluidos 55 pacientes entre 0 a 17 años diagnosticados con IRA provenientes del Hospital Regional de Cajamarca (DIRESA-Cajamarca) durante los meses de agosto a diciembre del 2009. Las muestras fueron colectadas mediante hisopados nasofaríngeos y procesados para evaluar microorganismos patógenos respiratorios mediante las técnicas de amplificación de ácidos nucleicos mediante Reacción en Cadena de la Polimerasa: RT-PCR multiplex para la detección de: virus de la gripe A, B y C; virus respiratorio sincitial A y B; adenovirus; virus parainfluenza 1, 2, 3, y 4; rinovirus; enterovirus y coronavirus, RT-PCR a Tiempo Real para el diagnóstico de virus de la gripe A pandémica (H1N1) y PCR convencional para la detección de: Chlamydia pneumoniae, Mycoplasma pneumoniae, Chlamydia trachomatis y Bordetella pertussis. De acuerdo a la etiología, los resultados fueron categorizados en 4 grupos: grupo 1 (sólo detección de virus); grupo 2 (sólo detección de bacterias), grupo 3 (virus + bacterias) y grupo 4 (co-infección bacteriana). Resultados: De los 55 pacientes diagnosticados con IRA se evaluó la etiología de la siguiente manera: grupo 1, n = 29 (52,7%); grupo 2, n= 16 (20,09%); grupo 3, n = 6 (10,9%) y grupo 4, n = 2 (3,6%). De los 29 virus respiratorios identificados se observó: virus de la gripe A pandémica (H1N1) (n = 25, 45,45%), virus de la gripe A estacional (n = 3; 5,45%) y virus parainfluenza 1 (n = 1; 1,81%). De las 16 bacterias identificadas se observo: Chlamydia pneumoniae (n = 7 pacientes, 12,7%), Mycoplasma pneumoniae (n = 6 pacientes, 10,9%), Bordetella pertussis (n = 3 pacientes, 5,45%). De los 55 pacientes, 6 de ellos presentaron co-infección virus-bacteria: virus de la gripe A pandémica (H1N1) + Chlamydia pneumoniae (n = 4; 7,27), virus de la gripe A estacional + Mycoplasma pneumoniae (n = 1; 1,81%) y virus de la gripe A estacional + Bordetella pertussis (n = 1; 1,81%). Sóo 2 casos presentaron co-infección bacteriana: Mycoplasma pneumoniae + Chlamydia pneumoniae (n = 2; 3,62%). Conclusión: La técnica de amplificación de ácidos nucleicos, revela que los virus respiratorios representan el agente etiológico más común del IRA, las características clínicas no pueden distinguir entre infección viral o bacteriana. Por esta razón es importante implementar técnicas moleculares como pruebas de rutina en los laboratorios regionales para ofrecer un diagnóstico adecuado y a tiempo al paciente.