Made available in DSpace on 2014-06-11T19:29:42Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-02-11Bitstream added on 2014-06-13T18:59:23Z : No. of bitstreams: 1 manoel_ro_me_ilha.pdf: 1154303 bytes, checksum: bdb3ce1be2b5b94a2295c411e503126d (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O fluxo e padrões de dispersão de pólen foram investigados em um pequeno fragmento florestal isolado da espécie arbórea neotropical, polinizada por insetos da Copaifera langsdorffii, por meio da análise de paternidade e oito locos microssatélites, também foi investigado a coancestria e o tamanho efetivo populacional dentro de progênies para a conservação e recuperação ambiental. Sementes de polinização aberta (20 a 25 sementes) foram coletadas de 15 árvores matrizes de um fragmento, onde todos os indivíduos adultos foram previamente mapeados, medidos e genotipados para oito locos microssatélites. Vinte sementes foram coletadas da árvore vizinha mais próxima (1,2 km) do fragmento. Os níveis de diversidade genética foram significativamente maiores nos adultos do que nas progênies. Níveis significativos de endogamia foram detectados em progênies (F = 0,226), o que foi atribuído principalmente ao cruzamento entre parentes. A partir da análise de paternidade, baixos níveis de autofecundação (s = 8%) e imigração de pólen (m = 8%) foram observados no fragmento florestal, mas níveis muito altos foram detectados na árvore isolada (s = 20%; m = 75%), indicando que o fragmento e a árvore não estão reprodutivamente isolados e são conectados por dispersão de pólen a longas distancias (máximo detectado 1,420 m). Dentro do fragmento, o padrão de dispersão de pólen foi o vizinho próximo, com cerca de 49% do pólen se dispersando até 50 m. O tamanho efetivo populacional da árvore-matriz foi baixa, indicando a necessidade de se coletar muitas sementes de árvores (mínimo de 76 árvores) para fins de conservação. Em termos gerais, os resultados mostraram que o fragmento e a árvore isolada pela fragmentação florestal não estão reprodutivamente isoladas, embora o isolamento espacial parecesse aumentar a taxa de autofecundação e cruzamentos correlacionados / Pollen flow, dispersal and patterns were investigated in a small and isolated forest fragment of the neotropical, insect pollinated tree Copaifera langsdorffii, using paternity analysis and eight microsatellite loci, we also investigated the coancestry and effective population size of progeny array for conservation and environmental restoration purpose. Open-pollinated seeds (20 to 25 seeds) were collected from 15 seed trees of forest fragment, where all adults trees were previously mapped, measured and genotyped by eight microsatellite loci. Twenty seeds were also collected from the neighbour tree (1.2 km) of the forest fragment. Levels of genetic diversity were significantly higher in adults than offspring. Significant levels of inbreeding were detected in offspring (F=0.226), which was attributed mainly to the mating among relatives. From paternity analysis, low levels of selfing (s=8%) and pollen immigration (m=8%) were observed in the forest fragment, but very high levels were detected in the isolated tree (s=20%; m=75%), indicating that the forest fragment and the tree are not reproductive isolated and are connected by long pollen dispersal (maximum detected 1,420 m). Within the forest fragment, the pattern of pollen dispersal was the near neighbor with about 49% of the pollen being dispersed until 50 m. The effective population size of the progeny array was low, indicating the necessity to collect seeds from many seed trees (minimum of 76 trees) for conservation purposes. In general terms, the results showed that the fragment and the tree isolated by forest fragment are not brooked the genetic connectivity, although the spatial isolation seems increase selfing rate and correlated mating

Submitted by bruna ortiz (brunaortiz.f@gmail.com) on 2016-07-04T15:11:17Z No. of bitstreams: 1 Dissertação-Alacimar Viana Guedes.pdf: 1903772 bytes, checksum: 59ddccb481230e346acada71fee633a6 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-07-21T12:57:47Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação-Alacimar Viana Guedes.pdf: 1903772 bytes, checksum: 59ddccb481230e346acada71fee633a6 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-07-21T13:00:21Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação-Alacimar Viana Guedes.pdf: 1903772 bytes, checksum: 59ddccb481230e346acada71fee633a6 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-21T13:00:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação-Alacimar Viana Guedes.pdf: 1903772 bytes, checksum: 59ddccb481230e346acada71fee633a6 (MD5) Previous issue date: 2016-03-28 / FAPEAM - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas / The Amazon forest is distinguished by being the largest natural reservoir of plant wealth of the planet, where different each of their forest habitats has very rich and wide variety of species, often unique to a particular environment. Understanding how plant species are organized in their environment and how they use available resources is an important tool for the management and conservation of biodiversity. Thus, this study aimed to group tropical tree species according to environmental heterogeneity of the area, focusing on chemical and physical variables soil. The study was conducted in two forest sites in Central Amazonia: (a) forest management company Mil Precious Woods (PWA), the municipality of Silves, and (b) Experimental Field of Embrapa, located in the Agricultural District Suframa (CEDAS) Rio Preto da Eva. They were inventoried eight (08) continuous hectares at each site. All individuals with DAP≥ 10 cm were marked and identified in 2014 and had their registered UTM coordinates. 200 soil samples were collected at a depth of 0-20 cm per area, which were submitted to chemical and particle size analysis. They were surveyed 5,040 individuals distributed among 356 species on the site and give in 4,279 individuals represented by 203 species in the PWA site, with 191 species exclusive to the site and give in 69 exclusive PWA site. Among the five most abundant species on the site CEDAS are Eschweilera bracteosa, Protium amazonicum, Eschweilera coriacea, oblongifolia Licania and Pouteria sp, corresponding to 21% of individuals. In the PWA site, are Trattinnickia burserifolia, Eschweilera coriacea, Ocotea neesiana, Eschweilera collina and Trymatococcus amazonicus, which together account for 22% of all individuals. Although they are the same forest type, the two sites have distinct floristic composition, showing no floristic and structural homogeneity in upland forest in Central Amazon. The canonical correspondence analysis (CCA) indicated a significant correlation between the distribution of tree species along the topographic gradient and soil variables, with more pronounced effect of soil texture. The results suggest that it is possible to separate groups of species on the basis of soil characteristics, and texture is the variable which best describes the distribution of species throughout the soil gradient, mediated by the topography variations. / A floresta amazônica distingue-se por ser o maior reservatório natural de riqueza vegetal do planeta, seus diferentes ambientes florestais possui elevada riqueza e ampla variedade de espécies, muitas vezes exclusivas de determinado ambiente. Compreender como as espécies vegetais se organizam no seu ambiente e como utilizam os recursos disponíveis representa importante subsídio para o manejo e conservação da biodiversidade. Assim, o presente trabalho teve por objetivo agrupar espécies arbóreas tropicais segundo a heterogeneidade ambiental da área, com foco em variáveis químicas e física do solo. O estudo foi realizado em dois sítios florestais na Amazônia Central: (a) área de manejo florestal da empresa Mil Madeiras Preciosas (PWA), município de Silves, e (b) Campo Experimental da Embrapa, localizado no Distrito Agropecuário da Suframa (CEDAS), Rio Preto da Eva. Foram inventariados oito (08) hectares contínuos em cada sítio. Todos os indivíduos com DAP≥ 10 cm foram marcados e identificados e tiveram suas coordenadas UTM registradas. Foram coletadas 200 amostras de solo na profundidade de 0-20 cm por área, que foram submetidas às análises química e granulométrica. Foram inventariados 5.040 indivíduos distribuídos entre 356 espécies no sítio CEDAS e 4.279 indivíduos representados por 203 espécies no sítio PWA, sendo 191 espécies exclusivas do sítio CEDAS e 69 exclusivas do sítio PWA. Entre as cinco espécies mais abundantes no sítio CEDAS encontram-se: Eschweilera bracteosa, Protium amazonicum, Eschweilera coriacea, Licania oblongifolia e Pouteria sp., correspondendo a 21% do total de indivíduos. No sítio PWA, encontram-se Trattinnickia burserifolia, Eschweilera coriacea, Ocotea neesiana, Eschweilera collina e Trymatococcus amazonicus, que juntas correspondem a 22% do total de indivíduos. Apesar de constituírem a mesma tipologia florestal, os dois sítios apresentam composições florísticas distintas, evidenciando não homogeneidade florística e estrutural em florestas de terra firme na Amazônia Central. A análise de correspondência canônica (CCA) indicou correlação significativa entre a distribuição das espécies arbóreas ao longo do gradiente topográfico e as variáveis edáficas, com efeito mais pronunciado da textura do solo. Os resultados sugerem que é possível separar grupos de espécies em função das variáveis edáficas, e que a textura é a variável que melhor explica a distribuição das espécies ao longo do gradiente de solos, intermediada pelas variações de topografia.

Orientador: Alexandre Magno Sebbenn / Resumo: Cariniana estrellensis e Cariniana legalis são uma das maiores árvores dos biomas florestais da Amazônia e Mata Atlântica, sendo atualmente vulneráveis à extinção devido ao intenso desmatamento desses biomas. Estratégias para conservação in situ e ex situ são urgentes e estudos de diversidade genética e fluxo de genes são chaves e para esses propósitos. Assim, investigamos a diversidade genética, a estrutura genética espacial (SGS) e o fluxo histórico de genes em populações fragmentadas de ambas as espécies, utilizando marcadores de microssatélites. Todas as árvores encontradas nas populações foram mapeadas, medidas para o diâmetro na altura do peito (DAP) e amostrado o cambio de casca. O índice de fixação (F), em alguns casos, foi significativamente maior em árvores com menor DAP, indicando que as árvores menores apresentam um maior parentesco do que as maiores. Foi detectada SGS significativa para populações de ambas as espécies (60-350 m), indicando um padrão de dispersão de genes de isolamento pela distância (IBD). Para ambas as espécies, foi observada alta imigração de semente (38,5-61,5%) e pólen (80,1-100%), mostrando que as populações não são isoladas geneticamente. Não foi detectada autofecundação, mas o cruzamento entre árvores relacionadas foi detectado nas espécies (8,9-12,5%), sugerindo uma seleção mais forte contra árvores de autofecundação do que se originou do cruzamento entre árvores relacionadas. A distância de dispersão de pólen e sementes em C. estrellensi... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Cariniana estrellensis and Cariniana legalis, two of the largest trees in the Amazon and Atlantic Forest biomes, are currently vulnerable to extinction due to the intense deforestation of these biomes. Strategies for in and ex situ conservation are urgent, and studies of genetic diversity and gene flow are key aspects needed to develop these strategeis. Thus, we investigate the genetic diversity, spatial genetic structure (SGS), and historical gene flow in fragmented populations of both species, using microsatellite markers. All trees found in the study populations were mapped, measured for diameter at breast height (DBH), and sampled for bark cambium. Our results show that in some cases, fixation index (F) was significantly higher in trees with lower DBH, indicating that smaller trees have higher levels of inbreeding than larger ones. Significant SGS was detected in populations of both species (60-350 m), indicating a gene dispersal pattern of isolation by distance (IBD). For both species, we found high seed (38.5-61.5%) and pollen (80.1-100%) immigration demonstrating that populations are not genetically isolated. No self-fertilization was detected, but we did find evidence of mating among related trees (8.9-12.5%), suggesting stronger selection against selfed individuals than those originated from mating among relatives. Pollen and seed dispersal distance for C. estrellensis reached longer distances (> 3 km) than for C. legalis (maximum of 385 m). However, pollen and seeds... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Submitted by FRANCINE BEATRIZ DE SOUZA null (francinnysouza@yahoo.com.br) on 2018-03-25T19:33:25Z No. of bitstreams: 1 Francine__Tese_VersãoFinal_2018.pdf: 1284636 bytes, checksum: 8130187eea228723fe2e75938a47a468 (MD5) / Approved for entry into archive by Cristina Alexandra de Godoy null (cristina@adm.feis.unesp.br) on 2018-03-26T12:25:02Z (GMT) No. of bitstreams: 1 souza_fb_dr_ilha.pdf: 1284636 bytes, checksum: 8130187eea228723fe2e75938a47a468 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-03-26T12:25:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 souza_fb_dr_ilha.pdf: 1284636 bytes, checksum: 8130187eea228723fe2e75938a47a468 (MD5) Previous issue date: 2018-02-09 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Cariniana estrellensis e Cariniana legalis são uma das maiores árvores dos biomas florestais da Amazônia e Mata Atlântica, sendo atualmente vulneráveis à extinção devido ao intenso desmatamento desses biomas. Estratégias para conservação in situ e ex situ são urgentes e estudos de diversidade genética e fluxo de genes são chaves e para esses propósitos. Assim, investigamos a diversidade genética, a estrutura genética espacial (SGS) e o fluxo histórico de genes em populações fragmentadas de ambas as espécies, utilizando marcadores de microssatélites. Todas as árvores encontradas nas populações foram mapeadas, medidas para o diâmetro na altura do peito (DAP) e amostrado o cambio de casca. O índice de fixação (F), em alguns casos, foi significativamente maior em árvores com menor DAP, indicando que as árvores menores apresentam um maior parentesco do que as maiores. Foi detectada SGS significativa para populações de ambas as espécies (60-350 m), indicando um padrão de dispersão de genes de isolamento pela distância (IBD). Para ambas as espécies, foi observada alta imigração de semente (38,5-61,5%) e pólen (80,1-100%), mostrando que as populações não são isoladas geneticamente. Não foi detectada autofecundação, mas o cruzamento entre árvores relacionadas foi detectado nas espécies (8,9-12,5%), sugerindo uma seleção mais forte contra árvores de autofecundação do que se originou do cruzamento entre árvores relacionadas. A distância de dispersão de pólen e sementes em C. estrellensis atingiu longa distância (> 3 km) do que em C. legalis (máximo de 385 m). No entanto, o pólen e as sementes em C. estrellensis e o pólen em C. legalis foram dispersos em um padrão de IBD. Os resultados sugerem que as populações estudadas são adequadas para conservação in situ e ex situ. / Cariniana estrellensis and Cariniana legalis, two of the largest trees in the Amazon and Atlantic Forest biomes, are currently vulnerable to extinction due to the intense deforestation of these biomes. Strategies for in and ex situ conservation are urgent, and studies of genetic diversity and gene flow are key aspects needed to develop these strategeis. Thus, we investigate the genetic diversity, spatial genetic structure (SGS), and historical gene flow in fragmented populations of both species, using microsatellite markers. All trees found in the study populations were mapped, measured for diameter at breast height (DBH), and sampled for bark cambium. Our results show that in some cases, fixation index (F) was significantly higher in trees with lower DBH, indicating that smaller trees have higher levels of inbreeding than larger ones. Significant SGS was detected in populations of both species (60-350 m), indicating a gene dispersal pattern of isolation by distance (IBD). For both species, we found high seed (38.5-61.5%) and pollen (80.1-100%) immigration demonstrating that populations are not genetically isolated. No self-fertilization was detected, but we did find evidence of mating among related trees (8.9-12.5%), suggesting stronger selection against selfed individuals than those originated from mating among relatives. Pollen and seed dispersal distance for C. estrellensis reached longer distances (> 3 km) than for C. legalis (maximum of 385 m). However, pollen and seeds of C. estrellensis and pollen of C. legalis were dispersed in an IBD pattern. The results suggest that the studied populations are suitable for in and ex situ conservation.