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Uma proposta para a predi??o computacional da estrutura terci?ria de polipept?deos

Cardoso, Marcos Borba 12 July 2007 (has links)
Made available in DSpace on 2015-04-14T14:50:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 396435.pdf: 5923930 bytes, checksum: 9836e0a21f7fba5b0893387a40431ee7 (MD5) Previous issue date: 2007-07-12 / Nos ?ltimos anos, um dos grandes desafios da Ci?ncia da Computa??o perante a Bioinform?tica ? o desenvolvimento de algoritmos, os quais, em um tempo h?bil, consigam gerar as estruturas terci?rias de prote?nas a partir da seq??ncia linear de seus amino?cidos. Embora existam alguns m?todos que consigam gerar estruturas quando se possui outra prote?na com um alto grau de similaridade, quando n?o se possui o mesmo, os m?todos at? ent?o desenvolvidos n?o consigam realizar esta predi??o de forma n?o onerosa computacionalmente. Este trabalho apresenta um algoritmo recursivo capaz de predizer a topologia de polipept?deos, utilizando apenas os ?ngulos da cadeia principal de prote?nas com estruturas tridimensionais (3D) j? conhecidas. O mesmo se mostra eficaz quando aplicado ? mini-prote?na Trp-Cage (c?digo PDB 1L2Y) que possui apenas 20 amino?cidos, tendo uma estrutura predita de RMSD igual 3,7 ?; no entanto, para uma prote?na de 34 amino?cidos Mini-Prote?na Estabilizada por Pontes Dissulfeto (c?digo PDB 1ZDD) o mesmo se mostra ineficiente, gerando a melhor prote?na com o RMSD igual a 7,2 ?, devido ao fato de n?o ter sido percorrido todo o espa?o conformacional esperado para a mesma. Os resultados e as suas conseq??ncias s?o discutidos no trabalho.

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