Le potentiel de génération thrombine (TGP en anglais) est une nouvelle mesure qui permet de quantifier in vitro l'activité globale de la thrombine reflétant bien les mécanismes in vivo de la coagulation. Ce méthode de dosage est sensible aux déficits de facteurs de coagulation, à la prise d'anti-coagulants et à de nombreux troubles de la coagulation. Au moment où j'ai débuté ma thèse, seuls deux polymorphismes génétiques, tous les deux situés dans le gène F2 codant pour la prothrombine, étaient connus pour influencer la variabilité plasmatique du TGP. Mon projet de thèse avait pour objectifs d'identifier de nouveaux facteurs génétiques, mais également épigénétiques, pouvant influencer les taux plasmatiques de TGP. Dans une première partie, j'ai mené la toute première étude d'association génome-entier (GWAS pour Genome Wide Association Study en anglais) sur 3 biomarqueurs (temps de latence, quantité totale de thrombine produite et niveau maximal de thrombine produite) du TGP dans deux études françaises rassemblant 1267 sujets et j'ai répliqué les résultats les plus significatifs dans deux autres études françaises indépendantes de 1344 sujets. Cette stratégie a permis de mettre en évidence qu'un polymorphisme génétique du gène ORM1 était associé de manière robuste au temps de latence, biomarqueur caractérisant le temps nécessaire pour initier la coagulation après induction. Dans la seconde partie de ma thèse, en suivant une stratégie similaire mais cette fois-ci en étudiant non plus des polymorphismes génétiques mais des marques de méthylation d'ADN, j'ai recherché si des niveaux de méthylation de site CpG, mesurés à partir d'ADN sanguin et couvrant l'ensemble du génome, pouvaient être associés à la variabilité des 3 mêmes biomarqueurs de TGP. Malheureusement, à partir de deux échantillons mis à ma disposition et rassemblant 425 sujets, je n'ai pas pu mettre en évidence d'association robuste entre des marques de méthylation sanguine et la génération trombine. / Thrombin Generation Potential (TGP) is a promising in vitro measurement that allows quantifying thrombin activity, in a close way to what happens in vivo. It is sensitive to coagulation factors deficiencies, anticoagulant proteins and is associated to thrombotic disorders. There exists two polymorphisms located in the F2 (prothrombin) gene known to influence TGP levels, and altogether they explain 11.3% of the TGP inter-individual variability. With the aims of identifying novel genetic and epigenetic factors that influence TGP variability, I have performed two different studies in the present work. First, I conducted the first genome-wide association study for the three TGP biomarkers (ETP, Peak and Lagtime) using imputation data from two French studies. The most significant single nucleotide polymorphisms (SNPs) were then replicated in two independent French studies. This analysis lead to the discovery of ORM1 as a new gene participating to the control of TGP. Second, I followed a similar strategy using this time whole blood DNA methylation levels at CpG sites to identify DNA methylation marks involved in TGP variability. I analyzed the association between methylation-wide patterns from a French study and a French-Canadian families measured for TGP. Unfortunately, I did not identify robust associations between whole DNA methylation levels and thrombin generation.

Introduction: L’obésité est un facteur connu d’hypercoagulabilité in vitro et in vivo. Cependant peu d’études se sont intéressées aux facteurs de risque d’hypercoagulabilité biologique chez le patient obèse morbide, à sa variation après chirurgie bariatrique (CB) ainsi qu’aux facteurs de risques de maladie thromboembolique veineuse (MTEV) postopératoire après CB. Matériel et Méthodes: Tous les patients destinés à une CB entre le 1er Septembre 2014 et le 31 Janvier 2016 au CHU de Brest étaient éligibles pour notre étude de cohorte locale et ont bénéficié d’un large bilan sanguin préopératoire et à 12 mois postopératoires, incluant des tests de génération de thrombine (GT) avec mesure du potentiel endogène de thrombine (ETP), une méthode validée globale d’évaluation de la coagulation. En parallèle, nous avons extrait de la base du SNIIRAM de l’assurance maladie, tous les patients opérés d’une CB entre le 1er Janvier 2012 et le 30 Septembre 2014 et déterminer la fréquence d’une MTEV dans les 90 jours suivants la CB. Résultats: Cent-deux patients étaient inclus dans notre étude de cohorte brestoise. Les facteurs de risque (OR (95% IC)) de présenter un ETP dans le 4ème quartile de distribution étaient : taux de cholestérol total augmenté (Pas=1mmol/l) (2,6 (1,2-5,4);P =0,01) et taux de fibrinogène augmenté (Pas=1 g/l) (2,2; (1,1-4,5);P = 0,03). A un an post-opératoire (%perte de poids: 33.1±8.3), on retrouvait une baisse significative de l’ETP (%) (111 (96-129) vs. 84 (72-102) ; P<0.001), du taux de fibrinogène (g/l) (4,2±0,8 vs. 3,6±0,8 ; P<0.001) et une baisse non significative du taux de cholestérol total (mmol/l) (4,8±0,8 vs. 4,6±1,0; P=0,08). Apres extraction à partir du SNIIRAM, 110.824 patients étaient inclus. Le taux de MTEV dans les 90 jours était de 0,51%. Les principaux facteurs de risque de MTEV retrouvés en analyse multivariée étaient (P<0.001): un antécédent de MTEV (6,41 (4,50-9,14)), des complications post-opératoires (9,23 (7,30-11,68)), une défaillance cardiaque (2,45 (1,48-4,06), une chirurgie par laparotomie (2,38 (1,59-3,45)), un IMC ≥ 50 kg/m² (1,67 (1,28-2,18)), une sleeve gastrectomy (2,02 (1,39-2,93)) et une procédure de deuxième intention (1,37 (1,10-1,72)). Conclusion : Sur une étude de cohorte de plus de 110.000 patients, nous identifions un taux faible de MTEV dans les 90 jours post-opératoires après CB dépendant de facteurs de risque individuels et liés à la chirurgie. De surcroit nous identifions une baisse de la GT à 1 an post-opératoire en parallèle à une perte de poids massive et à une diminution de l’état inflammatoire. / Introduction: Obese patients are known to be in an in vitro and in an in vivo hypercoagulable state relative to normal-weight patients. Studies focusing exclusively on morbidly obese patients are lacking. Our study aimed to identify markers of enhanced coagulability, to compare its evolution one year after bariatric surgery (BS) and to determine risk factors of venous thromboembolism (VTE) within 90 postoperative days. Methods: All patients scheduled for bariatric surgery (BS) between September 1, 2014 and January 31, 2016 in Brest University Hospital were eligible for our prospective local study. In vitro coagulation was assessed using thrombin generation (TG) tests (Endogenous thrombin potential (ETP)). Data on all patients undergoing BS in France from 1st January 2012 to 30 September 2014 were also extracted from the database of the French national health care (SNIIRAM) to determine the rate of VTE in the 90 days after surgery. Results: One hundred and two patients were included in our study assessing TG. Risk factors for enhanced TG (ETP in the 4th quartile) were increased total cholesterol level (Step=1mmol/l) (2.6 (1.2-5.4); P =0.01) and increased fibrinogen level (Step=1g/l) (2.2 (1.1-4.5); P=0.03). At 12 postoperative months, we found a significant lower ETP (%) (111 (96-129) vs. 84 (72-102 P<0.001)), fibrinogen level (g/l) (4.2±0.8 vs. 3.6±0.8; P<0.001)) and a non-significant trend for lower total cholesterol level (mmol/l) (4.8±0.8 vs. 4.6±1.0; P=0.08). After extraction of the SNIIRAM database, 110,824 patients were included with a rate of VTE of 0.51% (90 post-operative days). Main risk factors for postoperative VTE were (p<0.001): history of VTE (6.41 (4.50-9.14)), postoperative complications (9.23 (7.30-11.68)), heart failure (2.45 (1.48-4.06), open approach (2.38 (1.59-3.45)), BMI ≥ 50 kg/m² (1.67 (1.28-2.18)), sleeve gastrectomy (2.02 (1.39-2.93)) and redo procedure (1.37 (1.10-1.72)). Conclusions: Our study highlights the role of total cholesterol and blood inflammatory marker levels in enhancing TG in morbidly obese patients and shows a decrease of TG at 12 months after BS. The risk of postoperative VTE after BS is low depending on the individual risk level.