Tesis por compendio / The present PhD thesis, entitled "Design of novel bio-gated nanomaterials for sensing and therapeutic applications", is focused on the design, preparation, characterization and evaluation of new smart hybrid organic-inorganic materials for their applications on the field of sensing and controlled drug delivery. The first chapter of this thesis introduces the concept of organic-inorganic hybrid materials containing switchable "gate-like" ensembles and their applications in the detection of chemical and biochemical species and as suitable materials for drug delivery applications. The second chapter describes the preparation of an aptamer-capped mesoporous material for the fluorogenic detection of thrombin in human plasma and serum. For the preparation of the material dye-loaded MCM-41 particles were capped with a thrombin aptamer (TBA). In the presence of thrombin, TBA was displaced from the surface due to the formation of TBA-protein complex, triggering the release of the dye. The capped system was tested in simulated human blood plasma and in PBS buffer with 10% of human serum and achieved a low limit of detection (LOD) for thrombin. Moreover, the prepared material displayed great selectivity for thrombin in the presence of other non-exclusive binding proteins. The gated-nanomaterial resulted suitable to perform an accurate thrombin detection in human serum. In the third chapter a new fluorogenic sensing nanoprobe for the detection of As(III) is described. The system consists of the combination of MSNs with an aptamer (Ars-3), which possesses a very high affinity to As(III), as a pore blocking agent. The sensitivity of the nanocarrier for As(III) was further studied. Furthermore, the selectivity of the nanocarrier towards As(III) in the presence of other cations was also successfully verified. In addition, the sensor allowed accurate As(III) determination in real media. The fourth chapter reports a novel proof-of-concept to detect Mycoplasma genomic DNA and cocaine. The new approach combined gated mesoporous silica nanoparticles and surface-enhanced Raman scattering (SERS) spectroscopy. In particular, two gated-hybrid mesoporous materials loaded with a SERS reporter and capped with suitable oligonucleotide sequences to detect Mycoplasma genomic DNA or cocaine, were prepared. Release of the reporter was triggered from the different materials by the presence of the corresponding target, and was detected by SERS upon adsorption on gold nanotriangles. This novel procedure allowed detecting Mycoplasma genomic DNA and cocaine with a high selectivity and sensitivity. The fifth chapter describes the development of a nanodevice able to deliver insulin as a function of the glucose concentration, in simulated human blood plasma. The glucose-driven nanomaterial consisted of ß-cyclodextrin-modified glucose oxidase (CD-GOx)-capped silica nanoparticles loaded with insulin. The reaction of glucose by the capping enzyme (GOx) triggered insulin release in a self-regulated manner. Furthermore, the response to glucose was found to be selective and other saccharides were unable to deliver the entrapped insulin. We hope the results obtained in this thesis may inspire further works to design smart nanodevices with application in analytical chemistry, clinical or environmental assays and self-regulated drug delivery systems. / La presente tesis doctoral, titulada "Diseño de nuevos nanomateriales con puertas moleculares biológicas para aplicaciones de detección y terapéuticas", se centra en el diseño, preparación, caracterización y evaluación de nuevos materiales híbridos orgánicos-inorgánicos inteligentes para su aplicación en el campo de la detección y liberación controlada de fármacos. El primer capítulo de la presente tesis introduce el concepto de los materiales híbridos orgánicos-inorgánicos funcionalizados con puertas moleculares y su aplicación en la detección de especies químicas y bioquímicas de interés y como materiales adecuados para su aplicación en liberación controlada de fármacos. El segundo capítulo describe la preparación de un material mesoporoso con aptámeros como puerta moleculares, para la detección fluorogénica de trombina en plasma y suero humano. En la preparación del material se utilizaron partículas de MCM-41 cargadas con un colorante y cuyos poros se taparon con un aptámero que reconoce la proteína trombina (TBA). En presencia de trombina el TBA se desplazó de la superficie debido a la formación del complejo TBA-proteína permitiendo así la liberación del colorante. El funcionamiento del material se evaluó en plasma humano simulado y en PBS con 10% de suero humano y se alcanzó un bajo límite de detección (LOD) para trombina. Además, el material resultó ser selectivo para trombina en presencia de otras proteínas no específicas. El nanomaterial resultó adecuado para la detección precisa de trombina en suero humano. En el tercer capítulo se describe una nuevo nanomaterial sensor para la detección fluorogénica de As (III). El sistema consiste en la combinación de nanopartículas mesoporosas de sílice (MSNs) con un aptámero (Ars-3), que posee una alta afinidad por el As(III), como agente bloqueante de los poros. Además, se estudió la sensibilidad del nanomaterial para As(III). Por otro lado, se demostró la selectividad del nanomaterial para As(III) en presencia de otros cationes. Adicionalmente, el sensor permitió una determinación precisa de As(III) en un medio real. El cuarto capítulo describe una novedosa prueba de concepto para la detección de ADN genómico de Mycoplasma y cocaína. El nuevo enfoque combinó MSNs con puertas moleculares y espectroscopía Raman amplificada en superficie (SERS). En particular, se prepararon dos materiales híbridos con puertas moleculares y cargados con un reportero SERS. Como puertas moleculares se utilizaron dos secuencias de oligonucleótidos para detectar ADN genómico de Mycoplasma o cocaína. La liberación del reportero SERS desde los materiales se indujo por la presencia del analito correspondiente, y fue detectado por SERS tras su adsorción sobre nanotríangulos de oro. Este nuevo procedimiento permitió detectar ADN genómico de Mycoplasma y cocaína con alta selectividad y sensibilidad. El quinto capítulo describe el desarrollo de un nanodispositivo capaz de liberar insulina en función de la concentración de glucosa en plasma sanguíneo humano simulado. El nanomaterial consiste en nanopartículas de sílice funcionalizadas cuyos poros se taparon con la enzima glucosa-oxidasa modificada con ß-ciclodextrinas (CD-GOx) y cargadas con insulina. La reacción de la glucosa por la enzima bloquenate (GOx) desencadenó la liberación autorregulada de insulina. Asimismo, se encontró que la respuesta a la glucosa era selectiva y otros azúcares no indujeron la liberación de la insulina cargada. Esperamos que los resultados obtenidos en esta tesis puedan inspirar otros trabajos para diseñar nanodispositivos inteligentes con aplicación en la química analítica, ensayos clínicos o medioambientales y en sistemas de liberación autorregulada de fármacos. / La present tesi doctoral, titulada "Disseny de nous nanomaterials amb portes moleculars biològiques per a aplicacions de detecció i terapèutiques", es centra en el disseny, preparació, caracterització i avaluació de nous materials híbrids orgànics-inorgànics intel·ligents per a la seua aplicació en el camp de la detecció i lliberació controlada de fàrmacs. El primer capítol de la present tesi introduïx el concepte dels materials híbrids orgànics-inorgànics funcionalizats amb portes moleculars i la seua aplicació en la detecció d'espècies químiques i bioquímiques d'interés i com a materials adequats per a la lliberació controlada de fàrmacs. El segon capítol descriu la preparació d'un material mesoporós amb aptámeros com a porta molecular, per a la detecció fluorogénica de trombina en plasma i sèrum humà. En la preparació del material es van utilitzar partícules de MCM-41 carregades amb un colorant i els porus del qual es van tapar amb un aptàmer que reconeix la proteïna trombina (TBA). En presència de trombina el TBA es va desplaçar de la superfície a causa de la formació del complex TBA-proteïna permetent així l'alliberament del colorant. El funcionament del material es va avaluar en plasma humà simulat i en PBS amb 10% de sèrum humà i es va aconseguir un baix límit de detecció (LOD) per a trombina. A més, el material va resultar ser selectiu para trombina en presència d'altres proteïnes no específiques. El nanomaterial va resultar adequat per a la detecció precisa de trombina en sèrum humà. En el tercer capítol es descriu un nou nanomaterial sensor per a la detecció fluorogènica d'As(III). El sistema consistix en la combinació de nanopartícules mesoporoses de sílice (MSNs) amb un aptàmer (Ars-3), que posseïx una alta afinitat per l'As(III), com a agent bloquejant dels porus. A més, es va estudiar la sensibilitat del nanomaterial per a As(III). D'altra banda, es va demostrar la selectivitat del nanomaterial per a As(III) en presència d'altres cations. Addicionalment, el sensor va permetre una determinació precisa d'As(III) en un medi real. El Quart capítol descriu una nova prova de concepte per a la detecció de ADN genòmic de Mycoplasma i cocaïna. El nou enfocament va combinar MSNs amb portes moleculars i espectroscòpia Raman amplificada en superfície (SERS). Concretament, es van preparar dos materials híbrids amb portes moleculars i carregats amb un reporter SERS. Com a portes moleculars es van utilitzar dos seqüències d'oligonucleòtids per a detectar ADN genòmic de Mycoplasma o cocaïna. L'alliberament del reporter SERS des dels materials es va induir per la presència de l'anàlit corresponent, i va ser detectada per SERS després de la seua adsorció sobre nanotriangles d'or. Este nou procediment va permetre detectar ADN genòmic de Mycoplasma i cocaïna amb alta selectivitat i sensibilitat. El quint capítol descriu el desenrotllament d'un nanodispositiu capaç d'alliberar insulina en funció de la concentració de glucosa en plasma sanguini humà simulat. El nanomaterial consistix en nanopartícules de sílice funcionalizades els porus del qual es van tapar amb l'enzim glucosa-oxidasa modificada amb ß-ciclodextrinas (CD-GOx) i carregades amb insulina. La reacció de la glucosa per l'enzim bloquejant (GOx) va desencadenar l'alliberament autoregulat d'insulina. Així mateix, es va trobar que la resposta a la glucosa va ser selectiva i altres sucres no van induir la lliberació de la insulina carregada. Esperem que els resultats obtinguts en aquesta tesi puguen inspirar nus treballs per a dissenyar nanodispositius intel·ligents amb aplicació en la química analítica, assajos clínics o mediambientals i en sistemes de lliberació autoregulada de fàrmacs. / Oroval Cucarella, MDM. (2017). Design of novel bio-gated nanomaterials for sensing and therapeutic applications [Tesis doctoral]. Universitat Politècnica de València. https://doi.org/10.4995/Thesis/10251/78836 / Compendio

Tesis por compendio / [ES] La presente tesis doctoral titulada "Sistemas de liberacio'n controlada de fa'rmacos diseñados para mejorar el tratamiento de Enfermedad Inflamatoria Intestinal" se centra en el diseño, preparación, caracterización y evaluación in vivo de distintos sistemas de liberación controlada de fármacos en colon (CDDS, por sus siglas en inglés) utilizando como soporte micropartículas de silice mesoporosa, funcionalizadas con puertas moleculares. En conclusión, los estudios realizados demuestran que los materiales de silice mesoporosa, en combinación con puertas moleculares sensibles a estímulos específicos, tienen un gran potencial para el desarrollo de nuevos sistemas de liberación controlada de fármacos en el colon, dirigidos a mejorar el arsenal terapéutico disponible para el tratamiento de EII. La posibilidad de adaptar o personalizar la carga y las puertas moleculares hace que estos soportes de sílice mesoporosa sean una opción interesante para el desarrollo de nuevos sistemas de liberación controlada de fármacos en diferentes aplicaciones biomédicas. Finalmente, esperamos que los resultados obtenidos en esta tesis doctoral sirvan de inspiración para el desarrollo de sistemas de liberación controlada de fármacos innovadores y cada vez más inteligentes, para su aplicación tanto en medicina como en otras áreas. / [CA] La present tesi doctoral titulada "Sistemes d'alliberament controlat de farmacs dissenyats per a millorar el tractament de Malaltia Inflamatoria Intestinal" se centra en el disseny, preparacio, caracteritzacio i avaluacio in vivo de diferents sistemes d'alliberament controlat de farmacs en colon (*CDDS, per les seues sigles en angles) utilitzant com a suport microparticules de si'lice mesoporosa, funcionalitzades amb portes moleculars. En conclusio, els estudis realitzats demostren que els materials de si'lice mesoporosa, en combinacio amb portes moleculars sensibles a estimuls especifics, tenen un gran potencial per al desenvolupament de nous sistemes d'alliberament controlat de farmacs en el colon, dirigits a millorar l'arsenal terapeutic disponible per al tractament de MII. La possibilitat d'adaptar o personalitzar la carrega i les portes moleculars, fa que aquests suports de silice mesoporosa siguen una opcio interessant per al desenvolupament de nous sistemes d'alliberacio controlada de farmacs en diferents aplicacions biomediques. Finalment, esperem que els resultats obtinguts en aquesta tesi doctoral servisquen d'inspiracio per al desenvolupament de sistemes d'alliberament controlat de farmacs innovadors i cada vegada mes intel·ligents, per a la seua aplicacio tant en medicina com en altres arees. / [EN] This PhD thesis entitled "Smart drug delivery systems designed to improve Inflammatory Bowel Disease therapy" is focused on the design, synthesis, characterization and in vivo evaluation of several Colon Drug Delivery Systems (CDDS) using hybrid mesoporous silica microparticles as scaffolds containing molecular gates. In conclusion, the studies shown in this Thesis demonstrate that mesoporous silica materials in combination with responsive molecular gates have great potential in the design and preparation of new CDDS to improve the therapeutic options available for IBD. The possibility to adapt the cargo and the molecular gate makes mesoporous silica support especially appealing for similar controlled drug delivery applications in the biomedical field. We hope that the obtained results could inspire the development of new innovative smart drug delivery systems in this or other fields. / We thank the Spanish Government (projects MAT2015-64139-C4-1-R and AGL2015-70235-C2-2-R (MINECO/FEDER)) and the Generalitat Valenciana (project PROMETEOII/2014/047) for support. AHT thanks to the Spanish MEC for his FPU grant. We thank the Generalitat Valenciana (Project PROMETEO2018/024) / Hernández Teruel, A. (2019). Smart drug delivery systems designed to improve Inflammatory Bowel Disease therapy [Tesis doctoral]. Universitat Politècnica de València. https://doi.org/10.4995/Thesis/10251/129863 / Compendio

La presente tesis doctoral titulada ¿Materiales funcionales híbridos para el reconocimiento óptico de explosivos nitroaromáticos mediante interacciones supramoleculares¿ se basa en la combinación de principios de Química Supramolecular y de Ciencia de los Materiales para el diseño y desarrollo de nuevos materiales híbridos orgánico-inorgánicos funcionales capaces de detectar explosivos nitroaromáticos en disolución. En primer lugar se realizó una búsqueda bibliográfica exhaustiva de todos los sensores ópticos (cromogénicos y fluorogénicos) descritos en la bibliografía y que abarca el periodo desde 1947 hasta 2011. Los resultados de la búsqueda están reflejados en el capítulo 2 de esta tesis. El primer material híbrido preparado está basado en la aplicación de la aproximación de los canales iónicos y, para ello, emplea nanopartículas de sílice funcionalizadas con unidades reactivas y unidades coordinantes (ver capítulo 3). Este soporte inorgánico se funcionaliza con tioles (unidad reactiva) y una poliamina lineal (unidad coordinante) y se estudia el transporte de una escuaridina (colorante) a la superficie de la nanopartícula en presencia de diferentes explosivos. En ausencia de explosivos, la escuaridina (color azul y fluorescencia intensa) es capaz de reaccionar con los tioles anclados en la superficie decolorando la disolución. En presencia de explosivos nitroaromáticos se produce una inhibición de la reacción escuaridinatiol y la suspensión permanece azul. Esta inhibición es debida a la formación de complejos de transferencia de carga entre las poliaminas y los explosivos nitroaromáticos. En la segunda parte de esta tesis doctoral se han preparado materiales híbridos con cavidades biomiméticas basados en el empleo de MCM-41 como soporte inorgánico mesoporoso (ver capítulo 4). Para ello se ha procedido al anclaje de tres fluoróforos (pireno, dansilo y fluoresceína) en el interior de los poros del soporte inorgánico y, posteriormente, se ha hidrofobado el interior de material mediante la reacción de los silanoles superficiales con 1,1,1,3,3,3-hexametildisilazano. Mediante este procedimiento se consiguen cavidades hidrófobas que tienen en su interior los fluoróforos. Estos materiales son fluorescentes cuando se suspenden en acetonitrilo mientras que cuando se añaden explosivos nitroaromáticos a estas suspensiones se observa una desactivación de la emisión muy marcada. Esta desactivación de la emisión es debida a la inclusión de los explosivos nitroaromáticos en la cavidad biomimética y a la interacción de estas moléculas (mediante interacciones de ¿- stacking) con el fluoróforo. Una característica importante de estos materiales híbridos sensores es que pueden ser reutilizados después de la extracción del explosivo de las cavidades hidrofóbicas. En la última parte de esta tesis doctoral se han desarrollado materiales híbridos orgánicoinorgánicos funcionalizados con ¿puertas moleculares¿ que han sido empleados también para detectar explosivos nitroaromáticos (ver capítulo 5). Para la preparación de estos materiales también se ha empleado MCM-41 como soporte inorgánico. En primer lugar, los poros del soporte inorgánico se cargan con un colorante/fluoróforo seleccionado. En una segunda etapa, la superficie externa del material cargado se ha funcionalizado con ciertas moléculas con carácter electrón dador (pireno y ciertos derivados del tetratiafulvaleno). Estas moléculas ricas en electrones forman una monocapa muy densa (debida a las interacciones dipolo-dipolo entre estas especies) alrededor de los poros que inhibe la liberación del colorante. En presencia de explosivos nitroaromáticos se produce la ruptura de la monocapa, debido a interacciones de ¿-stacking con las moléculas ricas en electrones, con la consecuencia de una liberación del colorante atrapado en el interior de los poros observándose una respuesta cromo-fluorogénica / Salinas Soler, Y. (2013). Functional hybrid materials for the optical recognition of nitroaromatic explosives involving supramolecular interactions [Tesis doctoral]. Editorial Universitat Politècnica de València. https://doi.org/10.4995/Thesis/10251/31663 / Premios Extraordinarios de tesis doctorales

[ES] La tesis doctoral "Nanostructured supports for the detection of pathogens and biomolecules of interest based on molecular gates with oligonucleotides" se centra en el diseño de nanomateriales híbridos orgánico-inorgánicos como biosensores innovadores para la detección rápida y específica de patógenos como el virus del papiloma humano (VPH) y la bacteria Vibrio vulnificus, así como biomoléculas relevantes como miR-4732-3p, relacionado con la cardiotoxicidad en pacientes con cáncer. Los sensores desarrollados, basados en puertas moleculares en alúmina mesoporosa y validados con muestras clínicas, destacan por su alta sensibilidad, especificidad, rapidez y facilidad de uso, lo que los hace prometedores para aplicaciones en diagnóstico y monitoreo ambiental. / [CA] The doctoral thesis "Nanostructured supports for the detection of pathogens and biomolecules of interest based on molecular gates with oligonucleotides" focuses on the design of organic-hybrid nanomaterialsInorganic as innovative biosensors for rapid and specific detection of pathogens such as human papillomavirus (HPV) and the bacterium Vibrio vulnificus, as well as relevant biomolecules such as miR-4732-3p, related to cardiotoxicity in cancer patients. The developed sensors, based on mesoporous alumina molecular gates and validated with clinical samples, stand out for their high sensitivity, specificity, speed and ease of use, which makes them promising for applications in diagnosis and environmental monitoring. / [EN] La tesi doctoral "Nanostructured supports for the detection of pathogens and biomolecules of interest based on molecular gates with oligonucleotides" se centra en el disseny de nanomaterials híbrids orgànic-inorgànics com biosensors innovadors per a la detecció ràpida i específica de patògens com el virus del papil·loma humà (VPH) i el bacteri Vibrio vulnificus, així com biomolècules rellevants com miR-4732-3p, relacionat amb la cardiotoxicitat en pacients amb càncer. Els sensors desenrotllats, basats en portes moleculars en alúmina mesoporosa i validats amb mostres clíniques, destaquen per la seua alta sensibilitat, especificitat, rapidesa i facilitat d'ús, la qual cosa els fa prometedors per a aplicacions en diagnòstic i monitoratge ambiental. / This research was supported by project PID2021-126304OB-C41 funded by MCIN/AEI and by European Regional Development Fund - A way of doing Europe. This work has received funding from the European Union’s Horizon 2020 Development of an Innovative Fluorogenic Biosensor for Direct Detection of Vibrio vulnificus, a Climate Change Biomarker research and innovation programme under grant agreement No 899708. This research was also supported by CIBER -Consorcio Centro de Investigación Biomédica en Red (CB06/01/2012), Instituto de Salud Carlos III, Ministerio de Ciencia e Innovación. This study forms part of the Advanced Materials programme (MFA/2022/049) and was supported by MCIN with funding from European Union NextGeneration EU (PRTR-C17.I1) and by Generalitat Valenciana. The study was also supported by the grants PID2020-120619RB-I00 funded by MCIN/AEI and CIAICO/2021/293 funded by “Conselleria de Educación, Universidades y Empleo” (Generalitat Valenciana, Spain). / Aranda Sobrino, MDLN. (2024). Nanostructured Supports for Detection of Pathogens and Biomolecules of Interest Based on Molecular Gates with Oligonucleotides [Tesis doctoral]. Universitat Politècnica de València. https://doi.org/10.4995/Thesis/10251/211237