CLUSTER est la première mission spatiale permettant l'étude à trois dimensions de la magnétosphère terrestre. Son orbite polaire et sa configuration de quatre satellites en tétraèdre lui permettent d'effectuer des mesures in situ dans plusieurs régions de la magnétosphère, notamment dans la plasmasphère. Cette thèse rassemble une série de travaux sur les structures de plasma rencontrées sur l'orbite de CLUSTER durant la période 2001-2004. La quantité physique étudiée est essentiellement la densité électronique, mais aussi le champ magnétique continu. Dans une première partie, deux outils d'analyse multipoints, le gradient spatial et la méthode des délais, sont décrits, testés et discutés sur des jeux de données synthétiques, puis sur des données réelles, pour diverses situations typiques. Dans le cadre de conditions favorables, ces analyses révèlent le mouvement, l'orientation de frontières, ainsi que les dimensions des structures rencontrées, impossibles à estimer par une mission composée d'un seul satellite. Une seconde partie s'intéresse plus globalement à la plasmasphère, notamment à la topologie et à la dynamique de ses structures de densité à petite et grande échelle. Cette étude s'appuie sur les analyses multipoints vues précédemment, mais elle utilise également des données d'autres instruments de CLUSTER, des images globales de la plasmasphère fournies par la mission IMAGE, ainsi que des résultats d'études statistiques et de simulations numériques. Enfin, la thèse décrit une analyse statistique menée sur un autre jeu de données: les densités de puissance spectrales des ondes électromagnétiques mesurées à basse altitude par le satellite Viking durant l'année 1986.

Spatial distribution and seasonal succesion of phytoplankton along the longitudinal axis of a eutrophic Římov reservoir was investigated in 2007. Inflow, transitional and lacustrine zones were distinquished in the reservoir according to physical, chemical and biological parameters. Using a functional group concept, typical phytoplankton assemblages were found.

Besides spatial heterogeneity, an important component of diversity of the protist communities is also the variation in species assemblages through time (temporal turnover). Spatial and temporal variation in patterns of distribution and abundance of lentic microphytobenthos assemblages is often large and occurs at relatively small spatial scale. Desmids (Zygnematophyceae) often constitute a characteristic part of the microphytobenthos of peat bogs. Despite their important role in primary production and fact that they are useful indicators of ecosystem uniqueness, investigations of their seasonality and spatial distribution are scarce. In my thesis I have investigated if desmid epipelic communities are driven rather by neutral or niche-based processes, and I also focused on the factors affecting their diversity, seasonal dynamics and spatial patterns at the local spatial scale. The study was conducted at the two different types of biotopes - minerotrophic lowland peat bogs (Doksy region) and ombrotrophic raised bogs (Jizera Mountains region). Seasonal changes in species composition and diversity of assemblages were not evident. This may be affected by a monopolization effect and also that local abundance of species was positively correlated with population persistence, which suggests that high local...