Dans cette thèse, nous nous proposons de contribuer à la définition de systèmes de crypto-calculs pour la manipulation en aveugle de données confidentielles. L’objectif particulier de ce travail est l’amélioration des performances du chiffrement homomorphe. La problématique principale réside dans la définition d’une approche d’accélération qui reste adaptable aux différents cas applicatifs de ces chiffrements, et qui, de ce fait, est cohérente avec la grande variété des paramétrages. C’est dans cet objectif que cette thèse présente l’exploration d’une architecture hybride de calcul pour l’accélération du chiffrement de Fan et Vercauteren (FV).Cette proposition résulte d’une analyse de la complexité mémoire et calculatoire du crypto-calcul avec FV. Une partie des contributions rend plus efficace l’adéquation d’un système non-positionnel de représentation des nombres (RNS) avec la multiplication de polynôme par transformée de Fourier sur corps finis (NTT). Les opérations propres au RNS, facilement parallélisables, sont accélérées par une unité de calcul SIMD type GPU. Les opérations de NTT à la base des multiplications de polynôme sont implémentées sur matériel dédié de type FPGA. Des contributions spécifiques viennent en soutien de cette proposition en réduisant le coût mémoire et le coût des communications pour la gestion des facteurs de rotation des NTT.Cette thèse ouvre des perspectives pour la définition de micro-serveurs pour la manipulation de données confidentielles à base de chiffrement homomorphe. / In this thesis, we propose to contribute to the definition of encrypted-computing systems for the secure handling of private data. The particular objective of this work is to improve the performance of homomorphic encryption. The main problem lies in the definition of an acceleration approach that remains adaptable to the different application cases of these encryptions, and which is therefore consistent with the wide variety of parameters. It is for that objective that this thesis presents the exploration of a hybrid computing architecture for accelerating Fan and Vercauteren’s encryption scheme (FV).This proposal is the result of an analysis of the memory and computational complexity of crypto-calculation with FV. Some of the contributions make the adequacy of a non-positional number representation system (RNS) with polynomial multiplication Fourier transform over finite-fields (NTT) more effective. RNS-specific operations, inherently embedding parallelism, are accelerated on a SIMD computing unit such as GPU. NTT-based polynomial multiplications are implemented on dedicated hardware such as FPGA. Specific contributions support this proposal by reducing the storage and the communication costs for handling the NTTs’ twiddle factors.This thesis opens up perspectives for the definition of micro-servers for the manipulation of private data based on homomorphic encryption.