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Estudo da incidência de candidemia e diversidade genética de Candida em pessoas internadas em Unidades Hospitalares de Manaus - Amazonas

Corrêa, Marcelo Augusto da Eira 28 February 2014 (has links)
Submitted by Geyciane Santos (geyciane_thamires@hotmail.com) on 2015-07-31T15:06:37Z No. of bitstreams: 1 Dissertação - Marcelo Augusto da Eira Corrêa.pdf: 3302859 bytes, checksum: 38417d5930f880c0e2b8cebbe92fda6a (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2015-08-04T15:09:55Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação - Marcelo Augusto da Eira Corrêa.pdf: 3302859 bytes, checksum: 38417d5930f880c0e2b8cebbe92fda6a (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2015-08-04T15:16:22Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação - Marcelo Augusto da Eira Corrêa.pdf: 3302859 bytes, checksum: 38417d5930f880c0e2b8cebbe92fda6a (MD5) / Made available in DSpace on 2015-08-04T15:16:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação - Marcelo Augusto da Eira Corrêa.pdf: 3302859 bytes, checksum: 38417d5930f880c0e2b8cebbe92fda6a (MD5) Previous issue date: 2014-02-28 / FAPEAM - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas / Candidemia is a bloodstream infection caused by Candida. Its incidence varies between 1.27 and 3.9 cases per 1000 admissions in Brazil and from 0.29 to 1.95 cases per 1,000 admissions in the world. C. albicans is the main agent with an incidence ranging from 25.9 % to 59 %. This study aimed to determine the incidence of candidemia in 11 Hospital Units Manaus (public and private) and to determine the genetic diversity among isolates of Candida albicans and identify the existence of cryptic species Candida parapsilosis complex. The C. albicans isolates were subjected to molecular typing technique for multilocus sequencing (MLST) and identified as C. parapsilosis, were subjected to PCR/RFLP. Altogether 101 isolates were studied of the genus Candida. The overall incidence was found to be 2.31 cases per 1,000 admissions and 0.61 cases per 1000 patients/day. The genus Candida was the second cause of bloodstream infections in the studied hospitals, representing 8.6 % of all cases. The most prevalent species was Candida albicans representing 35.64 % of the cases followed by Candida tropicalis with 30.69 %. The male (68,24 %) was most affected by these infections than females (31,76 %). The overall mortality rate was 37.21 % and the species with the highest mortality rates Candida tropicalis was 53.85%. 58 different alleles were identified by the technique of MLST and one allele for the gene SYA1 has been set as a new allele. Their combinations represented 25 different genotypes, of which 15 were identified as new genotypes and sent to the curator for analysis. Of the 22 isolates originally described as C. parapsilosis, three were reidentified as C. orthopsilosis and C. metapsilosis. Of the 25 genotypes found for C. albicans was the main STD 90 and this data differ from the data found in Brazil and in the world , pointing DST 69 as the most common . Were identified for the first time in our region , blood stream infections by C. parapsilosis cryptic species complex with three cases of C. orthopsilosis and one case of C. metapsilosis. / Candidemia é a infecção de corrente sanguínea causada por leveduras do gênero Candida. Sua incidência varia entre 1,27 e 3,9 casos por 1000 internações no Brasil e 0,29 a 1,95 casos por 1000 internações no mundo. C. albicans é o principal agente etiológico com uma incidência que varia entre 25,9% a 59%. Este trabalho teve como objetivo verificar a incidência de candidemia em 11 Unidades Hospitalares de Manaus (públicas e privadas), bem como determinar a diversidade genética entre os isolados de Candida albicans e identificar a existência de espécies crípticas do complexo Candida parapsilosis. Os isolados de Candida albicans foram submetidos à técnica de tipagem molecular por sequenciamento de multilocus (MLST) e os identificados como C. parapsilosis, foram submetidos à PCR/RFLP. Ao todo foram estudados 101 isolados do gênero Candida. A incidência geral encontrada foi de 2,31 casos por 1000 internações e 0,61 casos por 1000 pacientes/dia. O gênero Candida foi o segundo causador das infecções de corrente sanguínea nas unidades hospitalares estudadas, representando 8,6% de todos os casos. A espécie mais prevalente foi Candida albicans representando 35,64% dos casos seguida por Candida tropicalis com 30,69%. O gênero masculino (68,24%) foi mais acometido por essas infecções do que o gênero feminino (31,76%). A taxa de mortalidade geral foi de 37,21% e a espécie que apresentou maiores taxas de mortalidade foi Candida tropicalis com 53,85%. Foram identificados 59 alelos diferentes pela técnica de MLST sendo que um alelo para o gene SYA1 foi configurado como novo alelo. Suas combinações representaram 25 genótipos diferentes, sendo que 15 foram identificados como novos genótipos. Dos 22 isolados inicialmente descritos como C. parapsilosis, três foram reidentificados como C. orthopsilosis e uma como C. metapsilosis. Dos 25 genótipos encontrados para C. albicans o principal foi o DST 90 e esse dado diverge dos dados encontrados no Brasil e no mundo, que apontam o DST 69 como o mais comum. Foram identificadas pela primeira vez em nossa região, infecções de corrente sanguíneas por espécies crípticas do complexo C. parapsilosis, com três casos de C. orthopsilosis e um caso de C. metapsilosis.

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