Thesis (Ph. D.)--University of Missouri-Columbia, 2000. / Typescript. Vita. Includes bibliographical references (leaves 185-226). Also available on the Internet.

Thesis (Ph. D.)--University of Washington, 2003. / Vita. Includes bibliographical references (leaves 102-112).

The ability of culturing cells in vitro has given many advantages in biological research and has become a standard methodology in drug discovery and toxicology. However traditional culturing methods give limited possibilities comparing to microfluidic systems. In order to understand the cellular mechanisms of Natural killers against virus infected cells and tumors, we developed a method for observing in parallel, high numbers of individual Natural killer-target cell conjugates in confined regions. An important advantage of this method is that it gives the possibility to keep track of large numbers of specific conjugates in a time scale of several days. Thus live cell imaging of NK-Target cell interactions in multi-well microstructures, can offer valid statistical information about NK cells processes that can lead to a better understanding of the function and regulation of the immune system. / Ανοσολογία είναι ο επιστημονικός κλάδος που διερευνά τους σύνθετους μηχανισμούς με τους οποίους το ανθρώπινο σώμα αντιδρά και καταπολεμά μολύνσεις ή δυσλειτουργίες που προέρχονται είτε από παθογόνα ή από μεταλλάξεις των κυττάρων του ίδιου του οργανισμού. Οι αντιδράσεις του ανοσοποιητικού συστήματος διαχωρίζονται σε εγγενείς και προσαρμοσμένες άνοσες αντιδράσεις ανάλογα με την ταχύτητα και την εξειδίκευση των αντιδράσεων αυτών ενάντια στα παθογόνα. Το εγγενές ανοσοποιητικό σύστημα αντιδρά άμεσα και συνήθως είναι αρκετά αποτελεσματικό ώστε να εξοντώσει το παθογόνο πριν προκαλέσει αρρώστια. Σε περιπτώσεις όπου η δραστικότητα το εγγενούς δεν είναι επαρκής, το προσαρμοσμένο ανοσοποιητικό σύστημα ενεργοποιείται με την βοήθεια του εγγενούς και χρησιμοποιώντας πολύ συγκεκριμένους μηχανισμούς με τη βοήθεια των οποίων παύει η διαδικασία της μόλυνσης. Τα φυσικά κύτταρα δολοφόνοι (Natural killer cells-NK) ανήκουν στο εγγενές ανοσοποιητικό σύστημα και παίζουν σημαντικό ρόλο στην προστασία του οργανισμού και την ρύθμιση του ανοσοποιητικού συστήματος. Βασικός στόχος της διπλωματικής εργασίας είναι η διερεύνηση των αλληλεπιδράσεων μεταξύ φυσικών κυττάρων δολοφόνων και κυττάρων στόχων. Τα κύτταρα στόχοι είναι είτε κύτταρα μολυσμένα με ιούς ή καρκινικά κύτταρα. Η αρχική υπόθεση ήταν ότι οι πληροφορίες σχετικά με τις λειτουργίες των NK κυττάρων είναι ευκολότερο να καταγραφούν και να αναλυθούν εκτενέστερα, αν μεγάλος αριθμός μεμονωμένων ζευγών ΝΚ-στόχων παρατηρηθούν ξεχωριστά σε περιορισμένο μικρόχωρο. Για την επίτευξη του σκοπού αυτού χρησιμοποιήθηκαν μικροσυσκευές πολυκυψελών εντός των οποίων καλλιεργήθηκαν ξεχωριστά για αρκετές μέρες κύτταρα στόχοι και κύτταρα δολοφόνοι, έτσι ώστε να ελεγχθεί η ζωτικότητα και η λειτουργικότητα των κυττάρων μέσα στους μικρόχωρους. Πιο συγκεκριμένα, για τον έλεγχο αυτό τα κύτταρα τοποθετήθηκαν στις κυψέλες και καλλιεργήθηκαν για 3-4 ημέρες. Κάθε μέρα μία συγκεκριμένη περιοχή της μικροσυσκευής παρατηρήθηκε σε απλό οπτικό μικροσκόπιο και τα κύτταρα μέσα στις κυψέλες μετρήθηκαν. Τα δεδομένα καταγράφηκαν σε μορφή πινάκων και επεξεργάστηκαν στο MatLab. Τα ιστογράμματα που κατασκευάστηκαν έδειξαν ότι η κατανομή των κυττάρων μέσα στις κυψέλες μεταβάλεται και ο συνολικός αριθμός τους αυξάνεται. Τα πειράματα σχετικά με τον έλεγχο του πολλαπλασιασμού των κυττάρων πραγματοποιήθηκαν για 3 διαφορετικούς τύπους, 221Cw6, Nishi και NKL. Εφόσον πρώτα έγινε ο έλεγχος βίο-συμβατότητας των κυττάρων στις μικροκυψέλες, στη συνέχεια κύτταρα δολοφόνοι και κύτταρα στόχοι επεξεργάστηκαν με ειδικές φθορίζουσες βαφές, τοποθετήθηκαν στις μικροσυσκευές και παρατηρήθηκαν με τη χρήση συνεστιακού φθορίζοντος μικροσκοπίου. Με χρήση ειδικής λειτουργίας του μικροσκοπίου, εικόνες συλλέχθηκαν κάθε1-3 λεπτά για 6-12 ώρες. Με τη χρήση της λειτουργίας αυτής ήταν δυνατή η παρακολούθηση των κινήσεων των κυττάρων μέσα στις κυψέλες και η καταγραφή της συμπεριφοράς τους και των γεγονότων κατά την διάρκεια του πειράματος. Έχοντας μεγάλο αριθμό κυψελών (60-100) σε κάθε πείραμα, υπήρξε η δυνατότητα παρατήρησης μεγάλου αριθμού γεγονότων εκ των οποίων κάποια ήταν εξαιρετικά σπάνια η ακόμα και μοναδικά. Λεπτομέρειες σχετικά με την μεθοδολογία των πειραμάτων, την καταγραφή και ανάλυση των αποτελεσμάτων, αναγράφονται αναλυτικά και επεξηγούνται στην παρούσα εργασία.

published_or_final_version / Obstetrics and Gynaecology / Master / Master of Philosophy

Le premier but de mon projet de doctorat a ete la caracterisation moleculaire de l'interface entre les recepteurs activateurs des cellules Natural Killer (NK) et de leurs ligands exprimes dans les cellules infectees ainsi que l'implication de cette interaction sur la reponse a l'infection par le cytomegalovirus (MCMV). / J'ai tire un avantage de la variation naturelle au sein des membres lies aux recepteurs Ly49C ainsi que de la disponibilite des structures cristallines des Ly49 afin de comprendre les determinants moleculaires des interactions Ly49H-m157 et egalement identifier les residus des acides amines qui permettent de discriminer entre les recepteurs qui se lient et ceux qui ne se lient pas a m157. Mes decouvertes suggerent que le "site 2" du contact entre le CMH de classe I et Ly49 n'est visiblement pas implique dans la liaison avec m157. Au contraire, les residus localises au niveau de l'interface homodimere-recepteur seraient probablement critiques a la reconnaissance fonctionnelle de la glycoproteine m157. Notre approche fonctionnelle et de modelisation tridimensionnelle suggerent que l'architecture du dimere Ly49H est cruciale pour l'accessibilite de m157 mais non pour les molecules de CMH de classe I et relient la variabilite dans l'homodimerisation des Ly49 a la reconnaissance directe des produits pathogeniques. / Un autre mecanisme de la reponse de l'hote contre MCMV provient de l'etude de la souche de souris MA/My, laquelle, malgre l'absence du gene Ly49h ainsi que la proteine pour laquelle il code, y est hautement resistant. Des etudes anterieures ont demontre qu'une interaction epistatique entre un gene issu du groupe des genes Ly49 sur le chromosome 6 et le CMH (H2) sur le chromosome 17 est associee avec la resistance au virus. Utilisant une methode de co-culture de cellules reportrices NFAT-GFP exprimant les recepteurs activateurs Ly49 et de fibroblastes primaires infectes, j'ai montre que le recepteur activateur Ly49P des cellules NK reconnait specifiquement les cellules infectees par MCMV et que cette reconnaissance depend de la presence de l'haplotype H2k. Ce signal etait bloque par l'utilisation des anticorps anti-H2-D k mais non par anti-H2-Kk. Ces resultats indiquent l'existence d'un nouveau mecanisme des cellules NK implique dans la resistance au MCMV, lequel depend de l'interaction fonctionnelle entre le recepteur Ly49P et la molecule du MHC de classe I, H2-Dk, dans les cellules infectees par MCMV. Comme contribution directe de ce travail, nous avons demontre que la resistance chez MA/My est au moins partiellement dependante des interactions entre le recepteur Ly49P et la molecule H2-Dk modifiee par le virus dans les cellules infectees. Comme MCMV regule negativement l'expression des molecules du CMH de classe I, j'ai confirme la presence de H2-Dk dans les cellules infectees par l'utilisation d'un virus MCMV recombinant portant un gene rapporteur GFP. En permutant la plateforme peptidique de liaison, les domaines transmembranaires et intracellulaires entre les molecules H2-Db et H2-D k, j'ai demontre que la plateforme peptidique de liaison est critique pour la reconnaissance des cellules infectees. Par le criblage d'un panel de mutants MCMV portant des genes impliques dans l'evasion immune, j'ai demontre que l'infection de fibroblastes par le MCMV depourvu du gene m04 (Deltam04) abolit totalement l'activation de Ly49P. (Abstract shortened by UMI.)

Thesis (Ph.D. in Immunology) -- University of Colorado at Denver and Health Sciences Center, 2006. / Typescript. Includes bibliographical references (leaves 129-141). Free to UCDHSC affiliates. Online version available via ProQuest Digital Dissertations;

Diss. (sammanfattning) Stockholm : Karolinska institutet, 2005. / Härtill 4 uppsatser.

Diss. (sammanfattning) Stockholm : Karol. inst., 2003. / Härtill 5 uppsatser.

Diss. (sammanfattning) Stockholm : Karol. inst., 2002. / Härtill 4 uppsatser.

Diss. (sammanfattning) Stockholm : Karolinska institutet, 2002. / Härtill 4 uppsatser.