Thesis (PhD)--Montana State University--Bozeman, 2009. / Typescript. Chairperson, Graduate Committee: Tomas Gedeon. Includes bibliographical references (leaves 118-125).

Thèse (Ph.D.)--Université Laval, 2008. / Bibliogr. Publié aussi en version électronique dans la Collection Mémoires et thèses électroniques.

Thesis (doctoral)--Université de Genève. / Includes bibliographical references.

Thesis (Ph. D.)--University of Wisconsin--Madison, 1969. / Typescript. Vita. eContent provider-neutral record in process. Description based on print version record. Includes bibliographical references.

Thèse (M.Sc.Géogr.) -- Université Laval, 2004. / Bibliogr.: f. 93-96. Publié aussi en version électronique.

Tesis de grado--arqueología--México--Escuela nacional de antrología e historia, 1960.

Doktorsavhandling--Göteborg, 1992. / Résumé en anglais.

abstract: Molecular dynamics (MD) simulations provide a particularly useful approach to understanding conformational change in biomolecular systems. MD simulations provide an atomistic, physics-based description of the motions accessible to biomolecular systems on the pico- to micro-second timescale, yielding important insight into the free energy of the system, the dynamical stability of contacts and the role of correlated motions in directing the motions of the system. In this thesis, I use molecular dynamics simulations to provide molecular mechanisms that rationalize structural, thermodynamic, and mutation data on the interactions between the lac repressor headpiece and its O1 operator DNA as well as the ERK2 protein kinase. I performed molecular dynamics simulations of the lac repressor headpiece - O1 operator complex at the natural angle as well as at under- and overbent angles to assess the factors that determine the natural DNA bending angle. I find both energetic and entropic factors contribute to recognition of the natural angle. At the natural angle the energy of the system is minimized by optimization of protein-DNA contacts and the entropy of the system is maximized by release of water from the protein-DNA interface and decorrelation of protein motions. To identify the mechanism by which mutations lead to auto-activation of ERK2, I performed a series of molecular dynamics simulations of ERK1/2 in various stages of activation as well as the constitutively active Q103A, I84A, L73P and R65S ERK2 mutants. My simulations indicate the importance of domain closure for auto-activation and activity regulation. My results enable me to predict two loss-of-function mutants of ERK2, G83A and Q64C, that have been confirmed in experiments by collaborators. One of the powerful capabilities of MD simulations in biochemistry is the ability to find low free energy pathways that connect and explain disparate structural data on biomolecular systems. An extention of the targeted molecular dynamics technique using constraints on internal coordinates will be presented and evaluated. The method gives good results for the alanine dipeptide, but breaks down when applied to study conformational changes in GroEL and adenylate kinase. / Dissertation/Thesis / Ph.D. Chemistry 2011

Des levés géophysiques réalisés au lac du Bourget (nord-ouest des Alpes françaises) à l'aide d'un échosondeur multifaisceaux et d'un profileur acoustique de sous-surface ont permis d'obtenir un modelé à haute résolution du plancher lacustre. L'organisation de la couche superficielle du remplissage sédimentaire a également pu être précisée. Plusieurs mouvements de masse ont été identifiés et décrits. Des réflexions datées lors de précédentes études ont été utilisées afin de réaliser la première séquence des événements de mouvements de masse du lac du Bourget. Le déclenchement des mouvements de masse identifiés peut être lié à des facteurs géologiques, environnementaux et humains. Quatre séismes semblent à l'origine du déclenchement de mouvements de masse vers 9400 ans cal. BP, à la transition Holocène inférieur/Holocène moyen, vers 4500 ans cal. BP et en 1822 AD. La forme du lac et sa dynamique sédimentaire ont toutefois prédisposé le déclenchement de mouvements de masse. L'implantation d'infrastructures humaines a également influencé le déclenchement de mouvements de masse récents.

Ce mémoire présente les résultats d’une étude pétrographique et métallogénique d’indices de Ni-Cu de la Suite Plutonique de De La Blache (SPDLB). Située dans la partie est de la Province de Grenville et datée à 1327 Ma, la SPDLB s’est mise en place durant l’Elsonien moyen. Elle consiste en un coeur anorthositique à leucotroctolitique, et une bordure (gabbro)noritique (±Ol) à ultramafique. Les indices étudiés peuvent être subdivisés en deux groupes: les indices Outardes-4 sud, Boudrias-Est/Doyon et de la Buse, encaissés dans des roches ultramafiques; et l’indice Thibault encaissé dans des leucotroctolites. Les données géochimiques suggèrent que les indices proviendraient de magmas distincts. Les concentrations en Se, S et les valeurs δ34S montrent une composante crustale importante, liée à une contamination par les gneiss encaissants. Les dépôts de Ni-Cu se seraient formés dans les unités (ultra)mafiques produites par cristallisation fractionnée, selon le modèle classique de mise en place de dépôts de sulfures magmatiques. Le faible potentiel économique des indices étudiés peut s’expliquer par l’absence de certains facteurs clés généralement présents dans les dépôts de Ni-Cu-ÉGP magmatiques de classe mondiale. / This master thesis is a petrographic and metallogenic study of Ni-Cu prospects associated with the De La Blache Plutonic Suite (DLBPS), in the eastern part of the Grenville Province. Dated at 1327 Ma, the DLBPS intruded during the middle Elsonian. It consists of an anorthositic to leucotroctolitic core, and a (gabbro)noritic(±Ol) to ultramafic border. The studied prospects can be subdivided in two groups: the Outardes-4 South, Boudrias- Est/Doyon and Buse prospects, hosted in ultramafic rocks; and the Thibault prospect, hosted in leucotroctolites. Geochemical data suggests that the different prospects originated from distinct magmas. Se and S concentrations, as well as δ34S values show an important crustal component, related to contamination by the country-rock gneisses. The Ni-Cu deposits formed in the (ultra)mafic units produced by fractional crystallization, as in the classical sulfide magmatic deposits genesis model. The weak economic importance of the studied prospects can be explained by the absence of key factors generally present in worldclass Ni-Cu-PGE magmatic deposits.