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Recherche et caractérisation du potentiel antiviral et probiotique de nouvelles souches de bactéries lactiques d'origine vaginale / Screening and characterization of antiviral and probiotic properties of novel lactic acid bacteria from human vaginal origin

Al Kassaa, Imad 30 September 2014 (has links)
Dans ce travail, nous avons déterminé la composition de la flore vaginale d'un échantillon signatificatif de femmes Libanaises, puis évaluer l’effet antagoniste des souches lactiques notamment des lactobacilles contre certains pathogènes vaginales. Ainsi, sur les 135 prélèvements effectués, 53 isolats ont été identifiés par les méthodes de galerie API50 CH et pyroséquençage des régions variables (V1 et V2) du gène ADNr 16S. Les résultats obtenus ont montré une discordance entre les deux méthodes utilisées et sus-citées. Les résultats de l'effet antagoniste montrent que 7 souches sont antagonistes. L’identification des souches antagonistes a été confirmée par séquençage complet du gène ADNr 16S. En sus du potentiel antagoniste de ces lactobacilles, nous avons regardé d'autres propriétés biologiques de ces souches pouvant permettre une application probiotique. Trois isolats ont montré des propriétés intéréssantes d'hydrophobicité, d'autoaggrégation et dépourvues des caractères pathogènes. Afin d’évaluer l’effet antiviral de ces 3 isolats, des tests de cytotoxicité et d’adhésion sur une lignée cellulaire "Véro cell" ont été effectués. L’activité antivirale a été évaluée in vitro, vis-à-vis du virus herpétique de type-2 (VHS-2) et du virus non enevelopé CVBE4 comme virus contrôle. l'activité antivirale des lactobacilles a été evaluée dans 3 temps d'addition differents (Pre-infection, co-incubation et post-infection). On a choisi la souche qui a montré la meilleure activité anti-VHS-2, il s’agit de L. gasseri CMUL57. L’activité antivirale de cette souche (CMUL57) a été étudiée profondément afin d’expliquer le mécanisme de cette interaction bactérie/virus. / The aim of this work is to determine the diversity of Lactobacillus species in vaginal flora in samples from Lebanese women and to evaluate the antagonistic effect of these strains against several vaginal pathogens in women. Thus, of the 135 samples collected, 53 isolates were isolated and identified by the gallery API50 CH (BioMerieux, France) and by pyrosequencing of the variable regions (V1 and V2) of the 16S rDNA gene. The results showed a large discrepancy between the two methods used. The antagonism results obtained showed the presence of 7 antagonistic strains against four pathogenic strains. The complete identification of these strains was confirmed by complete sequencing of the 16S gene (16S rDNA). Note that L. plantarum CMUL140 showed a strong anti-S. aureus activity and was used in a co-culture test. In addition to the potential antagonism of these lactobacilli, we looked at other features that can help in using these strains as probiotics. Therefore, we evaluated their probiotic and safe characteristics. To assess the antiviral effect of these three isolates, cytotoxicity and adhesion tests were performed on a "Vero cell" cell line. The results showed that none of three isolates were cytotoxic and carried a strong adhesion. Antiviral activity in vitro was evaluated against the herpes simplex virus type-2 (HSV-2) and CVBE4 as virus control. In order to investigate the anti-HSV-2 activity of lactobacilli, the strains were added to the infected cells at different intervals: pre-infection, co-incubation and post-infection. L.gasseri CMUL57 showed the strongest anti-HSV-2 activity and showed the capacity to trap HSV-2 on their cell wall.

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