Le mercure (Hg) est un élément métallique naturellement présent dans l'environnement qui connaît aussi un cycle d’émission anthropique. Le Hg est présent sous différentes formes inorganiques (mercure élémentaire Hg°; mercure ionique Hg2+) et organiques (e.g. méthylmercure MeHg). Le Hg peut être méthylé dans l'eau et les sédiments par le métabolisme des bactéries pour former du MeHg, la forme chimique la plus toxique qui est de plus bioamplifiée dans la chaîne alimentaire aquatique. Le travail effectué dans cette thèse « Etude de la spéciation et du devenir du mercure dans les eaux côtières » a répondu à trois objectifs: - Déterminer les formes chimiques du Hg dans les eaux côtières à des concentrations inférieures au ng/L (10-9 g/L).- Etudier les transformations du Hg (Méthylation, Deméthylation et Réduction) dans les eaux estuariennes et côtières et leur influence sur le cycle du Hg dans la zone littorale (panache turbide de l’Adour). Evaluer les émissions du Hg gazeux (Hg°) dans les zones estuariennes et côtières par l’utilisation des modèles semi-empirique d’échange gazeux à l’interface eau-atmosphère. / Mercury (Hg) is a metallic element naturally found in all the environmental media that could also be released by anthropogenic processes. Mercury is present in various chemical forms, inorganic (elemental mercury Hg°, ionic mercury Hg2+) and organic (e.g. methylmercury MeHg). Hg can be methylated in water and sediments by the metabolism of the bacteria to form MeHg, the most toxic Hg form which is biomagnified in the aquatic food chain. This work "Study of mercury speciation and fate in coastal waters" had three objectives: - Determination of the chemical forms of Hg in coastal waters at low concentrations, lower than ng/L (10-9 g/L). - Determination of Hg transformations (Methylation, Demethylation and Reduction) in estuarine and coastal waters and their influence on the Hg cycle in the coastal zone (turbid plume of the Adour River). - Evaluation of the emission of gaseous Hg (Hg°) in coastal and estuarine zone using semi-empirical gas exchange models at the water-air interface.