La Stimulation Magnétique Transcrânienne (SMT) est une technique de stimulation neuronale offrant de nombreuses applications médicales. Cependant son utilisation reste empirique. L'objectif de cette thèse était de mettre en place un logiciel permettant de mieux comprendre les effets de la stimulation et d'aider à la réalisation de séances de SMT. Suite au développement de ce logiciel, il est apparu que celui-ci était devenu patrimonial. L'objectif secondaire de ce travail fut donc d'analyser l'obsolescence du logiciel et d'essayer d'apporter des solutions pour limiter ce phénomène via l'utilisation de l'Ingénierie Dirigée par les Modèles (IDM). Après avoir présenté les phénomènes régissant l'activité cérébrale nous présentons les différentes techniques de stimulation neuronale et les avantages qu'offre la SMT. Nous présentons également les bases nécessaires à la compréhension des phénomènes électromagnétiques, puis une introduction aux concepts fondamentaux de l'IDM. Dans une troisième partie, l'accent est mis sur les différentes modélisations et méthodes de calcul des effets de la Stimulation Magnétique Transcrânienne avant de présenter la solution qui a été retenue et implantée dans le simulateur. Les deux dernières parties du manuscrit se focalisent sur le simulateur dans sa globalité (visualisation 3D) puis à la manière dont il pourrait être refactorisé pour faciliter sa maintenance et l'inclusion des évolutions possibles que nous présentons en conclusion.