Spelling suggestions: "subject:"aparine anda aquatic sciences"" "subject:"aparine ando aquatic sciences""
1 |
An assessment of electrofishing at different conductivities as a collection method for stream invertebrates / En bedömning av elfiske vid olika konduktiviteter som en insamlingsmetod för ryggradslösa djurBorgiel, Björn January 2020 (has links)
Electrofishing is a commonly used method to capture fish, but not as frequently used for collecting invertebrates, so-called “electrobugging”. It is well known that electrofishing has a negative effect on some organismss, but not many studies have investigated how invertebrates, e.g. invertebrate larvae are affected. There is no knowledge of whether the larva is damaged or killed by electrofishing. Some larvae can be used assess water quality. A measurement of how polluted freshwater is, the three orders Ephemeroptera, Plecoptera and Trichoptera (EPT) are used, which are very sensitive to pollution and eutrophication in running water. When electrofishing you need to adapt the method due to the water, where an important parameter is the conductivity. In this study, an investigation on how EPT is affected by two different conductivities 15.7 and 25.0 mS/m. How EPT is affected by the catching methods kick sampling and electrobugging. As well as whether there is a difference in catch efficiency between electrobugging and kick sampling depending on the different orders being captured. In this study, the conductivity tests were conducted in a laboratory and the comparison of the two catch methods and catch efficiency were conducted in field. It was 12.5 % of EPT which died in control and 2.5 % died of electrobugging in the two different conductivities. In kick samples, the delayed mortality was higher in the order Trichoptera (31%) than in Ephemeroptera (21%). Water conductivity has no effect on the extent to which EPT is affected by electrobugging at 400V. Only Ephemeroptera is more adversely affected by electrobugging than by kick sampling as a collection method. There is a difference in catch efficiency between electrobugging and kick sampling regarding the order that is caught. / Elfiske är en vanlig metod för att samla in fiskar, men används inte lika ofta för att samla in evertebrater, så kallad ”electrobugging”. Att elfiske påverkar en del organismer negativt är känt men det är inte så många studier som undersökt hur evertebrater t.ex. sländor, påverkas. Det saknas kunskap om huruvida sländorna skadas eller dör till följd av elfisket. Några sländeordningar kan användas för att tala om hur vattnet mår. Ett mått på hur förorenat sötvatten är så används de tre ordningarna Ephemeroptera, Plecoptera, och Trichoptera (EPT) vilka är väldigt känsliga för föroreningar och övergödning i rinnandevatten. När man elfiskar behöver man anpassa metoden efter vattnet, där en viktig parameter är konduktiviteten. I denna studie undersöktes hur EPT påverkas av två olika konduktiviteter 15,7 och 25,0 mS/m. Hur EPT påverkas av fångstmetoderna sparkprov och electrobugging. Samt om det finns en skillnad i fångsteffektivitet mellan electrobugging och sparkprover beroende på vilka olika ordningar som fångas. I denna studie gjordes test på konduktivitet i labb och jämförelsen av de två fångstmetoderna och fångsteffektiviteten i fält. Det var 12,5 % av EPT som dog i kontroll och 2,5 % dog av electrobugging i de två olika konduktiviteterna. I sparkprover var den fördröjda dödligheten högre hos Trichoptera (31%) än hos Ephemeroptera (21 %). Vattnets konduktivitet har inte någon betydelse i för i vilken utsträckning EPT påverkas av electrobugging vid 400V. Det är endast Ephemeroptera som påverkas mer negativt av electrobugging än av sparkprover som insamlingsmetod. Det finns en skillnad i fångsteffektivitet mellan electrobugging och sparkprover gällande vilka ordningar man fångar.
|
2 |
En studie för att kontrollera känsligheten av primers för lake (Lota lota), lax (Salmo salar) och öring (Salmo trutta) / A study to control the sensitivity of primers for burbot (Lota lota), salmon (Salmo salar) and brown trout (Salmo trutta)Borgiel, Björn January 2018 (has links)
eDNA is a fast and popular method to collect information about species presence in the environment. eDNA is DNA that is collected from environmental samples, such as water, from DNA that is expelled from organisms interacting with their environment. eDNA is an effective way to find species with small populations and alien species. There are two ways to analyze eDNA, with high-throughput DNA sequencing methods and DNA metabarcoding or use of species-specific primers and PCR. In this study, we focus on the latter, designing species-specific primers for Burbot, Brown trout, and Atlantic Salmon, testing their validity in detecting eDNA of these species with functional PCR. We also evaluated eDNA collection methods, testing different scenarios in aquarium tanks with different number of dead and alive fishes. Primers and experimental setup such as use of different temperatures of the PCR reaction used in this study didn’t result in a functional PCR as determined by electrophoresis gel. There are some problems with the design of the PCR methods for eDNA since the purpose is to design methods that can identify certain species. However, future development of eDNA methods will probably include sequencing and not detection of PCR product sizes. eDNA methods will complete traditional trapping methods like net and electrofishing, but not replace them. / eDNA är en snabb och populär metod för att samla information om arters abundans i miljön. eDNA är DNA taget från miljö prover, så som vatten, från DNA som frigörs från organismer som intrigerar med deras miljön. eDNA är ett effektivt sätt att hitta arter med små populationer och främmande arter. De finns två olika sätt att analysera eDNA, med DNA-sekvenseringsmetoder med hög genomströmning och DNA-metabarkodning eller användning av artspecifika primrar och PCR. I denna studie fokuserade vi på den senare, designade artspecifika primers för lake, lax och öring, testa deras validitet vid detektering av eDNA hos dessa arter med funktionell PCR. Vi utvärderade också eDNA-insamlingsmetoder, testa olika scenarier i akvarietankar med olika antal döda och levande fiskar. Primers och experimentell uppställning, såsom användning av olika temperaturer för PCR-reaktionen som användes i denna studie, resulterade inte i en funktionell PCR såsom bestämd av elektroforesgel. Det finns några problem med utformningen av PCR-metoderna för eDNA, eftersom syftet är att utforma metoder som kan identifiera vissa arter. Emellertid kommer framtida utveckling av eDNA-metoder troligtvis att inkludera sekvensering och inte detektering av PCR-produktstorlekar. eDNA-metoder kommer att komplettera traditionella fångstmetoder som nät- och elektrofiske, men inte ersätta dem.
|
Page generated in 0.0755 seconds