La grosseur des particules aéroportées contenant des virus varie entre la grosseur du virus et celle de la particule à laquelle il s'accroche. Le comportement aérodynamique des aérosols viraux peut donc varier significativement et influencer l'efficacité de l'échantillonnage avec les échantillonneurs conventionnels. De plus, les virus aéroportés sont exposés à des conditions sévères qui peuvent affecter leur intégrité à tout moment entre la nébulisation et le traitement de l'échantillon. Il n'existe présentement aucun protocole standardisé pour l'échantillonnage d'aérosols viraux. Néanmoins, des échantillonneurs d'air et des méthodes d'analyse ont été essayés en laboratoire et sur le terrain. Suite aux nébulisations contrôlées en laboratoire, il a été conclu que la méthode d'échantillonnage utilisée pouvait avoir une influence significative sur l'intégrité virale. L'analyse du contenu en acides nucléiques par des méthodes de biologie moléculaire est donc mieux adaptée que l'analyse par culture. Les échantillonnages de terrain ont été effectués dans des usines de fabrication de fromages pour la détection d'espèces de bactériophages indésirables et dans des porcheries pour la détection de circovirus porcin de type 2 (CVP2). De faibles concentrations de bactériophages ont été détectées dans l'air des usines de fromages nous conscientisant à la possibilité de contaminations des fermentations par des aérosols. Les échantillons d'air des porcheries ont révélés de fortes concentrations de CVP2 suggérant la possibilité de transmission aéroportée du virus. Les échantillonneurs qui ont permis de détecter des aérosols viraux n'étaient pas les mêmes dans les deux environnements étudiés. Les faibles concentrations de bactériophages aéroportés dans les usines de fromages ont nécessité l'échantillonnage d'importants volumes d'air, alors que les fortes concentrations de virus présents dans les porcheries pouvaient être détectées facilement avec des volumes d'air beaucoup plus petits. La conclusion générale de ce travail est qu'il n'y a pas d'échantillonneur parfait pour les aérosols viraux. Les stratégies d'échantillonnages doivent être adaptées à l'environnement échantillonné et à la méthode d'analyse utilisée. / Airborne viral-laden particles can range from the size of the actual virus to the size of any aerosolized particle. The aerodynamic behavior of the airborne particles can thus vary significantly and influence the efficiency of sampling with conventional aerosol samplers. Furthermore, airborne viruses are exposed to harsh conditions that can affect their integrity at any time between their nebulization and the treatment of the samples. There is no standardized method for the sampling of airborne viruses. Aerosol samplers and analysis methods were tested in the laboratory and in the field. After the controlled nebulizations in the laboratory, it was concluded that the sampling method used could have a significant influence on viral integrity, rendering molecular biological analysis better suited than culture analysis. Field samplings were performed in cheese factories for the detection of undesirable bacteriophages and in swine confinement buildings (SCB) for the detection of porcine circovirus type 2 (PCV2). Low concentrations of airborne bacteriophages were found in the cheese factories raising the awareness for the possibility of fermentation vat contamination through the airborne route. Air samples from the SCB revealed very high concentrations of PCV2 suggesting the possibility of aerosol transmission of this virus. The samplers allowing the detection of airborne viruses were not the same in both environments. The low concentrations of airborne bacteriophages in the cheese plant necessitated large volumes of air samples, while the higher concentrations of viruses found in the SCB could be detected well over the detection limit with smaller volumes. The general conclusion of this work is that there is no perfect viral aerosol sampler. Sampling strategies need to be adapted to the environment sampled and to the analysis method used.