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Densidade microbiológica e potencial metabólico em cerrado nativo e cultivado / Microbiological density and metabolic potential at cerrado soil

Freitas, Douglas Siqueira 19 July 2014 (has links)
Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2015-03-26T11:47:22Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Douglas Siqueira Freitas - 2014.pdf: 1490936 bytes, checksum: 760aec6ca100ccf3d644ceaf93ade6ff (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2015-03-27T10:44:02Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Douglas Siqueira Freitas - 2014.pdf: 1490936 bytes, checksum: 760aec6ca100ccf3d644ceaf93ade6ff (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-27T10:44:02Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Douglas Siqueira Freitas - 2014.pdf: 1490936 bytes, checksum: 760aec6ca100ccf3d644ceaf93ade6ff (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2014-07-19 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The conservation of native and cultivated soils quality in the Cerrado region, seen by a microbiological point of view, has been discussed with both ecological as productive focus. In this work, the quality of native Cerrado was contrasted with that present in no-tillage system (soybean/sorghum), crop-livestock system (soy/pasture), cultivated coffee, eucalyptus forest and not managed grassland, to form the object of study. Since it is laborious to assess all the physical and chemical parameters that surround the quality of soil and, as the community of fungi and bacteria receive direct influence of these factors, the microbiological study can answer questions about the quality of a native or cultivated system. For this study 10 composite samples were collected within each cropping system on a transect shape, lying 20 meters from each other. The microbial community was evaluated for its density from the quantification of microbial biomass carbon, total carbon, microbial biomass nitrogen and total nitrogen. Once is known that the quantitative assessment would not be enough to express the behavior of microbial community, an analysis of the metabolic potential based on degrading capacity of substrates, enzyme assay and basal soil respiration tests were applied. Quantitative data showed that areas of pasture and no-tillage had similar microbial biomass of the soil under native Cerrado (control) but differ significantly in the degradative capacity of substrates and enzyme activity, showing that crops impress selection under microbiota in these areas. / A conservação da qualidade de solos nativos e cultivados na região do Cerrado, vista do ponto de vista microbiológico, tem sido discutida tanto com foco ecológico quanto produtivo. Neste trabalho, a biota do solo sob Cerrado nativo foi contrastada com aquela presente nos sistemas de cultivo plantio direto (soja/sorgo), integração lavoura-pecuária (soja/braquiária), café, floresta de eucalipto cultivada e pastagem não manejada, formando o objeto de estudo. Posto que é laborioso levantar todos os parâmetros físicos e químicos que circundam a qualidade de um solo e como a comunidade de fungos e bactérias sofre influência direta destes fatores, o estudo microbiológico, exclusivamente, pode responder sobre a qualidade de um sistema nativo ou cultivado. Para este estudo foram coletadas 10 amostras compostas dentro de cada sistema de cultivo em forma de transecto, distando 20 metros entre si. A comunidade microbiológica foi avaliada quanto a sua densidade a partir da quantificação do carbono da biomassa microbiana, do carbono total, do nitrogênio da biomassa e do nitrogênio total. Sabendo que a avaliação quantitativa não seria suficiente para expressar o comportamento da comunidade microbiana, a análise do potencial metabólico baseada nos testes de capacidade degradativa de substratos, teste enzimático e respiração basal do solo, foram aplicadas. Os dados quantitativos mostraram que as áreas de pastagem e plantio direto apresentam uma biomassa microbiana semelhante ao solo sob Cerrado nativo (controle) porém divergem significativamente na capacidade degradativa dos substratos e na atividade enzimática, mostrando que o cultivo imprimiu seleção sobre a microbiota nestas áreas.
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Caracterização genética e fisiológica de Crinipellis perniciosa. / Genetic and fisiological characterization de Crinipellis perniciosa.

Taís Guimarães Lana 23 April 2004 (has links)
O fungo basidiomiceto Crinipellis perniciosa é o agente causal da vassoura-de-bruxa do cacaueiro (Theobroma cacao), podendo causar sérios perdas na produção. Este fungo é capaz de colonizar, além do cacau, várias outras plantas hospedeiras, onde pode se adaptar às novas condições, contribuindo, dessa forma, para o aumento da variabilidade genética desse microrganismo. Assim sendo, o objetivo desse trabalho foi isolar e identificar C. perniciosa de tecidos sadios de cacaueiro e comparar a sua variabilidade genética e fisiológica com isolados patogênicos por meio de análises moleculares e fisiológicas. Após a desinfecção e retirada da casca dos ramos, colônias morfologicamente similares a C. perniciosa foram obtidas de tecidos sadios de cacaueiro, os quais foram considerados como endófitos. A identificação preliminar desses isolados foi baseada nas observações morfológicas, tais como coloração da colônia e presença de grampos de conexão. Posteriormente, os isolados de C. perniciosa foram caracterizados geneticamente por RAPD, e sequenciamento de regiões do rDNA (18S+5.8S+28S), resistência a fungicidas, produção de exoenzimas e patogenicidade ao cacaueiro. A análise por marcadores RAPD separou os 37 isolados em 8 grupos (G1 a G8), sendo o grupo G1 dividido em 2 subgrupos (G1-1 e G1-2). Por esta análise foi possível observar que linhagens com 100 % de similaridade foram isoladas de locais diferentes, enquanto que isolados obtidos de uma mesma planta podem ser geneticamente diferentes. A análise da seqüência do rDNA dos isolados de C. perniciosa mostrou a formação de 6 grupos distintos (R1 a R6). Isolados obtidos de uma mesma planta não se agruparam, reforçando a hipótese de que isolados geneticamente diferentes podem ocupar a mesma planta hospedeira. Quanto resistência a fungicidas (tebuconazole, mancozeb, benomil e óxido cuproso), foi observado que tebuconazole foi o mais eficiente na inibição do crescimento miceliar, enquanto benomil apresentar menor taxa de inibição. Isolados endofíticos e patogênicos apresentaram comportamento similar em relação aos fungicidas. Resultado semelhante foi observado quanto a produção de exoenzimas (amilase, lipase, pectinase, exo e endoglicanase). Foi observada a produção de todas as enzimas avaliadas, sendo possível detectar variações entre os isolados. Entretanto, esta variação não foi correlacionada ao hábito endofítico ou patogênico. A patogenicidade de 8 isolados de C. perniciosa foi avaliada em mudas de cacau Catongo. A porcentagem de plantas infectadas com sintomas variou de 55% a 100%. Isolados endofíticos apresentaram baixa virulência sobre o cacaueiro, tendo o isolado endofítico 31 induziu sintomas em 60% das plantas inoculadas, resultado este provavelmente devido à alta pressão de inóculo. Este trabalho mostra pela primeira vez C. perniciosa como endófito em tecidos não meristemático do cacaueiro. / The basidiomycete fungus Crinipellis perniciosa (Stahel) Singer is the causal agent of Witches' Broom Disease of Cacao (Theobroma cacao L.) which is the main factor limiting cocoa production in the Americas. Pod losses of up to 90% are experienced in affected areas as evidenced by the 50% drop in production in Bahia province, Brazil following the arrival of the C. perniciosa in the area in 1989. The disease has proven particularly difficult to control and many farmers in affected areas have given up cacao cultivation. Any useful control strategy for Witches' Broom disease must be effective against in range strains of the pathogen. It is already known that pathogenic variation exists among isolates of Crinipellis perniciosa obtained from different areas and host plants. However, any study was developed about the variability between endophytic and pathogenic population. In order to evaluate the genetic variability of 35 isolates of endophytic and pathogenic populations of Crinipellis perniciosa, the RAPD technique, ITS sequencing and fungicide susceptibility were performed. Genetic variability between 35 isolates of C. perniciosa was analysed by the random amplified polymorphic DNA (RAPD) technique, which indicated that isolates from other host plants were more diverse than isolates obtained from cacao plants. Among cacao isolates was observed at least two groups, one formed mainly by endophytic isolates and other by pathogenic ones. Analysis by ITS sequence grouped isolates independently of endophytic or pathogenic status. Fungicide susceptibility showed that cupric oxide inhibits statistically more endophytic isolates than pathogenic ones, showing that could have physiological differences between these populations. The present study highlighted the possible genetic and physiological differences between endophytic and pathogenic population of C. perniciosa.
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Efeitos da utilização de inoculantes microbianos em silagem de capim elefante com ou sem o uso de melaço

SILVA, Jefferson Salvador Lima Padilha da 06 February 2012 (has links)
Submitted by Cássio da Cruz Nogueira (cassionogueirakk@gmail.com) on 2017-05-15T15:59:16Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_EfeitoUtilizacaoInoculantes.PDF: 256880 bytes, checksum: ba9e77e3639c11d543032335a6b24ed5 (MD5) / Approved for entry into archive by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2017-05-18T12:13:32Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_EfeitoUtilizacaoInoculantes.PDF: 256880 bytes, checksum: ba9e77e3639c11d543032335a6b24ed5 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-18T12:13:32Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_EfeitoUtilizacaoInoculantes.PDF: 256880 bytes, checksum: ba9e77e3639c11d543032335a6b24ed5 (MD5) Previous issue date: 2012-02-06 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Objetivou-se avaliar a eficiência da utilização de inoculantes microbianos Lactobacillus plantarum + Pediococcus acidilactici e o uso de melaço na ensilagem de capim elefante. Os tratamentos: T1=Tratamento controle, sem inoculante e sem melaço; T2 = Tratamento com inoculação de 1,0x105 Lactobacillus plantarum + Pediococcus acidilactici + adição de 5% de melaço baseado na matéria verde do capim ensilado; T3 = Tratamento com inoculação de 1,0x105 Lactobacillus plantarum + Pediococcus acidilactici, sem melaço; T4 = Tratamento com inoculação de 1,0x106 Lactobacillus plantarum + Pediococcus acidilactici, com melaço e; T5 = Tratamento com inoculação de 1,0x106 Lactobacillus plantarum + Pediococcus acidilactici, sem melaço. Os resultados obtidos, mostraram que os inoculantes promoveram nas silagens um aumento nos teores de MS, PB, pH e nitrogênio amoniacal (%NH3/NT) entre o dia da abertura dos silos (dia 0) e no décimo dia de exposição ao ar (dia 10). Para FDN os valores foram menores após os dez dias de exposição ao ar. Os tratamentos 1, 2 e 3, tiveram melhores resultados quanto a contagem de fungos e leveduras no dia da abertura das silagens. O uso de inoculantes proporcionou as menores concentrações em relação a NH3/NT, mas não apresentaram diferenças significativas com os tratamentos inoculados. As perdas por efluentes e a recuperação de matéria seca não tiveram diferenças significativas (p >0,05). A utilização do melaço influenciou de forma positiva na estabilidade aeróbia, obtendo estabilidade até 27,5 horas após abertura dos silos, encontradas nos tratamentos 2 e 4. A utilização de melaço na dose de 1,0x105 de Lactobacillus plantarum + Pediococcus acidilactici com a adição de melaço foi o tratamento em que se obtiveram os melhores resultados para estabilidade, contagem de fungos e bactérias.

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