Dans cette thèse, nous traitons le problème de la séparation de sources audio multicanale par réseaux de neurones profonds (deep neural networks, DNNs). Notre approche se base sur le cadre classique de séparation par algorithme espérance-maximisation (EM) basé sur un modèle gaussien multicanal, dans lequel les sources sont caractérisées par leurs spectres de puissance à court terme et leurs matrices de covariance spatiales. Nous explorons et optimisons l'usage des DNNs pour estimer ces paramètres spectraux et spatiaux. À partir des paramètres estimés, nous calculons un filtre de Wiener multicanal variant dans le temps pour séparer chaque source. Nous étudions en détail l'impact de plusieurs choix de conception pour les DNNs spectraux et spatiaux. Nous considérons plusieurs fonctions de coût, représentations temps-fréquence, architectures, et tailles d'ensembles d'apprentissage. Ces fonctions de coût incluent en particulier une nouvelle fonction liée à la tâche pour les DNNs spectraux: le rapport signal-à-distorsion. Nous présentons aussi une formule d'estimation pondérée des paramètres spatiaux, qui généralise la formulation EM exacte. Sur une tâche de séparation de voix chantée, nos systèmes sont remarquablement proches de la méthode de l'état de l'art actuel et améliorent le rapport source-interférence de 2 dB. Sur une tâche de rehaussement de la parole, nos systèmes surpassent la formation de voies GEV-BAN de l'état de l'art de 14%, 7% et 1% relatifs en terme d'amélioration du taux d'erreur sur les mots sur des données à 6, 4 et 2 canaux respectivement / This thesis addresses the problem of multichannel audio source separation by exploiting deep neural networks (DNNs). We build upon the classical expectation-maximization (EM) based source separation framework employing a multichannel Gaussian model, in which the sources are characterized by their power spectral densities and their source spatial covariance matrices. We explore and optimize the use of DNNs for estimating these spectral and spatial parameters. Employing the estimated source parameters, we then derive a time-varying multichannel Wiener filter for the separation of each source. We extensively study the impact of various design choices for the spectral and spatial DNNs. We consider different cost functions, time-frequency representations, architectures, and training data sizes. Those cost functions notably include a newly proposed task-oriented signal-to-distortion ratio cost function for spectral DNNs. Furthermore, we present a weighted spatial parameter estimation formula, which generalizes the corresponding exact EM formulation. On a singing-voice separation task, our systems perform remarkably close to the current state-of-the-art method and provide up to 2 dB improvement of the source-to-interference ratio. On a speech enhancement task, our systems outperforms the state-of-the-art GEV-BAN beamformer by 14%, 7%, and 1% relative word error rate improvement on 6-channel, 4-channel, and 2-channel data, respectively