Un nombre croissant d'ontologies de grandes tailles ont été développées et mises à disposition dans des référentiels tels que le NCBO Bioportal. L'accès aux connaissances les plus pertinentes contenues dans les grandes ontologies a été identifié comme un défi important. À cette fin, nous proposons dans cette thèse trois notions différentes : modules d’ontologie minimale (sous-ontologies conservant toutes les implications sur un vocabulaire donné), meilleurs extraits ontologiques (certains petits nombres d’axiomes qui capturent le mieux les connaissances sur le vocabulaire permettant un degré de perte sémantique) et un module de projection (sous-ontologies d'une ontologie cible qui impliquent la subsomption, les requêtes d'instance et les requêtes conjonctives issues d'une ontologie de référence). Pour calculer le module minimal et le meilleur extrait, nous introduisons la notion de justification de subsomption en tant qu'extension de la justification (ensemble minimal d'axiomes nécessaires pour conserver une conséquence logique) pour capturer la connaissance de subsomption entre un terme et tous les autres termes du vocabulaire. De même, nous introduisons la notion de justifications de projection qui impliquent une conséquence pour trois requêtes différentes afin de calculer le module de projection. Enfin, nous évaluons nos approches en appliquant une implémentation prototype sur de grandes ontologies. / An increasing number of ontologies of large sizes have been developed and made available in repositories such as the NCBO Bioportal. Ensuring access to the most relevant knowledge contained in large ontologies has been identified as an important challenge. To this end, in this thesis, we propose three different notions: minimal ontology modules (sub-ontologies that preserve all entailments over a given vocabulary), best ontology excerpts (certain, small number of axioms that best capture the knowledge regarding the vocabulary by allowing for a degree of semantic loss) and projection module (sub-ontologies of a target ontology that entail subsumption, instance and conjunctive queries that follow from a reference ontology). For computing minimal module and best excerpt, we introduce the notion of subsumption justification as an extension of justification (a minimal set of axioms needed to preserve a logical consequence) to capture the subsumption knowledge between a term and all other terms in the vocabulary. Similarly, we introduce the notion of projection justifications that entail consequence for three different queries in order to computing projection module. Finally, we evaluate our approaches by applying a prototype implementation on large ontologies.