Notre patrimoine génétique dévoile, de plus en plus, les passerelles démogénétiques d’une susceptibilité plus accrue de certains individus à des maladies infectieuses complexes. En vue d’une caractérisation de la variabilité génétique des populations ouest-africaines, nous avons analysé 659 chromosomes X au locus dys44 qui comprend, 35 SNPs et un microsatellite distribués sur 2853 pb en amont et 5034 pb en aval de l’exon 44 du gène de la dystrophine en Xp21.3. Les génotypes obtenus, par ASO dynamique et électrophorèse sur gel d’acrylamide, ont servi à la détermination des haplotypes. Des paramètres comme la diversité haplotypique (G) et l'indice de fixation (Fst) ont été calculés. Des analyses en composantes principales ainsi que multidimensionnelles ont été réalisées. Sur 68 haplotypes détectés, 26 sont nouveaux, et cette région, avec une diversité haplotypique moyenne (Gmoy) de 0,91 ± 0,03, se révèle beaucoup plus hétérogène que le reste du continent (Gmoy = 0,85 ± 0,04). Toutefois, malgré l’existence de disparités sous régionales dans la distribution des variants du marqueur dys44, l’AMOVA montre d’une manière générale, une faible érosion de l’éloignement génétique entre les populations subsahariennes (Fst = 1,5% ; p<10-5). Certains variants tel que l’haplotype eurasien B006 paraissent indiquer des flux transsahariens de gènes entre les populations nord-africaines et celles subsahariennes, comme l’exemplifie le pool génétique de l’une des populations ubiquitaires de la famille linguistique Nigéro-congolaise : Les Fulani. Nos résultats vont aussi dans le sens d’un héritage phylétique commun entre les Biaka, les Afro-américains et les populations de la sous-famille de langues Volta-Congo. / The unravelling of our genetic heritage has revealed a demogenetic segueway leading to an increased susceptibility of certain individuals to complex infectious diseases. In order to characterize genetic variability among the West African populations, we analyzed 659 X chromosomes at the dys44 locus which comprises 35 SNPs and a microsatellite spanning a region 2853 bp upstream and 5034 bp downstream of exon 44 of the dystrophine gene in Xp21.3. The resulting genotypes, obtained by dynamic allele specific oligonucleotide hybridization and acrylamide gel electrophoresis, were used for haplotype construction. Gene diversity parameters such as the haplotypic diversity (G) and fixation indexes (Fst) were estimated. Multidimensional analysis of the data, including principal component analysis was also performed. Of the 68 distinct haplotypes detected in our data set, 26 were novel. The mean haplotypic diversity (Gmoy) was 0.91 ± 0.03 for this West African region which was shown to be more heterogeneous than the rest of the continent (Gmoy = 0.85 ± 0.04). However, despite certain sub-regional differences in the distribution of dys44 variants, the analysis of molecular variance showed an overall decline in the genetic distance between Sub-Saharan populations (Fst = 1.5% ; p<10-5). Certain variants, such as the Eurasian-specific haplotype B006, appear to suggest a Trans-Saharan gene flux between North African and Sub-Saharan populations as exemplified by the observed genetic pool of one of the ubiquitous populations of the Nigerian-Congolese linguistic family: The Fulani. Our results are also in agreement with a phyletic heritage between the Biaka, the Afro-Americans and the populations of the Volta-Congo language subfamilies.

Notre patrimoine génétique dévoile, de plus en plus, les passerelles démogénétiques d’une susceptibilité plus accrue de certains individus à des maladies infectieuses complexes. En vue d’une caractérisation de la variabilité génétique des populations ouest-africaines, nous avons analysé 659 chromosomes X au locus dys44 qui comprend, 35 SNPs et un microsatellite distribués sur 2853 pb en amont et 5034 pb en aval de l’exon 44 du gène de la dystrophine en Xp21.3. Les génotypes obtenus, par ASO dynamique et électrophorèse sur gel d’acrylamide, ont servi à la détermination des haplotypes. Des paramètres comme la diversité haplotypique (G) et l'indice de fixation (Fst) ont été calculés. Des analyses en composantes principales ainsi que multidimensionnelles ont été réalisées. Sur 68 haplotypes détectés, 26 sont nouveaux, et cette région, avec une diversité haplotypique moyenne (Gmoy) de 0,91 ± 0,03, se révèle beaucoup plus hétérogène que le reste du continent (Gmoy = 0,85 ± 0,04). Toutefois, malgré l’existence de disparités sous régionales dans la distribution des variants du marqueur dys44, l’AMOVA montre d’une manière générale, une faible érosion de l’éloignement génétique entre les populations subsahariennes (Fst = 1,5% ; p<10-5). Certains variants tel que l’haplotype eurasien B006 paraissent indiquer des flux transsahariens de gènes entre les populations nord-africaines et celles subsahariennes, comme l’exemplifie le pool génétique de l’une des populations ubiquitaires de la famille linguistique Nigéro-congolaise : Les Fulani. Nos résultats vont aussi dans le sens d’un héritage phylétique commun entre les Biaka, les Afro-américains et les populations de la sous-famille de langues Volta-Congo. / The unravelling of our genetic heritage has revealed a demogenetic segueway leading to an increased susceptibility of certain individuals to complex infectious diseases. In order to characterize genetic variability among the West African populations, we analyzed 659 X chromosomes at the dys44 locus which comprises 35 SNPs and a microsatellite spanning a region 2853 bp upstream and 5034 bp downstream of exon 44 of the dystrophine gene in Xp21.3. The resulting genotypes, obtained by dynamic allele specific oligonucleotide hybridization and acrylamide gel electrophoresis, were used for haplotype construction. Gene diversity parameters such as the haplotypic diversity (G) and fixation indexes (Fst) were estimated. Multidimensional analysis of the data, including principal component analysis was also performed. Of the 68 distinct haplotypes detected in our data set, 26 were novel. The mean haplotypic diversity (Gmoy) was 0.91 ± 0.03 for this West African region which was shown to be more heterogeneous than the rest of the continent (Gmoy = 0.85 ± 0.04). However, despite certain sub-regional differences in the distribution of dys44 variants, the analysis of molecular variance showed an overall decline in the genetic distance between Sub-Saharan populations (Fst = 1.5% ; p<10-5). Certain variants, such as the Eurasian-specific haplotype B006, appear to suggest a Trans-Saharan gene flux between North African and Sub-Saharan populations as exemplified by the observed genetic pool of one of the ubiquitous populations of the Nigerian-Congolese linguistic family: The Fulani. Our results are also in agreement with a phyletic heritage between the Biaka, the Afro-Americans and the populations of the Volta-Congo language subfamilies.

Le long des côtes nord-ouest africaines, parmi les plus poissonneuses au monde, les ressources halieutiques sont importantes tant du point de vue socio-économique que culturel. Les petits poissons pélagiques sont suivis au niveau sous régional depuis plus de trois décennies en s’appuyant sur les méthodes hydroacoustiques d’évaluation de stocks. Ces campagnes ont ainsi permis de fournir aux gouvernants une base scientifique en matière de prise de décision à des fins d’aménagement des pêcheries pélagiques. Un défi spécifique est de connaitre leur représentativité par rapport aux stocks ciblés. Nous rassurons sur cette représentativité sur la couverture de Sardinella aurita par ces campagnes. Par contre, pour S. maderensis une partie du stock ne serait pas échantillonnée et la méthode n’est pas adaptée pour Illisha africana et Ethmalosa fimbriata. Nous reportons des déplacements vers le nord dans la répartition de S. aurita et d’autres espèces de pélagique, attribués à la redistribution de l'intensité et de la productivité des upwellings [découpé en 5 sous zones du sud Maroc au sud Sénégal], diminuant ainsi l’abondance de la sardinelle dans la région côtière intertropicale. Pour la première fois en utilisant des séries chronologiques d'observation indépendantes à la méso-échelle, nous montrons un changement vers le nord dans la distribution de S. aurita depuis 1995 et l'attribuons au fort réchauffement de l'océan dans la région. De plus les changements spatiaux observés dans la biomasse de S. aurita au cours des 20 dernières années sont du même ordre de grandeur que ceux enregistrés pour les isothermes de surface. De tels changements auront une incidence sur les considérations politiques dans la gestion de la sécurité alimentaire dans plusieurs pays d'Afrique de l'Ouest. / Along the coast of North-West Africa, among the richest waters over the word, fish supply is important at both socio-economic and cultural levels. In this region, the small pelagic fish are the most abundant marine resources and are monitored using hydroacoustic stock assessment methods since more than three decades. These surveys have allowed providing to local authorities a sound scientific basis for deciding about the management of pelagic fisheries. A specific challenge is to know the representativity of these surveys with respect to the stocks targeted. In this work, we confirm this representativity for Sardinella aurita stock while for S. maderensis, a part of the stock could have not been sampled and for pour Ilisha africana and Ethmalosa fimbriata these surveys are not the best tool. Furthermore, Northward shifts in the distribution of sardinella in the Canary Current Large Marine Ecosystem are recorded in this work and have been attributed to the redistribution of upwelling intensity and productivity, resulting in the abundance of sardinella decreasing in the inter-tropical coastal region. Here for the first time using independent observational time series, we report a robust northward shift in S. aurita since 1995 and attribute it to the strong ocean warming in the region. The observed spatial shifts in biomass in the last 20 years are of the same order of magnitude as those recorded for surface isotherms. Such changes will impact policy considerations in the management of food security in several West African countries and should be considered with respect to “Intended Nationally Determined Contributions”.