Tese de mestrado integrado. Engenharia Electrotécnica e de Computadores. Faculdade de Engenharia. Universidade do Porto. 2012

Tese de Mestrado Integrado. Engenharia Informática e Computação. Faculdade de Engenharia. Universidade do Porto. 2012

Tese de Mestrado Integrado. Engenharia Informática e Computação. Faculdade de Engenharia. Universidade do Porto. 2012

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<p>DNA partition or segregation is the process that ensures the stable inheritance of genomic material. The majority of the bacterial plasmid and some chromosomal partition systems utilize ParA Walker-box-based partition systems. These systems require three components: a DNA centromere site, the ParA ATPase, and the ParB centromere binding protein. ParB binds to the centromere to form the partition complex, which then recruits the motor protein ParA. ParA mediates the partition of replicated DNA by a still poorly understood mechanism. Notably, recent data indicates that ParA Walker-box-based partition systems are employed not only by bacterial plasmids and chromosomes but also DNA elements in archaea. The work in this thesis focused on a homolog of the ParA protein from the first identified archaeal plasmid partition system, located on the plasmid pNOB8. pNOB8 plasmid is harbored in the thermophilic archaeaon, Sulfolobus solfataricus. The goals of this work were to structurally and biochemically characterize the ParA homolog to gain insights into its function.</p><p>Towards these goals, the structure of the ParA homolog was solved by X-ray crystallography in its apo and ADP bound states to resolutions of 2.45 Å and 2.73 Å, respectively. The overall structure was similar to bacterial ParA proteins. We next demonstrated that, similar to bacterial ParA proteins, this ParA homolog harbored ATP-dependent nonspecific DNA capabilities by using fluorescence polarization based DNA binding assays. By mutating the residues in the deviant Walker A motif, we were able to demonstrate the importance of ATP binding in its DNA binding function. Moreover, characterization of ATP and ADP binding were performed using ITC. Finally, we observed that ParA was able to form polymers in the presence of ATP, using negative stain electron microscopy. Our findings provide evidence that ParA Walker-box-based partition systems, which are the most common systems in bacteria, appear to also be found in archaea.</p> / Dissertation

We cannot analyze higher education without first examining the context in which higher education institutions must accomplish their mission.The world around us has growing increasingly complex, with alarming imbalances indeed, ours is a world of great inequality and inconsistency. Paradoxically, as the world becomes a greater whole, it sometimes appears to be shrinking. Globalization and interdependence among societies are today the general trend. Globalization is at once obvious, subconscious and omnipresent (Morin, 1999). It is also multifaceted, and should therefore be seen as a dynamic, heterogeneous process, rather than as a single reality. For some, globalization has brought benefits and opened new paths; for others, it has meant the loss of leadership and autonomy, as well as the social fragmentation of the world, in the service of the global economy. The world should be different from what it is. We are responsible for constructing aviable future for coming generations. Democracy, equity, social justice, peace, harmony and environmental conservation are important issues that require a positive transformation.Universities remain the most important institutions of higher education. They bring together that which has survived, that which is now living, and that which is still to come (Fuentes, 2002). These social institutions carry out strategic functions in cultural, scientific and technological development, as well as in projects of societal consolidation.This new world we envision requires a new sort of university one which creatively reexamines its missions and functions, and which reinvents itself, if necessary, in order to meet the challenges of contemporary circumstances. Universities must continue to serve as places for reflection and creativity, and as the developers of tools for social analysis, critical reflection and sustainability.At universities, new generations acquire theskills, knowledge and values that will all ow them to make good decisions throughout their lives. Logically, the educational content, the values and the abilities that students acquire must be in tune with society's new needs. Relevance should therefore be the main criterion used in determining whether higher education institutions are fulfilling their social function. Over the years, universities have been concerned about their relevance and theirability to respond to society in general. As a result of this concern, social changes have had a considerable impact on higher education institutions. In evaluating the relevance of an institution, therefore, we must take into account its original characteristics, its diversity, its various missions and objectives, and its organization. This preliminary analysis makes it possible to link relevance to quality. Efforts to improve the quality of higher education such as accreditation systems must not fail to consider the criterion of relevance.Quality is the result of a set of actions that respond to society's needs at a particular moment in time. Therefore, accreditation systems aimed at guaranteeing quality cannot conform to a single, universal model, or be based solely on theory and abstraction, or respond exclusively to market trends.This thesis describes a system of qualitative criteria and indicators that take social commitment into account. This system is designed to be used in accreditation processes to guarantee the quality of higher education institutions.

Mestre -- Escola Nacional de Saude Publica, Rio de Janeiro, 2002.

o principal objetivo desta pesquisa foi contribuir com a produção de informações destinadas a orientar o planejamento de espaços abertos junto a edificações de instituições para idosos, através do estudo das necessidades de seus usuários. A busca destas informações partiu da investigação da realidade vigente no município de Porto Alegre-RS, entre as instituições que atendem o público idoso de menor poder aquisitivo. Para isso, foram desenvolvidos dois estudos de campo. Visando obter uma visão geral sobre a situação dos espaços abertos nas instituições, o primeiro estudo consistiu de um levantamento preliminar, onde foram analisadas características fisicas de áreas externas existentes em uma amostra de doze instituições distribuídas na zona urbana do município. Os resultados deste estudo revelaram, em alguns casos, áreas externas muito limitadas e, na maioria dos casos, uma qualidade bastante fnsatisfatória dos espaços abertos disponíveis. O segundo estudo foi um estudo de caso múltiplo envolvendo duas instituições selecionadas dentre aquelas estudadas no levantamento preliminar. Partindo da abordagem utilizada nos estudos da interfuce comportamento humano e ambiente, referenciados na Psicologia Ambiental, este estudo teve por objetivo investigar as relações entre os espaços abertos das instituições e seus usuários, utilizando, como fontes de evidência, levantamentos fisicos, registros de arquivos, entrevistas e observações. Em suma, os resultados deste trabalho revelaram que: a) a presença de espaços abertos é considerada importante pelos idosos e pelos demais personagens das instituições; b) os idosos raramente visitam outros espaços abertos fora da instituição c) a qualidade dos espaços abertos disponíveis contribui positivamente com a satisfução dos idosos em relação à instituição, com a percepção dos idosos sobre a importância dos espaços abertos e com o tempo de permanência dos mesmos nas áreas externas; d) os idosos tendem a perceber o pátio predominantemente como um local de atividade; e) vegetação e Íllfta- restrutura para lazer ativo são as principais características associadas ao "pátio ideal" pelos idosos; f) a vegetação é avaliada positivamente pelos idosos, sobretudo, por seu caráter ornamental e produtivo; g) idosos consideram importante a possibilidade de cultivarem plantas no pátio da instituição; h) as características que mais influenciam a utilização do pátio pelos idosos são: acessibilidade e segurança, proximidade das edificações, liberdade de acesso, conforto, presença de elementos de interesse, possibilidade de desenvolvimento deatividades, e privacidade. Também se verificou que administradores, funcionários e visitantes não percebem o pátio da instituição como um local para seu próprio proveito.

La presente investigación tiene como objetivo estudiar la relación entre el bienestar psicológico y esperanza en internas de un penal de Lima. Además, se investigó los puntajes en estos dos constructos de acuerdo a algunas variables sociodemográficas y carcelarias. Para esto, se administró la Escala de Bienestar psicológico de Ryff, adaptada por Cubas (2003), con las modificaciones realizadas por Guimet (2011), y la prueba de Esperanza adaptada por Martínez, Cassaretto & Herth (2012) a un grupo de 59 internas. Los resultados mostraron que existe una relación significativa tanto entre las escalas globales de ambos constructos como entre algunas de sus respectivas dimensiones. Asimismo, se pudo observar que, tanto los niveles de bienestar psicológico como de esperanza, mostraron diferencias significativas según algunas variables, como el grado de instrucción, ubicación de la pareja, número de ingresos y tipo de visitas, en el caso del primer constructo; y de ubicación de la pareja y tipo de pabellón para el segundo constructo. / This research aims to study the relationship between well-being and hope in inmates from a prison in Lima. It also investigated the scores on these two constructs based on socio-demographic and penitentiary variables. In order to this, tests as the Psychological Well-being Scale Ryff adapted by Cubas (2003), in its new version by Guimet (2011), and the test Hope in Martinez, Cassaretto & Herth version (2012), were used in a group of 59 inmates. The results showed that there is a positive and significant relationship between the global scales in both tests and between some of their respective dimensions. In addition, both levels of psychological well-being and hope, show significant differences according to different variables such as educational attainment, location of the couple, income and number and kind of visits, in relation to the first construct; and location of the couple and type of flag in relation to the second construct. / Tesis

A incidência de câncer de cavidade oral vem aumentando progressivamente em todo mundo, conforme dados da OMS. Não obstante, o diagnóstico de CCO costuma ser feito tardiamente, resultando em uma menor sobrevida para esses pacientes. Por isso, a investigação de novos métodos de diagnóstico precoce pode contribuir para a redução da mortalidade dessa neoplasia. O teste de micronúcleos para o monitoramento de indivíduos com alto risco de CCO vem demonstrando ser um método de baixo custo e de fácil aplicação. É relevante ressaltar; entretanto, que não há relatos na literatura sobre a acurácia diagnóstica do teste de micronúcleos para lesões da cavidade oral. Desta forma, o presente estudo teve o objetivo de verificar a sensibilidade e a especificidade do teste de micronúcleos para detectar lesões de cavidade oral malignas ou potencialmente malignas. Trata-se de um estudo transversal com 48 participantes, que foram submetidos à biópsia de lesões da cavidade oral no ambulatório de Estomatologia do Hospital de Clínicas de Porto Alegre. As amostras de células esfoliadas foram coletadas em dois sítios diferentes da cavidade oral e a coloração de Feulgen foi utilizada para análise dos micronúcleos. As frequências de micronúcleos em amostras da área peri-lesional que foram maiores que 0,0005 apresentaram uma sensibilidade de 63,6% (49,9 – 77,2) e uma especificidade de 43,2% (29,1 – 57,9). Os valores preditivo positivo e preditivo negativo foram respectivamente de 25% (12,7 – 37,2) e 80% (68,6 – 91,3). Esses resultados sugerem que o teste de micronúcleos é pouco sensível e específico. / The World Health Organization predicts a continuing worldwide increase in the number of patients with oral cancer. Moreover, late diagnosis is often a reality for oral cavity cancer patients, leading to a poor overall survival rate. Investigations of screening methods that could contribute to early detection of cancer are; therefore, highly desirable. The micronucleus assay is a non-evasive, rapid, simple, sensitive and cost-effective bio-marker of chromosome damage. Nevertheless, as far as we know, there are no reports of the sensitivity and specificity of micronucleus test frequency for detecting malignant or potentially malignant oral cavity lesions in the literature. In order to fill this gap, we carried out a cross-sectional study with 48 participants presenting oral cavity lesion, who were indicated to undergo surgery biopsy (our reference standard) at Hospital de Clínicas de Porto Alegre. Samples of exfoliated cells were collected from two different sites in the oral cavity and Feulgen-Fast-Green staining was used to analyze the micronucleus. Eleven patients (22.9%) presented malignant or potentially malignant oral cavity lesions. In samples of perilesional area, micronucleus frequencies that were higher than 0.0005 had a sensitivity of 63.6% (49.9 - 77.2) and a specificity of 43.2% (29.1 - 57.9). The predictive positive (PPV) and negative (PNV) values were 25% (12.7 - 37.2) and 80% (68.6 - 91.3) respectively. These results suggest that the micronucleus test is low sensitivity and specificity.