Memoria para optar al Título Profesional de Médico Veterinario. Tesis para optar al Grado de Magíster en Ciencias Animales y Veterinarias mención Patología Animal. / La Antártida siempre ha fascinado a la comunidad científica, debido a que representa a uno de los últimos lugares vírgenes de nuestro planeta. Sus ecosistemas se encuentran aislados geográfica y climáticamente del resto de los continentes, sin embargo, su fauna no se halla exenta de enfermedades y agentes infecciosos. El objetivo de esta investigación consistió en aislar e identificar paramixovirus aviares (APMV) en ejemplares de pingüinos de papúa (Pygoscelis papua), provenientes del territorio Antártico. El estudio se efectuó en la Península Antártica Chilena, durante los años 2014 - 2015 y consideró la recolección de 345 muestras cloacales/ambientales desde colonias reproductivas localizadas en Isla Kopaitic (63°19' S, 57°55'W), Base Presidente Gabriel González Videla (64°49′S, 62°51′W), Dorian Bay (64°49’S, 63°30’W), Base Brown (64°53′S, 62°52′W) y Pleneau Island (65˚06'S, 64˚04'W). El análisis y procesamiento de muestras se desarrolló en el Laboratorio de Virología Animal de la Facultad de Ciencias Veterinarias y Pecuarias, Universidad de Chile. La metodología incluyó aislamiento viral, pruebas de hemoaglutinación, RT-PCR para la detección de miembros de la familia Paramyxoviridae y análisis filogenéticos de los resultados obtenidos. De la totalidad de muestras, 13 evidenciaron reacción hemoaglutinante, de estas, cinco resultaron positivas al RT-PCR de APMV y cuatro lograron ser secuenciadas para el análisis filogenético. La filogenia agrupa a los virus aislados dentro de los paramixovirus aviares, cercanamente emparentado con APMV-12 y APMV-13, pero sugiere la segregación en dos nuevas especies virales. Se logró aislar e identificar paramixovirus aviares en colonias de pingüino papúa del territorio antártico, con evidencia que sugiere la existencia de nuevas especies de estos agentes virales. Esto constituye el primer hallazgo de este grupo de agentes virales en Pygoscelis papua y refuerzan la necesidad de continuar desarrollando estudios en la avifauna antártica. / The scientific community has always been fascinated by the pristine nature of the antarctic continent. The South Pole ecosystems are geographically and climatically isolated from other continents, however, the fauna that lives in this place, is not free of diseases and infectious agents. The objective of this investigation was to isolate and to identify avian paramyxoviruses in Gentoo penguins (Pygoscelis papua) from the Antarctic territory. The sample collection of this study was performed in the Chilean Antarctic during 2014 – 2015, 345 cloacal / environmental samples were collected from reproductive colonies at isla Kopaitic (63 ° 19 'S, 57 ° 55'W), Base President Gabriel Gonzalez Videla (64 ° 49'S, 62 ° 51'W), Dorian Bay (64 ° 49'S, 63 ° 30'W), Brown Base (64 ° 53'S, 62 ° 52'W) and Pleneau Island (65˚06'S, 64˚04'W). The analysis and processing of samples was done in the Animal Virology Lab, College of Veterinary and Livestock Sciences, University of Chile. Viral isolation, haemagglutination tests, RT-PCR for the Paramyxoviridae detection and phylogenetic analyzes were conducted. Thirteen samples were isolated in embryonated chicken eggs, five of these samples were positive to RT-PCR. Three out five were sequenced for phylogenetic analysis. Phylogeny clasiffies viruses isolated as avian paramyxoviruses (APMV), closely related to APMV-12 and APMV-13, but not identical, which suggest that this new isolates could be new viral species. It was possible to isolate and to identify avian paramyxoviruses in Antarctic penguin colonies. Evidence suggests that a new species of these viral agents was discovered. These results constitute the first record of isolation of APMV in P. papua and reinforce the need to continue studies in the Antarctic avifauna. / Financiamiento: Proyecto INACH 12-13, y Proyectos de la Dirección de Investigación No. 121017019102080, No. 121017019102100 y No. 121017019102121.

Memoria para optar al Título Profesional de Médico Veterinario / El Avian avulavirus 19 (APMV) es un paramixovirus descubierto y aislado en 2017 desde pingüinos de Papúa (Pygoscelis papua) en la Isla Kopaitic del Territorio Antártico Chileno. En esta investigación se realizó la técnica de inhibición de la hemaglutinación (HI) para medir la presencia de anticuerpos específicos para este virus en las tres especies de pingüinos Pygoscelis spp. Los sueros se obtuvieron desde 7 localidades; Cabo Shirreff, Isla Doumer, Punta Biscoe, Bahía Paraíso, Isla Lagotelerie, Isla Ardley e Isla Avian. De un total de 496 muestras procesadas solo 45 resultaron positivas (9%). Se obtuvo evidencia del virus en las tres especies estudiadas, para los pingüinos de Adelia (P. adeliae) 1/80 (1,25%); en el caso de los de barbijo (P. antarctica) 30/206 (14,6%); y por último los Papúa 14/210 (6,7%). En cuanto a los sitios estudiados, 4/7 resultaron positivos (Cabo Shirreff, Doumer, Punta Biscoe y Bahía Paraíso). Del total de sitios muestreados, se identificaron tres grupos con diferentes niveles de anticuerpos, lo cual fue estadísticamente significativo como alto, medio y negativo. En los sitios donde se obtuvo un número reducido de muestras, se realizó una estimación de la prevalencia: Punta Biscoe ≥20%; Isla Doumer ≥ 14,5% y en Bahía Paraíso ≥17%. Por otro lado, en Cabo Shirref, donde se obtuvo una mayor cantidad de muestras de barbijo, se obtuvo una prevalencia verdadera de 14,6%. En la Isla Ardley, Isla Lagotelerie e Isla Avian no se encontró evidencia de infección. En cuanto a los posibles medios de transmisión de este nuevo virus, se describe a las aves acuáticas migratorias como importantes diseminadores en el ambiente. De éstas, las más relevantes serían los salteadores (Stercorarius spp.), que depredan pingüinos y que están en contacto directo con éstos. En el caso del virus de Newcastle (NDV), las personas son su principal riesgo de transmisión. Mucho queda por descifrar en cuanto a su forma de transmisión. En conclusión, la hipótesis resultó ser verdadera debido a que se encontró evidencia de infección en las tres especies estudiadas. Esta investigación crea nuevas interrogantes, sería interesante descifrar la temperatura mínima a la que AVA 19 permanece infectivo, quizás las bajas temperaturas beneficien a este virus envuelto. Este es el primer trabajo donde se investiga la seroprevalencia de Avian avulavirus 19, futuros trabajos son necesarios para entender mejor la dinámica infecciosa de estos nuevos agentes. / The Avian avulavirus 19 (APMV) is a paramyxovirus discovered and isolated in 2017 from Gentoo penguins (Pygoscelis papua) sampled in Kopaitic island, Chilean Antarctic territory. Hemagglutination inhibition (HI) assay were performed in order to measure the presence of specific antibodies for this virus in three species of Pygoscelis spp. The sera were obtained from 7 locations; Cape Shirreff, Doumer Island, Biscoe Point, Paradise Bay, Lagotelerie Island, Ardley Island and Avian Island. A total of 496 samples were tested, 45 (9%) were positive. Evidence of the virus infection was found on all three species. In the case of Adelie penguins (P. adeliae) 1 out of 80 (1.25%) were positive; for the Chinstrap penguins (P. antarctica) 30 out of 206 (14.6%); and finally, for the Gentoo penguins 14 out of 210 (6.7%) were positive. Overall results indicated that 4 locations were positive (Cape Shirreff, Doumer Island, Biscoe Point and Paradise Bay). From these sites, three groups with different antibody concentrations (high, medium and no antibodies) where identified, this was statistically significant. In the places where a few amounts of sera were obtained, it could only be performed an estimation of the prevalence. In Biscoe Point it’s ≥ 20%; ≥ 14.5% for Doumer Island and ≥ 17% in Paradise Bay. On the other hand, in Cape Shirreff, where a bigger amount of sera where sampled in Chinstrap penguins, a true prevalence of 14.6% were obtained. In the Ardley, Lagotelerie and Avian Islands no evidence of infection were found. As for the possible means of transmission of this new virus, it’s described in the literature that migratory waterfowl are important environment propagators of paramyxoviruses. The most relevant ones are skuas (Stercorarius spp.), which predate on penguins and are in direct contact with them. In the case of NDV people are the mains transmission risk. A lot remains unknown as for this virus transmission. In conclusion, the hypothesis proved positive because serological evidence was found on all three species. This research brings new questions. It would be interesting to figure out the minimum temperature in which AVA 19 remains infective, it may be possible that low temperatures benefit this enveloped virus. This is the first work where the seroprevalence of Avian avulavirus 19 is researched. Future works are needed to understand the infectious dynamics of these new agents. / Proyecto INACH 46-16