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Estudo genético quantitativo do fluxo lácteo em bovinos da raça Holandesa

Laureano, Monyka Marianna Massolini [UNESP] 24 November 2008 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:15Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2008-11-24Bitstream added on 2014-06-13T19:42:44Z : No. of bitstreams: 1 laureano_mmm_dr_jabo.pdf: 1370732 bytes, checksum: 917b233b8c336006b0fff4eae272a7b4 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Parâmetros genéticos para o fluxo lácteo medido no dia do controle (FLDC) de primeiras lactações de vacas da raça Holandesa foram estimados utilizando modelos de dimensão finita (TDM) e modelos de regressão aleatória. Para os TDM foram analisadas 10 características por meio de modelos uni e bi e multi-características e de repetibilidade, que continham como aleatórios, o efeito genético aditivo e o efeito residual e, como efeitos fixos, o grupo de contemporâneos e as covariáveis idade da vaca ao parto. A variável número de dias em lactação foi incluída somente no modelo de repetibilidade. Para os MRA, foram considerados os efeitos aleatórios genético aditivo direto, de ambiente permanente e o residual. Foram considerados como efeitos fixos, o grupo de contemporâneos, os efeitos linear e quadrático da covariável idade da vaca ao parto e a curva média de lactação da população, modelada por meio de polinômios ortogonais de Legendre de quarta ordem. Os efeitos aleatórios genético aditivo e de ambiente permanente foram modelados por meio de regressão aleatória sobre polinômios ortogonais de Legendre e por meio de funções b-splines. Diferentes estruturas de variâncias residuais foram testadas, por meio de classes contendo 1, 7, 10, 20 e 43 variâncias residuais, para os MRA modelados por meio de polinômios de Legendre. Já, para os MRA modelados por funções b-splines, a estrutura residual foi considerada heterogênea, contendo 7 classes de variâncias. Os MRA foram comparados usando o teste de razão de verossimilhança, o critério de informação de Akaike e o critério de informação de Bayesiano de Schwarz. As estimativas de herdabilidade (h2) para os FLDC variaram de 0,23 a 0,32 nas análises unicaracterísticas, de 0,24 a 0,32 nas bi-características e de 0,28 a 0,37 nas multicaracterísticas. Os valores de h2 estimados variaram no decorrer da... / Flow milk genetic parameters to the first lactation test-day milk yields of Holstein cattle were estimated using Test-day models (TDM) and Random regression models (RRM). Ten TDM differents traits were analyzed using uni, bi and multi-trait and repeatability animal models, that included the additive genetic as random effect and the fixed effects of contemporary group, age of cow (linear and quadratic) as covariables. The days in milk (linear) variable was included only at repeatability model. To RRM were included the additive genetic, permanent environmental and residual as random effects, the fixed effects of contemporary group, age of cow as covariable (linear and quadratic effects) and a 4th-order Legendre orthogonal polynomials of days in milk, to model the mean trend. The additive genetic and permanent environmental effects were fitted by Legendre orthogonal polynomials and b-splines functions. Different structures of residual variances were used, through the variances classes containing 1, 7, 10, 20, and e 43 residual variances, to the models fitted by Legendre orthogonal polynomials. Moreover, for the RRM fitted by b-splines-functions, the residual estructure was considered heterogeneous, having 7 variance classes. The RRM were compared by Likelihood ratio test, Bayesian and Akaike´s information criteria. The heritability estimated ranged from 0.23 to 0.32 by uni-trait analyses, from 0.24 to 0.32 by bi-traits analyses and from 0.28 to 0.37 by multi-trait analyses. The h2 estimates varied during the lactation being the highest estimate at the fourth month. The estimate obtained by the repeatability model was 0.27, and a repeatability estimate of 0.66. For the MRA fitted by Legendre orthogonal polynomials, related to the residual variance, the best model the one that deemed 7 residual classes. For the additive and permanent environmental effects, the having 3th-order... (Complete abstract click electronic access below)
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Estudo da produção de leite de caprinos utilizando modelos de regressão aleatória / Study of goat milk production using random regression models

Silva, Felipe Gomes da 25 July 2011 (has links)
Made available in DSpace on 2015-03-26T13:42:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 2141668 bytes, checksum: b7f9269723d229ff78c781b127e1558b (MD5) Previous issue date: 2011-07-25 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Data from the herd of goat industry, Federal University of Viçosa were used to evaluate the factors that influence milk production on the control (PLDC) and content of the Milk constituents (percentages of protein, fat, lactose and total solids in days of collection) in dairy goats fitness, define the best model of random regression using Legendre polynomials orthogonal to the first lactation in Alpine goats and check the effect of different control intervals (7, 14, 21 and 28 days) on genetic evaluation of Alpine goats. The editing of the data was performed using the SAS program, recoding and correction of the pedigree was made using the program RENPED. The program WOMBAT was used in all genetic evaluations. The program RENPED was used to calculate the area under the curve of breeding values for ranges from 7 to 210 and 7 to 290 days of production, resulting accumulated genetic values, A210 and A290 respectively. The Pearson and Spearman correlations were obtained using the SAS program. It was concluded that there is variation in the factors that significantly influenced each trait studied and each race. In genetic evaluation using random regression models, it is recommended to use only the covariate age of dam at kidding, avoiding the use of fixed effect of birth order. The random regression model using orthogonal Legendre polynomials more suitable for genetic evaluation of Alpine goat breed used was fixed regression of order 4, the regression of additive genetic effects of order 2, the regression of permanent environmental effects of order 7 and at least Five classes of residual variance. The prior study of the best model for genetic evaluation of a herd is very important to increase the precision and accuracy of the analysis. Range of controls to evaluate the milk production of Alpine goat breed using random regression models, must be seven days for breeding and improvement programs with high technical level. / Dados do rebanho do setor de caprinocultura da Universidade Federal de Viçosa foram utilizados para avaliar os fatores que influenciam a produção de leite no dia do controle (PLDC) e teor dos constituintes do leite (porcentagens de proteína, gordura, lactose e extrato seco total no dia da coleta) em caprinos de aptidão leiteira, definir o melhor modelo de regressão aleatória, utilizando polinômios ortogonais de Legendre, para primeira lactação de cabras Alpinas e verificar o efeito de diferentes intervalos de controle (7, 14, 21 e 28 dias) sobre a avaliação genética de cabras Alpinas. A edição dos dados foi feita utilizando o programa SAS, a recodificação e correção de erros do pedigree foi feita utilizando o programa RENPED. O programa WOMBAT foi utilizado em todas as avaliações genéticas. O programa RENPED foi utilizado para calcular a área abaixo da curva de valores genéticos dos animais para intervalos de 7 a 210 e 7 a 290 dias de produção, gerando os valores genéticos acumulados, a210 e a290 respectivamente. As correlações de Pearson e Spearman foram obtidas utilizando o programa SAS. Concluiu-se que existe variação quanto aos fatores que influenciaram significativamente cada característica estudada e cada raça. Em avaliações genéticas, utilizando modelos de regressão aleatória, recomenda-se a utilização apenas da covariável idade da cabra ao parto, evitando o uso do efeito fixo de ordem de parto. O modelo de regressão aleatória utilizando polinômios ortogonais de Legendre mais indicado para avaliação genética dos caprinos da raça Alpina utilizados, foi regressão fixa de ordem 4, a regressão de efeitos genéticos aditivos de ordem 2, a regressão de efeitos de ambiente permanente de ordem 7 e ao menos 5 classes de variância residual. O estudo do melhor modelo de análise previamente à avaliação genética de um rebanho é imprescindível para aumentar a precisão e acurácia das análises. Intervalos de controles para avaliar a produção de leite de caprinos da raça alpina utilizando modelos de regressão aleatória, devem ser de sete dias para programas de melhoramento e criatórios com alto nível de tecnificação.
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Modelos de curvas de crescimento e regressão aleatória em linhagens nacionais de frango caipira / Models of growth curves and random regression lines in national free-range chickens

Gregorí Alberto Rovadoscki 07 December 2012 (has links)
A avicultura é uma das principais atividades agropecuárias do Brasil, em 2011 o país produziu 12.230 toneladas de carne de frango, sendo o 3º maior produtor de frango do mundo, apenas atrás dos EUA e China. Parte deste êxito se deve principalmente ao melhoramento genético animal implantado nas últimas décadas. Os objetivos nesse estudo foram: 1º - Comparar as funções das curvas de crescimento: von Bertalanffy, Gompertz, Logística, Richards e Brody, pelo método dos Mínimos Quadrados Ordinários (QMO) e Quadrados Mínimos Ponderados (QMP) a dados de peso vivo para as linhagens experimentais de frango caipira (7P, Caipirão da ESALQ, Caipirinha da ESALQ e Carijó Barbado) e selecionar uma curva de crescimento que melhor descreva o padrão de crescimento para cada linhagem, e estimar os componentes genéticos (herdabilidades e correlações genéticas) dos parâmetros destas funções sob análise bicaracterística; 2º - Comparar modelos com diferentes ordens de ajuste por meio de funções polinomiais de Legendre, sob modelos de regressão aleatória, com variância residual heterogênea, para a estimação dos componentes de (co) variância e avaliação genética de linhagens experimentais de frango caipira (7P, Caipirão da ESALQ, Caipirinha da ESALQ e Carijó Barbado). O modelo que melhor se adequou a curva de crescimento para as linhagens estudadas foi à função de Gompertz ajustado pelo método dos Quadrados Mínimos Ponderados (QMP). Os parâmetros genéticos estimados para as medidas e dos modelos Gompertz ponderado podem ser utilizados como critérios de seleção, pois parecem ter efeito genético considerável para estas características. No entanto, deve-se haver cautela na utilização do parâmetro como critério de seleção para a linhagem Carijó Barbado devido a baixa herdabilidade. As correlações genéticas e fenotípicas entre as características e foram negativas e altas. Indicando que quanto maior o peso assintótico menor a taxa de crescimento. Dentre os modelos de Regressão Aleatória estudados o polinômio de 3ª ordem foi o que melhor se adequou para descrever as curvas de crescimento das linhagens estudadas. As estimativas de variâncias, herdabilidades foram afetadas pela modelagem da variância residual. Em geral as herdabilidades estimadas para as idades de 1 a 84 dias variaram de moderadas a altas para as linhagens estudadas, indicando que qualquer idade pode ser utilizada como critério de seleção. A seleção aos 42 dias de idade pode ser mantida como critério de seleção. / Aviculture is one of the main agribusiness activities in Brazil, in 2011 the country produced 12,230 tons of broiler meat, was the 3rd largest producer of broiler in the world, only behind the USA and China. Part of this success is mainly due to animal genetic improvement implemented in recent decades. In this study, our objectives were: 1 - to compare the functions of the Von Bertalanffy, Gompertz, Logistic, Richards and Brody growth curves by the Ordinary Least Squares and Weighted Least Squares method, from data for body weight from experimental free-range chicken lines (7P, Caipirão da ESALQ, Caipirinha da ESALQ and Carijó Barbado) and select a growth curve that best describes their growth. From this, estimates of the genetic components (heritability and genetic correlations) of the parameters of these functions under bivariate analysis; 2 - Comparing models with different orders of adjustment by means of Legendre polynomial functions under random regression models with heterogeneous residual variance for the estimation of (co) variance and genetic evaluation of experimental free-range chicken lines (7P, Caipirão da ESALQ, Caipirinha da ESALQ and Carijó Barbado). The model that best adapted the growth curve for all lines studied was the Gompertz function adjusted using weighted least squares. Genetic parameters for measurements and can be used as selection criteria because they seem to have considerable genetic effects for these characteristics. There should be caution in using the parameter as a selection criterion for the Carijó Barbado line due to low heritability. The genetic and phenotypic correlations between traits and were negative and high, indicating that the higher the asymptotic weight, the lower the growth rate. Among the Random Regression models studied the 3rd order polynomial was best adapted to describe the growth curves of the lines studied. Estimates of variances and heritabilities were affected by residual variance modeling. Overall heritability estimates between 1 to 84 days of age ranged from moderate to high for all lines, indicating that any age can be used as a selection criterion, including maintaining the current selection at 42 days of age.

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