Évaluer les stratégies d’histoire de vie d’espèces est indispensable à leur conservation. Un total de 3651 colonies de corail de feu, Millepora platyphylla, ont été mesurées, géoréférencées et collectées dans 5 habitats différents à Moorea afin d’évaluer le contexte biologique et écologique du maintien et du renouvellement des populations. Ce travail de thèse a démontré que la structure des populations diverge entre le lagon et la pente externe. À l’aide de marqueurs microsatellites nouvellement développés, nous avons démontré que cette espèce se reproduit principalement par fragmentation (80%) et que les fragments sont distribués en parfait alignement avec la dispersion des vagues. Les clones d’une même lignée clonale partagés entre habitats expriment différents phénotypes selon leur exposition aux vagues. Surprenamment, M. platyphylla affiche une morphologie vulnérable à la fragmentation dans les habitats exposés à la houle. L’analyse de parenté a révélé une forte contribution de l'autorecrutement (58%), une faible dispersion des propagules sexuées et une tendance à l’agrégation d’individus issus de mêmes parents. Enfin, nous avons démontré de la variabilité génétique intracoloniale, principalement due aux mutations somatiques (mosaïcisme), qui contribue ainsi à augmenter la diversité génétique dans la population. L’interaction de ces processus engendre une diversité génétique et phénotypique élevée dans la population et permet également le renouvellement local et la persistance de cette espèce à Moorea; habitat marginal. Ces stratégies d’histoire de vie augmentent ainsi le potentiel d’adaptation et la résilience de M. platyphylla face aux changements environnementaux. / Evaluating life history of species carries important implications for conservation biology. A total of 3651 colonies of the fire coral Millepora platyphylla was measured, georeferenced and collected in 5 different habitats in Moorea to evaluate the biological and ecological context of the population maintenance and renewal. This thesis has demonstrated that the population structure of this species varies greatly between lagoonal and fore reef habitats. Using newly developed microsatellite markers, we have shown that M. platyphylla relies heavily on clonal reproduction via fragmentation (80%) and that the fragments are distributed in perfect alignment with wave energy dispersal. Clonal lineages with clones shared among habitats revealed the ability of a single genotype to express different phenotypes depending on its exposure to swell wave energy. Surprisingly, M. platyphylla invests in a vulnerable morphology to wave-induced breakage in high energy reef habitats. Furthermore, parentage analysis revealed a high contribution from self-seeding (58%), limited dispersal of sexual propagules and sibling aggregations. At last, we have demonstrated intracolonial genotypic variability, mostly from somatic mutations (mosaicism), which creates novel genetic diversity within the population. The interaction of these processes generates a high level of genetic and phenotypic variation within the population and allows for local replenishment and the persistence of this fire coral species in Moorea, a marginal habitat. These life history strategies thus increase the adaptive potential and resilience of M. platyphylla in response to rapid and unpredictable environmental changes.

Le milieu littoral des espaces insulaires ultra-marins intertropicaux français est doublement impacté par les aléas hydro-climatiques et sismiques naturels, et par les actions anthropiques déstabilisatrices locales ou globales. Le mémoire traite spécifiquement des cas de Wallis & Futuna et de Lifou (archipel des Loyauté) dans le Pacifique sud et de Mayotte dans l’océan Indien. Il aborde, sous une approche pluridisciplinaire, les différentes facettes du potentiel d’adaptation des populations locales aux variations du niveau marin de différents ordres : ponctuel (associés aux vagues de tempêtes et de tsunami) et global (avec la transgression liée au réchauffement climatique mis en évidence par la communauté scientifique). La montée des eaux, qui semble inéluctable à moyen terme, et les risques hydro-climatiques et sismiques (tsunamis) actuels impliquent que les sociétés devront, dans un futur plus ou moins proche, ajuster leur vision des modes d’occupation de l’espace et tout particulièrement celle du domaine littoral sur lequel vit l’essentiel des populations des îles étudiées. Le croisement des différentes approches disciplinaires abordées dans le mémoire permet de proposer des méthodes et des outils novateurs en vue d’une optimisation des stratégies d’adaptation à la montée des eaux. / The coastal environment of French overseas territories is both affected by the hydroclimatic and natural seismic hazards, and local or global destabilizing anthropogenic actions. This PhD deals specifically with cases of Wallis and Futuna and Lifou (Loyalty Islands) in the South Pacific, and Mayotte in the Indian Ocean. In a multidisciplinary approach, it gets onto the different facets of the adaptation potential of local societies when it comes to changes at sea level: occasional (associated with storm waves and tsunami) and global (with sea level rise related to global warming). The sea level rise, that seems inevitable in the medium term, hydro-climatic and seismic (tsunami) risks, means that local societies will probably adjust and organize their territories in a different way, especially coastal area (the most occupied space at the island scale). The different disciplinary approaches crossing can offer innovative tools and methods for optimizing the sea level rise adaptation strategies.