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Viés nos ganhos genéticos preditos com seleção massal e de famílias de meios-irmãos / Obliquity in predicted genetic gains with mass and half-sib families selectionAloisio, Alcantara Vilarinho 01 April 2004 (has links)
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Previous issue date: 2004-04-01 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O objetivo deste trabalho foi avaliar o viés nas expressões de predição de ganho genético com seleção de plantas (capítulo 1) e de famílias de meios- irmãos (capítulo 2) em programas de melhoramento intrapopulacional. O estudo foi feito por meio de simulação, no qual, para seleção massal, foram considerados sistemas gênicos com um e 10 genes com distribuição independente. Para seleção de famílias foi considerado apenas sistema gênico de 10 genes. Foram consideradas três classes de população (muito melhorada, pouco melhorada e com freqüências intermediárias dos genes favoráveis), três valores de herdabilidade (10, 50 e 90%) e sete graus de dominância (2 e -2, 1 e -1, 0,5 e -0,5 e 0), sendo que com grau de dominância positivo o gene favorável é dominante e com grau de dominância negativo é recessivo. Foram considerados os 10 genes com as mesmas freqüências gênicas e com freqüências diferentes. Foram avaliados o viés percentual entre ganhos teórico e predito no primeiro ciclo de seleção massal e a correlação entre os mesmos ao longo de 10 ciclos de seleção, considerando as diferentes situações. Com seleção entre as famílias de meios-irmãos a pressuposição acerca da covariância aditiva entre indivíduo na unidade de seleção e seu parente na população melhorada foi a principal causa do viés, enquanto que com seleção massal o foi apenas nos casos de viés percentual baixo (inferior a 100%). Nas situações de elevado viés percentual (acima de 100%) a principal fonte de viés foi o uso de variância genotípica ou herdabilidade em sentido amplo no lugar de variância aditiva ou herdabilidade em sentido restrito, respectivamente. Com sistema gênico de 10 genes as expressões foram mais precisas que com sistema gênico de apenas um gene. Verificou-se que assumir ganho predito com seleção em ambos os sexos o dobro do ganho predito com seleção em apenas um sexo é apenas uma aproximação. Comparativamente à seleção após o florescimento, a seleção antes do florescimento aumentou o viés devido à pressuposição acerca da covariância aditiva entre indivíduo na unidade de seleção e seu parente na população melhorada e diminuiu o viés devido ao uso de variância genotípica ou herdabilidade em sentido amplo no lugar de variância aditiva ou herdabilidade em sentido restrito, respectivamente, e aumentou a média das correlações entre os dois ganhos. O aumento na proporção de selecionados aumentou consideravelmente a média do viés percentual e diminuiu a média da correlação entre os ganhos teórico e predito ao longo de 10 ciclos de seleção, mas apenas com o uso de variância genotípica ou de herdabilidade em sentido amplo (estimadas ou paramétricas). Com o uso de variância genotípica ou de herdabilidade em sentido amplo estimadas, comportamento semelhante foi observado com a redução no tamanho amostral. Viés de 30% na estimativa de variância ambiental aumentou o viés percentual entre ganhos teórico e predito apenas quando utilizados valores estimados de variância genotípica ou de herdabilidade em sentido amplo. Com seleção dentro de famílias e mesmas freqüências gênicas, o uso de variância genotípica ou herdabilidade em sentido amplo foi a principal fonte de viés, quando utilizados para predição do ganho genético valores paramétricos de variância ou de herdabilidade. Com freqüências diferentes, a pressuposição acerca da covariância aditiva entre indivíduo na unidade de seleção e seu parente na população melhorada é que foi a principal fonte de viés. Quando avaliadas as três fontes de viés juntas, tanto considerando mesmas freqüências gênicas como freqüências diferentes, a principal fonte de viés foi a pressuposição acerca da covariância aditiva entre indivíduo na unidade de seleção e seu parente na população melhorada. Com seleção dentro a magnitude do viés foi mais elevada que com seleção entre. / Aim of this study was to evaluate obliquity in expressions for the prediction of genetic gains due mass (chapter 1) and half-sib families selection (chapter 2) through intrapopulational improvement programs. Genetic systems with one and 10 genes of independent distribution for mass selection were simulated. Only the 10 gene system was admitted for family selection. Three population classes (strongly improved, slightly improved, and with intermediate frequencies of favorable genes), three heritability values (10, 50, and 90%) and seven dominance degrees (2 and -2, 1 and -1, 0.5 and -0.5, and 0) were taken into consideration. With a positive dominance degree, the favorable gene is dominant, and with a negative dominance degree it is recessive. 10 genes with equal and different genetic frequencies were focused on. The percentile obliquity between theoretical and predicted genetic gains in the first cycle of mass selection and the correlation between them along the 10 selection cycles were evaluated for the different situations. In the case of selection between half- sib families, the assumption in relation to additive covariance between an individual in the selection unit and its relative in the improved population was the main cause of obliquity, while in the case of mass selection this was only true when the obliquity percentage was low (below 100%). When it was high (above 100%), the main cause of obliquity was the use of genotypic variance or broad-sense heritability instead of additive variance or heritability in the restricted sense, respectively. Expressions were more precise in the genetic system of 10 genes than the one with only one gene. Assuming a predicted gain due selection in both sexes as twice the predicted gain with selection in only one sex is merely an approximation. Selection before compared to selection after flowering increased obliquity, owing to the supposition in relation to additive covariance between the individual in the selection unit and its relative in the improved population, and decreased obliquity because of the use of genotypic variance or broad-sense heritability instead of additive variance or restricted sense heritability, respectively, and increased the correlation means between both gains. An increased percentage of the selected plants increased the mean obliquity percentage considerably and diminished the correlation mean between the theoretical and predicted along 10 selection cycles though with the use of genotypic variance or broad-sense heritability (estimative or parametric) only. When genotypic variance or broad-sense heritability were used for estimates, a similar behavior was observed for a smaller sample size. A 30% obliquity in the environmental variance estimate increased the obliquity proportion between theoretical and predicted gains only when estimated values of genotypic variance or broad-sense heritability were used. In selection within families and with equal genetic frequencies, the use of the genotypic variance or broad-sense heritability was the main source of obliquity, when parametric values in variance or heritability was used for the prediction of the genetic gain. With different frequencies, the supposition expressing additive covariance between the plant in the selection unit and its relative in the improved population was main source of obliquity. Of the three obliquity sources evaluated together, both for equal and different genetic frequencies, main obliquity source was the assumption describing additive covariance between the plant in the selection unit and its relative in the improved population. Selection within increased the magnitude of obliquity in comparison to selection between.
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Índice de seleção e análise de fatores na predição de ganhos genéticos em Coffea canephora var. conilon / Selection index and factor analysis for the prediction of genetic gains in Coffea canephora var. conilon.Ferreira, Adésio 29 July 2003 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-06-02T11:44:56Z
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Previous issue date: 2003-07-29 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / O café é um dos produtos primários de maior valor no mercado mundial. O Brasil é o terceiro maior produtor de Coffea canephora do mundo e acordo com os dados da CONAB (2003), o estado do Espírito Santo é o maior produtor brasileiro com 65,56% da produção total. Neste trabalho, foi realizado o estudo do comportamento de 40 genótipos de Coffea canephora var. conilon em dois locais, Marilândia e Sooretama, no Espírito Santo, tendo como objetivo, a orientação de estratégias no programa de melhoramento para se identificar genótipos superiores, a serem utilizados “per se” ou em programas de hibridação, que reunam simultaneamente uma série de atributos favoráveis. O comportamento “per se” dos 40 genótipos foi avaliado com base na estimação de parâmetros genéticos e ambientais. Verificou-se condição favorável à realização do melhoramento. As estratégias de seleção direta e indireta nas 14 características avaliadas não foram eficazes pois o objetivo de o programa de melhoramento da espécie objetiva obter materiais com caracteres simultâneos, em busca de ganhos racionais. Desta forma, utilizou-se a técnica de análise de fatores, da qual foram obtidas as “supercaracterísticas” PENEIRA (Fator1), BENEF/CICLO (Fator2), QUALIDADE 1(Fator3) e QUALIDADE 2 (Fator4) em Marilândia, e PENEIRA (Fator1), BENEF/CHOCHO (Fator2) e QUALIDADE 1(Fator3) em Sooretama. A utilização da técnica, nos dois locais não mostrou- se eficiente para a seleção simultânea em produção e nas “supercaracterísticas”. Diante dos resultados, trabalhou-se com a teoria de índices de seleção nas características Produção, Ciclo e Umidade e nas “supercaracterísticas,” obtidas pela análise de fatores, resultando em ganhos preditos equilibrados, em todas as características e “supercaracterísticas”. / Coffee is one of the most pricey raw products on the world market. Brazil is worldwide the third greatest producer of Coffea canephora and according to data of CONAB (2003), the nation’s top producer is the State of Espírito Santo with 65,56% of the total output.. In this study, the behavior of 40 Coffea canephora var. conilon genotypes was studied at two production sites, Marilândia and Sooretama, in Espírito Santo. Our objective was to outline strategies of a breeding program that identifies superior genotypes which combine a set of favorable attributes, to be used “per se” or in hybridization programs. Based on the estimation of genetic and environmental parameters, the 40 genotypes were evaluated in relation to the “per se” behavior. Favorable conditions for breeding were found. Direct and indirect selection strategies were not efficient for the 14 evaluated characteristics since this species improvement program aimed to obtain materials with simultaneous characters in search of rational gains. In this sense, “supercharacteristics” were obtained by the factor analysis technique: SIEVE (Factor1), BENEF/CYCLE (Factor2), QUALITY 1(Factor3) and QUALITY 2 (Factor4) in Marilândia; and SIEVE (Factor1), BENEF/CHOCHO (Factor2) and QUALITY 1 (Factor3) in Sooretama. At both sites, the use of the technique turned out to be inefficient for a simultaneous selection of yield and “supercharacteristics”. In view of the results, the selection index theory was used to work with the characteristics Yield, Cycle, and Moisture, and with the “supercharacteristics” obtained by factor analysis. This brought forth well-balanced forecast “supercharacteristics”. gains for all characteristics and / Dissertação importada do Alexandria
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Ganhos preditos e realizados, por diferentes estratégias de seleção, em populações de soja (Glycine max (L.) Merrill) / Predicted and realized gains, usin different selection strategies, in soybean populations (Glycine max (L.) Merril)Reis, Edésio Fialho dos 16 December 1999 (has links)
Submitted by Nathália Faria da Silva (nathaliafsilva.ufv@gmail.com) on 2017-10-17T13:21:08Z
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Previous issue date: 1999-12-16 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Utilizando-se populações de soja (Glycine max (L.) Merrill) originadas de três cruzamentos (‘CEPS 77-16’ x ‘Doko RC’, ‘CEPS 89-26’ x ‘IAC - 8’ e ‘CEPS 89-26’ x ‘FT-Cristalina’), foram estimados os ganhos esperados nas gerações F4, e F5 e obtidos os ganhos realizados nas gerações F5 e F, respectivamente. As populações foram conduzidas em Viçosa, MG, nos anos agrícolas 1995/96, 1996/97 e 1997/98. Na estimativa dos parâmetros envolvidos na predição para a geração F4 que foi conduzida em “bulk”, utilizou-se a regressão do valor do indivíduo F4 com a média de sua progênie na geração F5 com a devida ponderação pelo coeficiente de parentesco dessas gerações. A estimativa dos parâmetros envolvidos na predição para geração F5, que foi conduzida no campo com cultivares-padrão intercalares às linhas segregantes, foi feita, utilizando-se os cultivares-padrão para estimação da variação devido às causas não-genéticas, e a seleção foi feita nos valores fenotípicos corrigidos pela variação do cultivar-padrão em relação à média de suas repetições, sendo feita a predição de ganhos com base no valor fenotípico original e corrigido. As estratégias de seleção, aplicadas à geração F4, foram com base em plantas individuais, enquanto na geração F5 foram utilizadas estratégias com base em produção de grãos, nas quais se consideravam apenas o indivíduo, a familia e posteriormente, o indivíduo, a família e o indivíduo num índice combinado; utilizando-se simultaneamente produção de grãos, número de dias para maturação e altura de planta na maturação, o indivíduo foi usado como unidade de seleção. Nas populações conduzidas em “bulk” (geração F4), a seleção direta na característica foi a que promoveu maior expectativa de ganho, o que também correspondeu em nível de campo, ao passo que no experimento com cultivares- padrão intercalares (geração F5) a predição de ganhos se mostrou pouco variante quando se consideraram dados corrigidos e não-corrigidos, sendo a seleção individual a mais promissora; já em nível de campo, para ganho realizado, a estratégia de melhor “performance” foi a seleção simultânea. / Soybean (Glycine max (L.) Merril) populations originated from three crosses (‘CEPS 77-16’ x ‘Doko RC’, ‘CPES 89-26' x ‘IAC-8’ and ‘CEPS 89-26’ ‘FT-Cristalina’) were used to estimate predicted gains in F4 and F5 gcncrations and to obtain realized gains in F5 and F6 generations, respectively. The populations were conducted in Viçosa, MG, in the agricultural years of 1995/96, 1996/97 and 1997/98. For estimation of parameters involved in prediction for the F4 generation, which was conducted in bulk, it was utilized the regression of the F4 individual value on the mean of its progeny in the F5 generation, that was appropriately weighted by the kinship coefficient of those generations. The estimation of parameters involved in prediction for the F5 generation, which was conducted in the field with the standard cultivars inserted between the segregating lines, was carried out using the standard cultivars to estimate the variation due to non-genetic causes. Selection was performed using phenotypic values that have been corrected by the standard cultivar variation in relation to the mean of its replications, and gain prediction was estimated based on the corrected and original phenotypic value. The selection strategies applied to F4 generation were based on individual plants, whereas the strategies applied to F5 generation, based on grain yield, took into consideration only the individual, the family and, later, the individual, the family and the individual in a combined index; using at the same time grain yield, number of days for maturation and plant height at maturation, taking the individual as selection unit. For the populations conducted in bulk (generation F4), the selection performed directly for a trait gave greater expected gain, correspondent with results in the field, whereas prediction of gains for the experiments with the inserted standard cultivars (generation F5 ,) has been shown little variation when corrected and non-
corrected data were considered, being individual selection more promising; however, for results in the field and the realized gain, the strategy with the best performance was concurrent selection.
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Parâmetros genéticos e ganhos de seleção em pimenta de bode (Capsicum chinense Jacq) / Gnetic parameters and selection gains in pimenta de bode (Capsicum chinense Jacq)Di Prado, Poliana Regina Carloni 13 March 2013 (has links)
Submitted by Cláudia Bueno (claudiamoura18@gmail.com) on 2015-10-14T22:00:35Z
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Dissertação - Poliana Regina Carloni Di Prado - 2013.pdf: 1121268 bytes, checksum: de6b8400cf11e9a39e0a3bb61045e84e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2015-10-16T10:53:58Z (GMT) No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 2013-03-13 / The consumption of pepper genus Capsicum is in increasing demand worldwide. However few works have been conducted aiming their utilization in plant breeding research as well as in preserving their genetic patrimonium. The objectives of this work were to estimate the genetic parameters of a pimenta de bode (Capsicum chinense Jacq) population from the Southwest of Goiás as well as to assess gains from selection carried out in that population based on six selection criteria. Twenty seven genotypes and three commercial controls were used and the experiment arranged in a completely randomized bloc design with three replicates and four plants per plot spaced by 1.2 X 0.8 m. The estimated parameters were: genetic variance σ²g, environmental variance σ²e, phenotypic variance σ²g; genetic variance coefficient CVg%, the ratio between the genetic coefficient of variance and the environmental ratio CVg/CVe, and the heritability in broad sense term h2. The criteria used from gains selection were: selection I – shortening the flowering period; II - increase harvested fruit weight in the first harvest; III – increase fruit production; IV – increase 10 fruit weight; V – reduce 10 fruit weight; VI –shorten ripening period The CVg% was above 10% for the majority of the traits tested as well as the CVg/CVe , above 1, indicating the predominance of the genetic traits in relation to the environmental factors; being these traits considered ideal for use in genetic breeding programs. Heritability in broad sense (h2) varied from 54.27 to 99.66%. The selection criteria used presenting gains from selection were I, III, IV and VI, with 10.30, 69.59, 181 and 1.31 % respectively of gains obtained for the selected trait. / O consumo de pimentas, do gênero Capsicum, possui uma crescente demanda em nível mundial. Por outro lado, poucos trabalhos têm sido realizados com a finalidade de preservar o patrimônio genético dessas espécies e também utilização deste em programas de melhoramento genético. Os objetivos deste trabalho foram estimar os parâmetros genéticos de uma população de pimenta de bode (Capsicum chinense Jacq) do sudoeste goiano e os ganhos de seleção realizados nessa população baseados em seis critérios de seleção. Foram utilzados 27 genótipos e 3 testemunhas comerciais, o experimento foi conduzido em blocos casualizados, com três repetições, quatro plantas por parcela e espaçamento de 1.2x0.8m. Os parâmetros estimados foram variâncias genética σ²g, ambiental σ²e, fenotípica σ²f, o coeficiente de variação genético CVg%, a razão entre o coeficiente de variação genético e o ambiental CVg/CVe e a herdabilidade em sentido amplo h2. Os critérios utilizados foram; seleção I: reduzir os dias para florescimento, II: aumentar o peso na primeira colheita, III: aumentar a produção de frutos, IV: aumentar o peso de 10 frutos, V: reduzir o peso de 10 frutos e VI: reduzir os dias para maturação. O CVg% foi acima de 10% para a maioria das características, o CVg/CVe foi acima de 1 para a maioria das características indicando que os fatores genéticos são predominantes em relação aos ambientais. A h2 variou de 54.27 à 99.66%. Os critérios de seleção utilizados que apresentaram ganhos de seleção foram I, III, IV, VI com 10.30, 69.59, 181, 1.31% respectivamente de ganho realizado para característica selecionada.
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