Made available in DSpace on 2014-08-20T13:44:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_geri_eduardo_meneghello.pdf: 484002 bytes, checksum: fce3a37f2176aeefed1b425c5ccc0978 (MD5) Previous issue date: 2007-04-04 / The main reserve components in seeds are carbohydrates, lipids and proteins. Aside from their nutritious role, proteins have several important functions in seeds, being essential to the molecular biology of the plant. The detailed knowledge of proteins makes it possible to outline strategies of genetic improvement aimed at increasing production and tolerance to different pathologies, among other traits. Progress in the molecular biology, genomics and proteomics impelled the creation of a great volume of data on proteins of several vegetable species, with information about their functionality in the several tissues and organs they are part of. To use this information, it is necessary to rely on computational tools. This need impelled the appearance and development of bioinformatics, e.g. the use of computational tools for the study of biological data. The objective of this work was to quantify the proteins related to the seeds described already and available in the Swiss- Prot database, and to verify the similarity and hydrophobic pattern of the proteins with same function in different species. A detailed consultation was performed in the Swiss-Prot database, in search of proteins found in seeds, seedlings and their component tissues. The sequences found were grouped and analyzed according to the tissue in which they were expressed, epicotyl, aleurone, coleoptile, cotyledon, endosperm, hypocotyl, mesocotyl, immature seed, seedling and seeds. Alignments were performed among the sequences with similar function in different organs and in different species to verify similarities across tissues and species. The hydrophobic/ hydrophilic character in the proteins found was analyzed to identify patterns. Four hundred and fifty seed-related proteins are in stock at the Swiss Prot database. Oryza sativa, Zea mays, Arabidopsis thaliana, Triticum aestivum, Hordeum vulgare, Glycine max, which are the species that possess the largest number of seed proteins studied so far. There isn t a similarity in the sequences of amino acids of the proteins with same function / Dentre os principais componentes de reserva de uma semente destacam-se os carboidratos, os lipídeos e as proteínas. Além da função nutritiva, as proteínas têm diversas funções importantes nas sementes, sendo integrantes da biologia molecular da planta. O conhecimento detalhado das proteínas possibilita que sejam adotadas estratégias de melhoramento genético visando aumento de produção, resistência a patógenos, etc... Avanços na biologia molecular, genômica e proteômica impulsionaram a criação de um grande volume de dados sobre proteínas de diversas espécies vegetais, com informações sobre a sua funcionalidade nos diversos tecidos e órgãos. Para utilizar essas informações, é imprescindível a utilização de ferramentas computacionais. Essa necessidade impulsionou o surgimento e o desenvolvimento da bioinformática, que é a utilização de ferramentas computacionais para o estudo de dados biológicos. O objetivo deste trabalho foi quantificar as proteínas relacionadas às sementes já descritas e disponíveis no banco Swiss-Prot, e verificar a similaridade e padrão de hidrofobicidade das proteínas de mesma função em espécies diferentes. Para isso, foi feita uma consulta detalhada no banco de dados Swiss-Prot em busca de proteínas encontradas em sementes, plântulas e seus diversos tecidos. As seqüências encontradas foram agrupadas por tecido, sendo selecionadas e analisadas aquelas expressas no epicótilo, camada de aleurona, coleóptilo, cotilédones, endosperma, hipocótilo, mesocótilo, semente imatura, plântula e semente. Realizou-se alinhamentos entre as seqüências com função similar encontradas em diferentes órgãos e em diferentes espécies para verificar a similaridade existente entre as mesmas. Estudou-se a hidrofobicidade/hidrofilicidade nas proteínas encontradas, buscando identificar padrões. Existem 450 proteínas relacionadas a sementes depositadas no banco de dados Swiss-Prot.Oryza sativa, Zea mays, Arabidopsis thaliana, Triticum aestivum, Hordeum vulgare, Glycine max são espécies que possuem um maior número de proteínas de sementes estudadas. Não há um padrão de similaridade nas seqüências de aminoácidos das proteínas de mesma função