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Caract??risation et fonction de la prot??ine Nab2 chez Schizosaccharomyces pombe

Grenier St-Sauveur, Val??rie January 2014 (has links)
L?????tude qui vous est pr??sent??e dans ce m??moire est r??alis??e chez l???organisme Schizosaccharomyces pombe et elle porte sur la caract??risation de la prot??ine Nab2, une prot??ine liant les queues poly(A) ainsi que sur son implication dans la r??gulation g??nique. Tout d???abord, il faut savoir qu???il existe quatre modes de r??gulation (transcriptionnel, post-transcriptionnel, traductionnel et post-traductionnel) dans lesquels interviennent diff??rents types de prot??ines, en particulier des prot??ines liant les queues poly(A) des ARN, aussi connues sous le nom de PABPs. Ces prot??ines reconnaissent l???ARN ?? l???aide de diff??rents domaines de liaison et elles se subdivisent en deux cat??gories : les PABPs nucl??aires ou cytoplasmiques, repr??sent??es respectivement par PABPN1 et PABPC1 chez les mammif??res. Comprendre la fonction des PABPs rev??t un int??r??t particulier puisqu???elles sont impliqu??es ?? diff??rents stades de la r??gulation g??nique. Des maladies ont aussi ??t?? associ??es ?? deux PABPs nucl??aires humaines, PABPN1 et ZC3H14, mais aucune association entre leur fonction r??ciproque et la maladie n???a pu ??tre ??tablie. Une des fa??ons de comprendre leur r??le est d?????tudier celui de leurs orthologues respectifs. Chez la levure ?? fission, un orthologue de PABPN1 a ??t?? caract??ris?? et il s???agit de Pab2. S. pombe poss??de cependant une seconde PABP nucl??aire, Nab2, qui est caract??ris??e dans ces travaux. Des m??thodes in vivo et in vitro ont ??t?? utilis??es afin de confirmer le statut de la prot??ine, ?? savoir qu???il s???agit bel et bien d???une PABP nucl??aire et que celle-ci est non essentielle. L???identification de partenaires prot??iques de Nab2 par spectrom??trie de masse a aussi permis de relier Nab2 avec des processus de r??gulation g??nique tels que l?????pissage et la d??gradation. Puisque Pab2 est aussi associ??e ?? des fonctions en lien avec la d??gradation, il est possible de faire un parall??le entre ces deux prot??ines et de supposer qu???elles interagissent ensemble. La deuxi??me partie de ces travaux porte donc sur l?????tude de la relation fonctionnelle entre Nab2 et Pab2 et elle a permis de montrer un m??canisme de r??gulation opportuniste bas?? sur la liaison de la cible ARN par l???une ou l???autre de ces PABPs. En effet, l?????tude de la r??gulation du g??ne mod??le RPL30-2 indique que Nab2 et Pab2 ont des r??les oppos??s puisqu???ils sont respectivement des r??gulateurs positifs et n??gatifs de l???expression de son transcrit.

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