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Efeito de marcadores moleculares sobre características de crescimento e reprodutivas de bovinos da raça Canchim /

Grossi, Daniela do Amaral. January 2011 (has links)
Resumo: Neste trabalho, o objetivo foi estudar a associação de marcadores moleculares dos genes do fator do crescimento semelhante à insulina tipo 1 (IGF1), do hormônio do crescimento (GH) e do fator de transcrição da pituitária (PIT1) com pesos ao nascimento (PN), à desmama (PD), aos 12 (P12) e aos 18 (P18) meses de idade, ganho do nascimento a desmama (GND), idade (IPP) e peso (PPP) ao primeiro parto e perímetro escrotal medido aos 12 (PE12) e 18 (PE18) meses de idade em bovinos da raça Canchim. Análises pelo método de máxima verossimilhança restrita, sob modelo animal indicaram que o gene IGF1 foi responsável por 4±3% da variância fenotípica de PN e o gene GH responsável por 7±6% e 26±13% da variação fenotípica de P12 e PPP, respectivamente. Análises de substituição alélica de IGF1, GH e PIT1 sobre o valor genético (VG) direto e materno (PNmaterno e PDmaterno) das características identificaram que os animais com o alelo "229" de IGF1 teriam VG favoráveis para características reprodutivas e de crescimento. Para GH, o alelo "L" apresentou-se relacionado a maiores VG de P12 e IPP e menores VG de PPP. O alelo "Hinf-" de PIT1 foi associado a menores VG de PN, PDmaterno e IPP e maiores VG de PD e PPP. Concluiu-se que existe um QTL para características de crescimento e reprodutivas segregando junto ao marcador de IGF1. O gene GH foi associado com P12, PPP e IPP, enquanto que o gene PIT1 foi associado ao PD, P12 e PPP. A genotipagem de mais animais, ou a saturação da região desses genes por busca de outros polimorfismos, poderá contribuir para quantificar o exato efeito desses genes sobre as características estudadas / Abstract: Analyses of the association of genetic markers with economic traits in beef cattle have been mainly reported in developed countries. In the Brazilian Canchim breed, studies found association of polymorphism in the insulin-like growth factor 1 (IGF1), growth hormone (GH) and specific pituitary transcriptions (PIT1) genes with growth traits. However, no studies were found that used the variance component approach to estimate the genetic variance due to these genes, or QTLs linked to them, in Canchim cattle.The objective of this study was to evaluate the effects of molecular markers IGF1, GH and PIT1 on the growth and reproductive traits in Canchim cattle. The traits analyzed included: birth weight (BW), weaning weight (WW), average daily gain from birth to weaning (ADG), body weight at 12 (W12) and at 18 months (W18), age at first calving (AFC), body weight at first calving (WFC), scrotal circumference at 12 (SC12) and at 18 months of age (SC18). Proportion of phenotypic variance of these traits that are explained by polymorphisms on the IGF1, GH and PIT1 genes was estimated using the restricted maximum likelihood (REML). In addition the allele substitution effect of these genes on estimated breeding values (EBV) was verified by the least squares method. The polymorphism in the IGF1 explained 4±3% of the BW phenotypic variance, while the polymorphism in GH explained 7±6% e 26±13% of the estimated phenotypic variance for WW and WFC, respectively. There is a QTL for reproductive and growth traits segregating with the marker IGF1. The GH gene was associated with W12, AFC and WFC, while PIT1 was associated with WW, W12 and WFC. Genotyping of more animals or the saturation region of other polymorphisms may help to quantify the exact effect of these genes on these traits / Orientador: Danísio Prado Munari / Coorientador: Claudia Cristina Paro de Paz / Coorientador: Luciana Correia de Almeida Regitano / Banca: Roberto Carvalheiro / Banca: Mônica Corrêa Ledur / Banca: João Ademir de Oliveira / Banca: Sandra Aldair de Queiroz / Doutor
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Escolha dos níveis nutricionais na determinação do nível-ótimo e no ajuste de modelos estatísticos utilizados em ensaios dose-resposta /

Souza, Fernando Augusto de. January 2010 (has links)
Orientador: Euclides Braga Malheiros / Banca: Nilva Kazue Sakomura / Banca: Antonio Carlos de Laurentiz / Resumo: Este trabalho avaliou a influência da heterocedasticidade e dos níveis nutricionais (número e posição) utilizados em ensaios dose-resposta, na estimativa do nível-ótimo e no ajuste dos modelos, além de verificar o quão informativas são as estatísticas utilizadas para avaliar a precisão do ajuste (R², R² ajustado, CV e SQD). Utilizaram-se dados dos experimentos realizados por Nascimento et al. (2007) e Siqueira (2009) e dados simulados. Constatou-se que, quando os níveis estiveram distribuídos próximos do verdadeiro requerimento, os modelos com platô proporcionaram resultados mais confiáveis. Já os modelos quadrático e exponencial se mostraram mais adequados para situações no qual os níveis estão mais dispersos em relação ao verdadeiro requerimento. A heterocedasticidade não interferiu na estimativa do nível-ótimo, porém influenciou no ajuste dos modelos e proporcionou pequenas mudanças nos parâmetros das equações obtidas. O coeficiente de determinação (ajustado e não ajustado) foi diretamente influenciado pela definição do nível mais próximo do ótimo e dos níveis extremos, enquanto que, o coeficiente de variação e a soma dos quadrados dos desvios, pelos níveis iniciais e pelo nível próximo do ótimo. A soma dos quadrados dos desvios demonstrou ser mais sensível, pois seu valor apresentou pequenas variações entre os modelos nas diferentes situações, que as outras estatísticas não detectaram. Ressalta-se a importância de se estabelecer corretamente o intervalo dos níveis estudados para que a dispersão dos valores do nível-ótimo estimado seja minimizada e que o ajuste seja satisfatório, independente do modelo utilizado / Abstract: This work evaluated the influence of heteroskedasticity and the nutritional levels (number and position) used in dose-response trials to estimating the optimal-level and the adjustment of the models, also check how informative are the statistics used to evaluate the accuracy of fit (R ², R ² adjusted, CV and SQD). The data used in this experiment are from Nascimento et al. (2007) and' Siqueira (2009) trials and simulated data. It was found that when levels were distributed close to the real requirement, the models with plateau have provided more reliable results. Since the quadratic and exponential models were more suitable for situations in which the levels are more dispersed about the real requirement. The heteroskedasticity did not affect the estimate of the level-optimal, but influenced the adjustment of the models and provided small changes in the parameters of the equations obtained. The coefficient of determination (adjusted and unadjusted) was directly influenced by the definition of the level closest to the optimum and extreme levels, while the coefficient of variation and the sum of squares of deviations were influenced by the initial levels and the level close to the optimum. The sum of squares of deviations was more sensitive, because its value showed small variations between models in different situations that the other statistics did not detect. Emphasized the importance to precisely define the range of levels studied to the dispersion of the obtained optimal-level is minimized and the fit is satisfactory regardless of the model / Mestre

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