La littérature économique attribuant des rôles endogènes à l'évolution technologique et à lagéographie pour expliquer la croissance économique suggère que la compréhension des fluxde connaissances dans l'espace et de leurs conséquences sur les activités d'innovation est aucoeur de l'explication des disparités dans la croissance économique. À cet égard, cette thèsemet l'accent sur les réseaux de connaissances comme un mécanisme permettant la circulationdes connaissances dans l'espace et le temps. Parmi les différents types de réseaux deconnaissances, elle étudie les réseaux de collaboration de R&D et explore deux questionsprincipales.Tout d'abord, elle examine l'effet de la géographie sur la formation du réseau pour savoir si lesflux de connaissances par les réseaux de collaboration en R&D sont limités dans l'espace oupas. Elle s'enquiert de cette question à la fois pour le réseau multilatéral entre lesorganisations et le réseau inter-régional entre les régions européennes dans le domaine desbiotechnologies en utilisant les données sur les collaborations de R&D promues par lesProgrammes-Cadres Européens.Deuxièmement, elle explore comment un réseau évolutif de collaborations de R&D entre lesrégions affecte les performances des régions en matière d'innovation. Elle utilise l'économétriespatiale pour quantifier les effets statiques et dynamiques des flux de connaissances desvoisins spatiaux et d'un ensemble évolutif de partenaires de collaboration sur l'activitéinventive des régions dans le domaine des TIC au cours de la période 2003-2009. / The economic literature attributing endogenous roles to technological change and geography inexplaining economie growth suggests that understanding knowledge flows in space and theirconsequences on innovative activities is central to explaining disparities in economie growth. Inthis regard, this PhD thesis focuses on knowledge networks as a mechanism that enablesknowledge flows in space and time. Among different types of knowledge networks, it studiesR&D collaboration networks and addresses two main issues.First, it investigates the effect of geography on network formation to figure out whetherknowledge flows through R&D collaboration networks are constrained in space or not. It inquiresthis question both for multilateral R&D collaboration network among organizations and theresulting inter-regional network among European regions in the field of biotechnology using dataon R&D collaborations promoted via European Framework Programmes.Second, it addresses how an evolving network of R&D collaborations among regions affectsregional innovation performances in time. It employs a spatial econometric approach to quantifythe static and dynamic effects of knowledge flows from spatial neighbors and an evolving set ofcollaboration partners on inventive activity of regions in the field of ICT durin 2003-2009.